logo

Genes within 1Mb (chr1:30611412:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0441 0.0986 0.169 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 6.97e-02 0.143 0.0784 0.169 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 7.23e-01 0.0236 0.0662 0.169 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -112173 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0474 0.0696 0.169 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 8.10e-02 0.095 0.0542 0.169 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 9.55e-01 0.00363 0.0639 0.169 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 6.27e-01 0.0368 0.0756 0.169 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 6.26e-01 0.042 0.086 0.169 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 7.73e-01 0.0194 0.0672 0.169 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00317 0.0598 0.169 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 6.31e-01 0.0319 0.0663 0.169 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 8.37e-01 0.0122 0.0593 0.169 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 2.54e-02 0.158 0.0702 0.169 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 9.90e-01 0.00145 0.111 0.169 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 6.04e-01 0.0386 0.0741 0.169 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 8.44e-01 0.0129 0.0653 0.169 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 1.47e-01 0.0919 0.0631 0.169 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0767 0.0742 0.169 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 4.28e-01 0.0742 0.0933 0.169 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 1.58e-01 0.14 0.0991 0.169 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0345 0.118 0.169 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0816 0.0922 0.169 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0141 0.0659 0.169 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -798153 sc-eQTL 3.15e-01 0.109 0.108 0.169 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -894814 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0463 0.072 0.169 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 3.05e-01 0.107 0.104 0.169 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 4.64e-01 0.0568 0.0775 0.169 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 9.71e-01 0.0035 0.0961 0.169 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 4.73e-02 -0.122 0.0611 0.169 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 3.22e-01 0.0561 0.0566 0.169 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -297346 sc-eQTL 5.45e-01 0.0661 0.109 0.169 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -798153 sc-eQTL 1.17e-01 0.183 0.116 0.169 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -894814 sc-eQTL 8.03e-01 0.0257 0.103 0.169 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 1.57e-01 0.127 0.0896 0.169 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 1.84e-01 0.144 0.108 0.167 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0239 0.0741 0.167 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0507 0.0776 0.167 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 5.10e-02 0.174 0.0886 0.167 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 5.50e-01 0.0602 0.1 0.167 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 1.59e-02 0.222 0.0915 0.167 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 9.33e-01 0.00683 0.0815 0.169 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0375 0.0871 0.169 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 3.15e-01 0.0787 0.0781 0.169 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 4.64e-01 0.0471 0.0641 0.169 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 7.88e-01 0.0283 0.105 0.169 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 1.84e-01 0.145 0.109 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0783 0.127 0.171 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0129 0.129 0.171 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 2.41e-01 0.14 0.119 0.171 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -112173 sc-eQTL 9.23e-01 0.0101 0.104 0.171 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00288 0.0728 0.171 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 1.59e-01 -0.165 0.117 0.171 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0163 0.104 0.171 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0171 0.121 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 4.06e-02 0.207 0.1 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 6.87e-02 -0.173 0.0948 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -112173 sc-eQTL 2.86e-02 -0.217 0.0983 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 3.06e-01 0.0625 0.0609 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 5.03e-01 0.0575 0.0855 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 8.04e-01 0.0239 0.0958 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0769 0.118 0.168 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 3.12e-01 0.11 0.109 0.168 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 2.91e-01 0.1 0.0948 0.168 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -112173 sc-eQTL 3.40e-01 0.0868 0.0908 0.168 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 1.38e-01 0.119 0.0802 0.168 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0835 0.0921 0.168 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 6.18e-02 -0.201 0.107 0.168 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0328 0.107 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 6.40e-01 0.0434 0.0925 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 3.33e-01 0.079 0.0815 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -112173 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0449 0.0828 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 1.18e-01 0.0863 0.055 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0226 0.0727 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 5.22e-01 0.0576 0.0897 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0598 0.114 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00169 0.0942 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 9.66e-01 0.00392 0.0922 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -112173 sc-eQTL 2.24e-01 -0.108 0.0882 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 2.07e-02 0.138 0.0593 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 2.66e-01 0.0973 0.0873 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 3.37e-01 0.0907 0.0943 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0403 0.115 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 2.30e-01 0.136 0.113 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 6.61e-02 0.204 0.11 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 5.11e-01 0.0652 0.099 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 7.65e-01 0.0324 0.108 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 6.16e-01 0.048 0.0956 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 6.28e-01 0.0433 0.0892 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 8.06e-01 0.0194 0.0791 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0336 0.0631 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 5.76e-01 0.0379 0.0676 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 7.70e-01 0.0201 0.0686 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 5.89e-02 0.149 0.0782 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 4.02e-01 0.0948 0.113 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0527 0.0912 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 3.10e-01 0.082 0.0806 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 7.30e-01 0.0232 0.067 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00133 0.085 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 4.96e-01 0.0645 0.0946 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 8.51e-01 0.021 0.112 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 3.39e-01 0.102 0.106 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0393 0.0885 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 4.10e-02 0.182 0.0887 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 1.64e-01 0.146 0.104 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 7.79e-01 -0.029 0.103 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 7.81e-01 0.0336 0.121 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 3.91e-01 0.0798 0.0927 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 8.54e-01 0.0166 0.0902 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 1.99e-01 0.128 0.0995 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 7.39e-01 -0.035 0.105 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 7.69e-01 0.029 0.0987 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 5.42e-01 -0.068 0.111 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0709 0.0958 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00683 0.0772 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 2.93e-01 0.0778 0.0738 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00902 0.0924 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 6.28e-01 0.0488 0.101 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 3.70e-01 0.111 0.124 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 3.54e-01 -0.105 0.113 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 9.37e-02 0.179 0.106 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 3.04e-01 0.115 0.112 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0181 0.104 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 9.41e-02 -0.175 0.104 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 1.25e-01 -0.185 0.12 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 4.64e-02 0.23 0.115 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 2.18e-01 0.146 0.118 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 5.38e-01 0.0686 0.111 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 5.92e-01 0.0619 0.115 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0608 0.104 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 3.23e-01 0.117 0.118 0.169 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 3.55e-01 0.0973 0.105 0.169 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 7.87e-01 0.0273 0.101 0.169 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 5.58e-01 0.0557 0.0951 0.169 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0589 0.106 0.169 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 9.39e-01 0.00833 0.109 0.169 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 3.12e-01 0.121 0.119 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0779 0.101 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 7.56e-01 -0.033 0.106 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 4.71e-01 0.0753 0.104 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 7.77e-02 -0.185 0.104 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 6.92e-01 0.041 0.103 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 7.95e-02 0.199 0.113 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 8.59e-01 0.015 0.0843 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0581 0.0864 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 1.23e-01 0.142 0.0917 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 4.91e-01 0.0795 0.115 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 1.52e-01 0.136 0.0948 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 6.90e-01 -0.048 0.12 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00664 0.107 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 4.12e-01 0.0857 0.104 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 8.04e-02 0.174 0.0989 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 5.10e-01 0.0699 0.106 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 2.45e-02 0.229 0.101 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 6.89e-01 0.0448 0.112 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 1.38e-01 -0.129 0.0868 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0335 0.0943 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 1.89e-01 0.136 0.103 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 6.65e-01 0.0477 0.11 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 3.98e-01 0.0867 0.102 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 1.42e-02 0.346 0.139 0.159 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 8.65e-01 0.0283 0.166 0.159 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 8.80e-01 0.0218 0.144 0.159 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -112173 sc-eQTL 3.21e-01 -0.133 0.134 0.159 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 1.24e-01 -0.147 0.0948 0.159 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 7.13e-01 0.0484 0.131 0.159 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000153 0.14 0.159 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 1.27e-01 0.135 0.0885 0.17 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 5.30e-01 0.071 0.113 0.17 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 5.40e-01 0.0646 0.105 0.17 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 9.72e-01 0.00265 0.0756 0.17 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 6.40e-01 0.0495 0.106 0.17 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 4.01e-01 0.0816 0.097 0.17 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0835 0.115 0.169 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 6.94e-01 0.0438 0.111 0.169 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 2.38e-01 -0.105 0.0888 0.169 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 3.21e-02 0.218 0.101 0.169 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 8.37e-01 0.0215 0.104 0.169 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 3.92e-01 0.0889 0.104 0.169 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 3.33e-01 0.112 0.116 0.171 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0747 0.125 0.171 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0117 0.108 0.171 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 5.03e-01 0.0507 0.0755 0.171 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -798153 sc-eQTL 8.16e-01 0.0225 0.097 0.171 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -894814 sc-eQTL 6.16e-01 0.0478 0.0953 0.171 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 2.27e-01 -0.124 0.102 0.171 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 3.45e-01 0.088 0.093 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0515 0.104 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 1.23e-01 -0.108 0.07 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 2.55e-01 0.0702 0.0616 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -297346 sc-eQTL 9.83e-01 0.00242 0.116 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -798153 sc-eQTL 1.38e-01 0.175 0.117 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -894814 sc-eQTL 8.69e-01 0.0172 0.104 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 1.70e-01 0.133 0.0967 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 1.76e-01 0.132 0.0971 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 3.10e-01 0.117 0.115 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 2.25e-01 -0.101 0.083 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 2.92e-01 0.0674 0.0638 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -297346 sc-eQTL 6.38e-01 0.052 0.111 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -798153 sc-eQTL 4.93e-02 0.229 0.116 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -894814 sc-eQTL 8.50e-01 -0.018 0.0951 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 7.54e-01 0.0299 0.0955 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 1.01e-01 -0.242 0.147 0.158 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 8.08e-01 0.031 0.127 0.158 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 2.56e-01 0.149 0.131 0.158 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 8.62e-01 0.0249 0.143 0.158 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0312 0.132 0.158 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 5.14e-01 0.0832 0.127 0.158 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 7.84e-01 0.0298 0.109 0.171 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0133 0.117 0.171 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 4.56e-02 -0.197 0.098 0.171 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 5.37e-01 0.048 0.0776 0.171 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -297346 sc-eQTL 6.33e-01 0.0508 0.106 0.171 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -798153 sc-eQTL 5.31e-01 0.0697 0.111 0.171 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -894814 sc-eQTL 4.74e-01 0.0756 0.105 0.171 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 1.16e-01 0.165 0.105 0.171 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 2.47e-01 -0.118 0.102 0.172 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00192 0.109 0.172 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0138 0.0888 0.172 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0111 0.0806 0.172 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -297346 sc-eQTL 8.08e-03 0.238 0.0888 0.172 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -798153 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000361 0.0986 0.172 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -894814 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0529 0.0985 0.172 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 4.10e-02 0.208 0.101 0.172 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 4.21e-01 0.0953 0.118 0.169 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 3.76e-01 -0.115 0.13 0.169 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 1.08e-01 -0.173 0.107 0.169 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0679 0.1 0.169 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -798153 sc-eQTL 9.89e-01 0.00172 0.121 0.169 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -894814 sc-eQTL 2.11e-01 -0.118 0.0938 0.169 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 8.87e-02 0.188 0.11 0.169 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0603 0.115 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 8.96e-02 0.162 0.0952 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0469 0.0849 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -112173 sc-eQTL 1.88e-01 -0.127 0.0965 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 2.01e-01 0.0777 0.0606 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0153 0.0805 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000848 0.0877 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0803 0.105 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 6.89e-01 0.0332 0.0828 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 5.26e-01 0.0497 0.0783 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -112173 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0377 0.0754 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 1.15e-01 0.0836 0.0528 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 7.85e-01 0.0188 0.0686 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 6.07e-01 0.042 0.0814 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 2.36e-01 0.105 0.0881 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 5.28e-01 0.0632 0.1 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 1.06e-01 -0.103 0.0635 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 3.15e-01 0.0564 0.056 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -297346 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00478 0.115 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -798153 sc-eQTL 9.99e-02 0.193 0.117 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -894814 sc-eQTL 8.13e-01 0.0228 0.0966 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 2.27e-01 0.109 0.0901 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0734 0.0981 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 2.29e-01 -0.129 0.107 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 1.39e-01 -0.13 0.0876 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 5.85e-01 0.0385 0.0704 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -297346 sc-eQTL 2.79e-01 0.111 0.103 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -798153 sc-eQTL 5.90e-01 0.0575 0.107 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -894814 sc-eQTL 8.63e-01 0.0174 0.101 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 4.93e-02 0.199 0.1 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -685376 sc-eQTL 1.40e-01 0.16 0.108 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -685570 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0247 0.0741 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -454579 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0334 0.0812 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -146362 sc-eQTL 7.50e-02 0.161 0.0901 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -107092 sc-eQTL 4.01e-01 0.088 0.105 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -120281 sc-eQTL 1.16e-02 0.227 0.089 0.168 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -454579 eQTL 0.0179 0.0449 0.0189 0.0 0.0 0.168

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina