logo

Genes within 1Mb (chr1:30586149:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 1.40e-01 0.143 0.0963 0.218 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00481 0.0776 0.218 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0862 0.0648 0.218 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -137436 sc-eQTL 6.77e-01 0.0285 0.0684 0.218 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 3.52e-01 0.0499 0.0535 0.218 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 7.87e-01 -0.017 0.0628 0.218 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 6.58e-01 0.0329 0.0743 0.218 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0264 0.0823 0.218 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 1.96e-01 0.0831 0.0641 0.218 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 8.50e-01 0.0109 0.0573 0.218 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0587 0.0633 0.218 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 3.73e-02 0.118 0.0562 0.218 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0118 0.068 0.218 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 2.79e-01 0.116 0.107 0.218 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 6.09e-01 0.0366 0.0714 0.218 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 3.56e-01 0.0581 0.0628 0.218 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0112 0.0611 0.218 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 7.78e-01 0.0202 0.0716 0.218 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 2.26e-01 0.109 0.0897 0.218 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0625 0.0965 0.216 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 3.47e-01 0.108 0.114 0.216 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0966 0.0893 0.216 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0624 0.0638 0.216 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -823416 sc-eQTL 8.18e-02 -0.183 0.105 0.216 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -920077 sc-eQTL 1.33e-01 -0.105 0.0695 0.216 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 2.90e-01 -0.107 0.101 0.216 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0637 0.0746 0.218 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 7.92e-01 0.0245 0.0926 0.218 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0698 0.0592 0.218 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 8.59e-01 -0.00973 0.0546 0.218 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -322609 sc-eQTL 1.55e-01 0.149 0.104 0.218 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -823416 sc-eQTL 8.92e-01 0.0152 0.113 0.218 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -920077 sc-eQTL 3.92e-02 -0.204 0.0982 0.218 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 8.50e-02 0.149 0.0861 0.218 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00649 0.105 0.219 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0759 0.0718 0.219 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 7.64e-01 0.0227 0.0755 0.219 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 3.17e-02 0.186 0.086 0.219 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 1.67e-01 -0.135 0.0972 0.219 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 8.24e-01 0.0201 0.0902 0.219 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 6.32e-02 0.147 0.0787 0.218 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 9.72e-01 0.003 0.0849 0.218 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 9.69e-01 0.00294 0.0763 0.218 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0227 0.0625 0.218 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 8.11e-01 0.0246 0.102 0.218 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 6.48e-01 0.0488 0.107 0.218 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 1.11e-01 -0.195 0.122 0.224 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0847 0.124 0.224 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0702 0.115 0.224 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -137436 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0121 0.101 0.224 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 3.82e-01 0.0613 0.07 0.224 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0719 0.113 0.224 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 1.85e-01 0.133 0.0997 0.224 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 8.36e-01 0.0248 0.119 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 9.04e-01 0.012 0.0995 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0586 0.0938 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -137436 sc-eQTL 1.45e-01 0.142 0.0972 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 8.28e-01 0.013 0.06 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 7.35e-01 0.0285 0.0841 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 1.07e-01 -0.152 0.0936 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 3.17e-01 0.115 0.114 0.218 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 4.73e-01 0.0758 0.105 0.218 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 2.63e-01 -0.103 0.0916 0.218 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -137436 sc-eQTL 3.20e-02 -0.188 0.087 0.218 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0496 0.0779 0.218 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0591 0.0891 0.218 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 2.11e-01 0.131 0.104 0.218 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 5.80e-01 0.0577 0.104 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0219 0.0901 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 7.69e-01 0.0233 0.0794 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -137436 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00887 0.0806 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 9.95e-01 0.000336 0.0538 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00683 0.0707 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 1.34e-01 0.131 0.0869 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 7.63e-01 0.0344 0.114 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 4.69e-01 0.0681 0.0939 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 9.73e-02 -0.152 0.0914 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -137436 sc-eQTL 3.70e-01 0.0791 0.0881 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 3.77e-01 -0.053 0.0599 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 5.37e-01 -0.054 0.0872 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00359 0.0943 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0394 0.113 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0831 0.111 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 1.36e-01 -0.162 0.108 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 9.92e-01 0.000983 0.0971 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 9.60e-01 0.00537 0.106 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0479 0.0937 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 6.52e-01 -0.039 0.0862 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 8.87e-02 0.13 0.0759 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 1.47e-01 0.0884 0.0607 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0156 0.0654 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 3.25e-02 0.141 0.0656 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 5.55e-01 -0.045 0.0762 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 6.70e-01 0.0459 0.108 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 3.79e-01 0.0764 0.0867 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0595 0.0768 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0577 0.0637 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 3.84e-01 0.0704 0.0808 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 4.44e-01 0.069 0.09 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 8.37e-01 0.0223 0.109 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 2.40e-02 -0.233 0.102 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0539 0.0862 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 6.19e-01 0.0434 0.0872 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 2.77e-01 0.111 0.102 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0504 0.101 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 8.63e-01 0.0202 0.118 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0172 0.0901 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00325 0.0875 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 5.64e-01 0.0559 0.0968 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 2.48e-01 0.118 0.102 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 1.07e-01 0.154 0.0952 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 7.30e-01 0.0369 0.107 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 2.15e-01 0.114 0.092 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00616 0.0743 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 6.52e-02 -0.131 0.0706 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0386 0.0888 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 5.02e-01 0.065 0.0966 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 9.93e-01 0.00101 0.12 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 7.60e-01 0.0337 0.11 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 2.51e-02 0.231 0.102 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 2.67e-01 0.121 0.108 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 1.54e-01 0.143 0.1 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 6.36e-01 0.0481 0.102 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 5.77e-01 0.0639 0.114 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 7.27e-01 0.0384 0.11 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 3.33e-01 -0.109 0.112 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 6.25e-01 0.0516 0.105 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 2.63e-01 -0.123 0.109 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 1.95e-01 0.129 0.0987 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 1.99e-01 0.15 0.116 0.214 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 6.92e-01 0.041 0.103 0.214 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 5.83e-01 0.0544 0.099 0.214 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0661 0.0934 0.214 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0551 0.104 0.214 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 1.91e-01 0.14 0.107 0.214 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 1.41e-01 -0.175 0.118 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0374 0.1 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 8.15e-01 0.0247 0.106 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 3.08e-01 0.106 0.104 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 3.13e-01 0.106 0.104 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 8.26e-01 0.0227 0.103 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 9.50e-01 0.00691 0.11 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0765 0.0813 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 1.11e-01 0.133 0.0831 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 2.17e-02 0.203 0.088 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 7.61e-02 -0.198 0.111 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0346 0.0921 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 3.98e-01 -0.102 0.12 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 2.35e-01 0.128 0.107 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 8.84e-02 -0.178 0.104 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 2.87e-01 0.107 0.0998 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 1.18e-01 -0.166 0.106 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 3.54e-01 0.0954 0.103 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00556 0.108 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0525 0.0839 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 9.81e-01 0.00214 0.0908 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 1.30e-02 0.247 0.0985 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 6.70e-01 0.0453 0.106 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 1.46e-01 0.143 0.0981 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 4.20e-01 0.104 0.129 0.204 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 4.62e-02 0.296 0.147 0.204 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0319 0.13 0.204 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -137436 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0302 0.121 0.204 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0535 0.0865 0.204 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 2.17e-01 -0.146 0.118 0.204 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0118 0.126 0.204 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 6.31e-01 0.0408 0.0848 0.22 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0977 0.108 0.22 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 1.68e-01 0.139 0.1 0.22 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 2.11e-01 0.0901 0.0718 0.22 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 8.71e-01 0.0164 0.101 0.22 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 5.61e-01 0.054 0.0926 0.22 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 1.53e-01 0.16 0.111 0.218 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 2.53e-01 0.124 0.108 0.218 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0842 0.0865 0.218 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 3.61e-02 -0.207 0.0983 0.218 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 9.61e-01 0.00497 0.101 0.218 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0312 0.101 0.218 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0925 0.114 0.215 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 7.92e-01 0.0326 0.124 0.215 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0145 0.106 0.215 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 8.67e-01 0.0124 0.0744 0.215 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -823416 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0441 0.0954 0.215 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -920077 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0261 0.0938 0.215 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0392 0.101 0.215 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0793 0.0893 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0457 0.0998 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0797 0.0673 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 7.40e-01 0.0197 0.0593 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -322609 sc-eQTL 6.36e-02 0.207 0.111 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -823416 sc-eQTL 9.04e-01 0.0137 0.113 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -920077 sc-eQTL 4.78e-01 -0.071 0.0998 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 1.62e-01 0.13 0.0928 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 9.98e-01 0.000247 0.0941 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 8.61e-01 0.0195 0.111 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0139 0.0804 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0146 0.0618 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -322609 sc-eQTL 2.49e-01 -0.123 0.106 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -823416 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0331 0.113 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -920077 sc-eQTL 3.18e-03 -0.268 0.0899 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 1.64e-01 0.128 0.0917 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0327 0.143 0.209 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 9.65e-01 0.00535 0.123 0.209 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0922 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 5.96e-01 -0.073 0.137 0.209 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00729 0.127 0.209 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 5.53e-01 0.0728 0.123 0.209 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0878 0.105 0.218 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 1.20e-01 0.176 0.113 0.218 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 2.28e-02 0.218 0.0951 0.218 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 4.62e-01 0.0556 0.0755 0.218 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -322609 sc-eQTL 2.39e-01 0.122 0.103 0.218 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -823416 sc-eQTL 3.25e-01 0.107 0.108 0.218 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -920077 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0756 0.103 0.218 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 3.66e-01 0.0929 0.102 0.218 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0971 0.101 0.21 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00735 0.108 0.21 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 7.81e-01 0.0245 0.0879 0.21 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0875 0.0796 0.21 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -322609 sc-eQTL 8.13e-01 0.0213 0.0895 0.21 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -823416 sc-eQTL 5.44e-01 0.0594 0.0976 0.21 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -920077 sc-eQTL 1.15e-01 -0.154 0.097 0.21 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 9.57e-01 0.00551 0.101 0.21 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0773 0.111 0.215 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 3.83e-01 -0.107 0.122 0.215 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 3.68e-02 -0.211 0.1 0.215 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0223 0.0944 0.215 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -823416 sc-eQTL 1.36e-01 -0.17 0.114 0.215 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -920077 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0711 0.0887 0.215 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 4.80e-02 0.206 0.103 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0581 0.113 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 7.53e-01 0.0296 0.0938 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 1.28e-01 -0.126 0.0827 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -137436 sc-eQTL 3.67e-01 0.0855 0.0946 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 5.94e-01 0.0318 0.0595 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 8.99e-01 0.0101 0.0788 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0295 0.0859 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 6.67e-01 0.0443 0.103 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 9.64e-01 0.00362 0.0812 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 1.51e-01 -0.11 0.0764 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -137436 sc-eQTL 5.83e-01 0.0406 0.0739 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0271 0.052 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 8.83e-01 0.0099 0.0672 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 4.33e-01 0.0627 0.0798 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0395 0.0852 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0383 0.0965 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0727 0.0614 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00133 0.0541 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -322609 sc-eQTL 2.91e-01 0.117 0.11 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -823416 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00087 0.114 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -920077 sc-eQTL 6.01e-02 -0.175 0.0923 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 1.01e-01 0.143 0.0866 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 2.55e-01 -0.107 0.0937 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 9.60e-02 0.171 0.102 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 6.42e-01 0.0392 0.0842 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 5.83e-01 -0.037 0.0673 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -322609 sc-eQTL 1.39e-01 0.146 0.0979 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -823416 sc-eQTL 4.75e-01 0.073 0.102 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -920077 sc-eQTL 2.38e-01 -0.114 0.0965 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 5.80e-01 0.0538 0.0969 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -710639 sc-eQTL 7.74e-01 0.0303 0.105 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -710833 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0941 0.0717 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -479842 sc-eQTL 7.58e-01 0.0243 0.0788 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -171625 sc-eQTL 2.89e-02 0.192 0.0871 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132355 sc-eQTL 1.21e-01 -0.157 0.101 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -145544 sc-eQTL 7.55e-01 0.0274 0.0877 0.218 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000060688 \N -710639 2.95e-07 1.42e-07 6.41e-08 2.09e-07 1.07e-07 8.37e-08 1.9e-07 5.82e-08 1.59e-07 9.35e-08 1.62e-07 1.22e-07 1.95e-07 8.13e-08 5.36e-08 8.71e-08 4.45e-08 1.77e-07 7.16e-08 5.35e-08 1.18e-07 1.42e-07 1.62e-07 3.42e-08 1.98e-07 1.31e-07 1.2e-07 1.1e-07 1.31e-07 1.1e-07 1.06e-07 4.32e-08 3.56e-08 9.8e-08 3.97e-08 2.68e-08 4.62e-08 7.49e-08 6.41e-08 5.24e-08 5.94e-08 1.5e-07 3.99e-08 1.1e-08 3.36e-08 1.01e-08 7.83e-08 2.1e-09 4.67e-08