logo

Genes within 1Mb (chr1:30527709:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0135 0.106 0.145 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 2.93e-02 0.184 0.0841 0.145 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 4.63e-01 0.0524 0.0712 0.145 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -195876 sc-eQTL 9.04e-01 0.00907 0.075 0.145 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 7.10e-01 0.0218 0.0587 0.145 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0433 0.0687 0.145 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 7.05e-01 0.0308 0.0814 0.145 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 4.53e-01 0.0686 0.0911 0.145 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0465 0.0712 0.145 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 2.64e-01 0.0708 0.0633 0.145 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0693 0.0702 0.145 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0356 0.0628 0.145 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 4.11e-01 0.062 0.0752 0.145 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 5.74e-01 0.067 0.119 0.145 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 5.76e-01 0.0444 0.0792 0.145 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0441 0.0697 0.145 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0389 0.0677 0.145 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 3.20e-01 -0.079 0.0792 0.145 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 8.65e-01 0.017 0.0998 0.145 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 6.05e-01 0.0556 0.107 0.149 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 2.67e-01 -0.141 0.127 0.149 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0852 0.0992 0.149 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0473 0.0709 0.149 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -881856 sc-eQTL 9.71e-01 0.00433 0.117 0.149 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -978517 sc-eQTL 9.52e-01 0.00464 0.0775 0.149 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0853 0.112 0.149 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 9.98e-01 0.000189 0.0826 0.145 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0617 0.102 0.145 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0509 0.0656 0.145 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000342 0.0604 0.145 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -381049 sc-eQTL 6.88e-01 0.0467 0.116 0.145 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -881856 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0124 0.125 0.145 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -978517 sc-eQTL 3.06e-01 0.112 0.109 0.145 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 6.69e-01 0.0411 0.0959 0.145 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 3.06e-01 0.116 0.113 0.146 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 3.68e-01 0.0698 0.0774 0.146 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00668 0.0813 0.146 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 7.64e-01 0.0281 0.0936 0.146 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 2.42e-01 0.123 0.105 0.146 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 3.16e-01 0.0975 0.0969 0.146 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 7.77e-01 -0.025 0.0879 0.145 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 3.31e-01 0.0913 0.0938 0.145 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 3.96e-01 0.0717 0.0843 0.145 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0687 0.0691 0.145 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 2.07e-01 -0.143 0.113 0.145 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 9.58e-01 0.00619 0.118 0.145 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00336 0.143 0.14 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0363 0.144 0.14 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 2.46e-01 0.155 0.133 0.14 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -195876 sc-eQTL 2.30e-01 -0.14 0.116 0.14 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 6.55e-01 0.0365 0.0814 0.14 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 4.43e-01 -0.101 0.131 0.14 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 1.06e-01 -0.188 0.115 0.14 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00693 0.131 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 9.36e-02 0.183 0.109 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 3.17e-01 -0.103 0.103 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -195876 sc-eQTL 1.58e-01 -0.152 0.107 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 2.67e-01 0.0731 0.0658 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 6.23e-01 0.0455 0.0925 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0692 0.103 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 6.15e-01 -0.064 0.127 0.144 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 1.12e-01 0.186 0.117 0.144 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 7.43e-02 0.182 0.101 0.144 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -195876 sc-eQTL 8.57e-01 0.0176 0.0977 0.144 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 1.32e-01 0.13 0.0861 0.144 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 1.81e-01 -0.132 0.0987 0.144 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0946 0.116 0.144 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 9.65e-01 0.00508 0.114 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 3.29e-02 0.209 0.0974 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0104 0.0869 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -195876 sc-eQTL 7.15e-01 0.0323 0.0881 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 6.86e-01 0.0239 0.0588 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0618 0.0772 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 8.38e-01 0.0196 0.0955 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0347 0.122 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0207 0.1 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 9.35e-01 0.00802 0.0982 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -195876 sc-eQTL 2.84e-01 -0.101 0.094 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 5.83e-01 0.0352 0.064 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 4.11e-01 0.0767 0.0931 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 1.14e-01 0.159 0.1 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 7.90e-01 0.0322 0.121 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0225 0.119 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 5.49e-01 0.0697 0.116 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 7.51e-01 0.0329 0.104 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0885 0.113 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 6.26e-01 0.0488 0.1 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 3.58e-01 0.0869 0.0944 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 9.30e-01 0.00736 0.0839 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 6.01e-01 0.0351 0.0669 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0748 0.0716 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0459 0.0727 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 1.78e-01 0.112 0.0833 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000915 0.12 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 2.21e-01 -0.118 0.0966 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 3.17e-01 0.0859 0.0856 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0497 0.0711 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0798 0.0901 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0156 0.101 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 3.73e-01 0.106 0.118 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 1.00e+00 -5.92e-06 0.113 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0964 0.094 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00444 0.0953 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 7.10e-02 0.201 0.111 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0179 0.11 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 7.03e-02 0.231 0.127 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 3.91e-01 0.0844 0.0982 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0527 0.0954 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0773 0.106 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 7.18e-01 0.0402 0.111 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0554 0.104 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 7.73e-01 0.034 0.118 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0308 0.101 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0595 0.0815 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0219 0.0782 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 9.74e-01 0.00324 0.0976 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 2.97e-01 0.111 0.106 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 2.04e-01 0.165 0.129 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0595 0.119 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 8.78e-01 0.0172 0.112 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0117 0.117 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0112 0.109 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 2.58e-01 -0.124 0.109 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 1.71e-01 -0.173 0.126 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 1.14e-02 0.305 0.12 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 2.26e-02 0.282 0.123 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 8.91e-01 0.016 0.117 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 6.06e-01 0.0625 0.121 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0282 0.11 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0212 0.126 0.147 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 1.19e-01 0.173 0.111 0.147 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00793 0.107 0.147 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 2.97e-01 -0.105 0.101 0.147 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 1.10e-01 -0.179 0.112 0.147 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0685 0.116 0.147 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 1.96e-01 0.168 0.129 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 3.47e-01 -0.103 0.109 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0776 0.115 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 1.94e-01 0.147 0.113 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 7.66e-01 -0.034 0.114 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 8.60e-01 0.0199 0.113 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 6.90e-02 0.219 0.12 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 4.66e-01 0.0652 0.0894 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0664 0.0917 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 9.50e-01 0.0062 0.0979 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 9.18e-01 0.0127 0.123 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 6.18e-01 0.0506 0.101 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0578 0.127 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 3.76e-01 0.101 0.113 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 1.29e-01 0.168 0.11 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 3.35e-01 0.102 0.105 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 5.15e-01 0.0733 0.112 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 2.46e-01 0.126 0.108 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 8.92e-01 0.0161 0.118 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0292 0.0918 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 8.64e-01 0.017 0.0993 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 9.36e-01 0.00883 0.109 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 1.44e-01 0.169 0.115 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 5.08e-01 0.0714 0.108 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0633 0.152 0.133 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 9.74e-01 0.00568 0.177 0.133 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000417 0.154 0.133 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -195876 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0945 0.143 0.133 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0971 0.102 0.133 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 6.28e-01 0.0679 0.14 0.133 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 3.82e-01 -0.13 0.149 0.133 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 2.19e-01 0.117 0.0951 0.146 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 3.96e-01 0.103 0.121 0.146 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 4.16e-01 0.0921 0.113 0.146 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0811 0.0809 0.146 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0457 0.113 0.146 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0167 0.104 0.146 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 4.85e-02 -0.244 0.123 0.145 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0757 0.12 0.145 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 5.12e-01 0.0631 0.0959 0.145 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 3.63e-01 0.1 0.11 0.145 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 9.10e-01 0.0127 0.112 0.145 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0585 0.112 0.145 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 5.50e-01 0.0728 0.122 0.154 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0739 0.132 0.154 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 7.55e-01 0.0353 0.113 0.154 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0285 0.0793 0.154 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -881856 sc-eQTL 1.22e-01 -0.157 0.101 0.154 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -978517 sc-eQTL 1.15e-01 0.158 0.0994 0.154 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 5.37e-02 -0.207 0.107 0.154 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 3.80e-01 0.0872 0.099 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0178 0.111 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 2.34e-01 -0.089 0.0746 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 9.02e-01 0.00809 0.0657 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -381049 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0486 0.124 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -881856 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0212 0.125 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -978517 sc-eQTL 3.14e-01 0.112 0.111 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 7.82e-01 0.0287 0.103 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 6.96e-01 0.0404 0.103 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 6.92e-01 0.0484 0.122 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 8.18e-01 0.0204 0.0883 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0103 0.0678 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -381049 sc-eQTL 9.95e-01 0.000753 0.117 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -881856 sc-eQTL 9.04e-01 0.0149 0.124 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -978517 sc-eQTL 5.29e-01 0.0636 0.101 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 7.55e-01 0.0316 0.101 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 4.00e-01 -0.131 0.155 0.136 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 7.95e-01 0.0348 0.134 0.136 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 2.78e-01 0.15 0.137 0.136 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00137 0.15 0.136 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 4.55e-01 -0.103 0.138 0.136 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 8.22e-01 0.0302 0.134 0.136 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0517 0.115 0.149 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0607 0.124 0.149 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00767 0.105 0.149 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 1.66e-01 -0.114 0.0822 0.149 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -381049 sc-eQTL 3.84e-01 0.0984 0.113 0.149 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -881856 sc-eQTL 1.65e-01 -0.164 0.118 0.149 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -978517 sc-eQTL 6.85e-01 0.0455 0.112 0.149 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 3.54e-01 -0.104 0.112 0.149 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 1.11e-01 -0.173 0.108 0.149 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 3.27e-01 -0.114 0.116 0.149 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0212 0.095 0.149 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0459 0.0862 0.149 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -381049 sc-eQTL 6.26e-02 0.18 0.0959 0.149 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -881856 sc-eQTL 5.91e-02 -0.199 0.105 0.149 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -978517 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0454 0.105 0.149 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 2.59e-01 0.123 0.109 0.149 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 9.48e-01 0.0081 0.125 0.158 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0699 0.137 0.158 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0721 0.114 0.158 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0777 0.105 0.158 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -881856 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0129 0.128 0.158 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -978517 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0301 0.0995 0.158 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0209 0.117 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0343 0.124 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 1.89e-01 0.135 0.103 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 6.49e-01 0.0416 0.0913 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -195876 sc-eQTL 2.08e-01 -0.131 0.104 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 3.71e-01 0.0585 0.0653 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0617 0.0865 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 3.04e-01 -0.097 0.0941 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0451 0.111 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 1.47e-01 0.127 0.0876 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 9.08e-01 0.00968 0.0833 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -195876 sc-eQTL 7.66e-01 0.0239 0.0802 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 9.28e-01 0.00511 0.0565 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00791 0.0729 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 5.85e-01 0.0474 0.0866 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 5.36e-01 0.0581 0.0937 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 8.04e-01 0.0264 0.106 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0636 0.0676 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00391 0.0596 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -381049 sc-eQTL 6.33e-01 -0.058 0.121 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -881856 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0191 0.125 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -978517 sc-eQTL 1.99e-01 0.131 0.102 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 5.42e-01 0.0585 0.0959 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 1.92e-01 -0.137 0.105 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 6.64e-02 -0.21 0.114 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 5.24e-01 -0.06 0.094 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0759 0.0751 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -381049 sc-eQTL 2.76e-01 0.12 0.11 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -881856 sc-eQTL 1.13e-01 -0.18 0.113 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -978517 sc-eQTL 8.48e-01 0.0207 0.108 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0126 0.108 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -769079 sc-eQTL 3.84e-01 0.0991 0.114 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -769273 sc-eQTL 4.63e-01 0.0571 0.0777 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -538282 sc-eQTL 9.29e-01 0.00765 0.0852 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -230065 sc-eQTL 8.14e-01 0.0225 0.0953 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -190795 sc-eQTL 3.02e-01 0.113 0.11 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -203984 sc-eQTL 2.86e-01 0.101 0.0946 0.147 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -538282 eQTL 0.0313 0.0399 0.0185 0.0 0.0 0.161
ENSG00000237329 AL356320.2 -509025 eQTL 0.0139 -0.112 0.0455 0.00178 0.0 0.161

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina