logo

Genes within 1Mb (chr1:30609997:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0628 0.108 0.139 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 8.00e-02 0.151 0.0861 0.139 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 8.00e-01 0.0185 0.0727 0.139 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -113588 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0175 0.0765 0.139 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 7.54e-02 0.106 0.0594 0.139 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00503 0.0702 0.139 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 6.42e-01 0.0387 0.083 0.139 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00994 0.0948 0.139 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 9.51e-01 0.00455 0.0741 0.139 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 5.08e-01 0.0437 0.0659 0.139 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000218 0.0731 0.139 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 6.70e-01 0.0279 0.0654 0.139 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 2.88e-02 0.17 0.0774 0.139 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0425 0.123 0.139 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00787 0.0819 0.139 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 3.38e-01 0.0691 0.072 0.139 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 4.11e-01 0.0576 0.0699 0.139 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 7.82e-02 -0.144 0.0815 0.139 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 3.51e-01 0.0963 0.103 0.139 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 7.94e-01 0.0289 0.11 0.137 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 1.89e-01 -0.171 0.13 0.137 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0775 0.102 0.137 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 9.26e-01 0.00678 0.0731 0.137 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -799568 sc-eQTL 3.94e-01 0.103 0.12 0.137 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -896229 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0889 0.0796 0.137 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 3.70e-01 0.104 0.115 0.137 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 7.78e-01 0.024 0.0851 0.139 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0346 0.105 0.139 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 2.66e-02 -0.149 0.0669 0.139 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 2.63e-01 0.0696 0.062 0.139 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -298761 sc-eQTL 8.09e-01 0.029 0.12 0.139 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -799568 sc-eQTL 1.60e-01 0.18 0.128 0.139 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -896229 sc-eQTL 4.90e-01 0.0781 0.113 0.139 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 1.97e-01 0.127 0.0984 0.139 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 4.14e-01 0.0966 0.118 0.137 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 8.38e-01 0.0166 0.0808 0.137 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0199 0.0848 0.137 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 1.07e-03 0.316 0.0951 0.137 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 7.34e-01 0.0373 0.11 0.137 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 5.06e-03 0.282 0.0994 0.137 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 3.99e-01 0.075 0.0889 0.139 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 8.74e-01 0.0151 0.0951 0.139 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 9.91e-02 0.141 0.085 0.139 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0154 0.0701 0.139 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 8.08e-01 0.028 0.115 0.139 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 4.68e-01 0.0868 0.119 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 2.25e-01 -0.171 0.14 0.138 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 2.92e-01 -0.15 0.142 0.138 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 4.26e-01 0.105 0.132 0.138 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -113588 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0352 0.116 0.138 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 8.33e-01 0.017 0.0806 0.138 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0799 0.13 0.138 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0151 0.115 0.138 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 8.74e-01 0.0212 0.133 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 4.46e-02 0.223 0.11 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 5.93e-02 -0.197 0.104 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -113588 sc-eQTL 1.18e-02 -0.273 0.108 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 2.91e-01 0.0708 0.0668 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 5.74e-01 0.0529 0.094 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 9.09e-01 0.012 0.105 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0327 0.13 0.138 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 2.82e-01 0.129 0.119 0.138 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 2.15e-01 0.129 0.104 0.138 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -113588 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00294 0.0996 0.138 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 7.15e-02 0.159 0.0876 0.138 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 2.74e-02 -0.222 0.0999 0.138 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 2.91e-01 -0.125 0.118 0.138 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0471 0.118 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 4.41e-01 0.0788 0.102 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 3.71e-01 0.0805 0.0899 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -113588 sc-eQTL 9.65e-01 0.00399 0.0914 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 1.52e-01 0.0874 0.0607 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0484 0.0801 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 4.12e-01 0.0812 0.0989 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 2.37e-01 -0.147 0.124 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 7.14e-01 0.0377 0.103 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00135 0.101 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -113588 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0668 0.0966 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 3.19e-02 0.14 0.065 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 8.87e-02 0.162 0.095 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 1.57e-01 0.146 0.103 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 4.04e-01 -0.106 0.127 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 6.65e-01 0.054 0.125 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 8.67e-02 0.209 0.121 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 3.07e-01 0.111 0.109 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 5.71e-01 0.0676 0.119 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 2.16e-01 0.13 0.105 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 7.82e-01 0.0273 0.0984 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 7.64e-01 0.0263 0.0872 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00939 0.0697 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 9.19e-01 0.00756 0.0747 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 6.56e-01 0.0337 0.0757 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 1.94e-01 0.113 0.0867 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 8.05e-01 0.0307 0.124 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0503 0.0999 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 1.58e-01 0.125 0.088 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 9.23e-01 0.00713 0.0734 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00951 0.0931 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 2.24e-01 0.126 0.103 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 7.95e-01 0.0318 0.122 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 5.61e-01 0.0678 0.116 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0378 0.0971 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 4.05e-02 0.2 0.0972 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 9.12e-02 0.194 0.114 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0291 0.113 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0655 0.132 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 5.99e-01 0.0534 0.101 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 6.72e-01 0.0417 0.0985 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 2.08e-01 0.137 0.109 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0717 0.115 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 4.48e-01 0.0819 0.108 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0481 0.122 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 3.25e-01 -0.104 0.105 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 4.54e-01 0.0636 0.0848 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 5.98e-01 0.0429 0.0813 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0412 0.102 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 6.47e-01 0.0508 0.111 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 4.41e-01 0.104 0.135 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 3.98e-01 -0.105 0.124 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 3.50e-02 0.245 0.115 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 3.91e-01 0.105 0.122 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0361 0.113 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 3.73e-02 -0.237 0.113 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 3.23e-01 -0.127 0.128 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 7.46e-02 0.219 0.122 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 9.03e-02 0.213 0.125 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 6.56e-01 0.0527 0.118 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 5.17e-01 0.0795 0.123 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 9.07e-01 -0.013 0.111 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 4.06e-01 0.108 0.129 0.139 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 1.78e-01 0.155 0.114 0.139 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 5.99e-01 0.0579 0.11 0.139 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 6.59e-01 0.0459 0.104 0.139 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0649 0.116 0.139 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0257 0.119 0.139 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 1.91e-01 0.171 0.13 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0521 0.11 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0524 0.116 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 1.53e-01 0.163 0.114 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 5.36e-02 -0.221 0.114 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 5.30e-01 0.0711 0.113 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 2.32e-01 0.149 0.125 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 6.82e-01 0.038 0.0924 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0188 0.0949 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 5.90e-03 0.276 0.0994 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 7.79e-01 0.0356 0.127 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 1.19e-01 0.163 0.104 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 7.01e-01 -0.05 0.13 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0202 0.116 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 2.56e-01 0.128 0.113 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 3.06e-02 0.232 0.107 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 9.34e-01 0.00957 0.115 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 1.49e-02 0.268 0.109 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0128 0.122 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0617 0.0949 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0672 0.103 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 1.67e-02 0.269 0.111 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 2.16e-01 0.148 0.119 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 3.17e-01 0.111 0.111 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 1.55e-01 0.22 0.154 0.133 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0545 0.18 0.133 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0165 0.156 0.133 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -113588 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0885 0.145 0.133 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 3.02e-01 -0.107 0.104 0.133 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 6.00e-01 0.0748 0.142 0.133 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0408 0.152 0.133 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 1.10e-01 0.154 0.0958 0.139 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 3.85e-01 0.106 0.122 0.139 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 1.81e-01 0.152 0.114 0.139 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0827 0.0817 0.139 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 9.59e-01 0.00586 0.114 0.139 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 7.05e-01 0.0399 0.105 0.139 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 1.04e-01 -0.205 0.126 0.139 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0461 0.122 0.139 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0355 0.098 0.139 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 5.05e-02 0.219 0.111 0.139 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 8.77e-01 0.0178 0.114 0.139 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 4.85e-01 0.0798 0.114 0.139 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 9.96e-01 0.000586 0.129 0.139 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 1.92e-01 -0.182 0.139 0.139 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 5.40e-01 0.0735 0.12 0.139 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 5.55e-01 0.0496 0.084 0.139 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -799568 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0325 0.108 0.139 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -896229 sc-eQTL 5.25e-01 0.0674 0.106 0.139 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 8.01e-02 -0.199 0.113 0.139 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 1.92e-01 0.133 0.102 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0871 0.114 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 1.68e-01 -0.106 0.0768 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 2.64e-01 0.0756 0.0675 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -298761 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0165 0.127 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -799568 sc-eQTL 1.43e-01 0.189 0.128 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -896229 sc-eQTL 5.52e-01 0.0679 0.114 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 9.73e-02 0.176 0.106 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 4.07e-01 0.0877 0.106 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 5.65e-01 0.0721 0.125 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 1.07e-01 -0.145 0.0898 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 2.51e-01 0.0798 0.0693 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -298761 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0723 0.12 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -799568 sc-eQTL 1.24e-01 0.195 0.126 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -896229 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00605 0.103 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00613 0.104 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 8.37e-02 -0.284 0.163 0.124 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 7.09e-01 0.0529 0.141 0.124 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 2.13e-01 0.181 0.145 0.124 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 7.01e-01 -0.061 0.158 0.124 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0809 0.146 0.124 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 6.71e-01 0.0602 0.142 0.124 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0346 0.119 0.142 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 9.89e-01 0.00174 0.128 0.142 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 2.49e-01 -0.125 0.108 0.142 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 4.67e-01 0.062 0.0851 0.142 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -298761 sc-eQTL 7.06e-01 0.0441 0.117 0.142 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -799568 sc-eQTL 4.14e-01 0.0999 0.122 0.142 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -896229 sc-eQTL 3.77e-01 0.102 0.116 0.142 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 1.89e-01 0.152 0.115 0.142 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 2.00e-01 -0.143 0.111 0.143 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0436 0.119 0.143 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 9.05e-01 0.0117 0.0971 0.143 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 9.75e-01 0.00272 0.0882 0.143 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -298761 sc-eQTL 5.38e-02 0.19 0.098 0.143 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -799568 sc-eQTL 9.60e-01 0.00545 0.108 0.143 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -896229 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0236 0.108 0.143 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 3.69e-02 0.232 0.111 0.143 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 6.86e-01 0.052 0.128 0.144 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 2.69e-01 -0.156 0.14 0.144 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 8.06e-02 -0.204 0.116 0.144 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0518 0.109 0.144 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -799568 sc-eQTL 6.48e-01 0.0603 0.132 0.144 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -896229 sc-eQTL 1.78e-01 -0.138 0.102 0.144 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 3.08e-02 0.259 0.119 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 7.81e-01 -0.035 0.126 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 1.40e-01 0.155 0.104 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0634 0.0928 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -113588 sc-eQTL 4.76e-02 -0.209 0.105 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 1.64e-01 0.0926 0.0663 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0426 0.088 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 9.66e-01 0.00404 0.096 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 3.53e-01 -0.107 0.115 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 4.85e-01 0.0639 0.0913 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 6.17e-01 0.0433 0.0864 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -113588 sc-eQTL 7.82e-01 0.0231 0.0832 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 1.35e-01 0.0875 0.0583 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 6.95e-01 0.0297 0.0756 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 5.04e-01 0.0601 0.0898 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 3.16e-01 0.0973 0.0968 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 8.28e-01 0.0239 0.11 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 4.52e-02 -0.14 0.0695 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 2.02e-01 0.0786 0.0614 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -298761 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0714 0.126 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -799568 sc-eQTL 1.54e-01 0.184 0.129 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -896229 sc-eQTL 4.99e-01 0.0718 0.106 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 1.54e-01 0.141 0.0988 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 2.71e-01 -0.118 0.107 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 2.29e-01 -0.142 0.117 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0919 0.0963 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 5.72e-01 0.0436 0.0771 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -298761 sc-eQTL 5.36e-01 0.0698 0.113 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -799568 sc-eQTL 5.74e-01 0.0659 0.117 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -896229 sc-eQTL 7.75e-01 0.0317 0.111 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 1.04e-01 0.18 0.11 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -686791 sc-eQTL 4.16e-01 0.0967 0.119 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -686985 sc-eQTL 8.93e-01 0.011 0.0812 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -455994 sc-eQTL 9.85e-01 0.00166 0.0889 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -147777 sc-eQTL 2.32e-03 0.3 0.0972 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -108507 sc-eQTL 4.72e-01 0.0825 0.114 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -121696 sc-eQTL 3.02e-03 0.291 0.0969 0.138 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -455994 eQTL 0.00764 0.0555 0.0208 0.0 0.0 0.135

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina