logo

Genes within 1Mb (chr1:30544836:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 1.32e-01 0.142 0.0943 0.22 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0198 0.0759 0.22 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0649 0.0635 0.22 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -178749 sc-eQTL 6.92e-01 0.0266 0.0669 0.22 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 2.06e-01 0.0662 0.0522 0.22 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0428 0.0614 0.22 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 8.97e-01 0.00945 0.0727 0.22 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 6.80e-01 -0.033 0.08 0.22 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 1.51e-01 0.0897 0.0622 0.22 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 7.99e-01 0.0142 0.0557 0.22 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0597 0.0616 0.22 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 4.01e-02 0.113 0.0546 0.22 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 8.23e-01 0.0148 0.0661 0.22 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 3.13e-01 0.106 0.104 0.22 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 6.02e-01 0.0364 0.0697 0.22 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 2.83e-01 0.0658 0.0612 0.22 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 8.87e-01 -0.00851 0.0596 0.22 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00532 0.0698 0.22 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 1.86e-01 0.116 0.0874 0.22 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0591 0.0941 0.218 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 2.15e-01 0.138 0.111 0.218 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0964 0.0871 0.218 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0511 0.0623 0.218 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -864729 sc-eQTL 8.77e-02 -0.175 0.102 0.218 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -961390 sc-eQTL 1.60e-01 -0.0956 0.0678 0.218 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 1.50e-01 -0.142 0.0981 0.218 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0726 0.0727 0.22 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 6.37e-01 0.0427 0.0903 0.22 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 3.17e-01 -0.058 0.0578 0.22 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 7.08e-01 -0.02 0.0532 0.22 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -363922 sc-eQTL 6.74e-02 0.187 0.102 0.22 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -864729 sc-eQTL 8.43e-01 0.0218 0.11 0.22 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -961390 sc-eQTL 3.26e-02 -0.206 0.0957 0.22 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 1.12e-01 0.134 0.0841 0.22 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00564 0.102 0.221 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0792 0.0698 0.221 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 6.23e-01 0.0361 0.0734 0.221 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 2.50e-02 0.189 0.0836 0.221 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 1.84e-01 -0.126 0.0946 0.221 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 9.85e-01 0.00165 0.0877 0.221 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 5.32e-02 0.149 0.0767 0.22 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 7.92e-01 0.0219 0.0827 0.22 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0184 0.0744 0.22 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 6.94e-01 -0.024 0.0609 0.22 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 9.32e-01 0.00852 0.0998 0.22 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 7.48e-01 0.0334 0.104 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 1.98e-01 -0.156 0.121 0.224 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0716 0.122 0.224 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0511 0.113 0.224 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -178749 sc-eQTL 7.88e-01 0.0268 0.0992 0.224 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 3.94e-01 0.059 0.0691 0.224 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0506 0.112 0.224 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 2.01e-01 0.126 0.0984 0.224 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0285 0.118 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00211 0.0983 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 5.75e-01 -0.052 0.0927 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -178749 sc-eQTL 2.64e-01 0.108 0.0963 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 8.23e-01 0.0133 0.0593 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 8.91e-01 0.0114 0.0832 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 1.39e-01 -0.137 0.0926 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 3.19e-01 0.113 0.113 0.22 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 5.45e-01 0.0631 0.104 0.22 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0861 0.0903 0.22 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -178749 sc-eQTL 4.39e-02 -0.174 0.0858 0.22 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0267 0.0768 0.22 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0966 0.0876 0.22 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 3.24e-01 0.102 0.103 0.22 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 6.64e-01 0.0448 0.103 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0463 0.0888 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 7.45e-01 0.0255 0.0784 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -178749 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0143 0.0795 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 9.21e-01 0.00526 0.0531 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0277 0.0697 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 1.33e-01 0.129 0.0857 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 9.53e-01 0.00664 0.113 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 5.82e-01 0.0515 0.0933 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 1.49e-01 -0.132 0.0909 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -178749 sc-eQTL 2.32e-01 0.105 0.0874 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0463 0.0595 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0509 0.0867 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0252 0.0937 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0712 0.111 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0584 0.109 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 7.05e-02 -0.193 0.106 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 9.38e-01 0.00746 0.0953 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0044 0.104 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0301 0.092 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0409 0.0838 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 1.06e-01 0.12 0.0739 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 1.43e-01 0.0868 0.0591 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0142 0.0636 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 2.08e-02 0.148 0.0637 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0413 0.0741 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 6.89e-01 0.0419 0.105 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 2.72e-01 0.0927 0.0843 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0213 0.0748 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0495 0.062 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 4.35e-01 0.0615 0.0786 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 1.75e-01 0.119 0.0873 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 8.50e-01 0.02 0.106 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 4.22e-02 -0.204 0.0997 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0833 0.0837 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 5.23e-01 0.0542 0.0847 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 2.25e-01 0.12 0.0989 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0674 0.0977 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00322 0.114 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 8.46e-01 -0.017 0.0876 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 9.50e-01 0.00534 0.0851 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 5.96e-01 0.0499 0.0942 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 2.49e-01 0.114 0.0988 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 1.06e-01 0.15 0.0926 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 8.39e-01 0.0212 0.104 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 2.66e-01 0.0998 0.0896 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 8.21e-01 0.0163 0.0723 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 1.07e-01 -0.112 0.0688 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0496 0.0864 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 4.97e-01 0.064 0.094 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0186 0.117 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 7.66e-01 0.032 0.108 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 1.58e-02 0.243 0.0997 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 3.80e-01 0.093 0.106 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 4.66e-01 0.0716 0.0979 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 7.38e-01 0.0332 0.0991 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 5.11e-01 0.0742 0.113 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 5.80e-01 0.0599 0.108 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 3.18e-01 -0.11 0.11 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 7.14e-01 0.0382 0.104 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 2.17e-01 -0.133 0.108 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 1.34e-01 0.146 0.0972 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 1.29e-01 0.173 0.113 0.216 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 8.75e-01 0.0159 0.101 0.216 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 7.23e-01 0.0343 0.0969 0.216 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0238 0.0914 0.216 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0753 0.102 0.216 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 2.33e-01 0.125 0.105 0.216 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 1.21e-01 -0.179 0.115 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0161 0.0977 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0127 0.103 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 2.70e-01 0.112 0.101 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 4.85e-01 0.0711 0.102 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00639 0.1 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 9.90e-01 0.0013 0.107 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0894 0.079 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 6.49e-02 0.15 0.0806 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 2.09e-02 0.199 0.0856 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 7.17e-02 -0.195 0.108 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0198 0.0896 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0741 0.117 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 1.26e-01 0.16 0.104 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 1.84e-01 -0.135 0.102 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 2.90e-01 0.103 0.097 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 1.66e-01 -0.143 0.103 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 3.96e-01 0.085 0.0999 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0155 0.105 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0456 0.0816 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 9.04e-01 0.0106 0.0883 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 6.69e-03 0.262 0.0956 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 5.51e-01 0.0615 0.103 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 2.76e-01 0.104 0.0956 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 3.89e-01 0.108 0.125 0.207 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 4.23e-02 0.293 0.142 0.207 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0215 0.126 0.207 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -178749 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0158 0.118 0.207 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0541 0.0838 0.207 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 2.75e-01 -0.125 0.114 0.207 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00786 0.122 0.207 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 4.15e-01 0.0676 0.0828 0.222 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0521 0.105 0.222 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 2.09e-01 0.123 0.0978 0.222 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 2.94e-01 0.074 0.0703 0.222 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 6.60e-01 0.0433 0.0984 0.222 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 7.00e-01 0.0349 0.0905 0.222 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 1.28e-01 0.165 0.108 0.22 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 3.55e-01 0.0974 0.105 0.22 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0737 0.0841 0.22 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 4.68e-02 -0.191 0.0956 0.22 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0153 0.0983 0.22 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0151 0.0982 0.22 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0834 0.11 0.217 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 5.98e-01 0.0632 0.12 0.217 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00972 0.103 0.217 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 8.45e-01 0.0141 0.0721 0.217 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -864729 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0917 0.0923 0.217 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -961390 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0357 0.0909 0.217 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0743 0.0978 0.217 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0991 0.087 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0251 0.0973 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 3.63e-01 -0.06 0.0657 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 9.41e-01 0.00429 0.0578 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -363922 sc-eQTL 3.28e-02 0.231 0.108 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -864729 sc-eQTL 7.29e-01 0.0382 0.11 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -961390 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0641 0.0973 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 2.10e-01 0.114 0.0905 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0244 0.0917 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 7.87e-01 0.0293 0.108 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 9.72e-01 0.00279 0.0783 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0252 0.0602 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -363922 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0799 0.104 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -864729 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0385 0.11 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -961390 sc-eQTL 2.10e-03 -0.272 0.0874 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 2.55e-01 0.102 0.0895 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0627 0.14 0.209 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 4.49e-01 0.0908 0.12 0.209 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 4.17e-01 -0.1 0.123 0.209 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0471 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0392 0.124 0.209 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 6.97e-01 0.0469 0.12 0.209 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 3.08e-01 -0.105 0.103 0.22 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 1.27e-01 0.168 0.11 0.22 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 8.04e-03 0.247 0.0922 0.22 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 5.54e-01 0.0436 0.0736 0.22 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -363922 sc-eQTL 1.79e-01 0.135 0.1 0.22 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -864729 sc-eQTL 3.84e-01 0.0919 0.105 0.22 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -961390 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0908 0.0998 0.22 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 5.05e-01 0.0667 0.0999 0.22 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0769 0.0981 0.213 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 8.60e-01 0.0185 0.105 0.213 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 8.96e-01 0.0112 0.0856 0.213 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 1.82e-01 -0.104 0.0774 0.213 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -363922 sc-eQTL 5.81e-01 0.0481 0.0871 0.213 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -864729 sc-eQTL 4.09e-01 0.0787 0.095 0.213 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -961390 sc-eQTL 6.91e-02 -0.172 0.0943 0.213 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 8.93e-01 0.0132 0.0986 0.213 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0647 0.114 0.209 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0946 0.125 0.209 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 1.53e-02 -0.25 0.102 0.209 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0224 0.0966 0.209 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -864729 sc-eQTL 1.10e-01 -0.187 0.116 0.209 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -961390 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0723 0.0908 0.209 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 7.24e-02 0.192 0.106 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0825 0.112 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 8.71e-01 0.0151 0.0929 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 1.76e-01 -0.111 0.082 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -178749 sc-eQTL 4.70e-01 0.0679 0.0938 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 4.07e-01 0.0489 0.0589 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0132 0.078 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0287 0.085 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 7.92e-01 0.0269 0.102 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0228 0.0805 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0943 0.0759 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -178749 sc-eQTL 5.43e-01 0.0447 0.0733 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0196 0.0516 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0031 0.0667 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 4.95e-01 0.0541 0.0792 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 4.27e-01 -0.066 0.0829 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0175 0.0941 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0597 0.0599 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 8.54e-01 -0.00971 0.0527 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -363922 sc-eQTL 1.41e-01 0.158 0.107 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -864729 sc-eQTL 9.18e-01 0.0114 0.111 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -961390 sc-eQTL 5.57e-02 -0.173 0.09 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 1.45e-01 0.124 0.0845 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 2.02e-01 -0.117 0.0912 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 7.58e-02 0.177 0.0995 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 4.78e-01 0.0583 0.082 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0504 0.0656 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -363922 sc-eQTL 9.82e-02 0.158 0.0953 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -864729 sc-eQTL 4.63e-01 0.073 0.0994 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -961390 sc-eQTL 1.34e-01 -0.141 0.0939 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 6.12e-01 0.0481 0.0945 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -751952 sc-eQTL 7.71e-01 0.0299 0.102 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752146 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0981 0.0696 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -521155 sc-eQTL 5.45e-01 0.0464 0.0766 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -212938 sc-eQTL 2.33e-02 0.193 0.0846 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -173668 sc-eQTL 1.66e-01 -0.137 0.0984 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -186857 sc-eQTL 9.08e-01 0.00992 0.0853 0.22 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000060688 \N -751952 3.02e-07 1.33e-07 5.72e-08 2.05e-07 9.8e-08 8.21e-08 1.81e-07 5.85e-08 1.5e-07 6.75e-08 1.67e-07 1.2e-07 1.79e-07 7.95e-08 5.82e-08 7.97e-08 4.45e-08 1.51e-07 6.92e-08 4.95e-08 1.25e-07 1.26e-07 1.58e-07 3.22e-08 1.72e-07 1.22e-07 1.12e-07 1.06e-07 1.26e-07 1.05e-07 1.06e-07 3.84e-08 3.68e-08 8.89e-08 3.07e-08 2.68e-08 5.58e-08 8.68e-08 6.42e-08 5.13e-08 5.81e-08 1.5e-07 5.27e-08 1.34e-08 2.64e-08 1.8e-08 1e-07 1.96e-09 4.8e-08