logo

Genes within 1Mb (chr1:30628638:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 4.78e-01 0.0916 0.129 0.1 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 9.47e-02 -0.172 0.103 0.1 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 1.96e-01 -0.112 0.0862 0.1 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -94947 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0621 0.0909 0.1 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 4.49e-01 -0.054 0.0712 0.1 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 2.21e-01 -0.102 0.0832 0.1 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 4.76e-01 0.0705 0.0987 0.1 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 2.21e-01 -0.134 0.11 0.1 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 8.68e-01 0.0143 0.0859 0.1 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 6.05e-01 0.0395 0.0764 0.1 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 9.14e-02 -0.143 0.0841 0.1 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 5.93e-01 0.0405 0.0757 0.1 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 7.50e-01 -0.029 0.0908 0.1 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0944 0.144 0.1 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 5.85e-01 0.0525 0.0962 0.1 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 6.80e-01 0.035 0.0847 0.1 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 1.23e-01 -0.127 0.0818 0.1 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 4.89e-01 0.0668 0.0963 0.1 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 2.93e-01 0.127 0.121 0.1 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 7.51e-01 0.0416 0.131 0.099 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 3.64e-01 0.141 0.155 0.099 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0234 0.121 0.099 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0829 0.0865 0.099 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -780927 sc-eQTL 2.11e-01 -0.179 0.142 0.099 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -877588 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0223 0.0947 0.099 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 3.83e-01 -0.12 0.137 0.099 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 3.01e-01 -0.103 0.0996 0.1 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0341 0.124 0.1 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0328 0.0793 0.1 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0132 0.073 0.1 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -280120 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0844 0.14 0.1 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -780927 sc-eQTL 6.72e-01 0.0639 0.15 0.1 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -877588 sc-eQTL 1.00e+00 4e-05 0.133 0.1 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 8.16e-02 0.201 0.115 0.1 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0477 0.141 0.101 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 9.82e-01 0.00216 0.0964 0.101 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 5.53e-01 0.06 0.101 0.101 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 9.29e-01 0.0103 0.116 0.101 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 2.21e-02 -0.298 0.129 0.101 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0651 0.121 0.101 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 3.40e-01 0.102 0.106 0.1 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0267 0.114 0.1 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 8.25e-02 -0.177 0.102 0.1 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 2.75e-02 -0.184 0.0829 0.1 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 4.03e-01 0.115 0.137 0.1 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 9.77e-01 0.00406 0.143 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0603 0.164 0.102 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 1.95e-01 -0.215 0.165 0.102 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 3.23e-01 0.152 0.154 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -94947 sc-eQTL 8.17e-01 0.0313 0.135 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00265 0.0939 0.102 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 8.68e-01 0.0253 0.152 0.102 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 3.91e-01 0.115 0.134 0.102 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 3.13e-01 0.159 0.157 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 5.51e-01 0.0781 0.131 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0718 0.123 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -94947 sc-eQTL 3.40e-01 0.123 0.128 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0138 0.079 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00965 0.111 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 6.68e-02 -0.227 0.123 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 2.83e-01 0.169 0.157 0.101 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0589 0.145 0.101 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 1.08e-01 -0.202 0.125 0.101 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -94947 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0326 0.121 0.101 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0538 0.107 0.101 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 3.18e-01 -0.122 0.122 0.101 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 8.76e-01 0.0223 0.143 0.101 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 6.51e-01 0.0637 0.141 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 9.06e-02 -0.205 0.121 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0948 0.107 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -94947 sc-eQTL 1.27e-01 -0.165 0.108 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0581 0.0725 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 1.34e-01 -0.143 0.0948 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 3.29e-01 0.115 0.117 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 1.91e-01 -0.198 0.151 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 4.22e-01 -0.1 0.125 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 9.44e-01 0.00863 0.122 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -94947 sc-eQTL 6.28e-01 0.0569 0.117 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0807 0.0796 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 2.53e-01 -0.133 0.116 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0307 0.125 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 5.84e-01 0.0823 0.15 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0975 0.148 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 1.33e-01 -0.218 0.144 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 6.00e-02 -0.242 0.128 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 1.42e-01 -0.207 0.141 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0856 0.125 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 1.59e-01 -0.162 0.115 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 9.59e-01 0.00529 0.102 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 1.65e-01 0.113 0.0811 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 7.97e-02 -0.153 0.0867 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 4.61e-01 0.0653 0.0885 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0257 0.102 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00448 0.144 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 3.63e-01 0.106 0.116 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0274 0.103 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0842 0.0853 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 6.45e-01 0.05 0.108 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 8.85e-01 0.0175 0.121 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 5.73e-01 0.0825 0.146 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 7.67e-02 -0.246 0.139 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 3.53e-01 -0.108 0.116 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 1.54e-01 -0.167 0.117 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 6.90e-01 0.0549 0.137 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0255 0.136 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 7.18e-01 -0.057 0.157 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0177 0.121 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 1.98e-01 0.151 0.117 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 3.83e-02 -0.268 0.129 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 4.26e-01 0.109 0.136 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 3.25e-02 0.273 0.127 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 2.52e-01 -0.165 0.144 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 2.92e-01 0.131 0.124 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0238 0.1 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 1.91e-01 -0.125 0.0954 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 9.53e-01 0.00699 0.12 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 9.40e-01 0.00988 0.13 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 2.31e-01 -0.196 0.163 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 7.94e-01 0.0391 0.15 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 2.23e-01 0.172 0.14 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 2.60e-01 -0.166 0.147 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 1.04e-01 0.222 0.136 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 4.58e-01 0.102 0.138 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0186 0.15 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0154 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 2.63e-01 -0.165 0.147 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 4.39e-01 -0.107 0.138 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 1.61e-01 -0.201 0.143 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 3.53e-01 0.121 0.13 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0139 0.157 0.1 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0499 0.139 0.1 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 4.15e-01 -0.109 0.133 0.1 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 2.14e-02 -0.287 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 4.41e-01 0.108 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 1.93e-01 0.187 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 7.77e-01 0.0452 0.16 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0749 0.135 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0228 0.142 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 4.81e-01 0.0985 0.139 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 1.91e-01 0.183 0.14 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 3.32e-01 0.134 0.138 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0813 0.15 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 8.64e-01 0.019 0.111 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 4.56e-01 0.0847 0.114 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 9.79e-01 0.00321 0.121 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 8.68e-02 -0.259 0.151 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0277 0.125 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0361 0.168 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 1.54e-01 0.213 0.149 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0272 0.146 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 4.44e-01 -0.107 0.139 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 1.51e-01 -0.213 0.148 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 7.97e-01 0.037 0.143 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 2.58e-01 0.164 0.145 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00455 0.113 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 8.75e-01 0.0193 0.123 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 8.02e-01 -0.034 0.135 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 2.08e-01 -0.18 0.143 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 4.52e-01 0.1 0.133 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 8.15e-01 0.0398 0.169 0.104 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 3.31e-02 0.415 0.192 0.104 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 6.63e-01 0.0746 0.17 0.104 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -94947 sc-eQTL 9.15e-01 0.0171 0.159 0.104 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0724 0.113 0.104 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 5.08e-01 -0.103 0.155 0.104 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0933 0.165 0.104 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 1.18e-01 0.177 0.113 0.102 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 4.54e-01 -0.108 0.144 0.102 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 1.53e-01 0.191 0.133 0.102 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 2.83e-01 0.103 0.0959 0.102 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0923 0.134 0.102 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 7.02e-01 0.0473 0.124 0.102 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 2.33e-01 0.18 0.15 0.1 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0438 0.146 0.1 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 2.17e-01 -0.144 0.116 0.1 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 3.78e-02 -0.277 0.132 0.1 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0868 0.136 0.1 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 2.65e-01 -0.152 0.136 0.1 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 4.80e-01 -0.111 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 3.75e-01 0.151 0.169 0.1 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 2.07e-01 0.184 0.145 0.1 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 9.17e-02 -0.172 0.101 0.1 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -780927 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0969 0.131 0.1 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -877588 sc-eQTL 4.85e-01 0.0901 0.129 0.1 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0363 0.139 0.1 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 5.82e-01 -0.066 0.12 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 3.77e-01 -0.118 0.133 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 5.94e-02 -0.17 0.0896 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 4.46e-01 0.0605 0.0792 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -280120 sc-eQTL 3.66e-01 -0.135 0.149 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -780927 sc-eQTL 6.60e-01 0.0667 0.151 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -877588 sc-eQTL 7.72e-01 0.0388 0.134 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 1.97e-02 0.289 0.123 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 6.75e-01 -0.053 0.126 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 6.48e-01 0.0682 0.149 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 2.43e-01 0.126 0.108 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 6.97e-01 0.0323 0.0829 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -280120 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0879 0.143 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -780927 sc-eQTL 5.83e-01 0.0833 0.152 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -877588 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0303 0.123 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 1.78e-01 0.166 0.123 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0915 0.192 0.088 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0154 0.165 0.088 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 5.11e-02 -0.331 0.168 0.088 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0971 0.185 0.088 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 3.49e-01 0.16 0.17 0.088 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0118 0.166 0.088 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 3.28e-02 -0.3 0.14 0.1 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 2.51e-01 0.174 0.151 0.1 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 2.12e-03 0.391 0.126 0.1 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 7.01e-01 0.0389 0.101 0.1 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -280120 sc-eQTL 6.72e-01 0.0586 0.138 0.1 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -780927 sc-eQTL 6.23e-01 0.0712 0.145 0.1 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -877588 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0382 0.137 0.1 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00375 0.137 0.1 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0407 0.135 0.1 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0455 0.144 0.1 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 9.31e-01 0.0102 0.118 0.1 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 1.32e-01 -0.161 0.106 0.1 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -280120 sc-eQTL 3.63e-01 -0.109 0.119 0.1 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -780927 sc-eQTL 9.40e-01 0.00978 0.131 0.1 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -877588 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0867 0.13 0.1 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 2.19e-01 -0.166 0.135 0.1 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 6.49e-01 0.0687 0.151 0.096 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 2.83e-01 -0.178 0.165 0.096 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 2.32e-02 -0.309 0.135 0.096 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 6.47e-01 0.0584 0.127 0.096 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -780927 sc-eQTL 3.73e-01 -0.138 0.154 0.096 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -877588 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00468 0.12 0.096 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 6.61e-02 0.259 0.14 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 4.96e-01 0.103 0.152 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0216 0.126 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 2.19e-01 -0.137 0.111 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -94947 sc-eQTL 2.84e-01 0.137 0.127 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000716 0.0801 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0399 0.106 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 1.52e-01 -0.165 0.115 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 3.61e-01 -0.125 0.136 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 5.17e-02 -0.21 0.107 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 1.19e-01 -0.159 0.102 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -94947 sc-eQTL 2.67e-01 -0.109 0.0982 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0677 0.0692 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 1.73e-01 -0.122 0.0891 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 3.48e-01 0.0999 0.106 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 6.05e-01 -0.059 0.114 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0732 0.129 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0648 0.0822 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 7.55e-01 0.0226 0.0724 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -280120 sc-eQTL 4.74e-01 -0.106 0.147 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -780927 sc-eQTL 6.26e-01 0.0741 0.152 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -877588 sc-eQTL 9.81e-01 0.00297 0.125 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 1.75e-02 0.276 0.115 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 1.13e-01 -0.2 0.125 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 2.72e-01 0.152 0.138 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 7.61e-02 0.2 0.112 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 2.34e-01 -0.108 0.0902 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -280120 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0107 0.132 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -780927 sc-eQTL 7.64e-01 0.0412 0.137 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -877588 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0457 0.13 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 3.24e-01 -0.128 0.13 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -668150 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0393 0.142 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -668344 sc-eQTL 9.88e-01 0.0014 0.0968 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -437353 sc-eQTL 6.39e-01 0.0497 0.106 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0242 0.119 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 sc-eQTL 9.09e-03 -0.354 0.135 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -103055 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0413 0.118 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142910 TINAGL1 -947847 pQTL 0.0121 -0.0674 0.0268 0.00184 0.0 0.09
ENSG00000162510 MATN1 -94947 eQTL 0.00214 -0.109 0.0354 0.00231 0.00219 0.0824
ENSG00000162511 LAPTM5 -129136 eQTL 0.00686 0.0488 0.018 0.0 0.0 0.0824
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -89866 eQTL 6.09e-03 -0.0624 0.0227 0.0 0.0 0.0824

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina