Genes within 1Mb (chr1:30595326:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0493 0.106 0.154 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 5.89e-02 0.16 0.084 0.154 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 3.76e-01 0.0629 0.071 0.154 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -128259 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0411 0.0747 0.154 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 4.50e-01 0.0442 0.0585 0.154 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0579 0.0685 0.154 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000139 0.0812 0.154 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 2.60e-01 0.103 0.0914 0.154 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0264 0.0716 0.154 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 4.87e-01 0.0443 0.0637 0.154 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0544 0.0705 0.154 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0374 0.0631 0.154 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 1.47e-01 0.11 0.0753 0.154 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 6.03e-01 0.0623 0.12 0.154 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 6.17e-01 0.0398 0.0796 0.154 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0192 0.0701 0.154 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00783 0.0681 0.154 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 1.50e-01 -0.115 0.0794 0.154 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 5.70e-01 0.0569 0.1 0.154 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 5.90e-01 0.0572 0.106 0.155 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0833 0.125 0.155 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 6.72e-01 0.0418 0.0984 0.155 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 8.01e-01 0.0178 0.0703 0.155 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -814239 sc-eQTL 6.28e-01 0.0562 0.116 0.155 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -910900 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0648 0.0766 0.155 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 6.06e-01 0.0573 0.111 0.155 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0047 0.0822 0.154 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0707 0.102 0.154 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0847 0.0651 0.154 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 5.72e-01 0.0339 0.06 0.154 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -313432 sc-eQTL 8.90e-01 0.0159 0.115 0.154 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -814239 sc-eQTL 6.12e-01 0.0628 0.124 0.154 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -910900 sc-eQTL 3.65e-01 0.0989 0.109 0.154 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 5.91e-01 0.0513 0.0953 0.154 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 2.92e-01 0.12 0.114 0.152 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 5.37e-01 0.0483 0.0781 0.152 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 8.93e-01 0.0111 0.082 0.152 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 2.13e-01 0.117 0.094 0.152 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 6.65e-01 0.046 0.106 0.152 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 2.19e-02 0.223 0.0967 0.152 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0494 0.0873 0.154 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 3.00e-01 0.0968 0.0931 0.154 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 3.04e-01 0.0862 0.0838 0.154 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0309 0.0688 0.154 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0598 0.113 0.154 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 5.02e-01 0.0789 0.117 0.154 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0447 0.141 0.151 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 4.17e-01 -0.116 0.142 0.151 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 2.22e-01 0.162 0.132 0.151 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -128259 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0198 0.116 0.151 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0356 0.0806 0.151 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 3.49e-01 -0.122 0.13 0.151 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 3.37e-01 -0.111 0.115 0.151 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 8.81e-01 0.0194 0.13 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 1.19e-01 0.168 0.108 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 1.40e-01 -0.151 0.102 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -128259 sc-eQTL 2.20e-02 -0.242 0.105 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 6.42e-01 0.0304 0.0652 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0113 0.0916 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0517 0.102 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0723 0.126 0.153 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 1.95e-01 0.15 0.116 0.153 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 5.73e-02 0.192 0.1 0.153 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -128259 sc-eQTL 9.87e-01 0.0016 0.0967 0.153 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 1.45e-01 0.125 0.0853 0.153 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 1.36e-02 -0.241 0.0967 0.153 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 3.61e-01 -0.105 0.115 0.153 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0614 0.114 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 1.03e-01 0.161 0.0983 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 5.56e-01 0.0515 0.0872 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -128259 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0326 0.0885 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 8.51e-01 0.0111 0.0591 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0455 0.0776 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 6.76e-01 0.0401 0.0959 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 2.78e-01 -0.132 0.121 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 8.41e-01 0.0201 0.1 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 8.15e-01 0.023 0.0982 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -128259 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0783 0.0941 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 5.11e-01 0.0421 0.064 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 2.17e-01 0.115 0.0929 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 1.54e-01 0.144 0.1 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0572 0.12 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 2.96e-01 0.124 0.118 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 1.38e-01 0.171 0.115 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 8.45e-01 0.0202 0.103 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0164 0.113 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 2.96e-01 0.104 0.0994 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 2.89e-01 0.101 0.095 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 9.98e-01 0.000193 0.0845 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 8.68e-01 0.0113 0.0674 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0524 0.0722 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0541 0.0732 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 2.33e-01 0.1 0.0839 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 4.87e-01 0.0838 0.12 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0816 0.097 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 3.61e-01 0.0786 0.0859 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00213 0.0714 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0273 0.0905 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 3.92e-01 0.0864 0.101 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 3.57e-01 0.11 0.119 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 7.83e-01 0.0312 0.113 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0637 0.0943 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 4.13e-01 0.0782 0.0953 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 2.33e-01 0.133 0.111 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 9.39e-01 0.00847 0.11 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 4.85e-01 0.0897 0.128 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 6.07e-01 0.0508 0.0985 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0559 0.0956 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0289 0.106 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00678 0.111 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 7.17e-01 0.0381 0.105 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 7.32e-01 0.0407 0.118 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 8.68e-01 -0.017 0.102 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0293 0.0822 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 9.15e-01 0.00843 0.0788 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0339 0.0983 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 2.48e-01 0.124 0.107 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 3.16e-01 0.132 0.131 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0981 0.12 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 5.83e-01 0.0622 0.113 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 6.86e-01 0.0479 0.119 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0591 0.11 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 1.71e-01 -0.152 0.11 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0852 0.124 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 4.54e-03 0.334 0.116 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 9.60e-03 0.312 0.119 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 5.42e-01 0.0697 0.114 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 4.63e-01 0.087 0.118 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0376 0.107 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0158 0.125 0.156 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 1.09e-01 0.178 0.11 0.156 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 5.87e-01 0.058 0.106 0.156 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0344 0.1 0.156 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 2.43e-01 -0.131 0.112 0.156 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 7.20e-01 0.0414 0.115 0.156 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 9.78e-02 0.21 0.126 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0961 0.107 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0697 0.113 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 1.39e-01 0.165 0.111 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 2.67e-01 -0.124 0.111 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 2.25e-01 0.134 0.11 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 6.23e-02 0.225 0.12 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 8.02e-01 0.0225 0.0893 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0251 0.0916 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 3.80e-01 0.0859 0.0976 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 6.74e-01 0.0515 0.122 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 2.51e-01 0.116 0.101 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0839 0.126 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 4.42e-01 0.087 0.113 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 1.75e-01 0.149 0.11 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 1.66e-01 0.145 0.105 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 3.65e-01 0.101 0.112 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 1.37e-02 0.265 0.106 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0128 0.118 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0194 0.0923 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 9.91e-01 0.00116 0.0999 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 2.82e-01 0.118 0.11 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 6.25e-01 0.057 0.116 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 3.45e-01 0.102 0.108 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 1.61e-01 0.225 0.159 0.141 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 8.22e-01 -0.042 0.186 0.141 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0443 0.162 0.141 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -128259 sc-eQTL 2.04e-01 -0.192 0.15 0.141 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 3.27e-01 -0.106 0.107 0.141 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 3.81e-01 0.129 0.147 0.141 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0233 0.157 0.141 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 2.30e-01 0.115 0.0957 0.154 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 3.54e-01 0.113 0.122 0.154 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 3.01e-01 0.118 0.113 0.154 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0751 0.0814 0.154 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 9.17e-01 0.0118 0.114 0.154 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 7.87e-01 0.0284 0.105 0.154 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 7.33e-02 -0.22 0.122 0.154 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0571 0.119 0.154 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 7.76e-01 0.0272 0.0955 0.154 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 1.31e-01 0.165 0.109 0.154 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 4.13e-01 0.0913 0.111 0.154 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 6.01e-01 0.0583 0.111 0.154 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 7.31e-01 0.0424 0.123 0.159 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 4.43e-01 -0.102 0.133 0.159 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 1.31e-01 0.173 0.114 0.159 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 6.80e-01 0.0332 0.0802 0.159 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -814239 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0809 0.103 0.159 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -910900 sc-eQTL 1.05e-01 0.164 0.101 0.159 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 2.12e-01 -0.136 0.109 0.159 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 2.25e-01 0.12 0.0984 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0698 0.11 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0495 0.0745 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 5.18e-01 0.0423 0.0653 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -313432 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0817 0.123 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -814239 sc-eQTL 5.56e-01 0.0734 0.125 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -910900 sc-eQTL 4.73e-01 0.0791 0.11 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 6.91e-01 0.0409 0.103 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 8.07e-01 0.0253 0.103 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0233 0.122 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0853 0.0879 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 7.68e-01 0.02 0.0677 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -313432 sc-eQTL 7.74e-01 0.0337 0.117 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -814239 sc-eQTL 5.24e-01 0.079 0.124 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -910900 sc-eQTL 3.60e-01 0.0921 0.1 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 5.91e-01 0.0543 0.101 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 1.72e-01 -0.209 0.152 0.142 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 7.12e-01 0.0486 0.131 0.142 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 4.51e-01 0.102 0.135 0.142 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 6.10e-01 0.0753 0.147 0.142 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0597 0.136 0.142 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 9.85e-01 0.00248 0.132 0.142 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0928 0.115 0.156 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0705 0.124 0.156 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0562 0.105 0.156 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0444 0.0824 0.156 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -313432 sc-eQTL 7.20e-01 0.0405 0.113 0.156 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -814239 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0946 0.118 0.156 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -910900 sc-eQTL 7.56e-01 0.0349 0.112 0.156 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0251 0.112 0.156 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 7.85e-02 -0.19 0.107 0.158 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0616 0.115 0.158 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0251 0.0943 0.158 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0201 0.0856 0.158 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -313432 sc-eQTL 1.95e-02 0.223 0.0947 0.158 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -814239 sc-eQTL 2.40e-01 -0.123 0.104 0.158 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -910900 sc-eQTL 7.46e-01 -0.034 0.105 0.158 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 7.03e-02 0.196 0.108 0.158 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 7.08e-01 0.0466 0.124 0.164 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0695 0.136 0.164 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 3.72e-01 -0.101 0.113 0.164 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0345 0.105 0.164 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -814239 sc-eQTL 5.94e-01 0.0679 0.127 0.164 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -910900 sc-eQTL 2.64e-01 -0.11 0.0985 0.164 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 8.51e-02 0.2 0.115 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0195 0.123 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 1.91e-01 0.134 0.102 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 9.29e-01 0.00814 0.0907 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -128259 sc-eQTL 4.96e-02 -0.202 0.102 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 4.71e-01 0.0469 0.0649 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 1.16e-01 -0.135 0.0854 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 4.55e-01 -0.07 0.0935 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 1.62e-01 -0.157 0.112 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 2.28e-01 0.107 0.0884 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 6.46e-01 0.0386 0.0839 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -128259 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0138 0.0808 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 9.41e-01 0.00421 0.0569 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 8.79e-01 0.0112 0.0735 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 6.56e-01 0.0389 0.0873 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 4.51e-01 0.0706 0.0935 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0196 0.106 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0807 0.0674 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 5.45e-01 0.036 0.0594 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -313432 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0768 0.121 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -814239 sc-eQTL 6.00e-01 0.0655 0.125 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -910900 sc-eQTL 2.31e-01 0.123 0.102 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 5.10e-01 0.0631 0.0957 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 7.19e-02 -0.187 0.103 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 1.58e-01 -0.161 0.113 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 4.67e-01 -0.068 0.0933 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00281 0.0747 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -313432 sc-eQTL 4.73e-01 0.0783 0.109 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -814239 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0873 0.113 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -910900 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00121 0.107 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 5.07e-01 0.0714 0.107 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -701462 sc-eQTL 3.81e-01 0.101 0.115 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -701656 sc-eQTL 5.71e-01 0.0445 0.0784 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -470665 sc-eQTL 7.91e-01 0.0228 0.086 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -162448 sc-eQTL 2.65e-01 0.107 0.0958 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -123178 sc-eQTL 6.02e-01 0.0578 0.111 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -136367 sc-eQTL 2.70e-02 0.211 0.0945 0.153 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -470665 eQTL 0.0415 0.0386 0.0189 0.0 0.0 0.159


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina