logo

Genes within 1Mb (chr1:30543768:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00792 0.107 0.15 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 4.37e-02 0.173 0.0852 0.15 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 3.75e-01 0.064 0.072 0.15 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -179817 sc-eQTL 9.13e-01 0.00829 0.0759 0.15 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 8.57e-01 0.0107 0.0594 0.15 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0373 0.0696 0.15 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 9.12e-01 0.00913 0.0824 0.15 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 2.10e-01 0.115 0.0918 0.15 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0374 0.0719 0.15 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 3.55e-01 0.0593 0.064 0.15 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0643 0.0709 0.15 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0486 0.0634 0.15 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 5.57e-01 0.0447 0.076 0.15 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 4.01e-01 0.101 0.12 0.15 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 5.89e-01 0.0433 0.08 0.15 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0418 0.0704 0.15 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0364 0.0684 0.15 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 2.26e-01 -0.097 0.0799 0.15 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0114 0.101 0.15 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 5.98e-01 0.0568 0.108 0.153 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 2.55e-01 -0.145 0.127 0.153 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0751 0.0998 0.153 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 4.32e-01 -0.056 0.0712 0.153 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -865797 sc-eQTL 7.85e-01 0.0321 0.118 0.153 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -962458 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0343 0.0779 0.153 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0658 0.113 0.153 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000985 0.0835 0.15 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0724 0.103 0.15 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0683 0.0662 0.15 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 8.80e-01 0.00925 0.061 0.15 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -364990 sc-eQTL 4.47e-01 0.0893 0.117 0.15 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -865797 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0194 0.126 0.15 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -962458 sc-eQTL 6.86e-01 0.0449 0.111 0.15 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 7.01e-01 0.0373 0.0969 0.15 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 1.85e-01 0.152 0.114 0.15 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 4.55e-01 0.0586 0.0782 0.15 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000694 0.0822 0.15 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 6.35e-01 0.0449 0.0945 0.15 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 2.95e-01 0.111 0.106 0.15 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 3.14e-01 0.0987 0.0979 0.15 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0453 0.0886 0.15 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 5.77e-01 0.0529 0.0947 0.15 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 5.08e-01 0.0565 0.0852 0.15 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0353 0.0698 0.15 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 3.09e-01 -0.116 0.114 0.15 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 8.46e-01 0.0232 0.119 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0464 0.144 0.145 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0599 0.146 0.145 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 1.05e-01 0.219 0.134 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -179817 sc-eQTL 2.37e-01 -0.14 0.118 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 8.61e-01 0.0145 0.0825 0.145 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 3.93e-01 -0.114 0.133 0.145 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 1.06e-01 -0.19 0.117 0.145 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 7.40e-01 0.0441 0.132 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 1.31e-01 0.166 0.11 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 3.98e-01 -0.088 0.104 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -179817 sc-eQTL 2.64e-01 -0.121 0.108 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 4.73e-01 0.0478 0.0665 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 7.01e-01 0.0359 0.0934 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0733 0.104 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0107 0.129 0.149 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 1.89e-01 0.156 0.118 0.149 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 7.69e-02 0.182 0.102 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -179817 sc-eQTL 8.54e-01 0.0183 0.0988 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 1.28e-01 0.133 0.0871 0.149 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 1.73e-01 -0.136 0.0998 0.149 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 3.40e-01 -0.112 0.117 0.149 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0461 0.115 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 3.95e-02 0.204 0.0985 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 8.74e-01 0.014 0.0878 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -179817 sc-eQTL 6.83e-01 0.0365 0.0891 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 9.29e-01 0.00527 0.0595 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0299 0.0781 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 7.96e-01 0.025 0.0965 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0391 0.123 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0123 0.101 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 9.12e-01 0.0109 0.0992 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -179817 sc-eQTL 2.93e-01 -0.1 0.0949 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 7.65e-01 0.0194 0.0646 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 5.87e-01 0.0512 0.0941 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 2.06e-01 0.128 0.101 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0394 0.122 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 4.77e-01 0.0851 0.12 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 2.32e-01 0.14 0.117 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 7.40e-01 0.0348 0.105 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0907 0.114 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 6.81e-01 0.0416 0.101 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 1.17e-01 0.15 0.0951 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 9.11e-01 0.00953 0.0848 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 7.37e-01 0.0228 0.0677 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0678 0.0724 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 5.69e-01 -0.042 0.0735 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 2.47e-01 0.0978 0.0843 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 9.13e-01 0.0133 0.122 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0888 0.098 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 3.91e-01 0.0745 0.0868 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0388 0.0721 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 1.80e-01 -0.123 0.0911 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0349 0.102 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 4.27e-01 0.0955 0.12 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0116 0.115 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0737 0.0953 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 9.83e-01 -0.002 0.0965 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 1.19e-01 0.175 0.112 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00894 0.111 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 5.31e-02 0.249 0.128 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 5.04e-01 0.0661 0.0988 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0256 0.096 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 5.48e-01 -0.064 0.106 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0163 0.112 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0403 0.105 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 6.17e-01 0.0596 0.119 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0329 0.102 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0698 0.0823 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00864 0.079 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0167 0.0986 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 4.96e-01 0.0731 0.107 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 2.32e-01 0.157 0.131 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0786 0.121 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 7.27e-01 0.0397 0.114 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 7.86e-01 0.0322 0.119 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 9.19e-01 0.0113 0.11 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 2.30e-01 -0.133 0.111 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 3.11e-01 -0.128 0.125 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 8.52e-03 0.315 0.119 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 1.66e-02 0.294 0.122 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00519 0.116 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 4.94e-01 0.0824 0.12 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0313 0.109 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0445 0.127 0.152 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 2.02e-01 0.143 0.112 0.152 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0168 0.107 0.152 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0641 0.101 0.152 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 1.94e-01 -0.147 0.112 0.152 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 6.24e-01 -0.057 0.116 0.152 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 1.02e-01 0.21 0.128 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 2.47e-01 -0.126 0.108 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0734 0.114 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 1.61e-01 0.158 0.112 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0552 0.113 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 6.11e-01 0.0568 0.112 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 2.03e-02 0.28 0.12 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 7.85e-01 0.0245 0.0896 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0381 0.0919 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 9.43e-01 0.00707 0.098 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 6.99e-01 0.0476 0.123 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 8.52e-01 0.0189 0.101 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0468 0.129 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 3.48e-01 0.108 0.115 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 1.24e-01 0.172 0.112 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 3.07e-01 0.11 0.107 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 7.30e-01 0.0395 0.114 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 2.47e-01 0.128 0.11 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00387 0.119 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0513 0.0929 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 9.41e-01 0.00747 0.101 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 6.91e-01 0.044 0.111 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 1.51e-01 0.168 0.117 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 5.36e-01 0.0676 0.109 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 6.07e-01 0.0805 0.156 0.137 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0854 0.181 0.137 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00706 0.157 0.137 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -179817 sc-eQTL 3.31e-01 -0.143 0.146 0.137 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0926 0.104 0.137 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 5.85e-01 0.0785 0.143 0.137 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 3.76e-01 -0.135 0.152 0.137 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 2.43e-01 0.113 0.0964 0.15 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 4.90e-01 0.0848 0.123 0.15 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 7.15e-01 0.0419 0.115 0.15 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0941 0.0819 0.15 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00809 0.115 0.15 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00734 0.106 0.15 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 1.69e-01 -0.173 0.125 0.15 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 3.94e-01 -0.104 0.121 0.15 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 5.89e-01 0.0526 0.0973 0.15 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 1.77e-01 0.15 0.111 0.15 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 9.16e-01 0.012 0.114 0.15 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0283 0.113 0.15 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 4.81e-01 0.0868 0.123 0.159 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0685 0.133 0.159 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 5.44e-01 0.0695 0.114 0.159 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0288 0.0802 0.159 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -865797 sc-eQTL 2.11e-01 -0.129 0.103 0.159 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -962458 sc-eQTL 8.74e-02 0.173 0.1 0.159 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 5.12e-02 -0.212 0.108 0.159 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 3.34e-01 0.0967 0.0999 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 6.29e-01 -0.054 0.112 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0934 0.0753 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 9.21e-01 0.00656 0.0663 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -364990 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0188 0.125 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -865797 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0189 0.126 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -962458 sc-eQTL 6.96e-01 0.0437 0.112 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 8.90e-01 0.0145 0.104 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 7.53e-01 0.0329 0.104 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 7.02e-01 0.0472 0.123 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0281 0.089 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00406 0.0684 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -364990 sc-eQTL 5.54e-01 0.0699 0.118 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -865797 sc-eQTL 9.18e-01 0.013 0.125 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -962458 sc-eQTL 8.72e-01 0.0164 0.102 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 6.34e-01 0.0486 0.102 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 2.68e-01 -0.171 0.154 0.142 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 7.80e-01 0.0371 0.132 0.142 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 3.10e-01 0.139 0.136 0.142 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 7.81e-01 0.0413 0.148 0.142 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 3.42e-01 -0.13 0.137 0.142 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 6.98e-01 0.0516 0.133 0.142 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0587 0.117 0.153 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0831 0.125 0.153 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0153 0.106 0.153 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 1.81e-01 -0.112 0.083 0.153 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -364990 sc-eQTL 3.48e-01 0.107 0.114 0.153 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -865797 sc-eQTL 9.93e-02 -0.197 0.119 0.153 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -962458 sc-eQTL 6.38e-01 0.0534 0.113 0.153 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 2.07e-01 -0.143 0.113 0.153 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 1.74e-01 -0.149 0.109 0.154 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0891 0.117 0.154 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 9.66e-01 0.00403 0.0956 0.154 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0414 0.0868 0.154 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -364990 sc-eQTL 6.02e-02 0.182 0.0965 0.154 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -865797 sc-eQTL 8.93e-02 -0.18 0.105 0.154 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -962458 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0829 0.106 0.154 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 3.09e-01 0.112 0.11 0.154 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 8.74e-01 0.0199 0.125 0.164 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0887 0.137 0.164 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0776 0.114 0.164 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0969 0.106 0.164 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -865797 sc-eQTL 9.15e-01 0.0138 0.129 0.164 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -962458 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0811 0.0997 0.164 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 6.85e-01 0.0478 0.117 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 7.90e-01 0.0333 0.125 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 2.78e-01 0.113 0.104 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 5.85e-01 0.0505 0.0923 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -179817 sc-eQTL 2.69e-01 -0.116 0.105 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 5.33e-01 0.0413 0.0661 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0696 0.0874 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 3.09e-01 -0.097 0.0952 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0793 0.112 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 1.41e-01 0.131 0.0885 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 8.29e-01 0.0182 0.0842 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -179817 sc-eQTL 7.45e-01 0.0264 0.081 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0105 0.0571 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 9.17e-01 0.00766 0.0737 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 7.89e-01 0.0234 0.0875 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 5.51e-01 0.0565 0.0946 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 9.74e-01 0.00356 0.107 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0875 0.0682 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 9.35e-01 0.0049 0.0601 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -364990 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00482 0.123 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -865797 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0198 0.126 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -962458 sc-eQTL 5.23e-01 0.0662 0.103 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 5.20e-01 0.0623 0.0968 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 2.10e-01 -0.132 0.105 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 8.28e-02 -0.2 0.115 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0469 0.0946 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0641 0.0756 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -364990 sc-eQTL 2.86e-01 0.118 0.11 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -865797 sc-eQTL 1.09e-01 -0.184 0.114 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -962458 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00213 0.109 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 7.41e-01 -0.036 0.109 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -753020 sc-eQTL 2.25e-01 0.14 0.115 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -753214 sc-eQTL 5.46e-01 0.0475 0.0787 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -522223 sc-eQTL 8.90e-01 0.0119 0.0862 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -214006 sc-eQTL 6.96e-01 0.0377 0.0963 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -174736 sc-eQTL 3.36e-01 0.107 0.111 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -187925 sc-eQTL 3.50e-01 0.0896 0.0957 0.151 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -522223 eQTL 0.0436 0.0368 0.0182 0.0 0.0 0.16

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina