logo

Genes within 1Mb (chr1:30533525:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0117 0.105 0.15 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 2.57e-02 0.187 0.0832 0.15 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 4.75e-01 0.0504 0.0705 0.15 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -190060 sc-eQTL 8.52e-01 0.0139 0.0742 0.15 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 7.74e-01 0.0167 0.0581 0.15 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 6.81e-01 -0.028 0.0681 0.15 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 7.63e-01 0.0244 0.0806 0.15 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 5.05e-01 0.0603 0.0903 0.15 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0444 0.0706 0.15 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 3.12e-01 0.0636 0.0627 0.15 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0668 0.0696 0.15 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0316 0.0623 0.15 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 2.66e-01 0.0831 0.0745 0.15 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 7.46e-01 0.0382 0.118 0.15 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 6.37e-01 0.0372 0.0785 0.15 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0539 0.0691 0.15 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0398 0.0671 0.15 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0634 0.0786 0.15 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 8.69e-01 0.0163 0.099 0.15 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 6.00e-01 0.0555 0.106 0.153 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 2.11e-01 -0.157 0.125 0.153 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0889 0.098 0.153 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 4.42e-01 -0.054 0.07 0.153 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -876040 sc-eQTL 8.18e-01 0.0267 0.116 0.153 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -972701 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0103 0.0766 0.153 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0904 0.111 0.153 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 9.49e-01 0.00527 0.0821 0.15 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0671 0.102 0.15 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0561 0.0651 0.15 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 9.60e-01 0.00301 0.06 0.15 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -375233 sc-eQTL 6.11e-01 0.0587 0.115 0.15 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -876040 sc-eQTL 8.48e-01 0.0238 0.124 0.15 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -972701 sc-eQTL 2.85e-01 0.117 0.109 0.15 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 6.68e-01 0.0409 0.0952 0.15 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 3.28e-01 0.11 0.112 0.15 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 4.50e-01 0.0581 0.0768 0.15 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 9.61e-01 0.00399 0.0807 0.15 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 7.27e-01 0.0325 0.0929 0.15 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 2.49e-01 0.12 0.104 0.15 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 3.10e-01 0.0978 0.0961 0.15 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0319 0.0871 0.15 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 3.33e-01 0.0902 0.0929 0.15 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 5.46e-01 0.0506 0.0836 0.15 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0371 0.0686 0.15 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 1.92e-01 -0.147 0.112 0.15 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 9.80e-01 0.0029 0.117 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 8.19e-01 0.0323 0.141 0.145 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 9.76e-01 0.00432 0.142 0.145 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 1.77e-01 0.178 0.132 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -190060 sc-eQTL 2.77e-01 -0.126 0.115 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00742 0.0806 0.145 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0935 0.13 0.145 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 5.32e-02 -0.222 0.114 0.145 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 9.82e-01 0.00286 0.13 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 1.07e-01 0.175 0.108 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0883 0.102 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -190060 sc-eQTL 1.76e-01 -0.144 0.106 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 3.71e-01 0.0585 0.0652 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 7.13e-01 0.0337 0.0917 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0721 0.103 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0802 0.126 0.149 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 1.68e-01 0.16 0.116 0.149 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 6.71e-02 0.185 0.101 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -190060 sc-eQTL 8.85e-01 0.014 0.0969 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 1.12e-01 0.136 0.0854 0.149 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 1.59e-01 -0.138 0.0979 0.149 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0745 0.115 0.149 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 9.30e-01 0.00991 0.113 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 3.28e-02 0.208 0.0966 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00827 0.0861 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -190060 sc-eQTL 6.45e-01 0.0403 0.0874 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 8.30e-01 0.0126 0.0584 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0291 0.0767 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 8.39e-01 0.0193 0.0947 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0438 0.12 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 9.50e-01 0.00625 0.0994 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 9.33e-01 0.0082 0.0973 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -190060 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0988 0.0932 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 6.59e-01 0.028 0.0634 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 4.43e-01 0.0709 0.0923 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 1.86e-01 0.132 0.0994 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 7.68e-01 0.0352 0.119 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00779 0.117 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 4.61e-01 0.0849 0.115 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 7.76e-01 0.0293 0.103 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 4.49e-01 -0.085 0.112 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 4.57e-01 0.0738 0.0989 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 4.06e-01 0.078 0.0938 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 8.20e-01 0.019 0.0833 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 6.64e-01 0.0289 0.0665 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0748 0.0711 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0315 0.0723 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 1.91e-01 0.108 0.0827 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 8.80e-01 0.018 0.119 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 2.23e-01 -0.117 0.0959 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 3.73e-01 0.0759 0.085 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0415 0.0706 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0972 0.0894 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 9.34e-01 0.00823 0.0999 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 4.47e-01 0.0898 0.118 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 9.80e-01 0.00281 0.112 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0866 0.0934 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 9.72e-01 0.00335 0.0947 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 7.79e-02 0.195 0.11 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 8.84e-01 -0.016 0.109 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 1.32e-01 0.191 0.126 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 4.18e-01 0.079 0.0972 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0425 0.0945 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0358 0.105 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 6.60e-01 0.0484 0.11 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 6.71e-01 -0.044 0.104 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 8.74e-01 0.0185 0.117 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0319 0.101 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0667 0.0809 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0285 0.0776 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 8.66e-01 0.0164 0.0969 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 3.26e-01 0.104 0.105 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 2.18e-01 0.159 0.129 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0775 0.118 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00659 0.111 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00153 0.116 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 8.94e-01 0.0144 0.108 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 2.49e-01 -0.126 0.109 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 1.95e-01 -0.163 0.125 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 1.20e-02 0.301 0.119 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 3.19e-02 0.263 0.122 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 8.73e-01 0.0186 0.116 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 4.69e-01 0.0872 0.12 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0331 0.109 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0378 0.125 0.152 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 1.15e-01 0.174 0.11 0.152 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0179 0.106 0.152 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0692 0.0999 0.152 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 8.71e-02 -0.19 0.111 0.152 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0738 0.115 0.152 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 1.65e-01 0.178 0.128 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 3.22e-01 -0.108 0.108 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0474 0.114 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 1.83e-01 0.15 0.112 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0236 0.113 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 8.41e-01 0.0224 0.111 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 8.31e-02 0.207 0.119 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 6.07e-01 0.0456 0.0886 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0651 0.0909 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 9.24e-01 0.00926 0.097 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 9.91e-01 0.00137 0.122 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 5.84e-01 0.0549 0.1 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0801 0.126 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 5.00e-01 0.076 0.112 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 1.15e-01 0.172 0.109 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 3.83e-01 0.0913 0.104 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 4.64e-01 0.0815 0.111 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 2.83e-01 0.116 0.107 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 9.41e-01 0.00869 0.117 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0311 0.091 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 7.78e-01 0.0278 0.0984 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 8.55e-01 0.0198 0.108 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 1.94e-01 0.149 0.114 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 5.70e-01 0.0608 0.107 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 7.89e-01 0.0401 0.15 0.141 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0165 0.174 0.141 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0729 0.151 0.141 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -190060 sc-eQTL 4.69e-01 -0.102 0.14 0.141 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0896 0.1 0.141 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 5.97e-01 0.0729 0.137 0.141 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 3.09e-01 -0.149 0.146 0.141 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 1.85e-01 0.125 0.0941 0.15 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 3.72e-01 0.107 0.12 0.15 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 5.64e-01 0.0646 0.112 0.15 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0796 0.0801 0.15 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0719 0.112 0.15 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00872 0.103 0.15 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 5.03e-02 -0.24 0.122 0.15 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0936 0.119 0.15 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 4.05e-01 0.0795 0.0952 0.15 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 4.49e-01 0.0828 0.109 0.15 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 7.89e-01 0.0298 0.111 0.15 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0397 0.111 0.15 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 5.88e-01 0.0655 0.121 0.159 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0947 0.131 0.159 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 7.41e-01 0.0371 0.112 0.159 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0448 0.0787 0.159 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -876040 sc-eQTL 1.76e-01 -0.137 0.101 0.159 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -972701 sc-eQTL 1.17e-01 0.156 0.0987 0.159 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 3.37e-02 -0.226 0.106 0.159 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 3.21e-01 0.0977 0.0983 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0164 0.11 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0913 0.0741 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 8.51e-01 0.0123 0.0653 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -375233 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0534 0.123 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -876040 sc-eQTL 9.48e-01 0.00807 0.125 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -972701 sc-eQTL 3.18e-01 0.11 0.11 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 7.43e-01 0.0338 0.103 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 7.00e-01 0.0396 0.103 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 8.39e-01 0.0246 0.121 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 8.83e-01 0.0129 0.0876 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0092 0.0673 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -375233 sc-eQTL 9.26e-01 0.0109 0.116 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -876040 sc-eQTL 6.84e-01 0.0502 0.123 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -972701 sc-eQTL 4.96e-01 0.0682 0.0999 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 6.31e-01 0.0484 0.1 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 4.23e-01 -0.124 0.154 0.142 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 7.16e-01 0.0483 0.132 0.142 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 3.93e-01 0.117 0.136 0.142 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 8.82e-01 0.0221 0.148 0.142 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0547 0.137 0.142 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 7.02e-01 0.0508 0.132 0.142 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0436 0.115 0.153 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0885 0.123 0.153 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0268 0.104 0.153 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 1.57e-01 -0.116 0.0816 0.153 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -375233 sc-eQTL 3.50e-01 0.105 0.112 0.153 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -876040 sc-eQTL 2.72e-01 -0.129 0.117 0.153 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -972701 sc-eQTL 6.69e-01 0.0477 0.111 0.153 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0875 0.111 0.153 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 1.00e-01 -0.178 0.108 0.154 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0979 0.115 0.154 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0182 0.0944 0.154 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0461 0.0856 0.154 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -375233 sc-eQTL 4.26e-02 0.194 0.0951 0.154 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -876040 sc-eQTL 1.28e-01 -0.159 0.104 0.154 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -972701 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0168 0.105 0.154 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 3.17e-01 0.109 0.108 0.154 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 7.29e-01 0.0427 0.123 0.164 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 5.99e-01 -0.071 0.135 0.164 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0933 0.112 0.164 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0649 0.104 0.164 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -876040 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00067 0.126 0.164 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -972701 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0566 0.0979 0.164 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 8.26e-01 0.0253 0.115 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0316 0.123 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 2.27e-01 0.124 0.102 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 5.75e-01 0.0508 0.0905 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -190060 sc-eQTL 1.85e-01 -0.137 0.103 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 4.41e-01 0.05 0.0648 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0682 0.0857 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0822 0.0934 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0458 0.11 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 9.97e-02 0.143 0.0867 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 9.25e-01 0.0078 0.0826 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -190060 sc-eQTL 7.22e-01 0.0284 0.0795 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00441 0.056 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 9.01e-01 0.00904 0.0723 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 7.12e-01 0.0317 0.0858 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 4.92e-01 0.0641 0.0931 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 8.70e-01 0.0173 0.106 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0677 0.0672 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000107 0.0592 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -375233 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0579 0.121 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -876040 sc-eQTL 8.96e-01 0.0162 0.124 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -972701 sc-eQTL 1.93e-01 0.132 0.101 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 5.04e-01 0.0638 0.0952 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 1.87e-01 -0.137 0.104 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 6.78e-02 -0.208 0.113 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0644 0.0933 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 3.15e-01 -0.075 0.0745 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -375233 sc-eQTL 2.09e-01 0.137 0.109 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -876040 sc-eQTL 2.28e-01 -0.136 0.113 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -972701 sc-eQTL 6.93e-01 0.0425 0.107 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0157 0.108 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -763263 sc-eQTL 4.11e-01 0.0929 0.113 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -763457 sc-eQTL 5.64e-01 0.0446 0.0772 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -532466 sc-eQTL 8.60e-01 0.015 0.0846 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -224249 sc-eQTL 7.86e-01 0.0257 0.0945 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -184979 sc-eQTL 3.34e-01 0.105 0.109 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -198168 sc-eQTL 2.81e-01 0.102 0.0939 0.151 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -532466 eQTL 0.0286 0.0402 0.0184 0.0 0.0 0.16
ENSG00000237329 AL356320.2 -503209 eQTL 0.0292 -0.0987 0.0452 0.00122 0.0 0.16

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina