logo

Genes within 1Mb (chr1:30591053:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0351 0.107 0.15 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 6.33e-02 0.158 0.0849 0.15 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 3.99e-01 0.0606 0.0717 0.15 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -132532 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00648 0.0755 0.15 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 3.20e-01 0.0588 0.059 0.15 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0381 0.0692 0.15 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 6.91e-01 0.0326 0.0819 0.15 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 2.13e-01 0.115 0.0921 0.15 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0284 0.0722 0.15 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 4.87e-01 0.0447 0.0642 0.15 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0387 0.0712 0.15 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0461 0.0636 0.15 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 1.79e-01 0.102 0.076 0.15 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 5.07e-01 0.0801 0.12 0.15 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 5.68e-01 0.0459 0.0802 0.15 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 8.54e-01 -0.013 0.0706 0.15 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 9.70e-01 0.00261 0.0686 0.15 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 1.28e-01 -0.122 0.0799 0.15 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 5.20e-01 0.065 0.101 0.15 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 5.79e-01 0.0593 0.107 0.153 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 3.82e-01 -0.111 0.126 0.153 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 9.35e-01 0.00809 0.0991 0.153 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 9.17e-01 0.00742 0.0707 0.153 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -818512 sc-eQTL 5.75e-01 0.0655 0.117 0.153 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -915173 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0651 0.0771 0.153 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 7.92e-01 0.0296 0.112 0.153 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0243 0.083 0.15 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0696 0.103 0.15 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0816 0.0657 0.15 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 3.99e-01 0.0512 0.0606 0.15 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -317705 sc-eQTL 8.60e-01 0.0206 0.117 0.15 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -818512 sc-eQTL 5.94e-01 0.0668 0.125 0.15 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -915173 sc-eQTL 4.29e-01 0.0872 0.11 0.15 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 5.10e-01 0.0635 0.0962 0.15 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 2.83e-01 0.123 0.114 0.15 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 5.62e-01 0.0455 0.0784 0.15 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 9.18e-01 0.00854 0.0823 0.15 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 3.13e-01 0.0956 0.0945 0.15 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 8.52e-01 0.0199 0.106 0.15 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 4.36e-02 0.198 0.0974 0.15 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0545 0.0881 0.15 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 2.84e-01 0.101 0.094 0.15 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 4.67e-01 0.0617 0.0847 0.15 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0237 0.0694 0.15 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0797 0.114 0.15 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 3.14e-01 0.119 0.118 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0163 0.143 0.145 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0942 0.144 0.145 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 2.20e-01 0.165 0.134 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -132532 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0142 0.117 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00346 0.0818 0.145 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 4.27e-01 -0.105 0.132 0.145 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 3.83e-01 -0.102 0.117 0.145 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 9.85e-01 0.00255 0.131 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 2.10e-01 0.137 0.109 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 2.37e-01 -0.122 0.103 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -132532 sc-eQTL 2.44e-02 -0.241 0.106 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 4.74e-01 0.0473 0.0659 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 9.02e-01 0.0114 0.0926 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0361 0.104 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 4.30e-01 -0.1 0.127 0.149 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 2.15e-01 0.145 0.117 0.149 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 3.97e-02 0.209 0.101 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -132532 sc-eQTL 7.96e-01 0.0253 0.0976 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 8.30e-02 0.15 0.0859 0.149 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 4.09e-02 -0.202 0.098 0.149 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0748 0.116 0.149 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0487 0.115 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 1.38e-01 0.147 0.099 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 7.20e-01 0.0314 0.0878 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -132532 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00452 0.0891 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 5.95e-01 0.0316 0.0595 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 7.49e-01 -0.025 0.0781 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 4.33e-01 0.0757 0.0964 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 2.93e-01 -0.129 0.122 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 7.64e-01 0.0303 0.101 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 9.75e-01 0.00312 0.0989 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -132532 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0613 0.0948 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 3.45e-01 0.0609 0.0643 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 1.70e-01 0.129 0.0934 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 8.66e-02 0.173 0.101 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0624 0.121 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 2.40e-01 0.14 0.119 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 9.83e-02 0.193 0.116 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 6.70e-01 0.0445 0.104 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0527 0.114 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 5.28e-01 0.0636 0.101 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 1.95e-01 0.124 0.0956 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 9.98e-01 0.000163 0.0851 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 8.66e-01 0.0115 0.0679 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0425 0.0727 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0601 0.0738 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 2.64e-01 0.0948 0.0846 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 5.07e-01 0.0809 0.122 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0859 0.098 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 3.86e-01 0.0753 0.0867 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 8.64e-01 0.0124 0.0721 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0545 0.0914 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 2.99e-01 0.106 0.102 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 3.50e-01 0.112 0.12 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00199 0.114 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0539 0.095 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 2.97e-01 0.1 0.096 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 2.91e-01 0.119 0.112 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 7.12e-01 0.041 0.111 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 4.33e-01 0.102 0.13 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 4.47e-01 0.0758 0.0994 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0447 0.0966 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0374 0.107 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0275 0.113 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 7.09e-01 0.0396 0.106 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 6.27e-01 0.0578 0.119 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00365 0.103 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0328 0.0825 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 7.94e-01 0.0207 0.0791 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0301 0.0988 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 2.92e-01 0.113 0.107 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 3.28e-01 0.13 0.132 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 3.90e-01 -0.105 0.121 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 4.85e-01 0.08 0.114 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 5.74e-01 0.0674 0.12 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0503 0.111 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 2.93e-01 -0.118 0.112 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0888 0.125 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 7.92e-03 0.317 0.118 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 6.82e-03 0.33 0.121 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 6.20e-01 0.0573 0.115 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 6.74e-01 0.0506 0.12 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0342 0.108 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0257 0.127 0.152 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 1.74e-01 0.152 0.112 0.152 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 6.87e-01 0.0434 0.108 0.152 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0259 0.102 0.152 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 2.04e-01 -0.143 0.113 0.152 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 6.69e-01 0.0499 0.116 0.152 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 1.37e-01 0.19 0.127 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0941 0.108 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0972 0.113 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 1.34e-01 0.167 0.111 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 3.14e-01 -0.113 0.112 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 3.55e-01 0.102 0.11 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 6.36e-02 0.224 0.12 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 8.47e-01 0.0173 0.0897 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0295 0.0921 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 5.73e-01 0.0554 0.0981 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 8.72e-01 0.0198 0.123 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 2.51e-01 0.117 0.101 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0959 0.127 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 4.53e-01 0.0853 0.113 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 1.71e-01 0.151 0.11 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 1.96e-01 0.136 0.105 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 5.27e-01 0.0711 0.112 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 2.08e-02 0.25 0.107 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 9.22e-01 0.0116 0.119 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0118 0.0928 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00595 0.1 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 3.36e-01 0.106 0.11 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 7.54e-01 0.0366 0.117 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 2.63e-01 0.122 0.109 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 2.00e-01 0.207 0.16 0.133 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0339 0.187 0.133 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 8.74e-01 -0.026 0.163 0.133 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -132532 sc-eQTL 2.39e-01 -0.178 0.151 0.133 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0417 0.108 0.133 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 4.95e-01 0.101 0.148 0.133 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0886 0.158 0.133 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 2.06e-01 0.122 0.0959 0.15 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 3.56e-01 0.113 0.122 0.15 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 4.03e-01 0.0954 0.114 0.15 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0582 0.0817 0.15 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 9.03e-01 -0.014 0.114 0.15 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 5.73e-01 0.0593 0.105 0.15 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 8.12e-02 -0.217 0.124 0.15 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0406 0.12 0.15 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 9.28e-01 0.00874 0.0964 0.15 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 1.10e-01 0.176 0.11 0.15 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 4.20e-01 0.0907 0.112 0.15 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 7.16e-01 0.0409 0.112 0.15 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 7.31e-01 0.0424 0.123 0.159 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 4.43e-01 -0.102 0.133 0.159 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 1.31e-01 0.173 0.114 0.159 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 6.80e-01 0.0332 0.0802 0.159 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -818512 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0809 0.103 0.159 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -915173 sc-eQTL 1.05e-01 0.164 0.101 0.159 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 2.12e-01 -0.136 0.109 0.159 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 3.92e-01 0.0852 0.0994 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0677 0.111 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0611 0.0751 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 4.10e-01 0.0543 0.0659 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -317705 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0951 0.124 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -818512 sc-eQTL 5.80e-01 0.0697 0.126 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -915173 sc-eQTL 5.83e-01 0.0611 0.111 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 6.81e-01 0.0428 0.104 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 8.29e-01 0.0225 0.104 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 9.17e-01 0.0129 0.123 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0717 0.0887 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 7.35e-01 0.0231 0.0683 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -317705 sc-eQTL 6.16e-01 0.0593 0.118 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -818512 sc-eQTL 4.98e-01 0.0847 0.125 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -915173 sc-eQTL 3.33e-01 0.0983 0.101 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 5.42e-01 0.0621 0.102 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 1.07e-01 -0.247 0.152 0.139 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 6.21e-01 0.0654 0.132 0.139 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 4.53e-01 0.102 0.136 0.139 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 5.67e-01 0.0849 0.148 0.139 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 4.41e-01 -0.105 0.136 0.139 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 9.15e-01 0.0142 0.132 0.139 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 2.76e-01 -0.127 0.116 0.153 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 7.01e-01 -0.048 0.125 0.153 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0592 0.106 0.153 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0343 0.0831 0.153 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -317705 sc-eQTL 6.05e-01 0.0589 0.114 0.153 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -818512 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0914 0.119 0.153 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -915173 sc-eQTL 7.32e-01 0.0387 0.113 0.153 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0379 0.113 0.153 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 6.15e-02 -0.203 0.108 0.156 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0611 0.116 0.156 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0175 0.0948 0.156 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00334 0.0861 0.156 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -317705 sc-eQTL 3.50e-02 0.203 0.0955 0.156 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -818512 sc-eQTL 2.27e-01 -0.127 0.105 0.156 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -915173 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0285 0.105 0.156 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 6.27e-02 0.203 0.108 0.156 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 7.08e-01 0.0466 0.124 0.164 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0695 0.136 0.164 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 3.72e-01 -0.101 0.113 0.164 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0345 0.105 0.164 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -818512 sc-eQTL 5.94e-01 0.0679 0.127 0.164 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -915173 sc-eQTL 2.64e-01 -0.11 0.0985 0.164 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 8.51e-02 0.2 0.115 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0449 0.124 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 2.74e-01 0.113 0.103 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 7.11e-01 0.0339 0.0915 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -132532 sc-eQTL 1.13e-01 -0.165 0.104 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 3.12e-01 0.0663 0.0654 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0998 0.0865 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0464 0.0945 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 2.38e-01 -0.134 0.113 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 2.11e-01 0.112 0.0891 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 8.49e-01 0.0161 0.0846 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -132532 sc-eQTL 8.39e-01 0.0166 0.0815 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 7.11e-01 0.0212 0.0573 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 6.37e-01 0.035 0.074 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 4.14e-01 0.0719 0.0879 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 6.26e-01 0.046 0.0944 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00747 0.107 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0846 0.068 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 4.54e-01 0.045 0.0599 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -317705 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0676 0.122 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -818512 sc-eQTL 6.05e-01 0.0651 0.126 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -915173 sc-eQTL 2.82e-01 0.111 0.103 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 4.81e-01 0.068 0.0965 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 4.19e-02 -0.213 0.104 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 1.95e-01 -0.149 0.114 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0629 0.094 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 8.22e-01 0.017 0.0752 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -317705 sc-eQTL 5.27e-01 0.0695 0.11 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -818512 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0865 0.114 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -915173 sc-eQTL 9.29e-01 0.00964 0.108 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 5.61e-01 0.063 0.108 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -705735 sc-eQTL 3.35e-01 0.111 0.115 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -705929 sc-eQTL 6.16e-01 0.0396 0.0787 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -474938 sc-eQTL 7.92e-01 0.0228 0.0863 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -166721 sc-eQTL 3.88e-01 0.0832 0.0963 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -127451 sc-eQTL 8.06e-01 0.0273 0.111 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -140640 sc-eQTL 3.85e-02 0.198 0.095 0.151 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -474938 eQTL 0.0296 0.0413 0.0189 0.0 0.0 0.157

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina