logo

Genes within 1Mb (chr1:30522581:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 7.32e-02 0.202 0.112 0.152 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 2.57e-01 0.103 0.0903 0.152 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 2.81e-01 0.0819 0.0758 0.152 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -201004 sc-eQTL 6.40e-01 0.0374 0.0798 0.152 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00223 0.0625 0.152 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0396 0.0733 0.152 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 1.91e-01 0.113 0.0864 0.152 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 9.25e-01 0.0092 0.0971 0.152 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0131 0.0759 0.152 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00204 0.0676 0.152 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 5.25e-02 -0.145 0.0742 0.152 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 8.42e-01 0.0134 0.067 0.152 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 9.15e-01 0.00857 0.0802 0.152 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 2.86e-01 0.135 0.127 0.152 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0503 0.0844 0.152 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 5.56e-01 0.0438 0.0743 0.152 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 1.24e-01 -0.111 0.0718 0.152 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 7.62e-01 0.0256 0.0846 0.152 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 1.99e-01 -0.136 0.106 0.152 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0578 0.116 0.151 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 1.90e-01 -0.18 0.137 0.151 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 1.20e-01 -0.167 0.107 0.151 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 1.25e-01 -0.118 0.0765 0.151 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -886984 sc-eQTL 2.07e-01 0.16 0.126 0.151 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -983645 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0445 0.084 0.151 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 2.73e-01 -0.133 0.121 0.151 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 7.23e-01 0.0316 0.0892 0.152 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 6.14e-01 0.0558 0.11 0.152 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0393 0.0708 0.152 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 3.05e-01 0.0668 0.065 0.152 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -386177 sc-eQTL 5.97e-01 0.0663 0.125 0.152 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -886984 sc-eQTL 4.00e-01 0.113 0.134 0.152 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -983645 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0984 0.118 0.152 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 7.97e-02 0.181 0.103 0.152 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 8.61e-01 0.0216 0.123 0.152 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0164 0.0842 0.152 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 9.99e-01 -8.34e-05 0.0883 0.152 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 3.42e-01 0.0966 0.101 0.152 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 4.39e-01 0.0883 0.114 0.152 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 4.57e-01 0.0785 0.105 0.152 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 2.11e-01 0.116 0.0922 0.152 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0339 0.0989 0.152 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 1.37e-01 0.132 0.0885 0.152 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 2.02e-01 -0.093 0.0726 0.152 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 2.15e-01 -0.148 0.119 0.152 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0526 0.124 0.152 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 3.70e-01 -0.138 0.153 0.148 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 5.11e-01 0.102 0.154 0.148 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 7.64e-03 -0.38 0.141 0.148 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -201004 sc-eQTL 9.62e-01 0.00602 0.126 0.148 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 4.49e-01 0.0663 0.0874 0.148 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0676 0.141 0.148 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0777 0.125 0.148 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0503 0.138 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 8.64e-01 0.0198 0.115 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 7.94e-01 0.0284 0.109 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -201004 sc-eQTL 3.64e-01 -0.103 0.113 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0653 0.0692 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 1.25e-01 0.149 0.0968 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 8.76e-01 0.017 0.109 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 9.20e-01 0.0135 0.134 0.151 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 4.50e-01 0.0935 0.124 0.151 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0953 0.108 0.151 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -201004 sc-eQTL 6.46e-02 -0.19 0.102 0.151 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 1.19e-01 -0.142 0.0908 0.151 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 1.05e-01 -0.169 0.104 0.151 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 3.86e-01 0.106 0.122 0.151 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 2.88e-02 0.269 0.122 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 1.65e-02 0.254 0.105 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 3.16e-01 0.0944 0.0939 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -201004 sc-eQTL 6.62e-02 0.175 0.0947 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 6.83e-01 -0.026 0.0638 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0261 0.0838 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 2.43e-01 0.121 0.103 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 1.24e-01 0.201 0.13 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 8.10e-01 0.026 0.108 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 5.67e-01 0.0608 0.106 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -201004 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0125 0.102 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0479 0.069 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 4.50e-01 0.0761 0.101 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 5.00e-01 0.0734 0.109 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 2.53e-01 0.151 0.131 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0982 0.13 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 9.30e-03 -0.328 0.125 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 1.35e-01 -0.169 0.113 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 8.34e-02 -0.214 0.123 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0644 0.109 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0202 0.101 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 3.28e-01 0.0876 0.0893 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 7.17e-01 -0.026 0.0715 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0839 0.0764 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 9.46e-01 0.00523 0.0777 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000248 0.0893 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0389 0.128 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 6.24e-01 0.0506 0.103 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0162 0.0913 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0814 0.0755 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 2.85e-01 0.103 0.0958 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00468 0.107 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0244 0.128 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 1.37e-01 -0.181 0.121 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 2.60e-01 -0.114 0.101 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 9.36e-02 -0.172 0.102 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 1.79e-01 0.162 0.12 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 1.47e-01 -0.172 0.118 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 7.99e-01 0.0353 0.138 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 5.04e-01 -0.071 0.106 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00633 0.103 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 8.42e-01 0.0228 0.114 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 3.29e-01 0.117 0.12 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 1.86e-01 -0.149 0.112 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 1.86e-02 0.297 0.125 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 2.37e-01 -0.129 0.109 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 5.90e-01 0.0475 0.088 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 1.18e-01 -0.132 0.0839 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 2.65e-01 -0.117 0.105 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 3.43e-01 -0.109 0.114 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 8.77e-01 0.0221 0.143 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0608 0.131 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 4.53e-01 0.0925 0.123 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0926 0.129 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 1.44e-02 0.29 0.117 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 9.23e-01 0.0117 0.121 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 3.64e-01 -0.119 0.131 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 3.33e-01 0.122 0.126 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 8.63e-01 0.0223 0.129 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 1.27e-02 -0.3 0.119 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 7.09e-02 -0.226 0.125 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 5.42e-01 0.0695 0.114 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 3.91e-01 0.117 0.136 0.149 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 6.95e-01 0.0474 0.121 0.149 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 3.59e-01 0.106 0.115 0.149 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 1.39e-01 -0.161 0.108 0.149 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0822 0.121 0.149 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 9.87e-01 0.00209 0.125 0.149 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 2.23e-01 -0.169 0.138 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 7.97e-01 0.0302 0.117 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 8.73e-02 0.21 0.122 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 7.40e-01 0.0404 0.121 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 3.84e-01 -0.106 0.122 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 8.86e-01 0.0172 0.12 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 8.00e-01 0.0331 0.13 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0117 0.0964 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 5.56e-01 0.0583 0.0988 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 3.74e-01 0.0938 0.105 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0854 0.132 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 7.50e-01 0.0348 0.109 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 2.12e-01 0.174 0.139 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 6.01e-01 0.0654 0.125 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000608 0.122 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 9.96e-01 0.000599 0.116 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0808 0.123 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 1.71e-01 0.164 0.119 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 9.77e-01 0.00366 0.126 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 8.11e-02 -0.172 0.098 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0796 0.107 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 3.71e-01 0.105 0.117 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 2.92e-02 0.27 0.123 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 3.77e-01 0.102 0.116 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 3.41e-01 -0.15 0.157 0.148 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 1.14e-02 -0.457 0.178 0.148 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 6.01e-01 0.0831 0.159 0.148 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -201004 sc-eQTL 1.93e-01 0.193 0.147 0.148 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 5.53e-02 0.202 0.104 0.148 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 6.72e-01 0.0614 0.145 0.148 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 2.37e-01 -0.182 0.153 0.148 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 2.35e-01 -0.119 0.1 0.152 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 2.73e-01 -0.14 0.127 0.152 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 3.52e-01 0.111 0.119 0.152 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 1.07e-01 -0.138 0.0849 0.152 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 1.59e-01 -0.168 0.119 0.152 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0828 0.11 0.152 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0223 0.134 0.152 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 2.87e-03 -0.382 0.126 0.152 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 3.74e-01 0.0918 0.103 0.152 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 1.98e-02 -0.274 0.117 0.152 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 2.96e-02 -0.261 0.119 0.152 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 2.78e-01 0.131 0.12 0.152 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 2.01e-01 -0.17 0.132 0.156 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0071 0.144 0.156 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 2.36e-01 -0.147 0.123 0.156 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0735 0.0866 0.156 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -886984 sc-eQTL 3.31e-01 0.108 0.111 0.156 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -983645 sc-eQTL 9.63e-01 0.00502 0.109 0.156 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 2.82e-01 -0.127 0.117 0.156 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0183 0.107 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 4.15e-02 0.242 0.118 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0319 0.0808 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 4.60e-01 0.0524 0.0708 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -386177 sc-eQTL 3.62e-01 0.122 0.133 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -886984 sc-eQTL 5.26e-01 0.0858 0.135 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -983645 sc-eQTL 7.40e-01 0.0397 0.119 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 4.98e-02 0.218 0.11 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 6.13e-01 0.057 0.112 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0496 0.133 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0594 0.096 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 2.25e-01 0.0895 0.0736 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -386177 sc-eQTL 2.83e-01 -0.137 0.127 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -886984 sc-eQTL 6.49e-01 0.0616 0.135 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -983645 sc-eQTL 6.40e-03 -0.297 0.108 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 2.47e-01 0.128 0.11 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 1.83e-01 0.216 0.161 0.152 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 1.72e-01 -0.19 0.139 0.152 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0398 0.144 0.152 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 1.72e-02 -0.369 0.153 0.152 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0293 0.144 0.152 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0907 0.139 0.152 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 9.75e-01 0.00401 0.126 0.156 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 3.95e-01 -0.115 0.135 0.156 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 5.20e-01 0.0741 0.115 0.156 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 2.05e-01 0.114 0.0898 0.156 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -386177 sc-eQTL 3.67e-01 0.111 0.123 0.156 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -886984 sc-eQTL 5.57e-01 0.076 0.129 0.156 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -983645 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000859 0.122 0.156 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 9.07e-01 0.0143 0.123 0.156 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 5.74e-01 0.0655 0.116 0.156 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0812 0.124 0.156 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0558 0.101 0.156 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 7.21e-01 0.0329 0.092 0.156 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -386177 sc-eQTL 2.02e-01 -0.132 0.103 0.156 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -886984 sc-eQTL 1.03e-01 0.183 0.112 0.156 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -983645 sc-eQTL 8.58e-01 0.0201 0.113 0.156 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 9.66e-01 0.00492 0.117 0.156 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 9.31e-01 0.0115 0.132 0.164 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 2.95e-01 -0.151 0.144 0.164 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0791 0.12 0.164 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 1.58e-01 -0.157 0.111 0.164 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -886984 sc-eQTL 6.10e-01 0.0692 0.135 0.164 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -983645 sc-eQTL 9.19e-01 0.0107 0.105 0.164 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 3.86e-01 -0.107 0.123 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0949 0.132 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 5.32e-01 0.0687 0.11 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 2.39e-01 -0.115 0.097 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -201004 sc-eQTL 1.91e-01 -0.145 0.111 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 9.15e-02 -0.117 0.0693 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 8.38e-01 0.0189 0.0922 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 4.64e-01 0.0736 0.1 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 1.08e-02 0.304 0.118 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 1.45e-01 0.138 0.0944 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 2.81e-01 0.0968 0.0895 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -201004 sc-eQTL 9.57e-02 0.144 0.0859 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0334 0.0608 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 8.69e-01 0.0129 0.0786 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 1.79e-01 0.125 0.093 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 7.97e-01 0.0263 0.102 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 3.42e-01 0.11 0.115 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0495 0.0735 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 4.82e-01 0.0454 0.0646 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -386177 sc-eQTL 8.13e-01 0.0313 0.132 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -886984 sc-eQTL 5.69e-01 0.0774 0.136 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -983645 sc-eQTL 4.04e-01 -0.093 0.111 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 2.65e-02 0.23 0.103 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 5.20e-01 0.0714 0.111 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 2.30e-01 -0.146 0.121 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0164 0.0994 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 6.13e-01 0.0402 0.0795 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -386177 sc-eQTL 6.11e-01 0.0592 0.116 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -886984 sc-eQTL 3.85e-01 0.105 0.12 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -983645 sc-eQTL 3.92e-01 0.0978 0.114 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0117 0.114 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -774207 sc-eQTL 6.73e-01 0.0525 0.124 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774401 sc-eQTL 6.89e-01 -0.034 0.0849 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -543410 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0133 0.093 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -235193 sc-eQTL 3.62e-01 0.0948 0.104 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -195923 sc-eQTL 2.82e-01 0.129 0.12 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -209112 sc-eQTL 5.29e-01 0.0652 0.103 0.153 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000229447 AC114495.2 -741100 eQTL 0.0103 -0.126 0.0489 0.00196 0.0 0.137

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000229447 AC114495.2 -741100 3.07e-07 1.59e-07 5.91e-08 2.05e-07 1.03e-07 8.85e-08 7.1e-07 5.2e-08 1.86e-07 6.4e-08 1.66e-07 1.05e-07 4.11e-07 8.44e-08 6.27e-08 7.5e-08 4.18e-08 1.72e-07 7.09e-08 4.07e-08 1.26e-07 1.56e-07 3.99e-07 2.68e-08 3.27e-07 1.26e-07 1.07e-07 9.65e-08 6.91e-07 2.52e-07 1.06e-07 3.88e-08 2.74e-08 8.89e-08 3.46e-08 3.57e-08 5.03e-08 9.62e-08 6.86e-08 3.07e-08 4.19e-08 2.15e-07 4.76e-08 1.88e-08 6.92e-08 1.77e-08 1.27e-07 4.14e-09 4.81e-08