logo

Genes within 1Mb (chr1:30531287:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0117 0.105 0.15 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 2.57e-02 0.187 0.0832 0.15 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 4.75e-01 0.0504 0.0705 0.15 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -192298 sc-eQTL 8.52e-01 0.0139 0.0742 0.15 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 7.74e-01 0.0167 0.0581 0.15 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 6.81e-01 -0.028 0.0681 0.15 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 7.63e-01 0.0244 0.0806 0.15 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 5.05e-01 0.0603 0.0903 0.15 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0444 0.0706 0.15 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 3.12e-01 0.0636 0.0627 0.15 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0668 0.0696 0.15 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0316 0.0623 0.15 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 2.66e-01 0.0831 0.0745 0.15 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 7.46e-01 0.0382 0.118 0.15 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 6.37e-01 0.0372 0.0785 0.15 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0539 0.0691 0.15 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0398 0.0671 0.15 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0634 0.0786 0.15 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 8.69e-01 0.0163 0.099 0.15 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 6.00e-01 0.0555 0.106 0.153 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 2.11e-01 -0.157 0.125 0.153 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0889 0.098 0.153 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 4.42e-01 -0.054 0.07 0.153 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -878278 sc-eQTL 8.18e-01 0.0267 0.116 0.153 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -974939 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0103 0.0766 0.153 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0904 0.111 0.153 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 9.49e-01 0.00527 0.0821 0.15 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0671 0.102 0.15 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0561 0.0651 0.15 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 9.60e-01 0.00301 0.06 0.15 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -377471 sc-eQTL 6.11e-01 0.0587 0.115 0.15 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -878278 sc-eQTL 8.48e-01 0.0238 0.124 0.15 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -974939 sc-eQTL 2.85e-01 0.117 0.109 0.15 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 6.68e-01 0.0409 0.0952 0.15 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 3.28e-01 0.11 0.112 0.15 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 4.50e-01 0.0581 0.0768 0.15 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 9.61e-01 0.00399 0.0807 0.15 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 7.27e-01 0.0325 0.0929 0.15 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 2.49e-01 0.12 0.104 0.15 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 3.10e-01 0.0978 0.0961 0.15 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0319 0.0871 0.15 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 3.33e-01 0.0902 0.0929 0.15 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 5.46e-01 0.0506 0.0836 0.15 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0371 0.0686 0.15 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 1.92e-01 -0.147 0.112 0.15 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 9.80e-01 0.0029 0.117 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 8.19e-01 0.0323 0.141 0.145 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 9.76e-01 0.00432 0.142 0.145 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 1.77e-01 0.178 0.132 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -192298 sc-eQTL 2.77e-01 -0.126 0.115 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00742 0.0806 0.145 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0935 0.13 0.145 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 5.32e-02 -0.222 0.114 0.145 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 9.82e-01 0.00286 0.13 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 1.07e-01 0.175 0.108 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0883 0.102 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -192298 sc-eQTL 1.76e-01 -0.144 0.106 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 3.71e-01 0.0585 0.0652 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 7.13e-01 0.0337 0.0917 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0721 0.103 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0802 0.126 0.149 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 1.68e-01 0.16 0.116 0.149 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 6.71e-02 0.185 0.101 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -192298 sc-eQTL 8.85e-01 0.014 0.0969 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 1.12e-01 0.136 0.0854 0.149 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 1.59e-01 -0.138 0.0979 0.149 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0745 0.115 0.149 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 9.30e-01 0.00991 0.113 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 3.28e-02 0.208 0.0966 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00827 0.0861 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -192298 sc-eQTL 6.45e-01 0.0403 0.0874 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 8.30e-01 0.0126 0.0584 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0291 0.0767 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 8.39e-01 0.0193 0.0947 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0438 0.12 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 9.50e-01 0.00625 0.0994 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 9.33e-01 0.0082 0.0973 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -192298 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0988 0.0932 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 6.59e-01 0.028 0.0634 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 4.43e-01 0.0709 0.0923 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 1.86e-01 0.132 0.0994 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 7.68e-01 0.0352 0.119 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00779 0.117 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 4.61e-01 0.0849 0.115 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 7.76e-01 0.0293 0.103 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 4.49e-01 -0.085 0.112 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 4.57e-01 0.0738 0.0989 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 4.06e-01 0.078 0.0938 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 8.20e-01 0.019 0.0833 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 6.64e-01 0.0289 0.0665 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0748 0.0711 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0315 0.0723 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 1.91e-01 0.108 0.0827 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 8.80e-01 0.018 0.119 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 2.23e-01 -0.117 0.0959 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 3.73e-01 0.0759 0.085 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0415 0.0706 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0972 0.0894 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 9.34e-01 0.00823 0.0999 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 4.47e-01 0.0898 0.118 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 9.80e-01 0.00281 0.112 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0866 0.0934 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 9.72e-01 0.00335 0.0947 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 7.79e-02 0.195 0.11 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 8.84e-01 -0.016 0.109 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 1.32e-01 0.191 0.126 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 4.18e-01 0.079 0.0972 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0425 0.0945 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0358 0.105 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 6.60e-01 0.0484 0.11 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 6.71e-01 -0.044 0.104 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 8.74e-01 0.0185 0.117 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0319 0.101 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0667 0.0809 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0285 0.0776 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 8.66e-01 0.0164 0.0969 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 3.26e-01 0.104 0.105 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 2.18e-01 0.159 0.129 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0775 0.118 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00659 0.111 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00153 0.116 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 8.94e-01 0.0144 0.108 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 2.49e-01 -0.126 0.109 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 1.95e-01 -0.163 0.125 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 1.20e-02 0.301 0.119 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 3.19e-02 0.263 0.122 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 8.73e-01 0.0186 0.116 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 4.69e-01 0.0872 0.12 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0331 0.109 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0378 0.125 0.152 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 1.15e-01 0.174 0.11 0.152 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0179 0.106 0.152 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0692 0.0999 0.152 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 8.71e-02 -0.19 0.111 0.152 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0738 0.115 0.152 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 1.65e-01 0.178 0.128 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 3.22e-01 -0.108 0.108 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0474 0.114 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 1.83e-01 0.15 0.112 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0236 0.113 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 8.41e-01 0.0224 0.111 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 8.31e-02 0.207 0.119 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 6.07e-01 0.0456 0.0886 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0651 0.0909 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 9.24e-01 0.00926 0.097 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 9.91e-01 0.00137 0.122 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 5.84e-01 0.0549 0.1 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0801 0.126 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 5.00e-01 0.076 0.112 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 1.15e-01 0.172 0.109 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 3.83e-01 0.0913 0.104 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 4.64e-01 0.0815 0.111 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 2.83e-01 0.116 0.107 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 9.41e-01 0.00869 0.117 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0311 0.091 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 7.78e-01 0.0278 0.0984 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 8.55e-01 0.0198 0.108 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 1.94e-01 0.149 0.114 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 5.70e-01 0.0608 0.107 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 7.89e-01 0.0401 0.15 0.141 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0165 0.174 0.141 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0729 0.151 0.141 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -192298 sc-eQTL 4.69e-01 -0.102 0.14 0.141 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0896 0.1 0.141 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 5.97e-01 0.0729 0.137 0.141 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 3.09e-01 -0.149 0.146 0.141 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 1.85e-01 0.125 0.0941 0.15 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 3.72e-01 0.107 0.12 0.15 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 5.64e-01 0.0646 0.112 0.15 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0796 0.0801 0.15 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0719 0.112 0.15 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00872 0.103 0.15 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 5.03e-02 -0.24 0.122 0.15 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0936 0.119 0.15 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 4.05e-01 0.0795 0.0952 0.15 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 4.49e-01 0.0828 0.109 0.15 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 7.89e-01 0.0298 0.111 0.15 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0397 0.111 0.15 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 5.88e-01 0.0655 0.121 0.159 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0947 0.131 0.159 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 7.41e-01 0.0371 0.112 0.159 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0448 0.0787 0.159 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -878278 sc-eQTL 1.76e-01 -0.137 0.101 0.159 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -974939 sc-eQTL 1.17e-01 0.156 0.0987 0.159 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 3.37e-02 -0.226 0.106 0.159 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 3.21e-01 0.0977 0.0983 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0164 0.11 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0913 0.0741 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 8.51e-01 0.0123 0.0653 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -377471 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0534 0.123 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -878278 sc-eQTL 9.48e-01 0.00807 0.125 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -974939 sc-eQTL 3.18e-01 0.11 0.11 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 7.43e-01 0.0338 0.103 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 7.00e-01 0.0396 0.103 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 8.39e-01 0.0246 0.121 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 8.83e-01 0.0129 0.0876 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0092 0.0673 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -377471 sc-eQTL 9.26e-01 0.0109 0.116 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -878278 sc-eQTL 6.84e-01 0.0502 0.123 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -974939 sc-eQTL 4.96e-01 0.0682 0.0999 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 6.31e-01 0.0484 0.1 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 4.23e-01 -0.124 0.154 0.142 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 7.16e-01 0.0483 0.132 0.142 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 3.93e-01 0.117 0.136 0.142 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 8.82e-01 0.0221 0.148 0.142 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0547 0.137 0.142 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 7.02e-01 0.0508 0.132 0.142 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0436 0.115 0.153 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0885 0.123 0.153 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0268 0.104 0.153 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 1.57e-01 -0.116 0.0816 0.153 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -377471 sc-eQTL 3.50e-01 0.105 0.112 0.153 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -878278 sc-eQTL 2.72e-01 -0.129 0.117 0.153 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -974939 sc-eQTL 6.69e-01 0.0477 0.111 0.153 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0875 0.111 0.153 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 1.00e-01 -0.178 0.108 0.154 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0979 0.115 0.154 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0182 0.0944 0.154 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0461 0.0856 0.154 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -377471 sc-eQTL 4.26e-02 0.194 0.0951 0.154 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -878278 sc-eQTL 1.28e-01 -0.159 0.104 0.154 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -974939 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0168 0.105 0.154 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 3.17e-01 0.109 0.108 0.154 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 7.29e-01 0.0427 0.123 0.164 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 5.99e-01 -0.071 0.135 0.164 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0933 0.112 0.164 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0649 0.104 0.164 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -878278 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00067 0.126 0.164 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -974939 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0566 0.0979 0.164 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 8.26e-01 0.0253 0.115 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0316 0.123 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 2.27e-01 0.124 0.102 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 5.75e-01 0.0508 0.0905 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -192298 sc-eQTL 1.85e-01 -0.137 0.103 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 4.41e-01 0.05 0.0648 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0682 0.0857 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0822 0.0934 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0458 0.11 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 9.97e-02 0.143 0.0867 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 9.25e-01 0.0078 0.0826 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -192298 sc-eQTL 7.22e-01 0.0284 0.0795 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00441 0.056 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 9.01e-01 0.00904 0.0723 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 7.12e-01 0.0317 0.0858 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 4.92e-01 0.0641 0.0931 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 8.70e-01 0.0173 0.106 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0677 0.0672 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000107 0.0592 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -377471 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0579 0.121 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -878278 sc-eQTL 8.96e-01 0.0162 0.124 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -974939 sc-eQTL 1.93e-01 0.132 0.101 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 5.04e-01 0.0638 0.0952 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 1.87e-01 -0.137 0.104 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 6.78e-02 -0.208 0.113 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0644 0.0933 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 3.15e-01 -0.075 0.0745 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -377471 sc-eQTL 2.09e-01 0.137 0.109 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -878278 sc-eQTL 2.28e-01 -0.136 0.113 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -974939 sc-eQTL 6.93e-01 0.0425 0.107 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0157 0.108 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -765501 sc-eQTL 4.11e-01 0.0929 0.113 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -765695 sc-eQTL 5.64e-01 0.0446 0.0772 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -534704 sc-eQTL 8.60e-01 0.015 0.0846 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -226487 sc-eQTL 7.86e-01 0.0257 0.0945 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -187217 sc-eQTL 3.34e-01 0.105 0.109 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -200406 sc-eQTL 2.81e-01 0.102 0.0939 0.151 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -534704 eQTL 0.0232 0.0416 0.0183 0.0 0.0 0.161
ENSG00000237329 AL356320.2 -505447 eQTL 0.0319 -0.0968 0.045 0.00117 0.0 0.161

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina