logo

Genes within 1Mb (chr1:30544305:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00792 0.107 0.15 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 4.37e-02 0.173 0.0852 0.15 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 3.75e-01 0.064 0.072 0.15 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -179280 sc-eQTL 9.13e-01 0.00829 0.0759 0.15 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 8.57e-01 0.0107 0.0594 0.15 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0373 0.0696 0.15 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 9.12e-01 0.00913 0.0824 0.15 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 2.10e-01 0.115 0.0918 0.15 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0374 0.0719 0.15 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 3.55e-01 0.0593 0.064 0.15 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0643 0.0709 0.15 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0486 0.0634 0.15 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 5.57e-01 0.0447 0.076 0.15 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 4.01e-01 0.101 0.12 0.15 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 5.89e-01 0.0433 0.08 0.15 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0418 0.0704 0.15 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0364 0.0684 0.15 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 2.26e-01 -0.097 0.0799 0.15 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0114 0.101 0.15 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 5.98e-01 0.0568 0.108 0.153 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 2.55e-01 -0.145 0.127 0.153 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0751 0.0998 0.153 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 4.32e-01 -0.056 0.0712 0.153 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -865260 sc-eQTL 7.85e-01 0.0321 0.118 0.153 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -961921 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0343 0.0779 0.153 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0658 0.113 0.153 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000985 0.0835 0.15 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0724 0.103 0.15 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0683 0.0662 0.15 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 8.80e-01 0.00925 0.061 0.15 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -364453 sc-eQTL 4.47e-01 0.0893 0.117 0.15 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -865260 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0194 0.126 0.15 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -961921 sc-eQTL 6.86e-01 0.0449 0.111 0.15 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 7.01e-01 0.0373 0.0969 0.15 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 1.85e-01 0.152 0.114 0.15 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 4.55e-01 0.0586 0.0782 0.15 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000694 0.0822 0.15 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 6.35e-01 0.0449 0.0945 0.15 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 2.95e-01 0.111 0.106 0.15 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 3.14e-01 0.0987 0.0979 0.15 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0453 0.0886 0.15 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 5.77e-01 0.0529 0.0947 0.15 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 5.08e-01 0.0565 0.0852 0.15 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0353 0.0698 0.15 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 3.09e-01 -0.116 0.114 0.15 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 8.46e-01 0.0232 0.119 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0464 0.144 0.145 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0599 0.146 0.145 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 1.05e-01 0.219 0.134 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -179280 sc-eQTL 2.37e-01 -0.14 0.118 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 8.61e-01 0.0145 0.0825 0.145 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 3.93e-01 -0.114 0.133 0.145 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 1.06e-01 -0.19 0.117 0.145 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 7.40e-01 0.0441 0.132 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 1.31e-01 0.166 0.11 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 3.98e-01 -0.088 0.104 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -179280 sc-eQTL 2.64e-01 -0.121 0.108 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 4.73e-01 0.0478 0.0665 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 7.01e-01 0.0359 0.0934 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0733 0.104 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0107 0.129 0.149 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 1.89e-01 0.156 0.118 0.149 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 7.69e-02 0.182 0.102 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -179280 sc-eQTL 8.54e-01 0.0183 0.0988 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 1.28e-01 0.133 0.0871 0.149 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 1.73e-01 -0.136 0.0998 0.149 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 3.40e-01 -0.112 0.117 0.149 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0461 0.115 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 3.95e-02 0.204 0.0985 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 8.74e-01 0.014 0.0878 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -179280 sc-eQTL 6.83e-01 0.0365 0.0891 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 9.29e-01 0.00527 0.0595 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0299 0.0781 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 7.96e-01 0.025 0.0965 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0391 0.123 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0123 0.101 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 9.12e-01 0.0109 0.0992 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -179280 sc-eQTL 2.93e-01 -0.1 0.0949 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 7.65e-01 0.0194 0.0646 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 5.87e-01 0.0512 0.0941 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 2.06e-01 0.128 0.101 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0394 0.122 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 4.77e-01 0.0851 0.12 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 2.32e-01 0.14 0.117 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 7.40e-01 0.0348 0.105 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0907 0.114 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 6.81e-01 0.0416 0.101 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 1.17e-01 0.15 0.0951 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 9.11e-01 0.00953 0.0848 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 7.37e-01 0.0228 0.0677 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0678 0.0724 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 5.69e-01 -0.042 0.0735 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 2.47e-01 0.0978 0.0843 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 9.13e-01 0.0133 0.122 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0888 0.098 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 3.91e-01 0.0745 0.0868 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0388 0.0721 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 1.80e-01 -0.123 0.0911 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0349 0.102 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 4.27e-01 0.0955 0.12 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0116 0.115 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0737 0.0953 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 9.83e-01 -0.002 0.0965 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 1.19e-01 0.175 0.112 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00894 0.111 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 5.31e-02 0.249 0.128 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 5.04e-01 0.0661 0.0988 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0256 0.096 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 5.48e-01 -0.064 0.106 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0163 0.112 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0403 0.105 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 6.17e-01 0.0596 0.119 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0329 0.102 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0698 0.0823 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00864 0.079 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0167 0.0986 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 4.96e-01 0.0731 0.107 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 2.32e-01 0.157 0.131 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0786 0.121 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 7.27e-01 0.0397 0.114 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 7.86e-01 0.0322 0.119 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 9.19e-01 0.0113 0.11 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 2.30e-01 -0.133 0.111 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 3.11e-01 -0.128 0.125 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 8.52e-03 0.315 0.119 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 1.66e-02 0.294 0.122 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00519 0.116 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 4.94e-01 0.0824 0.12 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0313 0.109 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0445 0.127 0.152 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 2.02e-01 0.143 0.112 0.152 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0168 0.107 0.152 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0641 0.101 0.152 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 1.94e-01 -0.147 0.112 0.152 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 6.24e-01 -0.057 0.116 0.152 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 1.02e-01 0.21 0.128 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 2.47e-01 -0.126 0.108 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0734 0.114 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 1.61e-01 0.158 0.112 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0552 0.113 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 6.11e-01 0.0568 0.112 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 2.03e-02 0.28 0.12 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 7.85e-01 0.0245 0.0896 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0381 0.0919 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 9.43e-01 0.00707 0.098 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 6.99e-01 0.0476 0.123 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 8.52e-01 0.0189 0.101 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0468 0.129 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 3.48e-01 0.108 0.115 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 1.24e-01 0.172 0.112 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 3.07e-01 0.11 0.107 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 7.30e-01 0.0395 0.114 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 2.47e-01 0.128 0.11 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00387 0.119 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0513 0.0929 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 9.41e-01 0.00747 0.101 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 6.91e-01 0.044 0.111 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 1.51e-01 0.168 0.117 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 5.36e-01 0.0676 0.109 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 6.07e-01 0.0805 0.156 0.137 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0854 0.181 0.137 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00706 0.157 0.137 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -179280 sc-eQTL 3.31e-01 -0.143 0.146 0.137 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0926 0.104 0.137 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 5.85e-01 0.0785 0.143 0.137 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 3.76e-01 -0.135 0.152 0.137 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 2.43e-01 0.113 0.0964 0.15 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 4.90e-01 0.0848 0.123 0.15 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 7.15e-01 0.0419 0.115 0.15 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0941 0.0819 0.15 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00809 0.115 0.15 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00734 0.106 0.15 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 1.69e-01 -0.173 0.125 0.15 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 3.94e-01 -0.104 0.121 0.15 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 5.89e-01 0.0526 0.0973 0.15 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 1.77e-01 0.15 0.111 0.15 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 9.16e-01 0.012 0.114 0.15 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0283 0.113 0.15 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 4.81e-01 0.0868 0.123 0.159 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0685 0.133 0.159 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 5.44e-01 0.0695 0.114 0.159 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0288 0.0802 0.159 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -865260 sc-eQTL 2.11e-01 -0.129 0.103 0.159 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -961921 sc-eQTL 8.74e-02 0.173 0.1 0.159 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 5.12e-02 -0.212 0.108 0.159 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 3.34e-01 0.0967 0.0999 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 6.29e-01 -0.054 0.112 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0934 0.0753 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 9.21e-01 0.00656 0.0663 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -364453 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0188 0.125 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -865260 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0189 0.126 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -961921 sc-eQTL 6.96e-01 0.0437 0.112 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 8.90e-01 0.0145 0.104 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 7.53e-01 0.0329 0.104 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 7.02e-01 0.0472 0.123 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0281 0.089 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00406 0.0684 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -364453 sc-eQTL 5.54e-01 0.0699 0.118 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -865260 sc-eQTL 9.18e-01 0.013 0.125 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -961921 sc-eQTL 8.72e-01 0.0164 0.102 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 6.34e-01 0.0486 0.102 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 2.68e-01 -0.171 0.154 0.142 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 7.80e-01 0.0371 0.132 0.142 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 3.10e-01 0.139 0.136 0.142 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 7.81e-01 0.0413 0.148 0.142 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 3.42e-01 -0.13 0.137 0.142 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 6.98e-01 0.0516 0.133 0.142 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0587 0.117 0.153 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0831 0.125 0.153 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0153 0.106 0.153 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 1.81e-01 -0.112 0.083 0.153 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -364453 sc-eQTL 3.48e-01 0.107 0.114 0.153 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -865260 sc-eQTL 9.93e-02 -0.197 0.119 0.153 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -961921 sc-eQTL 6.38e-01 0.0534 0.113 0.153 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 2.07e-01 -0.143 0.113 0.153 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 1.74e-01 -0.149 0.109 0.154 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0891 0.117 0.154 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 9.66e-01 0.00403 0.0956 0.154 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0414 0.0868 0.154 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -364453 sc-eQTL 6.02e-02 0.182 0.0965 0.154 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -865260 sc-eQTL 8.93e-02 -0.18 0.105 0.154 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -961921 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0829 0.106 0.154 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 3.09e-01 0.112 0.11 0.154 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 8.74e-01 0.0199 0.125 0.164 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0887 0.137 0.164 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0776 0.114 0.164 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0969 0.106 0.164 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -865260 sc-eQTL 9.15e-01 0.0138 0.129 0.164 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -961921 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0811 0.0997 0.164 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 6.85e-01 0.0478 0.117 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 7.90e-01 0.0333 0.125 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 2.78e-01 0.113 0.104 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 5.85e-01 0.0505 0.0923 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -179280 sc-eQTL 2.69e-01 -0.116 0.105 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 5.33e-01 0.0413 0.0661 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0696 0.0874 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 3.09e-01 -0.097 0.0952 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0793 0.112 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 1.41e-01 0.131 0.0885 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 8.29e-01 0.0182 0.0842 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -179280 sc-eQTL 7.45e-01 0.0264 0.081 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0105 0.0571 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 9.17e-01 0.00766 0.0737 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 7.89e-01 0.0234 0.0875 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 5.51e-01 0.0565 0.0946 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 9.74e-01 0.00356 0.107 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0875 0.0682 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 9.35e-01 0.0049 0.0601 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -364453 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00482 0.123 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -865260 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0198 0.126 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -961921 sc-eQTL 5.23e-01 0.0662 0.103 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 5.20e-01 0.0623 0.0968 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 2.10e-01 -0.132 0.105 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 8.28e-02 -0.2 0.115 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0469 0.0946 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0641 0.0756 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -364453 sc-eQTL 2.86e-01 0.118 0.11 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -865260 sc-eQTL 1.09e-01 -0.184 0.114 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -961921 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00213 0.109 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 7.41e-01 -0.036 0.109 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -752483 sc-eQTL 2.25e-01 0.14 0.115 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -752677 sc-eQTL 5.46e-01 0.0475 0.0787 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -521686 sc-eQTL 8.90e-01 0.0119 0.0862 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -213469 sc-eQTL 6.96e-01 0.0377 0.0963 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174199 sc-eQTL 3.36e-01 0.107 0.111 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -187388 sc-eQTL 3.50e-01 0.0896 0.0957 0.151 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -521686 eQTL 0.043 0.037 0.0182 0.0 0.0 0.159

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina