logo

Genes within 1Mb (chr1:30645536:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 6.89e-01 -0.039 0.0975 0.19 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 3.98e-02 0.16 0.0773 0.19 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 8.88e-01 0.00924 0.0655 0.19 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -78049 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0373 0.0688 0.19 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 6.86e-02 0.0979 0.0535 0.19 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 3.78e-02 0.168 0.0806 0.19 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 5.90e-01 0.0341 0.0632 0.19 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 1.24e-01 0.115 0.0744 0.19 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 2.19e-01 0.105 0.0853 0.19 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 1.19e-01 0.104 0.0665 0.19 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 9.86e-01 0.00108 0.0595 0.19 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0903 0.0657 0.19 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0274 0.069 0.19 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 8.88e-01 0.00835 0.059 0.19 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 5.07e-02 0.138 0.0701 0.19 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 2.93e-01 0.118 0.112 0.19 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 6.70e-01 0.0319 0.0746 0.19 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 9.39e-01 0.00506 0.0657 0.19 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0296 0.0638 0.19 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 4.34e-01 0.0615 0.0785 0.19 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0499 0.0747 0.19 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 5.11e-01 0.0618 0.0939 0.19 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 8.61e-01 0.0178 0.102 0.189 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 4.33e-01 0.0944 0.12 0.189 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0214 0.0943 0.189 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 1.63e-01 -0.094 0.067 0.189 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0246 0.109 0.189 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -764029 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0779 0.111 0.189 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -860690 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0495 0.0735 0.189 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0361 0.106 0.189 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 7.66e-01 0.023 0.0771 0.19 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 2.47e-01 0.111 0.0953 0.19 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0549 0.0612 0.19 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0336 0.0564 0.19 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -263222 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0393 0.108 0.19 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 5.12e-01 0.0499 0.076 0.19 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -764029 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00379 0.116 0.19 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -860690 sc-eQTL 7.30e-01 0.0354 0.102 0.19 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00214 0.0896 0.19 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 1.32e-01 0.162 0.107 0.189 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 6.79e-01 0.0306 0.0737 0.189 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0736 0.0772 0.189 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 8.07e-01 0.0218 0.089 0.189 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00533 0.065 0.189 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 6.97e-01 -0.039 0.1 0.189 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00948 0.0924 0.189 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0233 0.081 0.19 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 7.44e-01 0.0283 0.0866 0.19 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 9.82e-01 0.00173 0.0779 0.19 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 4.62e-01 0.047 0.0637 0.19 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 4.67e-01 -0.062 0.0851 0.19 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0133 0.105 0.19 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 7.45e-01 0.0354 0.109 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 6.62e-02 0.235 0.127 0.189 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 7.84e-02 0.228 0.129 0.189 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 9.52e-01 0.00733 0.121 0.189 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -78049 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0327 0.105 0.189 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 5.07e-01 0.0488 0.0733 0.189 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 6.89e-01 -0.05 0.125 0.189 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0127 0.119 0.189 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 7.47e-01 0.0339 0.105 0.189 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0521 0.119 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 5.52e-01 0.0592 0.0994 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0835 0.0936 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -78049 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0332 0.0976 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 2.66e-01 0.0666 0.0598 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 1.54e-01 0.159 0.111 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 6.18e-01 0.042 0.0841 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 2.69e-01 0.104 0.0939 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0815 0.119 0.192 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 1.52e-01 0.157 0.109 0.192 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 9.18e-01 0.00977 0.0953 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -78049 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0283 0.0911 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 6.35e-01 0.0383 0.0808 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 9.95e-01 0.000734 0.108 0.192 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 4.77e-01 0.0658 0.0924 0.192 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 2.74e-01 0.118 0.108 0.192 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0516 0.107 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 4.41e-02 0.185 0.0912 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 9.48e-01 0.00532 0.0812 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -78049 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0904 0.0822 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 6.06e-01 0.0284 0.055 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 1.04e-01 0.158 0.0964 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 9.76e-01 0.00215 0.0723 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 5.66e-01 0.0513 0.0892 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00468 0.113 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 8.61e-01 0.0164 0.0934 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0753 0.0912 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -78049 sc-eQTL 1.22e-02 0.218 0.0864 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 2.73e-01 0.0653 0.0594 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 9.26e-02 0.182 0.108 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 3.87e-01 -0.075 0.0866 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 1.36e-01 0.14 0.0932 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 8.36e-02 -0.195 0.112 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0475 0.111 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 6.15e-02 0.203 0.108 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 4.27e-01 0.0772 0.097 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00523 0.0996 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 2.02e-01 0.135 0.106 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 5.71e-02 0.178 0.0929 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 2.44e-01 0.104 0.089 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 2.88e-01 0.084 0.079 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 8.85e-01 0.00917 0.0632 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0678 0.0676 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0101 0.0743 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 9.27e-01 0.00628 0.0687 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 6.10e-02 0.147 0.0783 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 5.10e-01 0.0746 0.113 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 8.54e-01 0.0168 0.0912 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 9.19e-01 0.00819 0.0808 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 1.52e-02 -0.162 0.0661 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 3.27e-01 0.088 0.0896 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 3.01e-01 -0.088 0.0848 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 4.18e-01 0.0768 0.0945 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 6.02e-02 0.211 0.112 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 9.51e-02 0.178 0.106 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 1.18e-01 -0.139 0.0887 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0882 0.0901 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0508 0.101 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 4.45e-01 0.0808 0.105 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0514 0.104 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 5.08e-01 0.0794 0.12 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 1.20e-01 0.143 0.0914 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0686 0.0891 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 6.92e-01 0.0392 0.0988 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 6.59e-01 0.038 0.086 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 9.47e-01 0.00687 0.104 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 1.87e-01 0.129 0.0973 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 8.03e-01 0.0279 0.112 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0759 0.0964 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 8.50e-02 -0.134 0.0772 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0987 0.0742 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 7.32e-01 0.0354 0.104 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 2.60e-01 0.105 0.0927 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 5.04e-01 0.0677 0.101 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0367 0.128 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 8.59e-01 0.0209 0.117 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0132 0.11 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 6.86e-01 0.0467 0.115 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 2.43e-01 -0.138 0.117 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 3.27e-01 -0.105 0.106 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0767 0.108 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 3.41e-01 -0.11 0.115 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 3.01e-01 0.114 0.11 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00374 0.113 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 5.51e-02 0.203 0.105 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0586 0.1 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 8.87e-01 0.0158 0.11 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 2.56e-01 0.113 0.0996 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 5.58e-01 0.0699 0.119 0.193 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 7.74e-01 0.0303 0.106 0.193 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 4.70e-01 0.0732 0.101 0.193 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 7.06e-01 0.0361 0.0955 0.193 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 3.30e-01 -0.102 0.105 0.193 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0407 0.106 0.193 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0498 0.11 0.193 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 7.69e-01 0.0351 0.119 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0304 0.101 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 3.94e-01 0.0901 0.105 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00576 0.104 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 5.29e-01 0.0637 0.101 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 9.30e-01 0.00927 0.105 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0239 0.103 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 4.39e-01 0.0882 0.114 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 7.63e-01 0.0255 0.0842 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0762 0.0863 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 5.68e-01 0.0527 0.0921 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 6.30e-01 0.0395 0.082 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 3.57e-01 -0.106 0.115 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 5.30e-01 0.0598 0.0952 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0257 0.12 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 5.48e-01 0.0645 0.107 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0581 0.104 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 3.60e-01 0.0913 0.0996 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 1.59e-01 0.158 0.112 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 3.85e-01 0.0923 0.106 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 2.18e-01 -0.126 0.102 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 2.24e-01 0.135 0.11 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 9.04e-01 0.0104 0.0864 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 1.21e-01 -0.145 0.0929 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 5.87e-01 0.0559 0.103 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 1.77e-01 -0.118 0.0873 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0814 0.109 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 7.52e-01 0.0321 0.101 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 9.89e-01 0.00188 0.132 0.174 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 4.33e-01 -0.12 0.153 0.174 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0792 0.133 0.174 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -78049 sc-eQTL 3.73e-01 0.111 0.124 0.174 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0489 0.0886 0.174 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0263 0.137 0.174 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 3.96e-01 0.103 0.121 0.174 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 4.16e-01 0.105 0.129 0.174 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 8.57e-01 0.0157 0.087 0.191 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 9.80e-01 0.00275 0.11 0.191 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 2.72e-01 0.113 0.103 0.191 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 6.08e-01 0.038 0.0739 0.191 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 3.96e-01 0.0921 0.108 0.191 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 6.40e-01 0.0483 0.103 0.191 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0592 0.0949 0.191 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 9.60e-01 0.00576 0.114 0.19 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 1.13e-01 0.175 0.11 0.19 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 2.83e-01 0.095 0.0882 0.19 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 5.86e-01 0.0552 0.101 0.19 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 1.51e-01 -0.157 0.109 0.19 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 6.11e-01 0.0525 0.103 0.19 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 4.96e-01 0.0703 0.103 0.19 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 1.89e-01 0.153 0.116 0.185 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0643 0.126 0.185 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 7.34e-01 0.0369 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0497 0.0759 0.185 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0276 0.11 0.185 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -764029 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0278 0.0976 0.185 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -860690 sc-eQTL 2.47e-01 0.111 0.0955 0.185 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0553 0.103 0.185 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 1.84e-01 0.121 0.0909 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 2.91e-01 0.108 0.102 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00711 0.0689 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0831 0.0602 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -263222 sc-eQTL 8.08e-01 0.0277 0.114 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 9.65e-02 0.154 0.0925 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -764029 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0374 0.115 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -860690 sc-eQTL 4.06e-01 0.0847 0.102 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00546 0.0951 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 5.17e-01 0.0628 0.0968 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 2.84e-01 0.123 0.114 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 5.35e-01 0.0513 0.0827 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 9.85e-01 0.00118 0.0636 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -263222 sc-eQTL 9.39e-01 0.00837 0.11 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 5.85e-01 0.0542 0.0991 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -764029 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00895 0.116 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -860690 sc-eQTL 8.09e-01 0.0228 0.0945 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0445 0.0948 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 1.67e-01 -0.196 0.141 0.2 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 2.12e-01 0.152 0.121 0.2 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 8.68e-01 0.0208 0.125 0.2 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 8.76e-01 0.0213 0.136 0.2 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 3.78e-01 -0.11 0.124 0.2 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 4.45e-02 -0.251 0.124 0.2 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 2.74e-01 0.133 0.121 0.2 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 1.59e-01 -0.15 0.106 0.189 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0331 0.115 0.189 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0968 0.0973 0.189 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0269 0.0765 0.189 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -263222 sc-eQTL 7.27e-02 -0.188 0.104 0.189 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 3.75e-01 0.0976 0.11 0.189 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -764029 sc-eQTL 7.05e-01 0.0416 0.11 0.189 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -860690 sc-eQTL 6.30e-01 0.0501 0.104 0.189 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 1.66e-01 0.144 0.103 0.189 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 1.95e-02 -0.235 0.0999 0.188 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0112 0.108 0.188 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0216 0.0883 0.188 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 2.47e-02 -0.179 0.0791 0.188 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -263222 sc-eQTL 3.86e-01 0.078 0.0897 0.188 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 7.48e-01 0.0332 0.103 0.188 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -764029 sc-eQTL 8.19e-01 0.0224 0.0981 0.188 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -860690 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0795 0.0978 0.188 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 2.33e-02 0.229 0.1 0.188 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0879 0.117 0.184 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 1.29e-01 0.195 0.128 0.184 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 3.20e-01 -0.106 0.107 0.184 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0482 0.0994 0.184 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 2.46e-01 -0.15 0.128 0.184 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -764029 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000837 0.121 0.184 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -860690 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0819 0.0934 0.184 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 5.76e-01 0.0617 0.11 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0771 0.114 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 1.30e-01 0.143 0.0942 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0152 0.0839 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -78049 sc-eQTL 2.79e-01 -0.104 0.0954 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 1.68e-01 0.0827 0.0598 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 7.85e-01 0.0271 0.0995 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 4.37e-01 0.0618 0.0794 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 3.07e-01 0.0885 0.0864 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0389 0.103 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 2.77e-01 0.0885 0.0812 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0326 0.077 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -78049 sc-eQTL 8.71e-01 -0.012 0.0742 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 4.94e-01 0.0357 0.0522 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 1.75e-02 0.225 0.0941 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 9.31e-01 0.00586 0.0675 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 2.66e-01 0.0891 0.0799 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 1.99e-01 0.113 0.0879 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 9.68e-02 0.166 0.0993 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0271 0.0637 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00683 0.056 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -263222 sc-eQTL 7.10e-01 0.0426 0.114 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 3.87e-01 0.0695 0.0802 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -764029 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0417 0.118 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -860690 sc-eQTL 6.92e-01 0.0382 0.0964 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0312 0.0902 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 1.46e-02 -0.235 0.0953 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0874 0.106 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0713 0.0866 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0799 0.0691 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -263222 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0794 0.101 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 5.74e-01 0.0518 0.092 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -764029 sc-eQTL 7.53e-01 0.033 0.105 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -860690 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00651 0.0997 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 1.44e-01 0.146 0.0993 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -651252 sc-eQTL 2.21e-01 0.132 0.108 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -651446 sc-eQTL 8.38e-01 0.0152 0.0739 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -420455 sc-eQTL 2.21e-01 -0.099 0.0807 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -112238 sc-eQTL 7.93e-01 0.0238 0.0905 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -999360 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0299 0.0687 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -72968 sc-eQTL 5.99e-01 -0.055 0.104 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -86157 sc-eQTL 6.85e-01 0.0365 0.0901 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162510 \N -78049 6.16e-06 7.87e-06 7.62e-07 3.81e-06 1.72e-06 2.48e-06 9.17e-06 1.18e-06 5.17e-06 3.77e-06 9.01e-06 3.25e-06 1.11e-05 3.27e-06 1.54e-06 4.66e-06 3.09e-06 3.77e-06 1.75e-06 1.68e-06 3.08e-06 7.41e-06 5.57e-06 1.93e-06 9.94e-06 2.34e-06 3.35e-06 2.13e-06 6.83e-06 7.59e-06 3.74e-06 4.9e-07 7.83e-07 2.78e-06 2.35e-06 1.6e-06 1.11e-06 5.58e-07 1.41e-06 7.17e-07 7.18e-07 9.19e-06 8.05e-07 1.66e-07 7.55e-07 9.43e-07 1.07e-06 6.71e-07 5.14e-07