logo

Genes within 1Mb (chr1:30524942:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0501 0.0905 0.239 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 9.05e-01 0.00865 0.0725 0.239 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0722 0.0607 0.239 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -198643 sc-eQTL 9.75e-02 -0.106 0.0636 0.239 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0274 0.0501 0.239 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 4.25e-01 0.0468 0.0586 0.239 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 1.08e-01 0.111 0.0691 0.239 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 6.01e-01 0.0406 0.0775 0.239 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0274 0.0606 0.239 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0639 0.0538 0.239 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 5.40e-01 0.0367 0.0597 0.239 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 4.11e-02 0.109 0.053 0.239 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 4.12e-02 0.13 0.0634 0.239 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 2.73e-02 -0.228 0.103 0.239 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0805 0.0689 0.239 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0477 0.0608 0.239 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0465 0.059 0.239 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 7.37e-01 0.0232 0.0692 0.239 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 1.16e-01 0.137 0.0865 0.239 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 8.91e-01 0.0127 0.0928 0.236 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 6.59e-02 0.201 0.109 0.236 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0514 0.086 0.236 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 5.76e-01 0.0344 0.0614 0.236 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -884623 sc-eQTL 1.30e-01 0.153 0.101 0.236 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -981284 sc-eQTL 4.81e-01 0.0473 0.067 0.236 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 4.08e-01 0.0804 0.097 0.236 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0612 0.0695 0.239 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0598 0.0862 0.239 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 2.08e-01 0.0697 0.0551 0.239 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 2.30e-01 0.0611 0.0507 0.239 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -383816 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0932 0.0977 0.239 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -884623 sc-eQTL 2.86e-01 0.112 0.105 0.239 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -981284 sc-eQTL 3.33e-01 0.0896 0.0923 0.239 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 5.44e-01 0.0491 0.0808 0.239 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 8.54e-01 0.0184 0.0997 0.238 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00916 0.0683 0.238 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 1.37e-01 -0.106 0.0712 0.238 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0427 0.0824 0.238 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 4.92e-01 0.0637 0.0925 0.238 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 5.74e-01 0.0481 0.0855 0.238 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 5.57e-01 0.043 0.0732 0.239 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 1.49e-01 0.113 0.0779 0.239 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0542 0.0703 0.239 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0144 0.0577 0.239 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 2.46e-01 0.11 0.0942 0.239 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0991 0.0981 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 2.26e-01 -0.14 0.115 0.245 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 2.96e-01 0.122 0.116 0.245 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 5.52e-01 0.0644 0.108 0.245 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -198643 sc-eQTL 2.29e-02 0.214 0.093 0.245 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0617 0.0657 0.245 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 1.00e-02 0.272 0.104 0.245 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 1.61e-01 -0.132 0.0936 0.245 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 2.62e-01 -0.126 0.112 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 6.58e-01 0.0416 0.0939 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 2.87e-01 0.0943 0.0884 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -198643 sc-eQTL 2.43e-01 -0.108 0.0919 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0247 0.0566 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0259 0.0794 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 1.74e-01 0.121 0.0885 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 8.74e-02 0.182 0.106 0.239 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 9.63e-01 0.00461 0.0984 0.239 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0935 0.0854 0.239 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -198643 sc-eQTL 5.50e-01 0.049 0.0819 0.239 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 2.01e-01 0.0929 0.0723 0.239 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 1.29e-01 0.126 0.0826 0.239 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 5.50e-02 -0.186 0.0965 0.239 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0135 0.0981 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0198 0.0847 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 1.11e-01 -0.119 0.0743 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -198643 sc-eQTL 4.39e-03 -0.214 0.0744 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0189 0.0506 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0361 0.0665 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 1.80e-02 0.193 0.0811 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0891 0.105 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00887 0.0865 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 9.22e-01 0.00825 0.0846 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -198643 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0285 0.0812 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0383 0.0551 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 3.71e-01 0.0719 0.0802 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0778 0.0866 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 8.40e-01 0.0215 0.106 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 6.91e-01 0.0415 0.104 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 1.28e-03 0.326 0.0997 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 8.34e-03 0.239 0.0896 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0589 0.0997 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 5.81e-01 0.0486 0.088 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 8.98e-01 0.0104 0.0816 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0434 0.0723 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0664 0.0576 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00684 0.0619 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 6.51e-02 0.116 0.0623 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 6.41e-02 0.133 0.0716 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 7.76e-01 0.029 0.102 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0931 0.0817 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0722 0.0724 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 6.15e-01 0.0303 0.0601 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 1.56e-01 0.108 0.076 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 1.16e-01 0.134 0.0845 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 8.59e-01 0.0181 0.102 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 3.13e-01 0.0982 0.097 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 7.45e-01 0.0263 0.081 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 7.26e-01 0.0288 0.0819 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0644 0.0958 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0782 0.0943 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 1.94e-01 -0.144 0.111 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0613 0.0851 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 8.84e-01 0.0121 0.0827 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 8.96e-01 0.0119 0.0916 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 6.87e-02 0.175 0.0956 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0145 0.0906 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 1.88e-01 -0.135 0.102 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0917 0.0883 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0189 0.0712 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0546 0.0682 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 5.31e-01 0.0534 0.0851 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 6.20e-01 0.046 0.0927 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0416 0.116 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0345 0.107 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 1.86e-01 -0.132 0.0998 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 2.65e-01 -0.117 0.105 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0205 0.0971 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 8.65e-02 0.168 0.0974 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 4.55e-02 -0.223 0.111 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0743 0.107 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 4.83e-01 0.0768 0.109 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 8.31e-01 -0.022 0.103 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0931 0.107 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0453 0.0966 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 8.65e-01 0.0183 0.108 0.24 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 5.02e-01 0.0641 0.0954 0.24 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 1.14e-01 -0.144 0.091 0.24 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 7.01e-01 0.0332 0.0863 0.24 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 4.42e-01 0.0739 0.096 0.24 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 3.82e-02 -0.205 0.0981 0.24 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0204 0.112 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 2.56e-01 0.107 0.0941 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 2.05e-01 -0.126 0.0988 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 9.07e-01 0.0115 0.0978 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0172 0.0983 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 1.13e-01 0.153 0.0963 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 2.27e-01 -0.127 0.105 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 8.39e-01 0.0158 0.0776 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 6.47e-02 -0.147 0.079 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0947 0.0847 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 3.59e-01 0.0977 0.106 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 5.39e-01 0.054 0.0877 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0963 0.112 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 5.02e-01 0.0675 0.1 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 6.50e-01 0.0445 0.0978 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0504 0.0933 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 8.92e-03 0.258 0.0976 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 1.84e-01 0.128 0.0956 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 4.35e-01 0.0809 0.103 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 8.64e-01 0.0139 0.0808 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0671 0.0873 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 7.86e-01 0.0262 0.0962 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 2.93e-01 -0.107 0.102 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0278 0.0948 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 1.98e-01 0.148 0.114 0.248 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 2.67e-01 -0.148 0.133 0.248 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 1.32e-01 -0.175 0.115 0.248 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -198643 sc-eQTL 7.04e-01 0.0412 0.108 0.248 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 7.95e-01 0.0201 0.0773 0.248 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0369 0.106 0.248 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0605 0.113 0.248 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0472 0.0795 0.239 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 3.60e-02 0.211 0.0999 0.239 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0401 0.0942 0.239 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 6.71e-01 0.0288 0.0676 0.239 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 4.73e-01 0.0679 0.0943 0.239 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 5.26e-01 0.0551 0.0868 0.239 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0169 0.105 0.239 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0907 0.101 0.239 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 1.62e-02 -0.194 0.0798 0.239 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 8.55e-01 0.0169 0.0927 0.239 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 2.25e-02 0.214 0.0933 0.239 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 1.46e-01 -0.137 0.0939 0.239 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 9.37e-01 0.0084 0.106 0.232 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 3.31e-01 0.112 0.115 0.232 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0553 0.0987 0.232 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 8.66e-01 0.0117 0.0692 0.232 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -884623 sc-eQTL 1.34e-01 0.133 0.0884 0.232 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -981284 sc-eQTL 9.54e-01 0.00502 0.0874 0.232 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00603 0.094 0.232 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 3.05e-01 -0.087 0.0846 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0756 0.0945 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0111 0.0641 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 9.00e-01 0.00704 0.0562 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -383816 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0641 0.106 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -884623 sc-eQTL 3.19e-01 0.107 0.107 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -981284 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0258 0.0948 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 6.32e-01 0.0424 0.0884 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0133 0.0895 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0331 0.106 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 2.03e-01 0.0972 0.0761 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 8.54e-01 0.0108 0.0587 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -383816 sc-eQTL 4.67e-01 0.0738 0.101 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -884623 sc-eQTL 2.21e-01 0.131 0.107 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -981284 sc-eQTL 8.67e-01 0.0146 0.0872 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 2.86e-01 0.0934 0.0874 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 2.39e-01 -0.158 0.133 0.239 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 1.98e-01 0.148 0.114 0.239 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 6.25e-01 0.058 0.118 0.239 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0637 0.129 0.239 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 3.69e-01 -0.107 0.118 0.239 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 7.54e-01 0.0361 0.115 0.239 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 6.47e-01 0.0458 0.0997 0.236 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0159 0.107 0.236 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 6.41e-01 0.0425 0.0909 0.236 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 4.63e-01 0.0524 0.0713 0.236 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -383816 sc-eQTL 2.27e-01 -0.118 0.0974 0.236 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -884623 sc-eQTL 8.97e-01 0.0132 0.102 0.236 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -981284 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0306 0.0969 0.236 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 8.46e-02 0.167 0.0962 0.236 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 9.27e-01 0.00857 0.093 0.235 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0807 0.099 0.235 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 2.47e-01 0.0937 0.0807 0.235 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 9.92e-02 0.121 0.0731 0.235 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -383816 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0508 0.0824 0.235 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -884623 sc-eQTL 1.30e-01 0.136 0.0895 0.235 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -981284 sc-eQTL 1.85e-03 0.277 0.0878 0.235 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0907 0.093 0.235 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 1.32e-01 0.164 0.108 0.215 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 3.08e-01 0.122 0.119 0.215 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0283 0.0989 0.215 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 4.48e-01 0.0699 0.0918 0.215 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -884623 sc-eQTL 1.52e-01 -0.16 0.111 0.215 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -981284 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0554 0.0865 0.215 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 1.78e-01 0.137 0.101 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 4.07e-01 0.0882 0.106 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 3.74e-01 0.0787 0.0883 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 8.99e-01 0.01 0.0784 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -198643 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0622 0.0893 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0154 0.0562 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 2.77e-01 0.0807 0.0741 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 9.66e-01 0.00344 0.081 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0606 0.0953 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 9.61e-01 0.00373 0.0754 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 9.64e-02 -0.118 0.0709 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -198643 sc-eQTL 1.91e-02 -0.16 0.0678 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0252 0.0483 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 9.39e-01 0.00482 0.0625 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 8.23e-02 0.129 0.0737 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0651 0.0807 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0464 0.0915 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 7.76e-01 0.0166 0.0584 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 4.58e-01 0.0381 0.0513 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -383816 sc-eQTL 9.27e-01 0.00955 0.105 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -884623 sc-eQTL 2.70e-01 0.119 0.107 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -981284 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0233 0.0883 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 3.69e-01 0.0743 0.0825 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0532 0.0874 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0574 0.0957 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 1.11e-01 0.125 0.078 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 5.44e-02 0.12 0.0622 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -383816 sc-eQTL 1.31e-01 -0.138 0.0912 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -884623 sc-eQTL 7.64e-01 0.0285 0.095 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -981284 sc-eQTL 5.76e-02 0.171 0.0894 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 9.91e-01 0.00099 0.0903 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -771846 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00183 0.1 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -772040 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0309 0.0685 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -541049 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0882 0.0749 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0583 0.0839 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 sc-eQTL 5.06e-01 0.0644 0.0967 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -206751 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0039 0.0836 0.237 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 eQTL 0.0105 -0.0277 0.0108 0.0 0.0 0.276
ENSG00000168528 SERINC2 -884623 eQTL 0.026 0.0931 0.0417 0.0 0.0 0.276
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -193562 eQTL 4.26e-02 0.0276 0.0136 0.0 0.0 0.276

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 LAPTM5 -232832 1.47e-06 1.66e-06 2.51e-07 1.28e-06 4.27e-07 6.52e-07 1.37e-06 4.28e-07 1.7e-06 7.15e-07 2.02e-06 1.32e-06 2.56e-06 4.89e-07 4.26e-07 9.68e-07 1.11e-06 1.15e-06 5.36e-07 5.44e-07 6.18e-07 2e-06 1.34e-06 7.85e-07 2.34e-06 8.08e-07 1e-06 9.91e-07 1.75e-06 1.3e-06 7.35e-07 2.45e-07 3.78e-07 6.23e-07 8.69e-07 6.16e-07 7.02e-07 3.66e-07 4.94e-07 1.71e-07 2.88e-07 2.07e-06 3.68e-07 9e-08 3.4e-07 3.19e-07 2.87e-07 1.97e-07 2.89e-07
ENSG00000168528 SERINC2 -884623 2.76e-07 1.34e-07 4.98e-08 1.97e-07 9.79e-08 9.91e-08 1.61e-07 5.66e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.52e-07 1.01e-07 1.52e-07 7.13e-08 6.12e-08 7.49e-08 4.01e-08 1.4e-07 6.07e-08 4.21e-08 1.26e-07 1.24e-07 1.45e-07 2.79e-08 1.5e-07 1.25e-07 1.1e-07 9.74e-08 1.23e-07 1.07e-07 1.06e-07 2.93e-08 3.73e-08 8.56e-08 3.81e-08 3.14e-08 5.45e-08 8.63e-08 6.71e-08 4.24e-08 5.39e-08 1.4e-07 5.22e-08 1.38e-08 3.2e-08 1.89e-08 1.19e-07 1.88e-09 5.01e-08