logo

Genes within 1Mb (chr1:30555871:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 1.32e-01 0.142 0.0943 0.22 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0198 0.0759 0.22 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0649 0.0635 0.22 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -167714 sc-eQTL 6.92e-01 0.0266 0.0669 0.22 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 2.06e-01 0.0662 0.0522 0.22 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0428 0.0614 0.22 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 8.97e-01 0.00945 0.0727 0.22 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 6.80e-01 -0.033 0.08 0.22 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 1.51e-01 0.0897 0.0622 0.22 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 7.99e-01 0.0142 0.0557 0.22 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0597 0.0616 0.22 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 4.01e-02 0.113 0.0546 0.22 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 8.23e-01 0.0148 0.0661 0.22 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 3.13e-01 0.106 0.104 0.22 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 6.02e-01 0.0364 0.0697 0.22 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 2.83e-01 0.0658 0.0612 0.22 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 8.87e-01 -0.00851 0.0596 0.22 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00532 0.0698 0.22 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 1.86e-01 0.116 0.0874 0.22 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0591 0.0941 0.218 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 2.15e-01 0.138 0.111 0.218 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0964 0.0871 0.218 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0511 0.0623 0.218 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -853694 sc-eQTL 8.77e-02 -0.175 0.102 0.218 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -950355 sc-eQTL 1.60e-01 -0.0956 0.0678 0.218 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 1.50e-01 -0.142 0.0981 0.218 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0726 0.0727 0.22 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 6.37e-01 0.0427 0.0903 0.22 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 3.17e-01 -0.058 0.0578 0.22 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 7.08e-01 -0.02 0.0532 0.22 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -352887 sc-eQTL 6.74e-02 0.187 0.102 0.22 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -853694 sc-eQTL 8.43e-01 0.0218 0.11 0.22 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -950355 sc-eQTL 3.26e-02 -0.206 0.0957 0.22 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 1.12e-01 0.134 0.0841 0.22 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00564 0.102 0.221 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0792 0.0698 0.221 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 6.23e-01 0.0361 0.0734 0.221 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 2.50e-02 0.189 0.0836 0.221 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 1.84e-01 -0.126 0.0946 0.221 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 9.85e-01 0.00165 0.0877 0.221 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 5.32e-02 0.149 0.0767 0.22 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 7.92e-01 0.0219 0.0827 0.22 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0184 0.0744 0.22 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 6.94e-01 -0.024 0.0609 0.22 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 9.32e-01 0.00852 0.0998 0.22 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 7.48e-01 0.0334 0.104 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 1.98e-01 -0.156 0.121 0.224 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0716 0.122 0.224 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0511 0.113 0.224 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -167714 sc-eQTL 7.88e-01 0.0268 0.0992 0.224 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 3.94e-01 0.059 0.0691 0.224 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0506 0.112 0.224 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 2.01e-01 0.126 0.0984 0.224 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0285 0.118 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00211 0.0983 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 5.75e-01 -0.052 0.0927 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -167714 sc-eQTL 2.64e-01 0.108 0.0963 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 8.23e-01 0.0133 0.0593 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 8.91e-01 0.0114 0.0832 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 1.39e-01 -0.137 0.0926 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 3.19e-01 0.113 0.113 0.22 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 5.45e-01 0.0631 0.104 0.22 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0861 0.0903 0.22 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -167714 sc-eQTL 4.39e-02 -0.174 0.0858 0.22 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0267 0.0768 0.22 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0966 0.0876 0.22 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 3.24e-01 0.102 0.103 0.22 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 6.64e-01 0.0448 0.103 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0463 0.0888 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 7.45e-01 0.0255 0.0784 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -167714 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0143 0.0795 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 9.21e-01 0.00526 0.0531 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0277 0.0697 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 1.33e-01 0.129 0.0857 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 9.53e-01 0.00664 0.113 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 5.82e-01 0.0515 0.0933 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 1.49e-01 -0.132 0.0909 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -167714 sc-eQTL 2.32e-01 0.105 0.0874 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0463 0.0595 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0509 0.0867 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0252 0.0937 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0712 0.111 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0584 0.109 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 7.05e-02 -0.193 0.106 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 9.38e-01 0.00746 0.0953 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0044 0.104 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0301 0.092 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0409 0.0838 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 1.06e-01 0.12 0.0739 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 1.43e-01 0.0868 0.0591 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0142 0.0636 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 2.08e-02 0.148 0.0637 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0413 0.0741 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 6.89e-01 0.0419 0.105 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 2.72e-01 0.0927 0.0843 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0213 0.0748 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0495 0.062 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 4.35e-01 0.0615 0.0786 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 1.75e-01 0.119 0.0873 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 8.50e-01 0.02 0.106 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 4.22e-02 -0.204 0.0997 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0833 0.0837 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 5.23e-01 0.0542 0.0847 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 2.25e-01 0.12 0.0989 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0674 0.0977 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00322 0.114 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 8.46e-01 -0.017 0.0876 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 9.50e-01 0.00534 0.0851 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 5.96e-01 0.0499 0.0942 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 2.49e-01 0.114 0.0988 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 1.06e-01 0.15 0.0926 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 8.39e-01 0.0212 0.104 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 2.66e-01 0.0998 0.0896 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 8.21e-01 0.0163 0.0723 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 1.07e-01 -0.112 0.0688 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0496 0.0864 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 4.97e-01 0.064 0.094 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0186 0.117 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 7.66e-01 0.032 0.108 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 1.58e-02 0.243 0.0997 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 3.80e-01 0.093 0.106 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 4.66e-01 0.0716 0.0979 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 7.38e-01 0.0332 0.0991 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 5.11e-01 0.0742 0.113 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 5.80e-01 0.0599 0.108 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 3.18e-01 -0.11 0.11 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 7.14e-01 0.0382 0.104 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 2.17e-01 -0.133 0.108 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 1.34e-01 0.146 0.0972 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 1.29e-01 0.173 0.113 0.216 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 8.75e-01 0.0159 0.101 0.216 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 7.23e-01 0.0343 0.0969 0.216 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0238 0.0914 0.216 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0753 0.102 0.216 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 2.33e-01 0.125 0.105 0.216 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 1.21e-01 -0.179 0.115 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0161 0.0977 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0127 0.103 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 2.70e-01 0.112 0.101 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 4.85e-01 0.0711 0.102 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00639 0.1 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 9.90e-01 0.0013 0.107 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0894 0.079 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 6.49e-02 0.15 0.0806 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 2.09e-02 0.199 0.0856 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 7.17e-02 -0.195 0.108 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0198 0.0896 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0741 0.117 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 1.26e-01 0.16 0.104 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 1.84e-01 -0.135 0.102 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 2.90e-01 0.103 0.097 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 1.66e-01 -0.143 0.103 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 3.96e-01 0.085 0.0999 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0155 0.105 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0456 0.0816 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 9.04e-01 0.0106 0.0883 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 6.69e-03 0.262 0.0956 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 5.51e-01 0.0615 0.103 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 2.76e-01 0.104 0.0956 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 3.89e-01 0.108 0.125 0.207 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 4.23e-02 0.293 0.142 0.207 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0215 0.126 0.207 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -167714 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0158 0.118 0.207 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0541 0.0838 0.207 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 2.75e-01 -0.125 0.114 0.207 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00786 0.122 0.207 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 4.15e-01 0.0676 0.0828 0.222 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0521 0.105 0.222 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 2.09e-01 0.123 0.0978 0.222 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 2.94e-01 0.074 0.0703 0.222 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 6.60e-01 0.0433 0.0984 0.222 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 7.00e-01 0.0349 0.0905 0.222 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 1.28e-01 0.165 0.108 0.22 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 3.55e-01 0.0974 0.105 0.22 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0737 0.0841 0.22 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 4.68e-02 -0.191 0.0956 0.22 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0153 0.0983 0.22 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0151 0.0982 0.22 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0834 0.11 0.217 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 5.98e-01 0.0632 0.12 0.217 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00972 0.103 0.217 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 8.45e-01 0.0141 0.0721 0.217 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -853694 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0917 0.0923 0.217 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -950355 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0357 0.0909 0.217 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0743 0.0978 0.217 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0991 0.087 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0251 0.0973 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 3.63e-01 -0.06 0.0657 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 9.41e-01 0.00429 0.0578 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -352887 sc-eQTL 3.28e-02 0.231 0.108 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -853694 sc-eQTL 7.29e-01 0.0382 0.11 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -950355 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0641 0.0973 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 2.10e-01 0.114 0.0905 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0244 0.0917 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 7.87e-01 0.0293 0.108 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 9.72e-01 0.00279 0.0783 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0252 0.0602 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -352887 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0799 0.104 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -853694 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0385 0.11 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -950355 sc-eQTL 2.10e-03 -0.272 0.0874 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 2.55e-01 0.102 0.0895 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0627 0.14 0.209 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 4.49e-01 0.0908 0.12 0.209 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 4.17e-01 -0.1 0.123 0.209 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0471 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0392 0.124 0.209 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 6.97e-01 0.0469 0.12 0.209 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 3.08e-01 -0.105 0.103 0.22 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 1.27e-01 0.168 0.11 0.22 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 8.04e-03 0.247 0.0922 0.22 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 5.54e-01 0.0436 0.0736 0.22 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -352887 sc-eQTL 1.79e-01 0.135 0.1 0.22 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -853694 sc-eQTL 3.84e-01 0.0919 0.105 0.22 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -950355 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0908 0.0998 0.22 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 5.05e-01 0.0667 0.0999 0.22 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0769 0.0981 0.213 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 8.60e-01 0.0185 0.105 0.213 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 8.96e-01 0.0112 0.0856 0.213 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 1.82e-01 -0.104 0.0774 0.213 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -352887 sc-eQTL 5.81e-01 0.0481 0.0871 0.213 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -853694 sc-eQTL 4.09e-01 0.0787 0.095 0.213 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -950355 sc-eQTL 6.91e-02 -0.172 0.0943 0.213 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 8.93e-01 0.0132 0.0986 0.213 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0647 0.114 0.209 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0946 0.125 0.209 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 1.53e-02 -0.25 0.102 0.209 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0224 0.0966 0.209 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -853694 sc-eQTL 1.10e-01 -0.187 0.116 0.209 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -950355 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0723 0.0908 0.209 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 7.24e-02 0.192 0.106 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0825 0.112 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 8.71e-01 0.0151 0.0929 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 1.76e-01 -0.111 0.082 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -167714 sc-eQTL 4.70e-01 0.0679 0.0938 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 4.07e-01 0.0489 0.0589 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0132 0.078 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0287 0.085 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 7.92e-01 0.0269 0.102 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0228 0.0805 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0943 0.0759 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -167714 sc-eQTL 5.43e-01 0.0447 0.0733 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0196 0.0516 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0031 0.0667 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 4.95e-01 0.0541 0.0792 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 4.27e-01 -0.066 0.0829 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0175 0.0941 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0597 0.0599 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 8.54e-01 -0.00971 0.0527 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -352887 sc-eQTL 1.41e-01 0.158 0.107 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -853694 sc-eQTL 9.18e-01 0.0114 0.111 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -950355 sc-eQTL 5.57e-02 -0.173 0.09 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 1.45e-01 0.124 0.0845 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 2.02e-01 -0.117 0.0912 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 7.58e-02 0.177 0.0995 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 4.78e-01 0.0583 0.082 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0504 0.0656 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -352887 sc-eQTL 9.82e-02 0.158 0.0953 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -853694 sc-eQTL 4.63e-01 0.073 0.0994 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -950355 sc-eQTL 1.34e-01 -0.141 0.0939 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 6.12e-01 0.0481 0.0945 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -740917 sc-eQTL 7.71e-01 0.0299 0.102 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -741111 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0981 0.0696 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -510120 sc-eQTL 5.45e-01 0.0464 0.0766 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -201903 sc-eQTL 2.33e-02 0.193 0.0846 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -162633 sc-eQTL 1.66e-01 -0.137 0.0984 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -175822 sc-eQTL 9.08e-01 0.00992 0.0853 0.22 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000060688 \N -740917 2.76e-07 1.3e-07 4.47e-08 1.84e-07 9.21e-08 9.8e-08 1.61e-07 5.2e-08 1.44e-07 4.94e-08 1.62e-07 8.55e-08 1.47e-07 6.76e-08 6.02e-08 7.53e-08 3.93e-08 1.27e-07 5.97e-08 4.04e-08 1.13e-07 1.28e-07 1.44e-07 3.03e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.06e-07 9.65e-08 1.12e-07 1.05e-07 9.64e-08 3.66e-08 3.61e-08 8.25e-08 8.38e-08 3.62e-08 5.37e-08 9.26e-08 6.86e-08 3.98e-08 4.69e-08 1.36e-07 5.2e-08 2.03e-08 4.25e-08 1.99e-08 1.22e-07 3.8e-09 5.04e-08