logo

Genes within 1Mb (chr1:30535247:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 8.61e-01 0.0198 0.113 0.124 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 3.13e-02 0.194 0.0897 0.124 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 7.68e-01 0.0225 0.0761 0.124 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -188338 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0066 0.08 0.124 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 7.37e-01 0.021 0.0626 0.124 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000815 0.0734 0.124 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 8.93e-01 0.0117 0.0869 0.124 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 3.13e-01 0.0986 0.0975 0.124 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0865 0.0761 0.124 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 7.83e-01 0.0187 0.068 0.124 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0926 0.0751 0.124 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0777 0.0672 0.124 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0322 0.0807 0.124 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 5.54e-01 0.0758 0.128 0.124 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 2.31e-01 0.102 0.0849 0.124 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 4.24e-01 -0.06 0.0749 0.124 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 5.46e-01 -0.044 0.0728 0.124 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0713 0.0852 0.124 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0254 0.107 0.124 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00248 0.115 0.126 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 2.57e-01 -0.154 0.136 0.126 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 9.03e-01 -0.013 0.107 0.126 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00436 0.0761 0.126 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -874318 sc-eQTL 8.36e-01 -0.026 0.126 0.126 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -970979 sc-eQTL 9.54e-01 0.00482 0.0832 0.126 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 9.33e-01 0.0102 0.12 0.126 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 9.63e-01 0.0041 0.0889 0.124 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 3.48e-01 -0.103 0.11 0.124 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0802 0.0705 0.124 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 6.86e-01 0.0263 0.065 0.124 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -373511 sc-eQTL 8.56e-01 0.0226 0.125 0.124 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -874318 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000352 0.134 0.124 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -970979 sc-eQTL 6.22e-01 0.0582 0.118 0.124 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 7.13e-01 0.038 0.103 0.124 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 4.08e-01 0.101 0.122 0.124 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 2.12e-01 0.104 0.0831 0.124 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 9.19e-01 0.00896 0.0875 0.124 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 6.83e-01 0.0412 0.101 0.124 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 3.50e-01 0.106 0.113 0.124 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 2.00e-01 0.134 0.104 0.124 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0613 0.0938 0.124 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 3.10e-01 0.102 0.1 0.124 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 4.13e-01 0.0738 0.0901 0.124 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0479 0.0739 0.124 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0521 0.121 0.124 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0352 0.126 0.124 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 8.82e-01 0.0233 0.157 0.117 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 9.05e-01 0.0188 0.158 0.117 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 5.80e-01 0.0813 0.147 0.117 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -188338 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0236 0.128 0.117 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 9.16e-01 0.00941 0.0895 0.117 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0361 0.145 0.117 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 4.19e-02 -0.259 0.126 0.117 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 7.38e-01 0.0471 0.141 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 1.61e-01 0.164 0.117 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0575 0.11 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -188338 sc-eQTL 3.70e-01 -0.103 0.115 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 3.13e-01 0.0712 0.0704 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 3.57e-01 0.0913 0.0989 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0662 0.111 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 6.66e-01 -0.059 0.136 0.123 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 2.00e-01 0.161 0.125 0.123 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 9.11e-02 0.185 0.109 0.123 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -188338 sc-eQTL 2.94e-01 -0.11 0.104 0.123 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 9.77e-02 0.153 0.0922 0.123 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 2.61e-01 -0.119 0.106 0.123 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0358 0.124 0.123 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00959 0.123 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 1.81e-02 0.249 0.105 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0239 0.0935 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -188338 sc-eQTL 9.76e-01 0.00287 0.0949 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00646 0.0634 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00275 0.0832 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 6.19e-01 0.0512 0.103 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0303 0.13 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0184 0.107 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00707 0.105 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -188338 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0865 0.101 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 6.59e-01 0.0302 0.0685 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 3.17e-01 0.0997 0.0995 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 4.21e-01 0.0868 0.108 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 8.03e-01 0.0325 0.13 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0357 0.127 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 3.43e-01 0.119 0.125 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 7.25e-01 0.0393 0.111 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 3.42e-01 -0.116 0.122 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 9.68e-01 0.00429 0.108 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 2.79e-01 0.11 0.101 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00572 0.0901 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 8.24e-01 0.016 0.072 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0922 0.0768 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0704 0.0781 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 8.41e-01 0.0181 0.0899 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 9.64e-01 0.00585 0.128 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 1.29e-01 -0.157 0.103 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 9.25e-01 0.00859 0.0916 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0284 0.0759 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 1.82e-01 -0.129 0.096 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 2.89e-01 -0.114 0.107 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 4.11e-01 0.105 0.128 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00175 0.122 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 1.44e-01 -0.148 0.101 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 8.24e-01 0.0228 0.103 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 3.67e-01 0.108 0.12 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0663 0.118 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 1.83e-01 0.183 0.137 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 1.20e-01 0.164 0.105 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 7.78e-01 -0.029 0.103 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0549 0.114 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 4.92e-01 0.0821 0.119 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0299 0.112 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 5.56e-01 0.0744 0.126 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 9.77e-01 0.00309 0.109 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0933 0.0875 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0428 0.084 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 9.19e-01 0.0107 0.105 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 5.25e-01 0.0727 0.114 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 2.93e-01 0.148 0.141 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0357 0.129 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0445 0.122 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0395 0.127 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0399 0.118 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 1.25e-01 -0.183 0.118 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 3.95e-01 -0.114 0.134 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 2.66e-03 0.383 0.126 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 4.43e-02 0.264 0.13 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 7.59e-01 0.0381 0.124 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00241 0.129 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 1.91e-01 -0.152 0.116 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0902 0.136 0.126 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 1.79e-01 0.161 0.12 0.126 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 9.27e-01 0.0106 0.115 0.126 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0878 0.109 0.126 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 3.11e-01 -0.123 0.121 0.126 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0907 0.125 0.126 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 3.73e-01 0.122 0.137 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0103 0.116 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 3.42e-01 -0.115 0.121 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 5.10e-01 0.079 0.12 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0332 0.12 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 9.42e-01 0.00864 0.119 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 1.18e-01 0.202 0.129 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 4.66e-01 0.0699 0.0957 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0118 0.0983 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 7.97e-01 0.027 0.105 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0117 0.131 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 5.99e-01 0.057 0.108 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0886 0.137 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 4.02e-01 0.102 0.122 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 4.77e-01 0.0848 0.119 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 3.70e-01 0.102 0.113 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 4.29e-01 0.0956 0.121 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 2.17e-01 0.144 0.116 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 7.47e-01 0.0408 0.126 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 8.00e-01 0.0251 0.0985 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00104 0.107 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 6.19e-01 0.0583 0.117 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 1.41e-01 0.183 0.124 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 5.34e-01 0.072 0.116 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 7.67e-01 0.0472 0.159 0.119 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 7.89e-01 0.0496 0.184 0.119 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 3.47e-01 -0.151 0.16 0.119 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -188338 sc-eQTL 2.38e-01 -0.176 0.148 0.119 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 2.96e-01 -0.111 0.106 0.119 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 4.54e-01 0.11 0.146 0.119 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 4.75e-01 -0.111 0.155 0.119 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 2.02e-01 0.13 0.102 0.124 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 5.07e-01 0.086 0.129 0.124 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 9.28e-01 0.0109 0.121 0.124 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 1.34e-01 -0.13 0.0862 0.124 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 6.44e-01 0.0561 0.121 0.124 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 9.17e-01 0.0117 0.111 0.124 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 7.16e-02 -0.239 0.132 0.124 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 3.43e-01 -0.122 0.128 0.124 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 6.87e-01 0.0415 0.103 0.124 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 4.27e-01 0.0937 0.118 0.124 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 8.66e-01 0.0203 0.12 0.124 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00159 0.12 0.124 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 4.74e-01 0.0938 0.131 0.132 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 2.79e-01 -0.153 0.141 0.132 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 3.21e-01 0.121 0.121 0.132 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 8.88e-01 -0.012 0.0853 0.132 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -874318 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0884 0.109 0.132 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -970979 sc-eQTL 1.86e-02 0.252 0.106 0.132 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 1.93e-01 -0.151 0.115 0.132 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 2.17e-01 0.131 0.106 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00604 0.119 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0873 0.0802 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 8.20e-01 0.0161 0.0706 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -373511 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0889 0.133 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -874318 sc-eQTL 9.60e-01 0.00679 0.135 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -970979 sc-eQTL 6.03e-01 0.0619 0.119 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 8.38e-01 0.0227 0.111 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0436 0.112 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0248 0.132 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 9.58e-01 0.00497 0.0953 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00789 0.0732 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -373511 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0104 0.126 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -874318 sc-eQTL 8.67e-01 0.0225 0.134 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -970979 sc-eQTL 9.93e-01 0.000951 0.109 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 6.00e-01 0.0573 0.109 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 2.23e-01 -0.204 0.167 0.112 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 9.83e-01 0.00313 0.144 0.112 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 4.86e-01 0.104 0.148 0.112 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 7.00e-01 0.0623 0.162 0.112 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0999 0.149 0.112 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 9.34e-01 -0.012 0.144 0.112 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00581 0.124 0.127 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 3.63e-01 -0.121 0.133 0.127 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0276 0.113 0.127 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0943 0.0886 0.127 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -373511 sc-eQTL 4.46e-01 0.0927 0.121 0.127 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -874318 sc-eQTL 8.75e-02 -0.217 0.126 0.127 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -970979 sc-eQTL 6.96e-01 0.0472 0.121 0.127 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 3.68e-01 -0.109 0.12 0.127 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 1.79e-01 -0.158 0.117 0.127 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 3.99e-01 -0.106 0.125 0.127 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0942 0.102 0.127 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0209 0.0931 0.127 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -373511 sc-eQTL 1.31e-01 0.157 0.104 0.127 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -874318 sc-eQTL 2.05e-02 -0.263 0.112 0.127 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -970979 sc-eQTL 9.07e-01 0.0133 0.114 0.127 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 5.51e-01 0.0705 0.118 0.127 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0869 0.133 0.13 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 8.97e-01 0.019 0.146 0.13 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 9.98e-01 0.000362 0.121 0.13 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 8.36e-01 0.0234 0.113 0.13 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -874318 sc-eQTL 6.98e-01 -0.053 0.137 0.13 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -970979 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0206 0.106 0.13 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 6.90e-01 0.0499 0.125 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 9.75e-01 0.00415 0.133 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 1.96e-01 0.143 0.11 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 6.55e-01 0.0439 0.0982 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -188338 sc-eQTL 2.72e-01 -0.123 0.112 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 4.92e-01 0.0483 0.0703 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0219 0.0931 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0992 0.101 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0667 0.12 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 9.91e-02 0.156 0.0941 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0242 0.0896 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -188338 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00123 0.0862 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0127 0.0607 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 5.47e-01 0.0472 0.0783 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 7.30e-01 0.0322 0.0931 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 6.42e-01 0.047 0.101 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0033 0.114 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0746 0.0727 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 8.52e-01 0.012 0.0641 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -373511 sc-eQTL 4.21e-01 -0.105 0.131 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -874318 sc-eQTL 9.81e-01 0.00323 0.134 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -970979 sc-eQTL 5.38e-01 0.0679 0.11 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 5.37e-01 0.0637 0.103 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 3.53e-01 -0.105 0.113 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 3.51e-02 -0.259 0.122 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 2.00e-01 -0.13 0.101 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 7.77e-01 -0.023 0.081 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -373511 sc-eQTL 2.98e-01 0.123 0.118 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -874318 sc-eQTL 4.46e-02 -0.246 0.122 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -970979 sc-eQTL 7.12e-01 0.043 0.116 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0646 0.117 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -761541 sc-eQTL 4.06e-01 0.102 0.122 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -761735 sc-eQTL 2.82e-01 0.0901 0.0836 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -530744 sc-eQTL 7.29e-01 0.0318 0.0918 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -222527 sc-eQTL 6.70e-01 0.0438 0.103 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183257 sc-eQTL 4.63e-01 0.087 0.118 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -196446 sc-eQTL 1.71e-01 0.14 0.102 0.125 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -530744 eQTL 0.021 0.0465 0.0201 0.0 0.0 0.132
ENSG00000237329 AL356320.2 -501487 eQTL 0.0209 -0.115 0.0495 0.00146 0.0 0.132

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina