logo

Genes within 1Mb (chr1:30542422:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00792 0.107 0.15 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 4.37e-02 0.173 0.0852 0.15 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 3.75e-01 0.064 0.072 0.15 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -181163 sc-eQTL 9.13e-01 0.00829 0.0759 0.15 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 8.57e-01 0.0107 0.0594 0.15 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0373 0.0696 0.15 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 9.12e-01 0.00913 0.0824 0.15 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 2.10e-01 0.115 0.0918 0.15 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0374 0.0719 0.15 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 3.55e-01 0.0593 0.064 0.15 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0643 0.0709 0.15 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0486 0.0634 0.15 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 5.57e-01 0.0447 0.076 0.15 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 4.01e-01 0.101 0.12 0.15 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 5.89e-01 0.0433 0.08 0.15 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0418 0.0704 0.15 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0364 0.0684 0.15 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 2.26e-01 -0.097 0.0799 0.15 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0114 0.101 0.15 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 5.98e-01 0.0568 0.108 0.153 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 2.55e-01 -0.145 0.127 0.153 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0751 0.0998 0.153 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 4.32e-01 -0.056 0.0712 0.153 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -867143 sc-eQTL 7.85e-01 0.0321 0.118 0.153 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -963804 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0343 0.0779 0.153 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0658 0.113 0.153 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000985 0.0835 0.15 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0724 0.103 0.15 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0683 0.0662 0.15 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 8.80e-01 0.00925 0.061 0.15 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -366336 sc-eQTL 4.47e-01 0.0893 0.117 0.15 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -867143 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0194 0.126 0.15 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -963804 sc-eQTL 6.86e-01 0.0449 0.111 0.15 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 7.01e-01 0.0373 0.0969 0.15 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 1.85e-01 0.152 0.114 0.15 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 4.55e-01 0.0586 0.0782 0.15 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000694 0.0822 0.15 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 6.35e-01 0.0449 0.0945 0.15 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 2.95e-01 0.111 0.106 0.15 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 3.14e-01 0.0987 0.0979 0.15 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0453 0.0886 0.15 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 5.77e-01 0.0529 0.0947 0.15 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 5.08e-01 0.0565 0.0852 0.15 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0353 0.0698 0.15 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 3.09e-01 -0.116 0.114 0.15 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 8.46e-01 0.0232 0.119 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0464 0.144 0.145 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0599 0.146 0.145 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 1.05e-01 0.219 0.134 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -181163 sc-eQTL 2.37e-01 -0.14 0.118 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 8.61e-01 0.0145 0.0825 0.145 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 3.93e-01 -0.114 0.133 0.145 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 1.06e-01 -0.19 0.117 0.145 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 7.40e-01 0.0441 0.132 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 1.31e-01 0.166 0.11 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 3.98e-01 -0.088 0.104 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -181163 sc-eQTL 2.64e-01 -0.121 0.108 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 4.73e-01 0.0478 0.0665 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 7.01e-01 0.0359 0.0934 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0733 0.104 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0107 0.129 0.149 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 1.89e-01 0.156 0.118 0.149 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 7.69e-02 0.182 0.102 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -181163 sc-eQTL 8.54e-01 0.0183 0.0988 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 1.28e-01 0.133 0.0871 0.149 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 1.73e-01 -0.136 0.0998 0.149 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 3.40e-01 -0.112 0.117 0.149 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0461 0.115 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 3.95e-02 0.204 0.0985 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 8.74e-01 0.014 0.0878 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -181163 sc-eQTL 6.83e-01 0.0365 0.0891 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 9.29e-01 0.00527 0.0595 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0299 0.0781 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 7.96e-01 0.025 0.0965 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0391 0.123 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0123 0.101 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 9.12e-01 0.0109 0.0992 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -181163 sc-eQTL 2.93e-01 -0.1 0.0949 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 7.65e-01 0.0194 0.0646 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 5.87e-01 0.0512 0.0941 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 2.06e-01 0.128 0.101 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0394 0.122 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 4.77e-01 0.0851 0.12 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 2.32e-01 0.14 0.117 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 7.40e-01 0.0348 0.105 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0907 0.114 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 6.81e-01 0.0416 0.101 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 1.17e-01 0.15 0.0951 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 9.11e-01 0.00953 0.0848 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 7.37e-01 0.0228 0.0677 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0678 0.0724 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 5.69e-01 -0.042 0.0735 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 2.47e-01 0.0978 0.0843 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 9.13e-01 0.0133 0.122 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0888 0.098 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 3.91e-01 0.0745 0.0868 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0388 0.0721 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 1.80e-01 -0.123 0.0911 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0349 0.102 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 4.27e-01 0.0955 0.12 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0116 0.115 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0737 0.0953 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 9.83e-01 -0.002 0.0965 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 1.19e-01 0.175 0.112 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00894 0.111 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 5.31e-02 0.249 0.128 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 5.04e-01 0.0661 0.0988 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0256 0.096 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 5.48e-01 -0.064 0.106 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0163 0.112 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0403 0.105 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 6.17e-01 0.0596 0.119 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0329 0.102 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0698 0.0823 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00864 0.079 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0167 0.0986 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 4.96e-01 0.0731 0.107 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 2.32e-01 0.157 0.131 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0786 0.121 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 7.27e-01 0.0397 0.114 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 7.86e-01 0.0322 0.119 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 9.19e-01 0.0113 0.11 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 2.30e-01 -0.133 0.111 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 3.11e-01 -0.128 0.125 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 8.52e-03 0.315 0.119 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 1.66e-02 0.294 0.122 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00519 0.116 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 4.94e-01 0.0824 0.12 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0313 0.109 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0445 0.127 0.152 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 2.02e-01 0.143 0.112 0.152 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0168 0.107 0.152 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0641 0.101 0.152 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 1.94e-01 -0.147 0.112 0.152 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 6.24e-01 -0.057 0.116 0.152 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 1.02e-01 0.21 0.128 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 2.47e-01 -0.126 0.108 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0734 0.114 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 1.61e-01 0.158 0.112 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0552 0.113 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 6.11e-01 0.0568 0.112 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 2.03e-02 0.28 0.12 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 7.85e-01 0.0245 0.0896 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0381 0.0919 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 9.43e-01 0.00707 0.098 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 6.99e-01 0.0476 0.123 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 8.52e-01 0.0189 0.101 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0468 0.129 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 3.48e-01 0.108 0.115 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 1.24e-01 0.172 0.112 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 3.07e-01 0.11 0.107 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 7.30e-01 0.0395 0.114 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 2.47e-01 0.128 0.11 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00387 0.119 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0513 0.0929 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 9.41e-01 0.00747 0.101 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 6.91e-01 0.044 0.111 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 1.51e-01 0.168 0.117 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 5.36e-01 0.0676 0.109 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 6.07e-01 0.0805 0.156 0.137 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0854 0.181 0.137 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00706 0.157 0.137 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -181163 sc-eQTL 3.31e-01 -0.143 0.146 0.137 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0926 0.104 0.137 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 5.85e-01 0.0785 0.143 0.137 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 3.76e-01 -0.135 0.152 0.137 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 2.43e-01 0.113 0.0964 0.15 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 4.90e-01 0.0848 0.123 0.15 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 7.15e-01 0.0419 0.115 0.15 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0941 0.0819 0.15 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00809 0.115 0.15 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00734 0.106 0.15 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 1.69e-01 -0.173 0.125 0.15 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 3.94e-01 -0.104 0.121 0.15 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 5.89e-01 0.0526 0.0973 0.15 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 1.77e-01 0.15 0.111 0.15 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 9.16e-01 0.012 0.114 0.15 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0283 0.113 0.15 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 4.81e-01 0.0868 0.123 0.159 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0685 0.133 0.159 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 5.44e-01 0.0695 0.114 0.159 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0288 0.0802 0.159 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -867143 sc-eQTL 2.11e-01 -0.129 0.103 0.159 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -963804 sc-eQTL 8.74e-02 0.173 0.1 0.159 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 5.12e-02 -0.212 0.108 0.159 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 3.34e-01 0.0967 0.0999 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 6.29e-01 -0.054 0.112 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0934 0.0753 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 9.21e-01 0.00656 0.0663 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -366336 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0188 0.125 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -867143 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0189 0.126 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -963804 sc-eQTL 6.96e-01 0.0437 0.112 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 8.90e-01 0.0145 0.104 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 7.53e-01 0.0329 0.104 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 7.02e-01 0.0472 0.123 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0281 0.089 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00406 0.0684 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -366336 sc-eQTL 5.54e-01 0.0699 0.118 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -867143 sc-eQTL 9.18e-01 0.013 0.125 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -963804 sc-eQTL 8.72e-01 0.0164 0.102 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 6.34e-01 0.0486 0.102 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 2.68e-01 -0.171 0.154 0.142 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 7.80e-01 0.0371 0.132 0.142 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 3.10e-01 0.139 0.136 0.142 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 7.81e-01 0.0413 0.148 0.142 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 3.42e-01 -0.13 0.137 0.142 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 6.98e-01 0.0516 0.133 0.142 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0587 0.117 0.153 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0831 0.125 0.153 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0153 0.106 0.153 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 1.81e-01 -0.112 0.083 0.153 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -366336 sc-eQTL 3.48e-01 0.107 0.114 0.153 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -867143 sc-eQTL 9.93e-02 -0.197 0.119 0.153 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -963804 sc-eQTL 6.38e-01 0.0534 0.113 0.153 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 2.07e-01 -0.143 0.113 0.153 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 1.74e-01 -0.149 0.109 0.154 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0891 0.117 0.154 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 9.66e-01 0.00403 0.0956 0.154 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0414 0.0868 0.154 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -366336 sc-eQTL 6.02e-02 0.182 0.0965 0.154 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -867143 sc-eQTL 8.93e-02 -0.18 0.105 0.154 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -963804 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0829 0.106 0.154 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 3.09e-01 0.112 0.11 0.154 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 8.74e-01 0.0199 0.125 0.164 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0887 0.137 0.164 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0776 0.114 0.164 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0969 0.106 0.164 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -867143 sc-eQTL 9.15e-01 0.0138 0.129 0.164 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -963804 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0811 0.0997 0.164 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 6.85e-01 0.0478 0.117 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 7.90e-01 0.0333 0.125 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 2.78e-01 0.113 0.104 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 5.85e-01 0.0505 0.0923 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -181163 sc-eQTL 2.69e-01 -0.116 0.105 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 5.33e-01 0.0413 0.0661 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0696 0.0874 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 3.09e-01 -0.097 0.0952 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0793 0.112 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 1.41e-01 0.131 0.0885 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 8.29e-01 0.0182 0.0842 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -181163 sc-eQTL 7.45e-01 0.0264 0.081 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0105 0.0571 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 9.17e-01 0.00766 0.0737 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 7.89e-01 0.0234 0.0875 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 5.51e-01 0.0565 0.0946 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 9.74e-01 0.00356 0.107 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0875 0.0682 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 9.35e-01 0.0049 0.0601 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -366336 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00482 0.123 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -867143 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0198 0.126 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -963804 sc-eQTL 5.23e-01 0.0662 0.103 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 5.20e-01 0.0623 0.0968 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 2.10e-01 -0.132 0.105 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 8.28e-02 -0.2 0.115 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0469 0.0946 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0641 0.0756 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -366336 sc-eQTL 2.86e-01 0.118 0.11 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -867143 sc-eQTL 1.09e-01 -0.184 0.114 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -963804 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00213 0.109 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 7.41e-01 -0.036 0.109 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -754366 sc-eQTL 2.25e-01 0.14 0.115 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -754560 sc-eQTL 5.46e-01 0.0475 0.0787 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -523569 sc-eQTL 8.90e-01 0.0119 0.0862 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -215352 sc-eQTL 6.96e-01 0.0377 0.0963 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -176082 sc-eQTL 3.36e-01 0.107 0.111 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -189271 sc-eQTL 3.50e-01 0.0896 0.0957 0.151 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -523569 eQTL 0.0479 0.0363 0.0183 0.0 0.0 0.159

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina