logo

Genes within 1Mb (chr1:30534625:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 1.88e-01 -0.168 0.127 0.111 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 9.95e-02 -0.168 0.102 0.111 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 2.13e-01 0.107 0.0855 0.111 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -188960 sc-eQTL 1.00e-01 -0.148 0.0896 0.111 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 1.54e-02 -0.17 0.0697 0.111 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000319 0.0828 0.111 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0878 0.0978 0.111 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0697 0.11 0.111 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0323 0.0857 0.111 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0946 0.076 0.111 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0128 0.0846 0.111 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 4.37e-01 0.0589 0.0756 0.111 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0168 0.0906 0.111 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 2.10e-01 -0.179 0.143 0.111 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 3.09e-01 -0.097 0.0951 0.111 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00624 0.084 0.111 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 1.07e-02 -0.207 0.0803 0.111 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 8.04e-01 0.0237 0.0956 0.111 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0429 0.12 0.111 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 8.54e-01 0.0238 0.129 0.11 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 7.14e-01 0.0562 0.153 0.11 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 1.20e-01 0.186 0.119 0.11 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0892 0.0853 0.11 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -874940 sc-eQTL 4.09e-01 0.116 0.141 0.11 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -971601 sc-eQTL 8.26e-01 0.0206 0.0934 0.11 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 2.45e-01 0.157 0.135 0.11 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0432 0.101 0.111 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 8.44e-01 0.0248 0.126 0.111 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 3.18e-02 0.172 0.0797 0.111 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0339 0.0741 0.111 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -374133 sc-eQTL 7.50e-01 0.0454 0.142 0.111 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -874940 sc-eQTL 2.04e-02 0.353 0.151 0.111 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -971601 sc-eQTL 1.46e-01 0.196 0.134 0.111 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0353 0.118 0.111 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 1.27e-01 0.213 0.139 0.109 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0305 0.0958 0.109 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0827 0.1 0.109 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 9.73e-02 -0.191 0.115 0.109 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 1.46e-02 0.316 0.128 0.109 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00037 0.12 0.109 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00952 0.104 0.111 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0511 0.111 0.111 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0426 0.0995 0.111 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 1.52e-01 -0.117 0.0812 0.111 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 3.86e-01 -0.116 0.133 0.111 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0578 0.139 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 6.91e-01 0.067 0.168 0.12 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 2.93e-01 0.178 0.169 0.12 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 8.68e-01 0.0263 0.158 0.12 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -188960 sc-eQTL 4.78e-01 0.0979 0.138 0.12 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 1.58e-01 -0.135 0.0955 0.12 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 1.97e-03 0.474 0.151 0.12 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 1.88e-01 -0.181 0.137 0.12 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 8.12e-01 0.0378 0.159 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0817 0.132 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 3.26e-01 0.122 0.124 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -188960 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0477 0.13 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 5.53e-03 -0.219 0.0782 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0767 0.112 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 4.26e-01 0.0996 0.125 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 2.86e-01 -0.162 0.151 0.112 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 4.87e-01 0.0972 0.14 0.112 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0186 0.122 0.112 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -188960 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0599 0.116 0.112 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 2.80e-03 -0.305 0.101 0.112 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0171 0.118 0.112 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 4.15e-01 -0.113 0.138 0.112 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 1.10e-01 -0.225 0.14 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 3.11e-01 -0.123 0.121 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 1.06e-01 0.173 0.107 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -188960 sc-eQTL 1.27e-01 -0.166 0.108 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 3.43e-01 -0.069 0.0725 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 8.87e-01 0.0135 0.0954 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 2.40e-01 -0.138 0.117 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 2.86e-01 0.16 0.149 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 4.69e-02 -0.245 0.122 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 9.24e-01 0.0115 0.121 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -188960 sc-eQTL 9.57e-02 -0.193 0.115 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 1.70e-01 -0.108 0.0785 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 5.34e-01 0.0715 0.115 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0665 0.124 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 1.25e-01 0.227 0.147 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0121 0.146 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 1.09e-01 -0.229 0.142 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 8.92e-01 0.0174 0.128 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 2.94e-01 -0.146 0.139 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 8.21e-01 0.0279 0.123 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0845 0.114 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0699 0.101 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 7.71e-02 -0.143 0.0804 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0451 0.0868 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0131 0.0881 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 9.24e-01 0.00961 0.101 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0298 0.145 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 6.23e-01 0.0573 0.116 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 8.49e-01 0.0196 0.103 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00154 0.0856 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 1.74e-01 0.147 0.108 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 1.04e-01 -0.196 0.12 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 3.47e-02 -0.301 0.142 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0205 0.136 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 1.44e-01 0.166 0.113 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 3.76e-01 -0.102 0.115 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 8.57e-01 0.0243 0.134 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 8.33e-01 0.028 0.132 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 1.09e-01 -0.248 0.154 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00592 0.119 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 4.05e-01 0.0961 0.115 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 2.69e-02 -0.282 0.126 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0496 0.134 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0996 0.126 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0712 0.144 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0966 0.124 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0058 0.0997 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0418 0.0955 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 2.66e-01 0.133 0.119 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 5.15e-01 0.0847 0.13 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 4.34e-01 -0.126 0.16 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 9.94e-01 0.00113 0.147 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 1.19e-01 -0.215 0.137 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 3.31e-02 -0.307 0.143 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0393 0.134 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0254 0.135 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 5.33e-01 0.0949 0.152 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 1.58e-01 -0.205 0.145 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 5.39e-01 0.0917 0.149 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 3.72e-01 -0.125 0.14 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 4.54e-01 0.109 0.145 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0537 0.132 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0102 0.155 0.113 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 2.59e-01 0.155 0.137 0.113 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0585 0.132 0.113 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 3.03e-01 -0.128 0.124 0.113 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 9.10e-01 0.0158 0.139 0.113 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0618 0.143 0.113 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 6.49e-01 0.0726 0.159 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0238 0.135 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 1.93e-01 0.184 0.141 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 4.80e-01 0.0988 0.139 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 1.32e-01 0.211 0.14 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 6.91e-02 0.251 0.137 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 2.80e-01 0.159 0.147 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 1.32e-01 -0.164 0.109 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 3.20e-01 -0.111 0.112 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 1.17e-01 -0.187 0.119 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 1.95e-01 0.193 0.149 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0558 0.123 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 2.80e-01 -0.172 0.159 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 3.15e-02 0.305 0.141 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0166 0.139 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 5.60e-02 -0.252 0.131 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0726 0.141 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 6.57e-01 0.0607 0.136 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 4.25e-01 0.116 0.145 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 6.49e-01 0.0516 0.113 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 1.16e-01 -0.192 0.122 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 1.19e-01 -0.21 0.134 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 1.26e-01 0.218 0.142 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0188 0.133 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 4.64e-01 -0.121 0.165 0.119 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0725 0.191 0.119 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0864 0.166 0.119 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -188960 sc-eQTL 4.62e-01 0.114 0.155 0.119 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0432 0.111 0.119 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 4.98e-01 0.103 0.151 0.119 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 4.56e-01 -0.12 0.161 0.119 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0544 0.112 0.113 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 7.83e-01 0.0392 0.142 0.113 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00442 0.133 0.113 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0011 0.0954 0.113 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 9.22e-01 -0.013 0.133 0.113 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0304 0.123 0.113 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 6.66e-01 0.0643 0.149 0.111 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 9.47e-01 0.00958 0.144 0.111 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 6.87e-01 0.0465 0.115 0.111 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0508 0.132 0.111 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 2.66e-01 0.15 0.134 0.111 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 5.01e-02 -0.262 0.133 0.111 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0802 0.152 0.11 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 5.06e-01 0.11 0.165 0.11 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 2.95e-01 0.149 0.141 0.11 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 2.14e-01 -0.123 0.099 0.11 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -874940 sc-eQTL 7.22e-03 0.34 0.125 0.11 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -971601 sc-eQTL 3.73e-01 0.112 0.125 0.11 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 7.13e-01 0.0497 0.135 0.11 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0927 0.122 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0017 0.137 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 1.34e-01 0.139 0.0921 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 1.18e-01 -0.127 0.0808 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -374133 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0691 0.153 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -874940 sc-eQTL 4.64e-03 0.435 0.152 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -971601 sc-eQTL 7.31e-01 0.0472 0.137 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0369 0.128 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0433 0.133 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0333 0.157 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 4.04e-01 0.0948 0.113 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 9.94e-01 0.00067 0.0873 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -374133 sc-eQTL 9.27e-01 0.0138 0.151 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -874940 sc-eQTL 2.48e-02 0.357 0.158 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -971601 sc-eQTL 6.94e-01 0.0511 0.13 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0279 0.13 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 4.85e-01 0.135 0.194 0.103 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 1.00e-01 -0.273 0.165 0.103 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 5.15e-02 0.333 0.169 0.103 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 4.49e-01 -0.142 0.186 0.103 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 4.40e-01 0.133 0.172 0.103 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0921 0.167 0.103 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 9.33e-02 0.241 0.143 0.107 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 2.12e-01 -0.193 0.154 0.107 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 9.32e-01 0.0112 0.131 0.107 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 8.50e-01 0.0196 0.103 0.107 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -374133 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0405 0.141 0.107 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -874940 sc-eQTL 2.88e-01 0.157 0.147 0.107 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -971601 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0204 0.14 0.107 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 6.43e-01 0.065 0.14 0.107 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 1.09e-01 0.213 0.132 0.113 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 5.08e-01 -0.094 0.142 0.113 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 5.27e-02 0.224 0.115 0.113 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0483 0.105 0.113 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -374133 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0725 0.118 0.113 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -874940 sc-eQTL 3.72e-01 0.115 0.129 0.113 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -971601 sc-eQTL 1.43e-01 0.188 0.128 0.113 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 1.52e-01 -0.191 0.133 0.113 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 5.29e-01 0.0953 0.151 0.107 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 7.52e-01 0.0526 0.166 0.107 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 4.05e-02 0.281 0.136 0.107 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 7.74e-02 -0.225 0.127 0.107 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -874940 sc-eQTL 2.31e-01 0.186 0.154 0.107 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -971601 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0601 0.12 0.107 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0741 0.142 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00798 0.151 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 9.45e-01 0.00869 0.125 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 2.94e-01 0.117 0.111 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -188960 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0545 0.127 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 4.71e-03 -0.223 0.0782 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00531 0.105 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 9.81e-01 0.00278 0.115 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 3.59e-01 -0.126 0.138 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 1.42e-02 -0.266 0.108 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 2.57e-01 0.117 0.103 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -188960 sc-eQTL 6.08e-02 -0.186 0.0985 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0665 0.0698 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 9.91e-01 0.001 0.0903 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0945 0.107 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 1.04e-01 -0.191 0.117 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 9.10e-01 -0.015 0.133 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 1.01e-01 0.139 0.0844 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0451 0.0746 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -374133 sc-eQTL 9.69e-01 0.00586 0.152 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -874940 sc-eQTL 1.21e-02 0.39 0.154 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -971601 sc-eQTL 5.90e-01 0.0693 0.128 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 9.83e-01 0.00263 0.12 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 4.44e-03 0.359 0.125 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 1.62e-01 -0.194 0.138 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 1.98e-01 0.147 0.113 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0149 0.0911 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -374133 sc-eQTL 6.69e-01 -0.057 0.133 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -874940 sc-eQTL 4.42e-01 0.106 0.138 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -971601 sc-eQTL 1.84e-01 0.174 0.13 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 3.67e-01 -0.118 0.131 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -762163 sc-eQTL 3.15e-01 0.142 0.141 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -762357 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0216 0.0963 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -531366 sc-eQTL 2.98e-01 -0.11 0.105 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -223149 sc-eQTL 4.78e-02 -0.233 0.117 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -183879 sc-eQTL 4.14e-02 0.276 0.135 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -197068 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0135 0.117 0.11 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000237329 AL356320.2 -502109 eQTL 0.0148 0.115 0.0472 0.00189 0.0 0.158

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina