logo

Genes within 1Mb (chr1:30642504:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0261 0.111 0.128 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 1.08e-01 0.142 0.088 0.128 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 8.32e-01 0.0158 0.0743 0.128 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -81081 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0459 0.078 0.128 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 1.06e-01 0.0986 0.0608 0.128 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0107 0.0717 0.128 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 5.21e-01 0.0545 0.0847 0.128 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000627 0.097 0.128 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0225 0.0758 0.128 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0059 0.0675 0.128 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0239 0.0747 0.128 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 7.27e-01 0.0233 0.0669 0.128 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 1.23e-01 0.123 0.0797 0.128 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0293 0.126 0.128 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 9.63e-01 0.00385 0.084 0.128 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 4.87e-01 0.0514 0.0739 0.128 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 4.10e-01 0.0592 0.0717 0.128 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 1.16e-01 -0.132 0.0837 0.128 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 3.12e-01 0.107 0.106 0.128 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 9.36e-01 0.00909 0.114 0.126 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 1.65e-01 -0.186 0.134 0.126 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0508 0.105 0.126 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 7.19e-01 0.027 0.0752 0.126 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -767061 sc-eQTL 5.57e-01 0.0729 0.124 0.126 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -863722 sc-eQTL 2.12e-01 -0.102 0.0818 0.126 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 1.88e-01 0.156 0.118 0.126 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 4.28e-01 0.0697 0.0877 0.128 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0646 0.109 0.128 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 1.06e-02 -0.177 0.0687 0.128 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 3.84e-01 0.0559 0.0641 0.128 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -266254 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0182 0.123 0.128 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -767061 sc-eQTL 1.26e-01 0.202 0.132 0.128 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -863722 sc-eQTL 7.02e-01 0.0446 0.117 0.128 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 1.73e-01 0.139 0.101 0.128 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 3.75e-01 0.107 0.121 0.127 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 7.26e-01 0.029 0.0827 0.127 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0251 0.0868 0.127 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 1.90e-03 0.307 0.0976 0.127 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 8.25e-01 0.0249 0.112 0.127 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 2.52e-03 0.31 0.101 0.127 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 3.63e-01 0.0828 0.0909 0.128 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0203 0.0974 0.128 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 5.73e-02 0.166 0.0868 0.128 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0184 0.0718 0.128 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 7.84e-01 0.0323 0.118 0.128 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 5.39e-01 0.0752 0.122 0.128 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 4.86e-01 -0.101 0.145 0.128 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 4.18e-01 -0.119 0.146 0.128 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 6.29e-01 0.0659 0.136 0.128 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -81081 sc-eQTL 8.77e-01 0.0184 0.119 0.128 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 5.88e-01 0.045 0.083 0.128 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0495 0.134 0.128 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0152 0.119 0.128 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 8.33e-01 0.0289 0.137 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 9.36e-02 0.191 0.113 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 8.90e-02 -0.183 0.107 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -81081 sc-eQTL 1.48e-02 -0.271 0.11 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 4.40e-01 0.053 0.0686 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 5.74e-01 0.0542 0.0964 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 9.49e-01 0.00697 0.108 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0241 0.133 0.127 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 3.79e-01 0.108 0.122 0.127 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 1.71e-01 0.146 0.106 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -81081 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0879 0.102 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 7.45e-02 0.161 0.0899 0.127 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 1.18e-02 -0.259 0.102 0.127 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 3.33e-01 -0.118 0.121 0.127 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0165 0.121 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 3.49e-01 0.0979 0.104 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 4.44e-01 0.0707 0.0921 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -81081 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0277 0.0936 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 2.74e-01 0.0683 0.0624 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0511 0.0821 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 2.05e-01 0.129 0.101 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 1.50e-01 -0.183 0.127 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 7.70e-01 0.0308 0.105 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 8.92e-01 -0.014 0.103 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -81081 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0792 0.0988 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 3.62e-02 0.14 0.0665 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 9.68e-02 0.162 0.0972 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 1.30e-01 0.16 0.105 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 6.25e-01 -0.064 0.131 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 8.03e-01 0.0321 0.128 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 1.99e-01 0.162 0.125 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 4.38e-01 0.0871 0.112 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 9.87e-01 0.00196 0.123 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 5.39e-01 0.0667 0.108 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 7.45e-01 0.0327 0.1 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 8.36e-01 0.0185 0.0891 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0486 0.0711 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0118 0.0762 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 5.54e-01 0.0458 0.0773 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 3.92e-01 0.0761 0.0887 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 9.39e-01 0.00971 0.127 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 2.89e-01 -0.109 0.102 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 2.89e-01 0.096 0.0904 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00816 0.0752 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0413 0.0954 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 3.49e-01 0.0996 0.106 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 8.93e-01 0.0169 0.125 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 6.06e-01 0.0617 0.119 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0744 0.0994 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 4.76e-02 0.199 0.0998 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 1.61e-01 0.165 0.117 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0677 0.116 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0613 0.136 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 4.28e-01 0.0824 0.104 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 5.40e-01 0.0619 0.101 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 2.14e-01 0.139 0.111 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0246 0.118 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 3.05e-01 0.113 0.11 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0402 0.125 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 3.36e-01 -0.104 0.108 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 6.29e-01 0.042 0.0868 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 7.80e-01 0.0233 0.0832 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0311 0.104 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 5.22e-01 0.0725 0.113 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 4.05e-01 0.116 0.139 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 3.51e-01 -0.119 0.127 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 7.17e-02 0.216 0.119 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 3.94e-01 0.107 0.125 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0448 0.116 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 3.53e-02 -0.246 0.116 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 1.82e-01 -0.176 0.131 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 7.54e-02 0.224 0.125 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 1.89e-01 0.17 0.129 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 3.82e-01 0.106 0.121 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0196 0.126 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 5.58e-01 -0.067 0.114 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 4.31e-01 0.105 0.133 0.128 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 2.37e-01 0.139 0.117 0.128 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 5.47e-01 0.068 0.113 0.128 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 6.70e-01 0.0455 0.106 0.128 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0676 0.118 0.128 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0596 0.122 0.128 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 3.56e-01 0.124 0.134 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0592 0.113 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0542 0.119 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 3.65e-01 0.106 0.117 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 4.60e-02 -0.234 0.117 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 4.33e-01 0.091 0.116 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 2.49e-01 0.147 0.128 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 6.80e-01 0.039 0.0947 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00508 0.0971 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 7.14e-03 0.277 0.102 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 8.91e-01 0.0179 0.13 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 1.10e-01 0.171 0.106 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0579 0.133 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0424 0.119 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 5.46e-01 0.07 0.116 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 3.57e-02 0.231 0.109 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 6.98e-01 0.0456 0.117 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 9.00e-03 0.295 0.112 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 9.03e-01 0.0153 0.125 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 7.97e-01 -0.025 0.0974 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0959 0.105 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 1.38e-02 0.284 0.114 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 2.24e-01 0.149 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 2.11e-01 0.143 0.114 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 1.55e-01 0.22 0.153 0.13 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0314 0.179 0.13 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0162 0.156 0.13 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -81081 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0882 0.145 0.13 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 3.18e-01 -0.103 0.103 0.13 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 6.05e-01 0.0735 0.142 0.13 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0313 0.151 0.13 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 7.12e-02 0.178 0.0982 0.128 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 6.47e-01 0.0576 0.126 0.128 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 2.31e-01 0.14 0.117 0.128 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0943 0.0838 0.128 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 6.23e-01 0.0579 0.117 0.128 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 6.85e-01 0.0439 0.108 0.128 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 1.57e-01 -0.184 0.129 0.128 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0728 0.126 0.128 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0528 0.1 0.128 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 1.38e-01 0.171 0.115 0.128 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 7.25e-01 0.0413 0.117 0.128 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 4.76e-01 0.0835 0.117 0.128 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0103 0.132 0.129 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 1.12e-01 -0.226 0.142 0.129 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 4.18e-01 0.0993 0.122 0.129 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 6.38e-01 0.0405 0.0859 0.129 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -767061 sc-eQTL 9.73e-01 0.00379 0.11 0.129 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -863722 sc-eQTL 3.43e-01 0.103 0.108 0.129 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 1.53e-01 -0.166 0.116 0.129 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 8.81e-02 0.178 0.104 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0896 0.117 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 1.11e-01 -0.126 0.0787 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 4.15e-01 0.0567 0.0694 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -266254 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0885 0.131 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -767061 sc-eQTL 9.23e-02 0.223 0.132 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -863722 sc-eQTL 7.41e-01 0.0387 0.117 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 6.31e-02 0.202 0.108 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 5.09e-01 0.0719 0.109 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 7.26e-01 0.045 0.128 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 1.25e-01 -0.142 0.0923 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 2.73e-01 0.0782 0.0711 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -266254 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0636 0.123 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -767061 sc-eQTL 1.16e-01 0.205 0.13 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -863722 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0581 0.106 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 7.64e-01 0.0319 0.106 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 1.08e-01 -0.272 0.168 0.109 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0115 0.146 0.109 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 2.19e-01 0.184 0.149 0.109 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0287 0.163 0.109 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 5.33e-01 -0.094 0.15 0.109 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 5.46e-01 0.0882 0.146 0.109 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 6.57e-01 0.0547 0.123 0.131 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0737 0.132 0.131 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 2.78e-01 -0.122 0.112 0.131 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 7.17e-01 0.032 0.0881 0.131 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -266254 sc-eQTL 8.90e-01 0.0168 0.121 0.131 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -767061 sc-eQTL 5.29e-01 0.0797 0.126 0.131 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -863722 sc-eQTL 5.37e-01 0.074 0.12 0.131 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 1.88e-01 0.158 0.119 0.131 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 3.35e-01 -0.111 0.115 0.131 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00806 0.123 0.131 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0797 0.1 0.131 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00553 0.0912 0.131 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -266254 sc-eQTL 8.15e-02 0.178 0.101 0.131 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -767061 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00978 0.112 0.131 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -863722 sc-eQTL 8.56e-01 0.0203 0.111 0.131 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 1.64e-01 0.161 0.115 0.131 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 6.05e-01 0.0679 0.131 0.13 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 2.74e-01 -0.157 0.143 0.13 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 1.93e-01 -0.155 0.119 0.13 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00445 0.111 0.13 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -767061 sc-eQTL 7.28e-01 0.0467 0.134 0.13 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -863722 sc-eQTL 1.67e-01 -0.144 0.104 0.13 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 2.84e-02 0.267 0.121 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00836 0.129 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 2.03e-01 0.137 0.107 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0584 0.0951 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -81081 sc-eQTL 3.30e-02 -0.231 0.107 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 2.68e-01 0.0756 0.068 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0611 0.0901 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 9.88e-01 0.00142 0.0983 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 3.79e-01 -0.104 0.118 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 4.44e-01 0.0719 0.0936 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 6.77e-01 0.037 0.0886 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -81081 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00805 0.0854 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 2.07e-01 0.0758 0.0599 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 6.70e-01 0.0331 0.0776 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 3.60e-01 0.0845 0.092 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 2.15e-01 0.124 0.0993 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 9.40e-01 0.00855 0.113 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 3.38e-02 -0.152 0.0713 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 2.87e-01 0.0674 0.0631 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -266254 sc-eQTL 2.85e-01 -0.138 0.129 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -767061 sc-eQTL 1.09e-01 0.213 0.132 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -863722 sc-eQTL 7.71e-01 0.0317 0.109 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 8.57e-02 0.175 0.101 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0517 0.111 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 1.40e-01 -0.18 0.121 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 1.44e-01 -0.146 0.0994 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 6.01e-01 0.0418 0.0799 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -266254 sc-eQTL 5.64e-01 0.0674 0.117 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -767061 sc-eQTL 7.26e-01 0.0424 0.121 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -863722 sc-eQTL 6.95e-01 0.0451 0.115 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 2.35e-01 0.137 0.115 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -654284 sc-eQTL 3.32e-01 0.118 0.121 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -654478 sc-eQTL 7.72e-01 0.0241 0.0831 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -423487 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00504 0.091 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -115270 sc-eQTL 2.62e-03 0.303 0.0995 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -76000 sc-eQTL 5.20e-01 0.0755 0.117 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -89189 sc-eQTL 1.40e-03 0.32 0.0988 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -423487 eQTL 0.00485 0.0629 0.0223 0.0 0.0 0.114

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina