logo

Genes within 1Mb (chr1:30522436:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 3.11e-02 0.255 0.117 0.13 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 3.02e-01 0.098 0.0948 0.13 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 3.16e-01 0.0799 0.0796 0.13 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -201149 sc-eQTL 5.78e-01 0.0467 0.0838 0.13 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0179 0.0657 0.13 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 7.95e-01 -0.02 0.077 0.13 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 2.50e-01 0.105 0.0908 0.13 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 8.42e-01 0.0204 0.103 0.13 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0057 0.0803 0.13 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 6.72e-01 0.0303 0.0714 0.13 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 4.09e-02 -0.161 0.0784 0.13 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 9.29e-01 0.00635 0.0708 0.13 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0165 0.0848 0.13 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 2.41e-01 0.156 0.133 0.13 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0347 0.0889 0.13 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 6.94e-01 0.0308 0.0783 0.13 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 2.31e-02 -0.172 0.0751 0.13 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 8.94e-01 0.0119 0.0891 0.13 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 1.85e-01 -0.148 0.111 0.13 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 9.03e-01 0.0151 0.124 0.128 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 2.35e-01 -0.174 0.146 0.128 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 1.62e-02 -0.275 0.113 0.128 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 7.70e-02 -0.145 0.0816 0.128 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -887129 sc-eQTL 3.65e-01 0.123 0.135 0.128 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -983790 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0342 0.0898 0.128 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 4.66e-02 -0.258 0.129 0.128 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 5.15e-01 0.061 0.0936 0.13 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 9.50e-01 0.00722 0.116 0.13 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 7.37e-01 -0.025 0.0744 0.13 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 4.53e-01 0.0514 0.0684 0.13 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -386322 sc-eQTL 8.72e-01 0.0212 0.132 0.13 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -887129 sc-eQTL 6.06e-01 0.0728 0.141 0.13 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -983790 sc-eQTL 1.45e-01 -0.181 0.124 0.13 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 5.40e-02 0.209 0.108 0.13 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 6.19e-01 0.0647 0.13 0.131 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0134 0.0889 0.131 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0309 0.0932 0.131 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 2.66e-01 0.119 0.107 0.131 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 5.44e-01 0.0732 0.12 0.131 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 4.68e-01 0.0808 0.111 0.131 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 3.04e-01 0.0996 0.0967 0.13 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0528 0.104 0.13 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 1.98e-01 0.12 0.0928 0.13 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 1.22e-01 -0.118 0.0759 0.13 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 1.72e-01 -0.171 0.125 0.13 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0145 0.13 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 2.27e-01 -0.199 0.164 0.122 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 1.97e-01 0.214 0.165 0.122 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 1.81e-02 -0.362 0.152 0.122 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -201149 sc-eQTL 7.61e-01 -0.041 0.135 0.122 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 7.07e-01 0.0354 0.0939 0.122 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 4.63e-01 -0.111 0.151 0.122 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 2.78e-01 -0.146 0.134 0.122 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 2.89e-01 -0.154 0.145 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 6.10e-01 0.0621 0.121 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 5.22e-01 0.0735 0.115 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -201149 sc-eQTL 5.47e-01 -0.072 0.119 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0978 0.0729 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 7.93e-02 0.18 0.102 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00484 0.115 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 4.22e-01 0.114 0.141 0.129 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 5.05e-01 0.0871 0.13 0.129 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0619 0.114 0.129 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -201149 sc-eQTL 4.59e-02 -0.216 0.108 0.129 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 9.44e-02 -0.161 0.0957 0.129 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 6.87e-02 -0.2 0.109 0.129 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 4.62e-01 0.0951 0.129 0.129 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 5.37e-03 0.36 0.128 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 1.46e-02 0.274 0.111 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 2.71e-01 0.109 0.0991 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -201149 sc-eQTL 9.20e-02 0.17 0.1 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0369 0.0673 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 9.49e-01 0.00565 0.0885 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 3.37e-01 0.105 0.109 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 2.09e-01 0.174 0.138 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 8.18e-01 0.0264 0.115 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0522 0.112 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -201149 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0875 0.107 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0818 0.0729 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 6.46e-01 0.0489 0.106 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 3.22e-01 0.114 0.115 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 3.47e-01 0.132 0.14 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0663 0.138 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 5.66e-03 -0.372 0.133 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 1.16e-01 -0.189 0.12 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 5.30e-02 -0.255 0.131 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 1.67e-01 -0.161 0.116 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00179 0.107 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 3.08e-01 0.0962 0.0942 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0135 0.0754 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 2.30e-01 -0.097 0.0805 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0224 0.082 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00246 0.0942 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 9.39e-01 0.0103 0.134 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 5.15e-01 0.0704 0.108 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 6.24e-01 0.0469 0.0957 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 3.22e-02 -0.169 0.0786 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 1.11e-01 0.16 0.1 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00845 0.112 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0618 0.134 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 6.46e-02 -0.236 0.127 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0878 0.106 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 8.76e-02 -0.184 0.107 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 3.82e-01 0.11 0.126 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 1.95e-01 -0.161 0.124 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 6.52e-01 0.0657 0.145 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0148 0.112 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0127 0.108 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 9.46e-01 0.00809 0.12 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 9.89e-02 0.208 0.125 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 2.26e-01 -0.144 0.118 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 1.67e-02 0.318 0.132 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0682 0.115 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 8.04e-01 0.023 0.0928 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 4.48e-02 -0.178 0.0881 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 1.43e-01 -0.162 0.11 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0985 0.121 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 4.20e-01 0.121 0.15 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0501 0.138 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 3.60e-01 0.119 0.129 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 2.32e-01 -0.162 0.135 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 1.97e-02 0.291 0.124 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 9.98e-01 0.000352 0.127 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0512 0.136 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 5.83e-01 0.0717 0.131 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 5.53e-01 0.0792 0.133 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 1.52e-02 -0.303 0.124 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 1.50e-01 -0.187 0.13 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 9.42e-01 0.00865 0.118 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 4.59e-01 0.106 0.143 0.128 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0174 0.127 0.128 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 3.09e-01 0.123 0.121 0.128 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 6.21e-02 -0.213 0.114 0.128 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 2.18e-01 -0.157 0.127 0.128 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 9.06e-01 0.0156 0.131 0.128 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 2.92e-01 -0.153 0.145 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0188 0.123 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 1.18e-01 0.201 0.128 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 2.51e-01 0.146 0.127 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0625 0.128 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 9.94e-01 0.000944 0.126 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 3.48e-01 0.128 0.136 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0127 0.101 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00904 0.104 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 6.04e-01 0.0573 0.11 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0411 0.138 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 4.60e-01 0.0844 0.114 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 5.54e-02 0.286 0.148 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 4.00e-01 0.112 0.133 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0555 0.13 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 5.56e-01 0.0733 0.124 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 3.20e-01 -0.131 0.132 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 6.10e-02 0.239 0.127 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0229 0.134 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 5.08e-02 -0.203 0.103 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0714 0.113 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 2.57e-01 0.141 0.124 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 5.68e-02 0.25 0.131 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 8.62e-01 0.0213 0.122 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 4.70e-01 -0.124 0.171 0.122 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 3.70e-02 -0.41 0.194 0.122 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 6.19e-01 0.0857 0.172 0.122 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -201149 sc-eQTL 3.39e-01 0.154 0.16 0.122 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 2.95e-02 0.248 0.112 0.122 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0115 0.157 0.122 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 3.34e-01 -0.161 0.166 0.122 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0765 0.105 0.133 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 4.41e-01 -0.103 0.133 0.133 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 4.16e-01 0.101 0.124 0.133 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 1.12e-01 -0.142 0.0888 0.133 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 2.74e-02 -0.274 0.123 0.133 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0616 0.115 0.133 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0478 0.141 0.13 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 2.89e-03 -0.403 0.134 0.13 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 3.83e-01 0.0953 0.109 0.13 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 2.22e-02 -0.284 0.123 0.13 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 2.09e-02 -0.293 0.126 0.13 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 4.48e-01 0.0966 0.127 0.13 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0977 0.141 0.132 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0438 0.153 0.132 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 4.59e-02 -0.261 0.13 0.132 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 1.70e-01 -0.126 0.0915 0.132 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -887129 sc-eQTL 7.40e-01 0.0392 0.118 0.132 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -983790 sc-eQTL 3.75e-01 0.103 0.116 0.132 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 4.99e-02 -0.244 0.124 0.132 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 6.88e-01 0.0451 0.112 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 1.77e-01 0.169 0.125 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00851 0.0848 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 5.13e-01 0.0487 0.0743 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -386322 sc-eQTL 7.78e-01 0.0395 0.14 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -887129 sc-eQTL 7.75e-01 0.0407 0.142 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -983790 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00169 0.125 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 3.34e-02 0.248 0.116 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 8.27e-01 0.0259 0.118 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 8.13e-01 -0.033 0.139 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0529 0.101 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 4.26e-01 0.0617 0.0774 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -386322 sc-eQTL 9.45e-02 -0.223 0.133 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -887129 sc-eQTL 8.00e-01 0.036 0.142 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -983790 sc-eQTL 4.02e-03 -0.328 0.113 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 8.73e-02 0.197 0.115 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 4.62e-01 0.127 0.172 0.127 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 3.45e-01 -0.14 0.148 0.127 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0557 0.153 0.127 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 2.26e-02 -0.376 0.163 0.127 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00161 0.153 0.127 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0971 0.148 0.127 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 7.27e-01 0.0465 0.133 0.133 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0749 0.143 0.133 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 5.16e-01 0.0787 0.121 0.133 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 2.59e-01 0.107 0.0948 0.133 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -386322 sc-eQTL 3.06e-01 0.133 0.13 0.133 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -887129 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0387 0.136 0.133 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -983790 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0466 0.129 0.133 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 8.39e-01 0.0262 0.129 0.133 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 8.61e-01 0.0216 0.123 0.133 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0182 0.131 0.133 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0687 0.107 0.133 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 6.70e-01 0.0415 0.0973 0.133 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -386322 sc-eQTL 3.35e-01 -0.105 0.109 0.133 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -887129 sc-eQTL 4.43e-01 0.0913 0.119 0.133 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -983790 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0882 0.119 0.133 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 8.85e-01 0.0179 0.123 0.133 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0241 0.14 0.144 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 3.41e-01 -0.146 0.153 0.144 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 3.41e-01 -0.121 0.127 0.144 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 2.43e-01 -0.138 0.118 0.144 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -887129 sc-eQTL 4.79e-01 0.102 0.143 0.144 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -983790 sc-eQTL 8.37e-01 -0.023 0.111 0.144 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 3.43e-01 -0.124 0.131 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 3.73e-01 -0.124 0.139 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 3.97e-01 0.0982 0.116 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 5.72e-01 -0.058 0.103 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -201149 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0963 0.117 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 4.65e-02 -0.146 0.0729 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 8.26e-01 0.0214 0.0973 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 7.99e-01 0.0271 0.106 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 2.40e-03 0.382 0.124 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 1.47e-01 0.145 0.1 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 6.56e-01 0.0424 0.095 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -201149 sc-eQTL 1.78e-01 0.123 0.0911 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0569 0.0643 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 5.44e-01 0.0505 0.0831 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 2.44e-01 0.115 0.0985 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 6.49e-01 0.0487 0.107 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 6.77e-01 0.0504 0.121 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0258 0.0771 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 6.26e-01 0.033 0.0678 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -386322 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0832 0.138 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -887129 sc-eQTL 7.70e-01 0.0416 0.142 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -983790 sc-eQTL 2.08e-01 -0.147 0.116 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 1.18e-02 0.273 0.108 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 4.38e-01 0.091 0.117 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 3.93e-01 -0.11 0.128 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0346 0.105 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 7.71e-01 0.0245 0.084 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -386322 sc-eQTL 3.71e-01 0.11 0.122 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -887129 sc-eQTL 9.72e-01 0.00441 0.127 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -983790 sc-eQTL 9.26e-01 0.0113 0.121 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0103 0.121 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -774352 sc-eQTL 4.85e-01 0.0914 0.131 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -774546 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0257 0.0894 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -543555 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0531 0.0979 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -235338 sc-eQTL 3.67e-01 0.0989 0.109 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -196068 sc-eQTL 3.95e-01 0.108 0.126 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -209257 sc-eQTL 3.99e-01 0.092 0.109 0.131 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000229447 AC114495.2 -741245 eQTL 0.0111 -0.134 0.0528 0.00192 0.0 0.113

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000229447 AC114495.2 -741245 2.66e-07 1.36e-07 3.65e-08 2.15e-07 9.16e-08 9.87e-08 1.44e-07 5.2e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.63e-07 1.19e-07 1.59e-07 8.07e-08 5.69e-08 7.17e-08 4.63e-08 1.18e-07 5.97e-08 4.04e-08 1.04e-07 1.23e-07 1.26e-07 4.05e-08 1.4e-07 1.19e-07 1.11e-07 9.74e-08 1.05e-07 1.12e-07 1.07e-07 3.84e-08 2.74e-08 8.34e-08 8.98e-08 3.93e-08 5.04e-08 9.44e-08 6.54e-08 3.6e-08 3.34e-08 1.33e-07 3.93e-08 1.52e-08 5.75e-08 1.84e-08 1.3e-07 4.26e-09 4.79e-08
ENSG00000284543 \N -983845 2.6e-07 1.16e-07 3.39e-08 1.84e-07 9.02e-08 9.32e-08 1.42e-07 5.49e-08 1.41e-07 4.38e-08 1.6e-07 8.36e-08 1.3e-07 6.56e-08 5.99e-08 8.01e-08 5.1e-08 1.1e-07 5.21e-08 4.03e-08 1.06e-07 1.3e-07 1.29e-07 4.67e-08 1.31e-07 1.13e-07 1.1e-07 9.15e-08 9.97e-08 1.1e-07 9.91e-08 3.95e-08 2.74e-08 8.68e-08 9.02e-08 3.9e-08 4.72e-08 8.91e-08 7.92e-08 3.37e-08 3.25e-08 1.37e-07 4.23e-08 3.23e-08 8.03e-08 1.68e-08 1.44e-07 4.6e-09 4.85e-08