logo

Genes within 1Mb (chr1:30593708:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 1.86e-01 0.133 0.1 0.194 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 8.18e-01 0.0185 0.0805 0.194 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0976 0.0672 0.194 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -129877 sc-eQTL 9.58e-01 0.00372 0.071 0.194 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 7.30e-01 0.0192 0.0556 0.194 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0667 0.065 0.194 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0132 0.0771 0.194 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0124 0.0862 0.194 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 6.89e-01 0.027 0.0673 0.194 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 6.50e-01 0.0272 0.0599 0.194 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0997 0.0661 0.194 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 2.58e-02 0.132 0.0587 0.194 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0079 0.0712 0.194 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 6.90e-01 0.0449 0.112 0.194 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0202 0.0748 0.194 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 9.38e-01 0.00517 0.0659 0.194 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0654 0.0638 0.194 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 5.58e-01 0.044 0.0749 0.194 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 3.61e-01 0.086 0.0941 0.194 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 2.50e-01 -0.116 0.1 0.191 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 3.21e-01 0.118 0.119 0.191 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0214 0.0932 0.191 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0972 0.0662 0.191 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -815857 sc-eQTL 2.17e-02 -0.251 0.108 0.191 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -912518 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0571 0.0726 0.191 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0744 0.105 0.191 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0646 0.0771 0.194 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00742 0.0957 0.194 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0339 0.0613 0.194 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00709 0.0565 0.194 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -315050 sc-eQTL 2.14e-01 0.135 0.108 0.194 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -815857 sc-eQTL 8.20e-01 0.0266 0.116 0.194 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -912518 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0772 0.102 0.194 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 1.80e-01 0.12 0.0893 0.194 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 9.97e-01 0.000396 0.109 0.195 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0732 0.0742 0.195 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 9.82e-01 0.00174 0.078 0.195 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 2.39e-01 0.106 0.0895 0.195 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 3.99e-02 -0.206 0.0999 0.195 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00634 0.0932 0.195 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 1.53e-01 0.12 0.0833 0.194 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 9.53e-01 0.00527 0.0895 0.194 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0427 0.0804 0.194 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0559 0.0659 0.194 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 4.88e-01 0.0749 0.108 0.194 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 4.71e-01 0.0811 0.112 0.194 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 3.48e-01 -0.119 0.126 0.199 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 1.20e-01 -0.198 0.127 0.199 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 1.32e-01 0.178 0.118 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -129877 sc-eQTL 8.37e-01 0.0213 0.103 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 7.32e-01 0.0247 0.0721 0.199 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 6.93e-01 -0.046 0.116 0.199 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 4.90e-01 0.0713 0.103 0.199 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 2.63e-01 0.139 0.124 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 5.32e-01 0.0646 0.103 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0341 0.0974 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -129877 sc-eQTL 7.72e-02 0.179 0.101 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0155 0.0622 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 7.31e-01 -0.03 0.0873 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 3.33e-02 -0.207 0.0967 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 5.88e-02 0.227 0.119 0.194 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 4.36e-01 0.0864 0.111 0.194 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 1.08e-01 -0.155 0.0959 0.194 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -129877 sc-eQTL 5.10e-02 -0.179 0.0914 0.194 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 7.23e-01 -0.029 0.0818 0.194 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 6.08e-01 -0.048 0.0935 0.194 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 4.38e-01 0.085 0.109 0.194 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 9.74e-01 0.00354 0.109 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 7.26e-01 -0.033 0.0943 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0205 0.0832 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -129877 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0549 0.0843 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0378 0.0563 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 6.76e-01 -0.031 0.074 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 3.91e-01 0.0785 0.0913 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 7.04e-01 0.0446 0.117 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 7.99e-01 0.0247 0.0968 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 1.97e-01 -0.122 0.0944 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -129877 sc-eQTL 3.10e-01 0.0923 0.0907 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0877 0.0615 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 9.38e-02 -0.15 0.0893 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 8.33e-01 0.0205 0.0971 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0944 0.119 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0308 0.117 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 3.74e-01 -0.102 0.114 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0252 0.102 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0265 0.112 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0408 0.0985 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0181 0.0902 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 8.27e-01 0.0175 0.08 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 1.53e-01 0.0913 0.0636 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0902 0.0682 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 2.19e-02 0.158 0.0686 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0674 0.0797 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 4.70e-01 0.0815 0.113 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 4.99e-01 0.0615 0.0908 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0254 0.0804 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0439 0.0667 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 3.31e-01 0.0823 0.0845 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 7.23e-01 0.0335 0.0943 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 9.89e-01 0.00154 0.113 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 7.85e-02 -0.188 0.106 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0126 0.0893 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0587 0.0903 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 2.88e-01 0.112 0.105 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 9.55e-01 0.00592 0.104 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 9.03e-01 -0.015 0.124 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0243 0.0949 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 8.85e-01 0.0133 0.0921 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 8.41e-01 0.0205 0.102 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 5.21e-01 0.0689 0.107 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 2.89e-02 0.219 0.0998 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 8.32e-01 -0.024 0.113 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 4.31e-01 0.0767 0.0973 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0652 0.0783 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 1.70e-02 -0.178 0.0742 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 9.15e-01 0.01 0.0938 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0153 0.102 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0471 0.126 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 9.75e-01 0.00365 0.115 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 2.06e-01 0.137 0.108 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0933 0.113 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 2.40e-01 0.123 0.105 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0285 0.106 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 3.84e-01 0.106 0.122 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 8.42e-01 0.0234 0.117 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 1.25e-01 -0.183 0.119 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 5.32e-01 0.0704 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0524 0.117 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 6.36e-02 0.196 0.105 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 2.14e-01 0.152 0.122 0.193 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0117 0.109 0.193 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 9.53e-01 0.00611 0.104 0.193 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 2.12e-01 -0.123 0.0979 0.193 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00717 0.109 0.193 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 2.13e-01 0.14 0.112 0.193 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 1.13e-01 -0.196 0.123 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0541 0.105 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 6.16e-01 0.0553 0.11 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 5.94e-01 0.0579 0.109 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 1.40e-01 0.161 0.109 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 5.19e-01 0.0694 0.107 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 9.88e-01 0.0017 0.115 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0637 0.0846 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 2.80e-01 0.0938 0.0867 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 1.43e-01 0.136 0.0922 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 5.21e-02 -0.225 0.115 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0258 0.0958 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0504 0.127 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 1.01e-01 0.185 0.112 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0883 0.11 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 6.67e-01 0.0453 0.105 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 3.21e-01 -0.111 0.112 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 2.41e-01 0.127 0.108 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 9.68e-01 0.00445 0.112 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0267 0.0876 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0796 0.0946 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 1.21e-01 0.162 0.104 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0673 0.11 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 6.33e-01 0.0492 0.103 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 3.64e-01 0.116 0.128 0.2 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 1.91e-01 0.194 0.147 0.2 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 9.79e-01 0.00335 0.129 0.2 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -129877 sc-eQTL 6.44e-01 0.0557 0.12 0.2 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 9.44e-01 0.0061 0.086 0.2 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 3.33e-01 -0.114 0.117 0.2 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00335 0.125 0.2 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 3.35e-01 0.0858 0.0888 0.196 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0534 0.113 0.196 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 2.73e-01 0.115 0.105 0.196 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 5.41e-02 0.145 0.0749 0.196 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 4.69e-01 0.0766 0.105 0.196 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 5.70e-01 0.0552 0.0971 0.196 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 1.46e-01 0.171 0.117 0.194 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 2.15e-01 0.141 0.113 0.194 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 2.42e-01 -0.107 0.0908 0.194 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 1.33e-01 -0.157 0.104 0.194 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 5.82e-01 0.0586 0.106 0.194 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0219 0.106 0.194 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 2.51e-01 -0.139 0.12 0.19 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0343 0.131 0.19 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 8.86e-01 0.0162 0.112 0.19 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0576 0.0786 0.19 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -815857 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0929 0.101 0.19 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -912518 sc-eQTL 9.49e-01 0.00635 0.0993 0.19 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 7.97e-01 0.0276 0.107 0.19 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00745 0.0926 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0411 0.103 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0897 0.0697 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 7.90e-01 0.0164 0.0614 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -315050 sc-eQTL 9.25e-02 0.194 0.115 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -815857 sc-eQTL 9.21e-01 0.0116 0.117 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -912518 sc-eQTL 4.69e-01 0.0749 0.103 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 2.20e-01 0.118 0.0962 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0532 0.0977 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0402 0.115 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 2.59e-01 0.0943 0.0832 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 8.77e-01 0.00996 0.0642 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -315050 sc-eQTL 2.10e-01 -0.139 0.11 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -815857 sc-eQTL 7.19e-01 0.0423 0.117 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -912518 sc-eQTL 4.08e-02 -0.194 0.0944 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 1.22e-01 0.148 0.0952 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0556 0.156 0.176 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 4.91e-01 0.0922 0.134 0.176 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 3.14e-01 -0.139 0.138 0.176 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 8.94e-01 0.0201 0.15 0.176 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 5.33e-01 0.0863 0.138 0.176 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 4.26e-01 0.107 0.134 0.176 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 3.30e-01 -0.106 0.109 0.193 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 4.17e-02 0.238 0.116 0.193 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 1.54e-02 0.24 0.0982 0.193 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 7.65e-01 0.0234 0.0782 0.193 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -315050 sc-eQTL 5.18e-01 0.0693 0.107 0.193 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -815857 sc-eQTL 2.39e-01 0.132 0.112 0.193 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -912518 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0517 0.106 0.193 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0278 0.106 0.193 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 7.08e-02 -0.19 0.105 0.186 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0317 0.112 0.186 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 4.08e-01 0.076 0.0917 0.186 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 1.13e-01 -0.132 0.0829 0.186 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -315050 sc-eQTL 9.16e-01 0.00986 0.0935 0.186 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -815857 sc-eQTL 3.13e-01 0.103 0.102 0.186 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -912518 sc-eQTL 7.45e-02 -0.181 0.101 0.186 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 7.41e-01 0.0349 0.106 0.186 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 1.95e-01 -0.152 0.117 0.192 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0855 0.129 0.192 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 3.26e-02 -0.227 0.105 0.192 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00553 0.0995 0.192 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -815857 sc-eQTL 1.27e-01 -0.184 0.12 0.192 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -912518 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0338 0.0936 0.192 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 3.45e-02 0.232 0.109 0.192 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 5.89e-01 0.0638 0.118 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 6.11e-01 0.0499 0.098 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0898 0.0867 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -129877 sc-eQTL 1.95e-01 0.128 0.0987 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 7.10e-01 0.0232 0.0622 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0231 0.0823 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 1.96e-01 -0.116 0.0894 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 8.78e-01 0.0164 0.107 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00994 0.0846 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 9.73e-02 -0.132 0.0795 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -129877 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00725 0.0771 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0642 0.0541 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0394 0.07 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 5.85e-01 0.0455 0.0832 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0309 0.0883 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0624 0.1 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0471 0.0637 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 7.97e-01 0.0144 0.0561 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -315050 sc-eQTL 3.50e-01 0.107 0.114 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -815857 sc-eQTL 8.36e-01 0.0243 0.118 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -912518 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0428 0.0965 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 1.30e-01 0.137 0.0899 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 8.81e-02 -0.165 0.0961 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 1.14e-01 0.167 0.105 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 1.82e-01 0.116 0.0864 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0779 0.0692 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -315050 sc-eQTL 9.69e-02 0.168 0.101 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -815857 sc-eQTL 3.36e-01 0.101 0.105 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -912518 sc-eQTL 2.27e-01 -0.121 0.0994 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 9.57e-01 0.00544 0.0999 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -703080 sc-eQTL 6.56e-01 0.0486 0.109 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -703274 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0807 0.0742 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -472283 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00306 0.0816 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -164066 sc-eQTL 2.30e-01 0.109 0.0908 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -124796 sc-eQTL 1.93e-02 -0.245 0.104 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -137985 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00652 0.0907 0.194 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162510 MATN1 -129877 eQTL 0.0196 -0.0577 0.0247 0.0 0.0 0.195

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000060688 \N -703080 3.21e-07 1.56e-07 6.86e-08 2.22e-07 1.07e-07 8.89e-08 2.4e-07 5.84e-08 1.89e-07 1.05e-07 1.83e-07 1.48e-07 2.38e-07 8.07e-08 6.27e-08 9.35e-08 5.27e-08 2.04e-07 7.36e-08 6.03e-08 1.24e-07 1.81e-07 1.69e-07 4.17e-08 2.17e-07 1.56e-07 1.31e-07 1.26e-07 1.37e-07 1.29e-07 1.26e-07 3.9e-08 3.65e-08 9.5e-08 4.04e-08 3.11e-08 4.43e-08 8.57e-08 6.21e-08 6.07e-08 4.36e-08 1.6e-07 4.17e-08 1.2e-08 3.4e-08 1.01e-08 7.97e-08 1.98e-09 4.98e-08