logo

Genes within 1Mb (chr1:30518951:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0186 0.0915 0.231 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 9.14e-01 0.00791 0.0733 0.231 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 8.45e-01 -0.012 0.0615 0.231 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -204634 sc-eQTL 4.48e-02 -0.129 0.0641 0.231 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0549 0.0505 0.231 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 6.86e-01 0.024 0.0593 0.231 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 7.99e-02 0.123 0.0697 0.231 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 9.04e-01 0.00948 0.0785 0.231 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 9.46e-01 0.00418 0.0614 0.231 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0487 0.0545 0.231 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 8.52e-01 0.0113 0.0605 0.231 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 1.37e-01 0.0804 0.0539 0.231 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 1.49e-01 0.0935 0.0645 0.231 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 1.46e-02 -0.257 0.104 0.231 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0548 0.0704 0.231 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0415 0.062 0.231 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0838 0.06 0.231 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0241 0.0706 0.231 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 1.86e-01 0.117 0.0884 0.231 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 9.04e-01 0.0114 0.0939 0.23 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 2.03e-01 0.141 0.111 0.23 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 3.07e-01 -0.089 0.0869 0.23 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 9.51e-01 0.00384 0.0622 0.23 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -890614 sc-eQTL 2.51e-01 0.118 0.102 0.23 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -987275 sc-eQTL 5.50e-01 0.0407 0.0679 0.23 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 6.46e-01 0.0452 0.0983 0.23 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0871 0.0706 0.231 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 2.52e-01 -0.101 0.0876 0.231 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 1.03e-01 0.0918 0.056 0.231 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 1.95e-01 0.067 0.0516 0.231 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -389807 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0271 0.0996 0.231 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -890614 sc-eQTL 1.78e-01 0.144 0.106 0.231 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -987275 sc-eQTL 2.22e-01 0.115 0.0938 0.231 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 3.70e-01 0.0737 0.0821 0.231 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 7.89e-01 -0.027 0.101 0.23 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 7.56e-01 0.0215 0.0689 0.23 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0916 0.072 0.23 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0491 0.0832 0.23 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 1.66e-01 0.129 0.0931 0.23 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 8.71e-01 0.014 0.0864 0.23 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 6.92e-01 0.0293 0.0739 0.231 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 2.15e-01 0.0979 0.0787 0.231 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0149 0.071 0.231 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0615 0.0581 0.231 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 3.05e-01 0.0977 0.0951 0.231 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0915 0.0991 0.231 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 3.18e-01 -0.117 0.117 0.232 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 3.08e-01 0.121 0.118 0.232 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 9.18e-01 0.0114 0.11 0.232 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -204634 sc-eQTL 3.77e-02 0.199 0.0951 0.232 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0516 0.067 0.232 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 1.90e-02 0.253 0.107 0.232 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0824 0.0957 0.232 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0654 0.114 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 6.47e-01 0.0434 0.0947 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 4.81e-02 0.176 0.0885 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -204634 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0818 0.0929 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0572 0.057 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 7.02e-01 0.0306 0.0801 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 2.55e-01 0.102 0.0894 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 6.57e-02 0.199 0.108 0.233 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 7.57e-01 0.031 0.1 0.233 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 7.08e-01 0.0326 0.087 0.233 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -204634 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00176 0.0833 0.233 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 6.09e-01 0.0378 0.0738 0.233 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 3.26e-01 0.083 0.0843 0.233 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 1.05e-01 -0.16 0.0983 0.233 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00926 0.0995 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0423 0.0859 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 1.27e-01 -0.115 0.0754 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -204634 sc-eQTL 5.05e-04 -0.264 0.0747 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0219 0.0514 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0582 0.0674 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 1.95e-02 0.194 0.0823 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 5.57e-01 -0.062 0.105 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0702 0.0869 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 9.43e-01 0.00613 0.0852 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -204634 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0568 0.0817 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0506 0.0554 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 4.87e-01 0.0563 0.0808 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0429 0.0873 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 4.53e-01 0.0812 0.108 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0479 0.106 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 3.16e-04 0.37 0.101 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 1.76e-02 0.219 0.0917 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0416 0.102 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 2.43e-01 0.105 0.0895 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0136 0.0826 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 9.82e-01 0.00162 0.0732 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0693 0.0583 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 7.02e-01 -0.024 0.0626 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 2.84e-01 0.0681 0.0634 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 2.97e-01 0.0762 0.0728 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 9.05e-01 0.0123 0.103 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 1.84e-01 -0.11 0.0825 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0514 0.0732 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 5.46e-01 0.0368 0.0608 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 1.68e-01 0.106 0.0768 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 7.77e-02 0.151 0.0853 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 8.77e-01 -0.016 0.103 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 1.82e-01 0.131 0.0977 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 8.68e-01 0.0136 0.0817 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00142 0.0827 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0124 0.0967 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0906 0.0951 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 1.26e-01 -0.171 0.111 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0726 0.0855 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 8.95e-01 -0.011 0.0832 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 2.45e-01 -0.107 0.0918 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 1.31e-01 0.146 0.0963 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 9.20e-01 0.00914 0.0911 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 1.30e-01 -0.158 0.104 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 2.18e-01 -0.111 0.0899 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 8.41e-01 0.0145 0.0726 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0589 0.0694 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 5.98e-01 0.0459 0.0868 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 6.52e-01 0.0427 0.0945 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 3.54e-01 -0.11 0.118 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 5.82e-01 0.0596 0.108 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 1.46e-01 -0.148 0.101 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 2.16e-01 -0.132 0.106 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00934 0.0986 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 1.11e-01 0.159 0.099 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 1.52e-01 -0.161 0.112 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0488 0.108 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 2.46e-01 0.128 0.11 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0424 0.103 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 9.88e-02 -0.177 0.107 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 9.95e-01 0.00063 0.0972 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 6.43e-01 0.0504 0.109 0.232 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 7.22e-01 0.0343 0.0963 0.232 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0956 0.0921 0.232 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0189 0.0871 0.232 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 4.93e-01 0.0666 0.097 0.232 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 6.64e-02 -0.183 0.0992 0.232 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 8.23e-01 0.0255 0.114 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 3.25e-01 0.0947 0.0959 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 1.42e-01 -0.148 0.1 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 7.31e-01 0.0343 0.0996 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 7.95e-01 0.026 0.1 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 2.03e-01 0.126 0.0982 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 5.55e-02 -0.203 0.106 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 7.76e-01 0.0225 0.0787 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 1.26e-01 -0.123 0.0804 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0907 0.0859 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 2.69e-01 0.119 0.108 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 4.87e-01 0.062 0.089 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 6.87e-02 -0.206 0.113 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 1.21e-01 0.157 0.101 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 9.14e-01 0.0107 0.0989 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0918 0.0942 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 7.10e-02 0.181 0.0996 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 9.01e-01 0.012 0.0971 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 2.36e-01 0.124 0.104 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 6.80e-01 0.0337 0.0815 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 8.12e-01 -0.021 0.0882 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 7.42e-01 -0.032 0.097 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0595 0.103 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0908 0.0955 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 6.39e-02 0.215 0.115 0.237 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 2.84e-01 -0.145 0.134 0.237 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 1.17e-01 -0.183 0.116 0.237 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -204634 sc-eQTL 5.71e-01 0.0621 0.109 0.237 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 5.45e-01 0.0474 0.0781 0.237 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0452 0.107 0.237 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 8.65e-01 0.0193 0.114 0.237 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0546 0.0807 0.23 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 4.02e-03 0.293 0.101 0.23 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0553 0.0956 0.23 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 7.15e-01 0.0251 0.0686 0.23 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0266 0.0959 0.23 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 8.90e-01 0.0122 0.0882 0.23 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0507 0.106 0.231 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0502 0.102 0.231 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 1.28e-01 -0.124 0.0814 0.231 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0346 0.0937 0.231 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 4.44e-02 0.191 0.0945 0.231 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 2.44e-01 -0.111 0.095 0.231 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0477 0.107 0.227 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 2.55e-01 0.132 0.116 0.227 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 8.72e-01 0.0161 0.0996 0.227 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00171 0.0698 0.227 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -890614 sc-eQTL 1.08e-01 0.144 0.089 0.227 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -987275 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0136 0.088 0.227 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0208 0.0948 0.227 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0562 0.085 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 1.34e-01 -0.142 0.0945 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 9.98e-01 0.000145 0.0643 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 7.22e-01 0.0201 0.0564 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -389807 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0261 0.106 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -890614 sc-eQTL 1.87e-01 0.142 0.107 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -987275 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00973 0.0951 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 8.77e-01 0.0138 0.0887 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0305 0.0897 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0146 0.106 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 3.27e-02 0.163 0.0758 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 7.99e-01 0.015 0.0589 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -389807 sc-eQTL 3.65e-01 0.0922 0.102 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -890614 sc-eQTL 1.26e-01 0.165 0.107 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -987275 sc-eQTL 9.19e-01 0.00887 0.0875 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 1.52e-01 0.126 0.0874 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 9.76e-02 -0.227 0.136 0.236 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 1.49e-01 0.17 0.117 0.236 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 6.66e-01 0.0525 0.121 0.236 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0877 0.132 0.236 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0378 0.122 0.236 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 5.70e-01 0.0672 0.118 0.236 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 6.50e-01 0.0457 0.101 0.229 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0547 0.108 0.229 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 4.56e-01 0.0684 0.0917 0.229 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 4.59e-01 0.0533 0.0719 0.229 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -389807 sc-eQTL 2.68e-01 -0.109 0.0984 0.229 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -890614 sc-eQTL 7.24e-01 0.0365 0.103 0.229 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -987275 sc-eQTL 8.89e-01 0.0136 0.0979 0.229 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 2.16e-01 0.121 0.0975 0.229 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0323 0.0941 0.231 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 2.05e-01 -0.127 0.1 0.231 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 3.66e-01 0.0741 0.0819 0.231 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 2.18e-01 0.0917 0.0742 0.231 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -389807 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0535 0.0834 0.231 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -890614 sc-eQTL 2.09e-01 0.114 0.0908 0.231 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -987275 sc-eQTL 1.07e-02 0.231 0.0896 0.231 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0855 0.0942 0.231 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 9.68e-02 0.18 0.108 0.212 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 7.22e-01 0.0425 0.119 0.212 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0908 0.0985 0.212 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 8.33e-01 0.0194 0.0919 0.212 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -890614 sc-eQTL 1.00e-01 -0.183 0.11 0.212 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -987275 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0435 0.0864 0.212 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 3.23e-01 0.1 0.101 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 2.44e-01 0.126 0.107 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 2.03e-01 0.114 0.0894 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 6.20e-02 0.148 0.0788 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -204634 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0334 0.0906 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0614 0.0568 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 1.97e-01 0.097 0.075 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 8.75e-01 0.0129 0.0821 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0393 0.0965 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0395 0.0763 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 9.80e-02 -0.119 0.0718 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -204634 sc-eQTL 4.19e-03 -0.197 0.0682 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0265 0.0489 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0216 0.0632 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 6.51e-02 0.138 0.0745 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0768 0.0814 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0958 0.0921 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 3.56e-01 0.0544 0.0588 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 3.83e-01 0.0452 0.0517 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -389807 sc-eQTL 5.69e-01 0.0602 0.106 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -890614 sc-eQTL 1.55e-01 0.155 0.108 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -987275 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00659 0.0891 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 3.73e-01 0.0744 0.0833 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0817 0.0884 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 1.96e-01 -0.125 0.0965 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 2.70e-01 0.0875 0.0791 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 8.64e-02 0.109 0.063 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -389807 sc-eQTL 2.52e-01 -0.106 0.0924 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -890614 sc-eQTL 6.74e-01 0.0405 0.0961 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -987275 sc-eQTL 2.57e-02 0.203 0.0902 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 7.50e-01 0.0292 0.0914 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -777837 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0511 0.101 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778031 sc-eQTL 9.02e-01 0.00849 0.0692 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -547040 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0647 0.0757 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0696 0.0846 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199553 sc-eQTL 3.24e-01 0.0964 0.0975 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -212742 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0379 0.0843 0.228 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 eQTL 0.0257 -0.0245 0.011 0.0 0.0 0.267
ENSG00000168528 SERINC2 -890614 eQTL 0.0456 0.0849 0.0424 0.0 0.0 0.267

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 LAPTM5 -238823 1.29e-06 1.01e-06 2.54e-07 1.32e-06 2.66e-07 6.09e-07 1.49e-06 3.46e-07 1.5e-06 6.23e-07 1.48e-06 6.62e-07 2.51e-06 2.95e-07 5.06e-07 9.23e-07 8.37e-07 7.08e-07 5.83e-07 6.9e-07 7.6e-07 1.69e-06 1.05e-06 6.57e-07 2.25e-06 3.91e-07 8.75e-07 7.09e-07 1.57e-06 1.26e-06 6.9e-07 9.48e-08 2.24e-07 6.53e-07 5.46e-07 4.3e-07 5.04e-07 2.21e-07 3.25e-07 2.51e-07 2.84e-07 2.09e-06 4.11e-07 9.66e-08 1.7e-07 1.24e-07 2.16e-07 5.45e-08 1.9e-07