logo

Genes within 1Mb (chr1:30549023:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0112 0.107 0.152 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 3.37e-02 0.181 0.0847 0.152 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 5.05e-01 0.048 0.0718 0.152 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -174562 sc-eQTL 8.99e-01 0.00964 0.0756 0.152 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 9.74e-01 0.00196 0.0592 0.152 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0332 0.0693 0.152 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 8.61e-01 0.0144 0.0821 0.152 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 1.95e-01 0.119 0.0915 0.152 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0326 0.0717 0.152 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 3.80e-01 0.0561 0.0638 0.152 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0574 0.0707 0.152 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0425 0.0633 0.152 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 3.70e-01 0.068 0.0757 0.152 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 4.20e-01 0.0968 0.12 0.152 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 6.41e-01 0.0373 0.0798 0.152 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0509 0.0702 0.152 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0275 0.0682 0.152 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0924 0.0797 0.152 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 9.41e-01 0.00744 0.101 0.152 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 5.57e-01 0.0631 0.107 0.155 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 2.23e-01 -0.155 0.127 0.155 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0815 0.0994 0.155 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0607 0.071 0.155 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -860542 sc-eQTL 6.02e-01 0.0611 0.117 0.155 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -957203 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0412 0.0776 0.155 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0768 0.112 0.155 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 9.83e-01 0.00182 0.0833 0.152 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0715 0.103 0.152 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0805 0.066 0.152 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 8.31e-01 0.013 0.0609 0.152 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -359735 sc-eQTL 4.99e-01 0.0791 0.117 0.152 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -860542 sc-eQTL 7.98e-01 0.0322 0.126 0.152 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -957203 sc-eQTL 5.74e-01 0.0623 0.111 0.152 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 6.08e-01 0.0496 0.0966 0.152 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 2.16e-01 0.141 0.114 0.152 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 4.89e-01 0.054 0.078 0.152 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00646 0.0819 0.152 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 6.54e-01 0.0422 0.0942 0.152 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 2.91e-01 0.112 0.106 0.152 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 2.48e-01 0.113 0.0975 0.152 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0388 0.0884 0.152 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 5.12e-01 0.062 0.0944 0.152 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 6.05e-01 0.044 0.085 0.152 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 8.08e-01 -0.017 0.0697 0.152 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 2.96e-01 -0.119 0.114 0.152 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 8.68e-01 0.0197 0.119 0.152 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 8.45e-01 -0.028 0.143 0.148 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0648 0.144 0.148 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 8.79e-02 0.229 0.133 0.148 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -174562 sc-eQTL 2.90e-01 -0.124 0.117 0.148 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0189 0.0819 0.148 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0793 0.132 0.148 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 7.04e-02 -0.211 0.116 0.148 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 7.45e-01 0.0429 0.132 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 1.25e-01 0.169 0.109 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0983 0.104 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -174562 sc-eQTL 2.40e-01 -0.127 0.108 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 5.63e-01 0.0384 0.0663 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 7.58e-01 0.0288 0.0931 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0594 0.104 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0269 0.128 0.151 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 2.31e-01 0.142 0.118 0.151 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 9.04e-02 0.174 0.102 0.151 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -174562 sc-eQTL 8.27e-01 0.0216 0.0985 0.151 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 1.15e-01 0.137 0.0868 0.151 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 1.45e-01 -0.145 0.0994 0.151 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 3.92e-01 -0.1 0.117 0.151 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0341 0.115 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 3.12e-02 0.213 0.0981 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00727 0.0875 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -174562 sc-eQTL 6.49e-01 0.0404 0.0887 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00739 0.0593 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0186 0.0779 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 8.02e-01 0.0241 0.0962 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0488 0.122 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 9.33e-01 0.00844 0.101 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 9.13e-01 0.0107 0.0988 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -174562 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0989 0.0946 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 8.42e-01 0.0129 0.0644 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 5.63e-01 0.0543 0.0937 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 2.29e-01 0.122 0.101 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0381 0.121 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 5.31e-01 0.0746 0.119 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 2.34e-01 0.139 0.116 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 6.43e-01 0.0483 0.104 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0878 0.114 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 6.18e-01 0.0502 0.1 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 1.18e-01 0.149 0.0948 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 8.51e-01 0.0158 0.0845 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 8.54e-01 0.0125 0.0675 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0665 0.0722 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0381 0.0733 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 2.06e-01 0.106 0.084 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 7.78e-01 0.0343 0.121 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0815 0.0978 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 3.35e-01 0.0835 0.0865 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0269 0.0719 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 1.88e-01 -0.12 0.0909 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0154 0.102 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 4.10e-01 0.0987 0.12 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00341 0.114 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0699 0.095 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 9.83e-01 0.00207 0.0962 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 1.13e-01 0.178 0.112 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 9.89e-01 0.00158 0.111 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 5.98e-02 0.241 0.127 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 5.33e-01 0.0615 0.0985 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0289 0.0957 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0423 0.106 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00668 0.111 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0231 0.105 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 6.12e-01 0.0601 0.118 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0388 0.102 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0738 0.082 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0109 0.0788 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0103 0.0983 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 4.71e-01 0.0772 0.107 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 2.19e-01 0.161 0.131 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 4.30e-01 -0.095 0.12 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 8.29e-01 0.0245 0.113 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 7.68e-01 0.0349 0.118 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 8.21e-01 0.0248 0.11 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 2.89e-01 -0.117 0.11 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 2.65e-01 -0.14 0.125 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 1.11e-02 0.303 0.118 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 2.10e-02 0.282 0.121 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 9.09e-01 0.0132 0.116 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 4.53e-01 0.0901 0.12 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0228 0.109 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0528 0.126 0.154 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 1.83e-01 0.149 0.111 0.154 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0268 0.107 0.154 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 6.71e-01 -0.043 0.101 0.154 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 1.65e-01 -0.156 0.112 0.154 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0572 0.116 0.154 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 7.81e-02 0.225 0.127 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 2.30e-01 -0.13 0.108 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0565 0.114 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 1.82e-01 0.15 0.112 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0512 0.113 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 5.82e-01 0.0613 0.111 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 2.49e-02 0.27 0.119 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 9.11e-01 0.01 0.0893 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0509 0.0915 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 9.74e-01 0.00318 0.0977 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 7.69e-01 0.036 0.122 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 7.75e-01 0.0289 0.101 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0491 0.129 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 3.59e-01 0.105 0.115 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 1.11e-01 0.178 0.111 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 3.20e-01 0.106 0.106 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 6.40e-01 0.0531 0.114 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 2.28e-01 0.132 0.109 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0149 0.119 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0475 0.0926 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000667 0.1 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 7.18e-01 0.0398 0.11 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 1.98e-01 0.15 0.116 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 4.91e-01 0.075 0.109 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 4.68e-01 0.113 0.155 0.141 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 7.31e-01 -0.062 0.18 0.141 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0283 0.157 0.141 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -174562 sc-eQTL 2.94e-01 -0.153 0.145 0.141 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0987 0.104 0.141 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 4.68e-01 0.104 0.142 0.141 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 3.15e-01 -0.153 0.151 0.141 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 2.07e-01 0.122 0.0961 0.152 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 4.85e-01 0.0854 0.122 0.152 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 7.14e-01 0.0419 0.114 0.152 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0878 0.0817 0.152 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0205 0.114 0.152 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0187 0.105 0.152 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 1.64e-01 -0.174 0.125 0.152 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0961 0.121 0.152 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 5.69e-01 0.0553 0.097 0.152 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 1.93e-01 0.145 0.111 0.152 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 7.68e-01 0.0334 0.113 0.152 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0288 0.113 0.152 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 4.88e-01 0.0853 0.123 0.161 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 5.38e-01 -0.082 0.133 0.161 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 5.56e-01 0.0674 0.114 0.161 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0406 0.0801 0.161 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -860542 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0989 0.103 0.161 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -957203 sc-eQTL 1.07e-01 0.162 0.1 0.161 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 3.24e-02 -0.232 0.107 0.161 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 3.37e-01 0.0959 0.0997 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0455 0.111 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 1.74e-01 -0.103 0.0751 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 8.05e-01 0.0164 0.0662 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -359735 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0384 0.125 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -860542 sc-eQTL 8.24e-01 0.0281 0.126 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -957203 sc-eQTL 6.20e-01 0.0554 0.112 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 7.43e-01 0.0341 0.104 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 7.35e-01 0.0353 0.104 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 8.41e-01 0.0247 0.123 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 6.53e-01 -0.04 0.0888 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00301 0.0683 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -359735 sc-eQTL 5.83e-01 0.0648 0.118 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -860542 sc-eQTL 6.46e-01 0.0574 0.125 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -957203 sc-eQTL 7.59e-01 0.0311 0.101 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 5.33e-01 0.0635 0.102 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 3.73e-01 -0.137 0.153 0.145 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 7.10e-01 0.0492 0.132 0.145 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 3.51e-01 0.127 0.136 0.145 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 6.75e-01 0.0621 0.148 0.145 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 4.91e-01 -0.094 0.136 0.145 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 6.10e-01 0.0676 0.132 0.145 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0468 0.116 0.156 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 4.12e-01 -0.103 0.125 0.156 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0299 0.106 0.156 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 1.70e-01 -0.114 0.0829 0.156 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -359735 sc-eQTL 3.61e-01 0.104 0.114 0.156 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -860542 sc-eQTL 2.35e-01 -0.142 0.119 0.156 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -957203 sc-eQTL 6.35e-01 0.0537 0.113 0.156 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 2.95e-01 -0.118 0.113 0.156 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 1.69e-01 -0.151 0.109 0.156 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0736 0.117 0.156 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 9.83e-01 0.002 0.0955 0.156 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0366 0.0867 0.156 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -359735 sc-eQTL 4.85e-02 0.191 0.0963 0.156 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -860542 sc-eQTL 1.75e-01 -0.144 0.106 0.156 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -957203 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0564 0.106 0.156 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 3.33e-01 0.107 0.11 0.156 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 6.41e-01 0.0582 0.125 0.167 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0858 0.137 0.167 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0843 0.113 0.167 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0855 0.105 0.167 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -860542 sc-eQTL 8.02e-01 0.0321 0.128 0.167 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -957203 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0906 0.0991 0.167 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 5.65e-01 0.0674 0.117 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 8.51e-01 0.0234 0.125 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 3.03e-01 0.107 0.104 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 6.70e-01 0.0392 0.0921 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -174562 sc-eQTL 2.48e-01 -0.121 0.105 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 5.99e-01 0.0348 0.0659 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0729 0.0871 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0816 0.095 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0761 0.112 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 1.00e-01 0.145 0.0881 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 9.67e-01 0.00348 0.0838 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -174562 sc-eQTL 7.25e-01 0.0284 0.0807 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0222 0.0568 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 8.37e-01 0.0151 0.0734 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 7.96e-01 0.0226 0.0872 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 5.55e-01 0.0558 0.0945 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 9.93e-01 0.00097 0.107 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 1.47e-01 -0.0989 0.068 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 8.58e-01 0.0107 0.06 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -359735 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0235 0.122 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -860542 sc-eQTL 8.09e-01 0.0305 0.126 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -957203 sc-eQTL 4.36e-01 0.0805 0.103 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 4.14e-01 0.079 0.0966 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 2.30e-01 -0.126 0.105 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 9.06e-02 -0.195 0.115 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0546 0.0944 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0616 0.0755 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -359735 sc-eQTL 2.74e-01 0.121 0.11 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -860542 sc-eQTL 2.50e-01 -0.132 0.114 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -957203 sc-eQTL 8.49e-01 0.0207 0.109 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0294 0.109 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -747765 sc-eQTL 2.67e-01 0.128 0.115 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -747959 sc-eQTL 5.96e-01 0.0416 0.0784 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -516968 sc-eQTL 9.60e-01 0.00429 0.086 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -208751 sc-eQTL 7.17e-01 0.0349 0.096 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -169481 sc-eQTL 3.43e-01 0.105 0.111 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -182670 sc-eQTL 2.76e-01 0.104 0.0954 0.153 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -516968 eQTL 0.0407 0.0372 0.0181 0.0 0.0 0.162

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina