logo

Genes within 1Mb (chr1:30552120:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 1.32e-01 0.142 0.0943 0.22 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0198 0.0759 0.22 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0649 0.0635 0.22 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -171465 sc-eQTL 6.92e-01 0.0266 0.0669 0.22 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 2.06e-01 0.0662 0.0522 0.22 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0428 0.0614 0.22 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 8.97e-01 0.00945 0.0727 0.22 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 6.80e-01 -0.033 0.08 0.22 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 1.51e-01 0.0897 0.0622 0.22 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 7.99e-01 0.0142 0.0557 0.22 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0597 0.0616 0.22 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 4.01e-02 0.113 0.0546 0.22 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 8.23e-01 0.0148 0.0661 0.22 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 3.13e-01 0.106 0.104 0.22 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 6.02e-01 0.0364 0.0697 0.22 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 2.83e-01 0.0658 0.0612 0.22 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 8.87e-01 -0.00851 0.0596 0.22 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00532 0.0698 0.22 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 1.86e-01 0.116 0.0874 0.22 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0591 0.0941 0.218 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 2.15e-01 0.138 0.111 0.218 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0964 0.0871 0.218 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0511 0.0623 0.218 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -857445 sc-eQTL 8.77e-02 -0.175 0.102 0.218 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -954106 sc-eQTL 1.60e-01 -0.0956 0.0678 0.218 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 1.50e-01 -0.142 0.0981 0.218 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0726 0.0727 0.22 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 6.37e-01 0.0427 0.0903 0.22 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 3.17e-01 -0.058 0.0578 0.22 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 7.08e-01 -0.02 0.0532 0.22 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -356638 sc-eQTL 6.74e-02 0.187 0.102 0.22 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -857445 sc-eQTL 8.43e-01 0.0218 0.11 0.22 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -954106 sc-eQTL 3.26e-02 -0.206 0.0957 0.22 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 1.12e-01 0.134 0.0841 0.22 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00564 0.102 0.221 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0792 0.0698 0.221 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 6.23e-01 0.0361 0.0734 0.221 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 2.50e-02 0.189 0.0836 0.221 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 1.84e-01 -0.126 0.0946 0.221 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 9.85e-01 0.00165 0.0877 0.221 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 5.32e-02 0.149 0.0767 0.22 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 7.92e-01 0.0219 0.0827 0.22 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0184 0.0744 0.22 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 6.94e-01 -0.024 0.0609 0.22 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 9.32e-01 0.00852 0.0998 0.22 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 7.48e-01 0.0334 0.104 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 1.98e-01 -0.156 0.121 0.224 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0716 0.122 0.224 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0511 0.113 0.224 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -171465 sc-eQTL 7.88e-01 0.0268 0.0992 0.224 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 3.94e-01 0.059 0.0691 0.224 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0506 0.112 0.224 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 2.01e-01 0.126 0.0984 0.224 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0285 0.118 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00211 0.0983 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 5.75e-01 -0.052 0.0927 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -171465 sc-eQTL 2.64e-01 0.108 0.0963 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 8.23e-01 0.0133 0.0593 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 8.91e-01 0.0114 0.0832 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 1.39e-01 -0.137 0.0926 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 3.19e-01 0.113 0.113 0.22 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 5.45e-01 0.0631 0.104 0.22 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0861 0.0903 0.22 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -171465 sc-eQTL 4.39e-02 -0.174 0.0858 0.22 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0267 0.0768 0.22 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0966 0.0876 0.22 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 3.24e-01 0.102 0.103 0.22 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 6.64e-01 0.0448 0.103 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0463 0.0888 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 7.45e-01 0.0255 0.0784 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -171465 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0143 0.0795 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 9.21e-01 0.00526 0.0531 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0277 0.0697 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 1.33e-01 0.129 0.0857 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 9.53e-01 0.00664 0.113 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 5.82e-01 0.0515 0.0933 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 1.49e-01 -0.132 0.0909 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -171465 sc-eQTL 2.32e-01 0.105 0.0874 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0463 0.0595 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0509 0.0867 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0252 0.0937 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0712 0.111 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0584 0.109 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 7.05e-02 -0.193 0.106 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 9.38e-01 0.00746 0.0953 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0044 0.104 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0301 0.092 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0409 0.0838 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 1.06e-01 0.12 0.0739 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 1.43e-01 0.0868 0.0591 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0142 0.0636 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 2.08e-02 0.148 0.0637 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0413 0.0741 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 6.89e-01 0.0419 0.105 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 2.72e-01 0.0927 0.0843 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0213 0.0748 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0495 0.062 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 4.35e-01 0.0615 0.0786 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 1.75e-01 0.119 0.0873 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 8.50e-01 0.02 0.106 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 4.22e-02 -0.204 0.0997 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0833 0.0837 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 5.23e-01 0.0542 0.0847 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 2.25e-01 0.12 0.0989 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0674 0.0977 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00322 0.114 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 8.46e-01 -0.017 0.0876 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 9.50e-01 0.00534 0.0851 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 5.96e-01 0.0499 0.0942 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 2.49e-01 0.114 0.0988 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 1.06e-01 0.15 0.0926 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 8.39e-01 0.0212 0.104 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 2.66e-01 0.0998 0.0896 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 8.21e-01 0.0163 0.0723 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 1.07e-01 -0.112 0.0688 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0496 0.0864 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 4.97e-01 0.064 0.094 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0186 0.117 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 7.66e-01 0.032 0.108 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 1.58e-02 0.243 0.0997 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 3.80e-01 0.093 0.106 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 4.66e-01 0.0716 0.0979 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 7.38e-01 0.0332 0.0991 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 5.11e-01 0.0742 0.113 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 5.80e-01 0.0599 0.108 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 3.18e-01 -0.11 0.11 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 7.14e-01 0.0382 0.104 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 2.17e-01 -0.133 0.108 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 1.34e-01 0.146 0.0972 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 1.29e-01 0.173 0.113 0.216 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 8.75e-01 0.0159 0.101 0.216 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 7.23e-01 0.0343 0.0969 0.216 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0238 0.0914 0.216 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0753 0.102 0.216 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 2.33e-01 0.125 0.105 0.216 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 1.21e-01 -0.179 0.115 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0161 0.0977 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0127 0.103 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 2.70e-01 0.112 0.101 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 4.85e-01 0.0711 0.102 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00639 0.1 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 9.90e-01 0.0013 0.107 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0894 0.079 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 6.49e-02 0.15 0.0806 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 2.09e-02 0.199 0.0856 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 7.17e-02 -0.195 0.108 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0198 0.0896 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0741 0.117 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 1.26e-01 0.16 0.104 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 1.84e-01 -0.135 0.102 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 2.90e-01 0.103 0.097 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 1.66e-01 -0.143 0.103 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 3.96e-01 0.085 0.0999 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0155 0.105 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0456 0.0816 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 9.04e-01 0.0106 0.0883 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 6.69e-03 0.262 0.0956 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 5.51e-01 0.0615 0.103 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 2.76e-01 0.104 0.0956 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 3.89e-01 0.108 0.125 0.207 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 4.23e-02 0.293 0.142 0.207 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0215 0.126 0.207 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -171465 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0158 0.118 0.207 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0541 0.0838 0.207 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 2.75e-01 -0.125 0.114 0.207 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00786 0.122 0.207 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 4.15e-01 0.0676 0.0828 0.222 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0521 0.105 0.222 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 2.09e-01 0.123 0.0978 0.222 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 2.94e-01 0.074 0.0703 0.222 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 6.60e-01 0.0433 0.0984 0.222 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 7.00e-01 0.0349 0.0905 0.222 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 1.28e-01 0.165 0.108 0.22 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 3.55e-01 0.0974 0.105 0.22 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0737 0.0841 0.22 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 4.68e-02 -0.191 0.0956 0.22 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0153 0.0983 0.22 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0151 0.0982 0.22 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0834 0.11 0.217 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 5.98e-01 0.0632 0.12 0.217 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00972 0.103 0.217 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 8.45e-01 0.0141 0.0721 0.217 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -857445 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0917 0.0923 0.217 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -954106 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0357 0.0909 0.217 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0743 0.0978 0.217 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0991 0.087 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0251 0.0973 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 3.63e-01 -0.06 0.0657 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 9.41e-01 0.00429 0.0578 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -356638 sc-eQTL 3.28e-02 0.231 0.108 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -857445 sc-eQTL 7.29e-01 0.0382 0.11 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -954106 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0641 0.0973 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 2.10e-01 0.114 0.0905 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0244 0.0917 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 7.87e-01 0.0293 0.108 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 9.72e-01 0.00279 0.0783 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0252 0.0602 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -356638 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0799 0.104 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -857445 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0385 0.11 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -954106 sc-eQTL 2.10e-03 -0.272 0.0874 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 2.55e-01 0.102 0.0895 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0627 0.14 0.209 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 4.49e-01 0.0908 0.12 0.209 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 4.17e-01 -0.1 0.123 0.209 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0471 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0392 0.124 0.209 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 6.97e-01 0.0469 0.12 0.209 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 3.08e-01 -0.105 0.103 0.22 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 1.27e-01 0.168 0.11 0.22 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 8.04e-03 0.247 0.0922 0.22 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 5.54e-01 0.0436 0.0736 0.22 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -356638 sc-eQTL 1.79e-01 0.135 0.1 0.22 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -857445 sc-eQTL 3.84e-01 0.0919 0.105 0.22 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -954106 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0908 0.0998 0.22 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 5.05e-01 0.0667 0.0999 0.22 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0769 0.0981 0.213 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 8.60e-01 0.0185 0.105 0.213 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 8.96e-01 0.0112 0.0856 0.213 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 1.82e-01 -0.104 0.0774 0.213 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -356638 sc-eQTL 5.81e-01 0.0481 0.0871 0.213 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -857445 sc-eQTL 4.09e-01 0.0787 0.095 0.213 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -954106 sc-eQTL 6.91e-02 -0.172 0.0943 0.213 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 8.93e-01 0.0132 0.0986 0.213 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0647 0.114 0.209 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0946 0.125 0.209 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 1.53e-02 -0.25 0.102 0.209 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0224 0.0966 0.209 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -857445 sc-eQTL 1.10e-01 -0.187 0.116 0.209 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -954106 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0723 0.0908 0.209 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 7.24e-02 0.192 0.106 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0825 0.112 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 8.71e-01 0.0151 0.0929 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 1.76e-01 -0.111 0.082 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -171465 sc-eQTL 4.70e-01 0.0679 0.0938 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 4.07e-01 0.0489 0.0589 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0132 0.078 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0287 0.085 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 7.92e-01 0.0269 0.102 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0228 0.0805 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0943 0.0759 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -171465 sc-eQTL 5.43e-01 0.0447 0.0733 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0196 0.0516 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0031 0.0667 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 4.95e-01 0.0541 0.0792 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 4.27e-01 -0.066 0.0829 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0175 0.0941 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0597 0.0599 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 8.54e-01 -0.00971 0.0527 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -356638 sc-eQTL 1.41e-01 0.158 0.107 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -857445 sc-eQTL 9.18e-01 0.0114 0.111 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -954106 sc-eQTL 5.57e-02 -0.173 0.09 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 1.45e-01 0.124 0.0845 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 2.02e-01 -0.117 0.0912 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 7.58e-02 0.177 0.0995 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 4.78e-01 0.0583 0.082 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0504 0.0656 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -356638 sc-eQTL 9.82e-02 0.158 0.0953 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -857445 sc-eQTL 4.63e-01 0.073 0.0994 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -954106 sc-eQTL 1.34e-01 -0.141 0.0939 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 6.12e-01 0.0481 0.0945 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -744668 sc-eQTL 7.71e-01 0.0299 0.102 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -744862 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0981 0.0696 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -513871 sc-eQTL 5.45e-01 0.0464 0.0766 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -205654 sc-eQTL 2.33e-02 0.193 0.0846 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -166384 sc-eQTL 1.66e-01 -0.137 0.0984 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -179573 sc-eQTL 9.08e-01 0.00992 0.0853 0.22 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000060688 \N -744668 3.02e-07 1.42e-07 5.72e-08 2.05e-07 9.87e-08 8.21e-08 1.81e-07 5.75e-08 1.5e-07 6.4e-08 1.59e-07 1.08e-07 1.87e-07 7.64e-08 5.72e-08 7.89e-08 4.31e-08 1.56e-07 6.92e-08 4.92e-08 1.25e-07 1.31e-07 1.58e-07 2.68e-08 1.85e-07 1.26e-07 1.12e-07 1.04e-07 1.26e-07 1.05e-07 1.07e-07 3.03e-08 3.43e-08 8.89e-08 3.81e-08 3.05e-08 5.51e-08 8.63e-08 6.67e-08 4.08e-08 5.54e-08 1.52e-07 5.27e-08 1.1e-08 2.82e-08 1.77e-08 1.11e-07 1.89e-09 4.8e-08