logo

Genes within 1Mb (chr1:30585652:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 1.40e-01 0.143 0.0963 0.218 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00481 0.0776 0.218 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0862 0.0648 0.218 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -137933 sc-eQTL 6.77e-01 0.0285 0.0684 0.218 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 3.52e-01 0.0499 0.0535 0.218 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 7.87e-01 -0.017 0.0628 0.218 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 6.58e-01 0.0329 0.0743 0.218 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0264 0.0823 0.218 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 1.96e-01 0.0831 0.0641 0.218 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 8.50e-01 0.0109 0.0573 0.218 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0587 0.0633 0.218 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 3.73e-02 0.118 0.0562 0.218 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0118 0.068 0.218 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 2.79e-01 0.116 0.107 0.218 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 6.09e-01 0.0366 0.0714 0.218 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 3.56e-01 0.0581 0.0628 0.218 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0112 0.0611 0.218 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 7.78e-01 0.0202 0.0716 0.218 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 2.26e-01 0.109 0.0897 0.218 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0625 0.0965 0.216 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 3.47e-01 0.108 0.114 0.216 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0966 0.0893 0.216 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0624 0.0638 0.216 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -823913 sc-eQTL 8.18e-02 -0.183 0.105 0.216 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -920574 sc-eQTL 1.33e-01 -0.105 0.0695 0.216 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 2.90e-01 -0.107 0.101 0.216 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0637 0.0746 0.218 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 7.92e-01 0.0245 0.0926 0.218 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0698 0.0592 0.218 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 8.59e-01 -0.00973 0.0546 0.218 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -323106 sc-eQTL 1.55e-01 0.149 0.104 0.218 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -823913 sc-eQTL 8.92e-01 0.0152 0.113 0.218 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -920574 sc-eQTL 3.92e-02 -0.204 0.0982 0.218 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 8.50e-02 0.149 0.0861 0.218 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00649 0.105 0.219 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0759 0.0718 0.219 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 7.64e-01 0.0227 0.0755 0.219 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 3.17e-02 0.186 0.086 0.219 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 1.67e-01 -0.135 0.0972 0.219 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 8.24e-01 0.0201 0.0902 0.219 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 6.32e-02 0.147 0.0787 0.218 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 9.72e-01 0.003 0.0849 0.218 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 9.69e-01 0.00294 0.0763 0.218 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0227 0.0625 0.218 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 8.11e-01 0.0246 0.102 0.218 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 6.48e-01 0.0488 0.107 0.218 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 1.11e-01 -0.195 0.122 0.224 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0847 0.124 0.224 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0702 0.115 0.224 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -137933 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0121 0.101 0.224 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 3.82e-01 0.0613 0.07 0.224 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0719 0.113 0.224 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 1.85e-01 0.133 0.0997 0.224 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 8.36e-01 0.0248 0.119 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 9.04e-01 0.012 0.0995 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0586 0.0938 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -137933 sc-eQTL 1.45e-01 0.142 0.0972 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 8.28e-01 0.013 0.06 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 7.35e-01 0.0285 0.0841 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 1.07e-01 -0.152 0.0936 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 3.17e-01 0.115 0.114 0.218 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 4.73e-01 0.0758 0.105 0.218 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 2.63e-01 -0.103 0.0916 0.218 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -137933 sc-eQTL 3.20e-02 -0.188 0.087 0.218 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0496 0.0779 0.218 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0591 0.0891 0.218 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 2.11e-01 0.131 0.104 0.218 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 5.80e-01 0.0577 0.104 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0219 0.0901 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 7.69e-01 0.0233 0.0794 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -137933 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00887 0.0806 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 9.95e-01 0.000336 0.0538 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00683 0.0707 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 1.34e-01 0.131 0.0869 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 7.63e-01 0.0344 0.114 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 4.69e-01 0.0681 0.0939 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 9.73e-02 -0.152 0.0914 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -137933 sc-eQTL 3.70e-01 0.0791 0.0881 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 3.77e-01 -0.053 0.0599 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 5.37e-01 -0.054 0.0872 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00359 0.0943 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0394 0.113 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0831 0.111 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 1.36e-01 -0.162 0.108 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 9.92e-01 0.000983 0.0971 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 9.60e-01 0.00537 0.106 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0479 0.0937 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 6.52e-01 -0.039 0.0862 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 8.87e-02 0.13 0.0759 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 1.47e-01 0.0884 0.0607 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0156 0.0654 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 3.25e-02 0.141 0.0656 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 5.55e-01 -0.045 0.0762 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 6.70e-01 0.0459 0.108 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 3.79e-01 0.0764 0.0867 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0595 0.0768 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0577 0.0637 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 3.84e-01 0.0704 0.0808 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 4.44e-01 0.069 0.09 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 8.37e-01 0.0223 0.109 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 2.40e-02 -0.233 0.102 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0539 0.0862 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 6.19e-01 0.0434 0.0872 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 2.77e-01 0.111 0.102 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0504 0.101 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 8.63e-01 0.0202 0.118 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0172 0.0901 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00325 0.0875 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 5.64e-01 0.0559 0.0968 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 2.48e-01 0.118 0.102 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 1.07e-01 0.154 0.0952 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 7.30e-01 0.0369 0.107 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 2.15e-01 0.114 0.092 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00616 0.0743 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 6.52e-02 -0.131 0.0706 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0386 0.0888 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 5.02e-01 0.065 0.0966 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 9.93e-01 0.00101 0.12 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 7.60e-01 0.0337 0.11 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 2.51e-02 0.231 0.102 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 2.67e-01 0.121 0.108 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 1.54e-01 0.143 0.1 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 6.36e-01 0.0481 0.102 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 5.77e-01 0.0639 0.114 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 7.27e-01 0.0384 0.11 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 3.33e-01 -0.109 0.112 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 6.25e-01 0.0516 0.105 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 2.63e-01 -0.123 0.109 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 1.95e-01 0.129 0.0987 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 1.99e-01 0.15 0.116 0.214 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 6.92e-01 0.041 0.103 0.214 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 5.83e-01 0.0544 0.099 0.214 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0661 0.0934 0.214 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0551 0.104 0.214 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 1.91e-01 0.14 0.107 0.214 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 1.41e-01 -0.175 0.118 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0374 0.1 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 8.15e-01 0.0247 0.106 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 3.08e-01 0.106 0.104 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 3.13e-01 0.106 0.104 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 8.26e-01 0.0227 0.103 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 9.50e-01 0.00691 0.11 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0765 0.0813 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 1.11e-01 0.133 0.0831 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 2.17e-02 0.203 0.088 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 7.61e-02 -0.198 0.111 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0346 0.0921 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 3.98e-01 -0.102 0.12 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 2.35e-01 0.128 0.107 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 8.84e-02 -0.178 0.104 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 2.87e-01 0.107 0.0998 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 1.18e-01 -0.166 0.106 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 3.54e-01 0.0954 0.103 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00556 0.108 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0525 0.0839 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 9.81e-01 0.00214 0.0908 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 1.30e-02 0.247 0.0985 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 6.70e-01 0.0453 0.106 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 1.46e-01 0.143 0.0981 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 4.20e-01 0.104 0.129 0.204 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 4.62e-02 0.296 0.147 0.204 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0319 0.13 0.204 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -137933 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0302 0.121 0.204 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0535 0.0865 0.204 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 2.17e-01 -0.146 0.118 0.204 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0118 0.126 0.204 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 6.31e-01 0.0408 0.0848 0.22 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0977 0.108 0.22 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 1.68e-01 0.139 0.1 0.22 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 2.11e-01 0.0901 0.0718 0.22 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 8.71e-01 0.0164 0.101 0.22 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 5.61e-01 0.054 0.0926 0.22 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 1.53e-01 0.16 0.111 0.218 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 2.53e-01 0.124 0.108 0.218 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0842 0.0865 0.218 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 3.61e-02 -0.207 0.0983 0.218 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 9.61e-01 0.00497 0.101 0.218 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0312 0.101 0.218 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0925 0.114 0.215 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 7.92e-01 0.0326 0.124 0.215 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0145 0.106 0.215 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 8.67e-01 0.0124 0.0744 0.215 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -823913 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0441 0.0954 0.215 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -920574 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0261 0.0938 0.215 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0392 0.101 0.215 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0793 0.0893 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0457 0.0998 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0797 0.0673 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 7.40e-01 0.0197 0.0593 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -323106 sc-eQTL 6.36e-02 0.207 0.111 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -823913 sc-eQTL 9.04e-01 0.0137 0.113 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -920574 sc-eQTL 4.78e-01 -0.071 0.0998 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 1.62e-01 0.13 0.0928 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 9.98e-01 0.000247 0.0941 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 8.61e-01 0.0195 0.111 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0139 0.0804 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0146 0.0618 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -323106 sc-eQTL 2.49e-01 -0.123 0.106 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -823913 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0331 0.113 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -920574 sc-eQTL 3.18e-03 -0.268 0.0899 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 1.64e-01 0.128 0.0917 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0327 0.143 0.209 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 9.65e-01 0.00535 0.123 0.209 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0922 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 5.96e-01 -0.073 0.137 0.209 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00729 0.127 0.209 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 5.53e-01 0.0728 0.123 0.209 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0878 0.105 0.218 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 1.20e-01 0.176 0.113 0.218 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 2.28e-02 0.218 0.0951 0.218 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 4.62e-01 0.0556 0.0755 0.218 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -323106 sc-eQTL 2.39e-01 0.122 0.103 0.218 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -823913 sc-eQTL 3.25e-01 0.107 0.108 0.218 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -920574 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0756 0.103 0.218 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 3.66e-01 0.0929 0.102 0.218 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0971 0.101 0.21 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00735 0.108 0.21 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 7.81e-01 0.0245 0.0879 0.21 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0875 0.0796 0.21 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -323106 sc-eQTL 8.13e-01 0.0213 0.0895 0.21 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -823913 sc-eQTL 5.44e-01 0.0594 0.0976 0.21 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -920574 sc-eQTL 1.15e-01 -0.154 0.097 0.21 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 9.57e-01 0.00551 0.101 0.21 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0773 0.111 0.215 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 3.83e-01 -0.107 0.122 0.215 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 3.68e-02 -0.211 0.1 0.215 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0223 0.0944 0.215 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -823913 sc-eQTL 1.36e-01 -0.17 0.114 0.215 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -920574 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0711 0.0887 0.215 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 4.80e-02 0.206 0.103 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0581 0.113 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 7.53e-01 0.0296 0.0938 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 1.28e-01 -0.126 0.0827 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -137933 sc-eQTL 3.67e-01 0.0855 0.0946 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 5.94e-01 0.0318 0.0595 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 8.99e-01 0.0101 0.0788 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0295 0.0859 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 6.67e-01 0.0443 0.103 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 9.64e-01 0.00362 0.0812 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 1.51e-01 -0.11 0.0764 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -137933 sc-eQTL 5.83e-01 0.0406 0.0739 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0271 0.052 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 8.83e-01 0.0099 0.0672 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 4.33e-01 0.0627 0.0798 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0395 0.0852 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0383 0.0965 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0727 0.0614 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00133 0.0541 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -323106 sc-eQTL 2.91e-01 0.117 0.11 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -823913 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00087 0.114 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -920574 sc-eQTL 6.01e-02 -0.175 0.0923 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 1.01e-01 0.143 0.0866 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 2.55e-01 -0.107 0.0937 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 9.60e-02 0.171 0.102 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 6.42e-01 0.0392 0.0842 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 5.83e-01 -0.037 0.0673 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -323106 sc-eQTL 1.39e-01 0.146 0.0979 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -823913 sc-eQTL 4.75e-01 0.073 0.102 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -920574 sc-eQTL 2.38e-01 -0.114 0.0965 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 5.80e-01 0.0538 0.0969 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -711136 sc-eQTL 7.74e-01 0.0303 0.105 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -711330 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0941 0.0717 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -480339 sc-eQTL 7.58e-01 0.0243 0.0788 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -172122 sc-eQTL 2.89e-02 0.192 0.0871 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -132852 sc-eQTL 1.21e-01 -0.157 0.101 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -146041 sc-eQTL 7.55e-01 0.0274 0.0877 0.218 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000060688 \N -711136 3.71e-07 2.17e-07 8.02e-08 2.49e-07 1.05e-07 1.08e-07 3.11e-07 7.12e-08 2.04e-07 1.28e-07 2.38e-07 1.72e-07 3.04e-07 8.54e-08 9.12e-08 1.14e-07 7.3e-08 2.66e-07 9.69e-08 7.26e-08 1.39e-07 2.07e-07 2e-07 4.81e-08 2.99e-07 1.9e-07 1.72e-07 1.69e-07 1.6e-07 1.69e-07 1.43e-07 6.78e-08 5.41e-08 1.03e-07 1.01e-07 5.23e-08 6.2e-08 5.8e-08 4.75e-08 7.77e-08 5.43e-08 2e-07 3.65e-08 1.72e-08 8.59e-08 8.59e-09 9.1e-08 2.71e-09 4.74e-08