logo

Genes within 1Mb (chr1:30573597:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00235 0.106 0.156 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 2.76e-02 0.187 0.0843 0.156 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 3.73e-01 0.0638 0.0714 0.156 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -149988 sc-eQTL 9.23e-01 0.00731 0.0752 0.156 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 7.71e-01 0.0171 0.0589 0.156 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0527 0.0689 0.156 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 8.93e-01 -0.011 0.0816 0.156 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 2.37e-01 0.108 0.0914 0.156 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 6.86e-01 -0.029 0.0716 0.156 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 4.27e-01 0.0507 0.0637 0.156 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0716 0.0705 0.156 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0407 0.0631 0.156 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 3.23e-01 0.0749 0.0755 0.156 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 3.42e-01 0.114 0.12 0.156 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 6.18e-01 0.0398 0.0797 0.156 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 5.69e-01 -0.04 0.0701 0.156 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0306 0.0681 0.156 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0942 0.0796 0.156 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 8.52e-01 0.0187 0.1 0.156 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 6.37e-01 0.0505 0.107 0.16 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 2.08e-01 -0.159 0.126 0.16 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0533 0.099 0.16 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0459 0.0707 0.16 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -835968 sc-eQTL 5.99e-01 0.0615 0.117 0.16 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -932629 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0311 0.0772 0.16 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0989 0.112 0.16 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0142 0.083 0.156 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 6.90e-01 -0.041 0.103 0.156 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0836 0.0657 0.156 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 9.81e-01 0.00141 0.0607 0.156 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -335161 sc-eQTL 4.14e-01 0.0953 0.116 0.156 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -835968 sc-eQTL 6.40e-01 0.0586 0.125 0.156 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -932629 sc-eQTL 5.33e-01 0.0687 0.11 0.156 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 7.58e-01 0.0297 0.0963 0.156 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 1.96e-01 0.147 0.113 0.157 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 4.30e-01 0.0615 0.0778 0.157 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 9.53e-01 0.00479 0.0817 0.157 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 4.78e-01 0.0667 0.0939 0.157 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 3.45e-01 0.0998 0.105 0.157 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 2.92e-01 0.103 0.0973 0.157 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 8.03e-01 -0.022 0.0879 0.156 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 4.62e-01 0.0692 0.0939 0.156 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 5.98e-01 0.0446 0.0844 0.156 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0195 0.0692 0.156 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 2.39e-01 -0.133 0.113 0.156 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00954 0.118 0.156 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 9.95e-01 0.000957 0.143 0.151 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0625 0.144 0.151 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 1.19e-01 0.208 0.133 0.151 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -149988 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0993 0.117 0.151 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0235 0.0816 0.151 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0642 0.132 0.151 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 1.06e-01 -0.188 0.116 0.151 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 9.39e-01 0.01 0.132 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 1.53e-01 0.156 0.109 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0972 0.103 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -149988 sc-eQTL 1.84e-01 -0.143 0.107 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 6.54e-01 0.0296 0.0661 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 9.81e-01 0.00225 0.0928 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0685 0.104 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0236 0.128 0.155 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 1.91e-01 0.154 0.117 0.155 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 1.21e-01 0.159 0.102 0.155 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -149988 sc-eQTL 9.63e-01 0.00459 0.098 0.155 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 1.34e-01 0.13 0.0864 0.155 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 1.30e-01 -0.15 0.0988 0.155 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 2.92e-01 -0.123 0.116 0.155 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0504 0.115 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 3.56e-02 0.207 0.0979 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 7.68e-01 0.0258 0.0872 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -149988 sc-eQTL 7.19e-01 0.0319 0.0885 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0142 0.0591 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0246 0.0777 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 8.84e-01 0.0141 0.0959 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0375 0.122 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 9.75e-01 0.00318 0.101 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 9.37e-01 0.00777 0.0986 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -149988 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0888 0.0944 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 8.78e-01 0.00987 0.0643 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 4.90e-01 0.0647 0.0935 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 2.24e-01 0.123 0.101 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0522 0.122 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 5.30e-01 0.0752 0.12 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 2.21e-01 0.144 0.117 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 6.37e-01 0.0494 0.105 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0771 0.114 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 4.91e-01 0.0696 0.101 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 1.94e-01 0.124 0.095 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 9.43e-01 0.00605 0.0845 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 8.78e-01 0.0104 0.0675 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0763 0.0721 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0229 0.0734 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 2.04e-01 0.107 0.084 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 7.22e-01 0.0431 0.121 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0593 0.0975 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 2.40e-01 0.102 0.0861 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0262 0.0717 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 1.56e-01 -0.129 0.0905 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 9.39e-01 0.00777 0.101 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 2.93e-01 0.126 0.119 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 9.35e-01 0.00929 0.114 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 2.86e-01 -0.101 0.0946 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 7.73e-01 0.0277 0.0959 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 1.11e-01 0.179 0.112 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0274 0.111 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 6.44e-02 0.236 0.127 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 5.48e-01 0.0591 0.0982 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0124 0.0955 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0455 0.106 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 9.33e-01 0.00937 0.111 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 9.01e-01 -0.013 0.105 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 5.60e-01 0.0689 0.118 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0448 0.102 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0725 0.0819 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 8.00e-01 -0.02 0.0787 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 8.91e-01 0.0135 0.0982 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 4.54e-01 0.0801 0.107 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 2.14e-01 0.163 0.13 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0845 0.12 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 7.42e-01 0.0373 0.113 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 8.06e-01 0.029 0.118 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0144 0.109 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 1.79e-01 -0.148 0.11 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 3.46e-01 -0.118 0.125 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 8.16e-03 0.315 0.118 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 1.76e-02 0.289 0.121 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 9.26e-01 0.0108 0.115 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 4.69e-01 0.0866 0.119 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0202 0.108 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0144 0.125 0.158 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 2.68e-01 0.123 0.111 0.158 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0136 0.106 0.158 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 9.73e-01 0.00337 0.1 0.158 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 1.13e-01 -0.177 0.111 0.158 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0796 0.115 0.158 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 1.23e-01 0.197 0.127 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 2.99e-01 -0.112 0.108 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0734 0.113 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 1.70e-01 0.153 0.111 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0653 0.112 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 7.24e-01 0.0391 0.111 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 2.30e-02 0.272 0.119 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 8.92e-01 0.0121 0.089 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0295 0.0913 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 7.79e-01 0.0274 0.0973 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 9.14e-01 0.0132 0.122 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 8.35e-01 0.021 0.101 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0422 0.128 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 2.32e-01 0.136 0.114 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 9.59e-02 0.184 0.11 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 2.98e-01 0.11 0.106 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 6.74e-01 0.0474 0.113 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 2.74e-01 0.119 0.109 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0147 0.118 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0397 0.0922 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 8.41e-01 0.02 0.0997 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 5.11e-01 0.0722 0.11 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 1.76e-01 0.157 0.116 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 5.51e-01 0.0646 0.108 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 4.13e-01 0.126 0.154 0.144 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0399 0.179 0.144 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0148 0.155 0.144 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -149988 sc-eQTL 3.64e-01 -0.131 0.144 0.144 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 3.21e-01 -0.103 0.103 0.144 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 3.96e-01 0.12 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 3.36e-01 -0.145 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 2.01e-01 0.122 0.0953 0.157 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 3.64e-01 0.11 0.121 0.157 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 6.15e-01 0.057 0.113 0.157 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0971 0.081 0.157 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 9.92e-01 0.00111 0.114 0.157 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0242 0.104 0.157 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 1.39e-01 -0.185 0.125 0.156 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 3.71e-01 -0.109 0.121 0.156 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 6.73e-01 0.041 0.097 0.156 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 2.02e-01 0.142 0.111 0.156 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 7.70e-01 0.0331 0.113 0.156 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00418 0.113 0.156 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 4.92e-01 0.0844 0.122 0.166 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0972 0.133 0.166 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 4.94e-01 0.0781 0.114 0.166 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0211 0.0799 0.166 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -835968 sc-eQTL 2.61e-01 -0.115 0.102 0.166 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -932629 sc-eQTL 1.41e-01 0.148 0.1 0.166 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 1.73e-02 -0.257 0.107 0.166 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 4.87e-01 0.0691 0.0992 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0403 0.111 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0897 0.0747 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00689 0.0658 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -335161 sc-eQTL 9.36e-01 -0.01 0.124 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -835968 sc-eQTL 6.39e-01 0.0589 0.125 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -932629 sc-eQTL 4.93e-01 0.0761 0.111 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 9.54e-01 0.00597 0.103 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 7.31e-01 0.0357 0.104 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 7.01e-01 0.047 0.122 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0522 0.0884 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0103 0.068 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -335161 sc-eQTL 5.42e-01 0.0716 0.117 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -835968 sc-eQTL 5.36e-01 0.0769 0.124 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -932629 sc-eQTL 8.60e-01 0.0179 0.101 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 5.73e-01 0.0572 0.101 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0992 0.153 0.148 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 5.26e-01 0.0837 0.132 0.148 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 2.81e-01 0.146 0.135 0.148 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 5.69e-01 0.0841 0.148 0.148 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 4.43e-01 -0.105 0.136 0.148 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 7.32e-01 0.0453 0.132 0.148 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0902 0.116 0.16 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0772 0.125 0.16 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00302 0.106 0.16 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 1.22e-01 -0.128 0.0825 0.16 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -335161 sc-eQTL 3.77e-01 0.1 0.113 0.16 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -835968 sc-eQTL 3.29e-01 -0.116 0.119 0.16 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -932629 sc-eQTL 6.46e-01 0.0518 0.113 0.16 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 1.97e-01 -0.145 0.112 0.16 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 1.31e-01 -0.166 0.109 0.161 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 8.58e-01 -0.021 0.117 0.161 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 9.58e-01 0.00502 0.0956 0.161 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0553 0.0867 0.161 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -335161 sc-eQTL 3.22e-02 0.207 0.0962 0.161 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -835968 sc-eQTL 3.29e-01 -0.104 0.106 0.161 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -932629 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0781 0.106 0.161 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 3.69e-01 0.0989 0.11 0.161 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 6.41e-01 0.0582 0.125 0.167 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0858 0.137 0.167 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0843 0.113 0.167 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0855 0.105 0.167 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -835968 sc-eQTL 8.02e-01 0.0321 0.128 0.167 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -932629 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0906 0.0991 0.167 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 5.65e-01 0.0674 0.117 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00146 0.124 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 3.08e-01 0.105 0.103 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 7.65e-01 0.0274 0.0915 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -149988 sc-eQTL 1.79e-01 -0.14 0.104 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 5.43e-01 0.04 0.0655 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0811 0.0866 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0897 0.0944 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0743 0.112 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 1.28e-01 0.135 0.0881 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 7.46e-01 0.0272 0.0838 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -149988 sc-eQTL 7.20e-01 0.0289 0.0807 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0257 0.0568 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 8.15e-01 0.0172 0.0734 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 9.02e-01 0.0107 0.0872 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 7.30e-01 0.0325 0.0941 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 8.53e-01 0.0198 0.107 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 1.26e-01 -0.104 0.0676 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 9.97e-01 -0.00021 0.0598 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -335161 sc-eQTL 9.68e-01 0.00495 0.122 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -835968 sc-eQTL 6.57e-01 0.0557 0.125 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -932629 sc-eQTL 3.92e-01 0.0881 0.103 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 5.17e-01 0.0625 0.0962 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 9.53e-02 -0.175 0.105 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 2.13e-01 -0.144 0.115 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0282 0.0944 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0768 0.0754 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -335161 sc-eQTL 2.68e-01 0.122 0.11 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -835968 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0948 0.114 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -932629 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00816 0.109 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0474 0.109 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -723191 sc-eQTL 2.32e-01 0.137 0.114 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -723385 sc-eQTL 5.38e-01 0.0483 0.0782 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -492394 sc-eQTL 8.03e-01 0.0214 0.0857 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -184177 sc-eQTL 5.26e-01 0.0608 0.0957 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -144907 sc-eQTL 3.77e-01 0.0977 0.11 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -158096 sc-eQTL 3.16e-01 0.0956 0.0952 0.157 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -492394 eQTL 0.0382 0.0369 0.0178 0.0 0.0 0.174

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina