logo

Genes within 1Mb (chr1:30560976:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 9.12e-01 0.0121 0.109 0.154 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 2.15e-02 0.199 0.0859 0.154 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 4.77e-01 0.052 0.0729 0.154 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -162609 sc-eQTL 9.99e-01 -6.93e-05 0.0768 0.154 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 8.60e-01 0.0106 0.0601 0.154 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0524 0.0704 0.154 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00501 0.0834 0.154 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 2.14e-01 0.116 0.0933 0.154 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0268 0.0731 0.154 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 4.47e-01 0.0495 0.065 0.154 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0756 0.072 0.154 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0382 0.0645 0.154 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 2.87e-01 0.0823 0.0771 0.154 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 3.89e-01 0.105 0.122 0.154 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 4.32e-01 0.064 0.0813 0.154 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0597 0.0716 0.154 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0342 0.0696 0.154 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0907 0.0813 0.154 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 9.87e-01 0.00173 0.102 0.154 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 5.70e-01 0.0619 0.109 0.158 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 2.59e-01 -0.146 0.128 0.158 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0613 0.101 0.158 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0595 0.0719 0.158 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -848589 sc-eQTL 5.38e-01 0.0732 0.119 0.158 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -945250 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0375 0.0787 0.158 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 3.53e-01 -0.106 0.114 0.158 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0269 0.0848 0.154 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0404 0.105 0.154 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0845 0.0672 0.154 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00383 0.062 0.154 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -347782 sc-eQTL 3.65e-01 0.108 0.119 0.154 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -848589 sc-eQTL 6.68e-01 0.0548 0.128 0.154 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -945250 sc-eQTL 5.76e-01 0.063 0.113 0.154 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 8.17e-01 0.0229 0.0985 0.154 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 1.97e-01 0.15 0.116 0.155 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 3.20e-01 0.0792 0.0794 0.155 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 9.64e-01 0.00379 0.0834 0.155 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 5.30e-01 0.0603 0.0959 0.155 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 3.95e-01 0.0917 0.108 0.155 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 3.78e-01 0.0879 0.0995 0.155 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0174 0.0898 0.154 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 3.95e-01 0.0816 0.0958 0.154 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 6.12e-01 0.0438 0.0862 0.154 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0278 0.0707 0.154 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 2.26e-01 -0.14 0.115 0.154 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0153 0.121 0.154 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 9.95e-01 0.000957 0.143 0.151 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0625 0.144 0.151 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 1.19e-01 0.208 0.133 0.151 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -162609 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0993 0.117 0.151 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0235 0.0816 0.151 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0642 0.132 0.151 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 1.06e-01 -0.188 0.116 0.151 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 8.38e-01 0.0275 0.135 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 1.90e-01 0.147 0.112 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 3.22e-01 -0.105 0.106 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -162609 sc-eQTL 1.87e-01 -0.145 0.11 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 7.97e-01 0.0174 0.0676 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 9.55e-01 0.0054 0.0949 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0635 0.106 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 9.65e-01 0.00571 0.131 0.153 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 2.21e-01 0.147 0.12 0.153 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 7.88e-02 0.184 0.104 0.153 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -162609 sc-eQTL 9.01e-01 0.0125 0.1 0.153 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 1.10e-01 0.142 0.0883 0.153 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 9.67e-02 -0.169 0.101 0.153 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 2.70e-01 -0.131 0.119 0.153 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0581 0.117 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 2.90e-02 0.219 0.0998 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 7.82e-01 0.0247 0.089 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -162609 sc-eQTL 7.95e-01 0.0235 0.0903 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0248 0.0603 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0177 0.0792 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 9.29e-01 0.00876 0.0979 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0176 0.125 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 8.54e-01 0.0189 0.103 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0135 0.101 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -162609 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0906 0.0964 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 8.98e-01 0.00843 0.0656 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 5.20e-01 0.0615 0.0954 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 2.04e-01 0.131 0.103 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0861 0.124 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 4.20e-01 0.0986 0.122 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 1.67e-01 0.165 0.119 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 6.40e-01 0.0501 0.107 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0605 0.117 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 4.01e-01 0.0867 0.103 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 1.39e-01 0.144 0.0968 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00435 0.0863 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 8.74e-01 0.0109 0.0689 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0829 0.0736 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0181 0.0749 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 1.91e-01 0.113 0.0857 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 7.29e-01 0.043 0.124 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0544 0.0998 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 2.80e-01 0.0954 0.0882 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0307 0.0733 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 1.68e-01 -0.128 0.0926 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 9.68e-01 0.00419 0.104 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 2.26e-01 0.148 0.122 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00103 0.116 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0926 0.0966 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 7.17e-01 0.0356 0.0979 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 9.78e-02 0.189 0.114 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0027 0.113 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 5.37e-02 0.252 0.13 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 3.52e-01 0.0935 0.1 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0347 0.0974 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0595 0.108 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 8.92e-01 0.0155 0.113 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0332 0.107 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 6.75e-01 0.0507 0.121 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0436 0.104 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0858 0.0836 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0209 0.0803 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 9.14e-01 0.0109 0.1 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 5.04e-01 0.0729 0.109 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 2.39e-01 0.157 0.133 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0882 0.122 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 5.86e-01 0.0628 0.115 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 8.04e-01 0.03 0.121 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 9.65e-01 0.00497 0.112 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 2.23e-01 -0.137 0.112 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 3.83e-01 -0.111 0.127 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 3.77e-03 0.351 0.12 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 2.57e-02 0.278 0.124 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 8.49e-01 0.0225 0.118 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 4.26e-01 0.0972 0.122 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0494 0.11 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0112 0.128 0.156 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 2.91e-01 0.119 0.113 0.156 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00459 0.109 0.156 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 9.47e-01 0.0068 0.102 0.156 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 1.05e-01 -0.185 0.113 0.156 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0785 0.117 0.156 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 1.15e-01 0.205 0.129 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 3.00e-01 -0.114 0.11 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0856 0.115 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 1.58e-01 0.161 0.113 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0653 0.114 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 7.79e-01 0.0318 0.113 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 2.12e-02 0.282 0.121 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 8.67e-01 0.0152 0.0908 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0211 0.0932 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 8.59e-01 0.0177 0.0994 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 9.83e-01 0.00273 0.125 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 9.85e-01 0.00188 0.103 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0429 0.13 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 1.84e-01 0.154 0.116 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 1.38e-01 0.168 0.113 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 3.54e-01 0.1 0.108 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 5.98e-01 0.0608 0.115 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 3.23e-01 0.11 0.111 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0207 0.121 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0173 0.0942 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 8.25e-01 0.0225 0.102 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 5.71e-01 0.0636 0.112 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 2.02e-01 0.152 0.118 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 6.46e-01 0.0509 0.111 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 4.13e-01 0.126 0.154 0.144 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0399 0.179 0.144 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0148 0.155 0.144 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -162609 sc-eQTL 3.64e-01 -0.131 0.144 0.144 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 3.21e-01 -0.103 0.103 0.144 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 3.96e-01 0.12 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 3.36e-01 -0.145 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 1.59e-01 0.137 0.0969 0.154 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 2.88e-01 0.131 0.123 0.154 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 5.75e-01 0.0648 0.115 0.154 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0807 0.0825 0.154 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00958 0.116 0.154 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 6.12e-01 -0.054 0.106 0.154 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 9.69e-02 -0.213 0.127 0.154 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0763 0.124 0.154 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 6.99e-01 0.0385 0.0993 0.154 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 1.76e-01 0.154 0.113 0.154 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 8.77e-01 0.0179 0.116 0.154 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 9.96e-01 0.000587 0.116 0.154 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 4.79e-01 0.0891 0.125 0.163 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 5.32e-01 -0.085 0.136 0.163 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 4.75e-01 0.0836 0.117 0.163 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0478 0.0818 0.163 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -848589 sc-eQTL 2.96e-01 -0.11 0.105 0.163 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -945250 sc-eQTL 2.05e-01 0.131 0.103 0.163 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 1.95e-02 -0.258 0.11 0.163 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 5.64e-01 0.0585 0.101 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0581 0.113 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 1.77e-01 -0.103 0.0762 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0144 0.0672 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -347782 sc-eQTL 9.73e-01 0.00426 0.127 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -848589 sc-eQTL 6.96e-01 0.0502 0.128 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -945250 sc-eQTL 5.17e-01 0.0734 0.113 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00683 0.106 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 8.19e-01 0.0242 0.106 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 6.98e-01 0.0485 0.125 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0369 0.0902 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0118 0.0694 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -347782 sc-eQTL 4.34e-01 0.0938 0.12 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -848589 sc-eQTL 5.50e-01 0.0759 0.127 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -945250 sc-eQTL 9.20e-01 0.0103 0.103 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 6.03e-01 0.0539 0.103 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 5.01e-01 -0.106 0.157 0.145 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 4.83e-01 0.0949 0.135 0.145 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 3.24e-01 0.137 0.139 0.145 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 6.20e-01 0.0752 0.151 0.145 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 4.64e-01 -0.102 0.139 0.145 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 7.09e-01 0.0507 0.135 0.145 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 3.90e-01 -0.102 0.118 0.158 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 4.57e-01 -0.095 0.127 0.158 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 9.97e-01 0.0004 0.108 0.158 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 9.92e-02 -0.14 0.0843 0.158 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -347782 sc-eQTL 3.35e-01 0.112 0.116 0.158 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -848589 sc-eQTL 3.90e-01 -0.105 0.121 0.158 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -945250 sc-eQTL 8.76e-01 0.018 0.115 0.158 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 1.86e-01 -0.152 0.115 0.158 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 1.18e-01 -0.175 0.111 0.158 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 9.57e-01 0.00642 0.119 0.158 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 9.73e-01 0.00327 0.0976 0.158 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0666 0.0885 0.158 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -347782 sc-eQTL 3.73e-02 0.206 0.0983 0.158 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -848589 sc-eQTL 3.31e-01 -0.106 0.108 0.158 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -945250 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0698 0.108 0.158 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 3.66e-01 0.102 0.112 0.158 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 5.79e-01 0.0707 0.127 0.164 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0741 0.14 0.164 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0966 0.116 0.164 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 3.89e-01 -0.093 0.108 0.164 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -848589 sc-eQTL 7.80e-01 0.0366 0.131 0.164 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -945250 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0967 0.101 0.164 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 5.96e-01 0.0635 0.119 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 8.43e-01 0.0251 0.127 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 3.91e-01 0.0907 0.105 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 7.73e-01 0.0271 0.0936 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -162609 sc-eQTL 1.57e-01 -0.151 0.106 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 5.64e-01 0.0387 0.067 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0828 0.0885 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 3.57e-01 -0.089 0.0965 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0756 0.114 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 8.62e-02 0.155 0.0897 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 8.80e-01 0.0129 0.0855 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -162609 sc-eQTL 7.83e-01 0.0227 0.0823 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0347 0.0579 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 7.94e-01 0.0195 0.0748 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 8.84e-01 0.013 0.0889 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 8.72e-01 0.0155 0.0961 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 9.28e-01 0.00991 0.109 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 1.26e-01 -0.106 0.0691 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0051 0.061 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -347782 sc-eQTL 8.22e-01 0.028 0.125 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -848589 sc-eQTL 7.07e-01 0.0483 0.128 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -945250 sc-eQTL 4.11e-01 0.0864 0.105 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 5.81e-01 0.0543 0.0983 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 7.92e-02 -0.188 0.107 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 2.95e-01 -0.123 0.117 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 7.64e-01 -0.029 0.0965 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0887 0.077 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -347782 sc-eQTL 2.73e-01 0.124 0.112 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -848589 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0893 0.117 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -945250 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0237 0.111 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0496 0.111 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -735812 sc-eQTL 2.42e-01 0.137 0.117 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -736006 sc-eQTL 4.06e-01 0.0665 0.0798 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -505015 sc-eQTL 8.06e-01 0.0216 0.0876 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -196798 sc-eQTL 5.89e-01 0.0529 0.0978 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -157528 sc-eQTL 4.30e-01 0.0891 0.113 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -170717 sc-eQTL 4.10e-01 0.0803 0.0973 0.155 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -505015 eQTL 0.0473 0.035 0.0176 0.0 0.0 0.175

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina