logo

Genes within 1Mb (chr1:30518936:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0212 0.0928 0.216 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 7.09e-01 0.0278 0.0743 0.216 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0287 0.0624 0.216 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -204649 sc-eQTL 4.71e-02 -0.13 0.065 0.216 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0337 0.0513 0.216 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 8.27e-01 0.0132 0.0602 0.216 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 7.08e-02 0.128 0.0707 0.216 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 9.74e-01 0.00264 0.0796 0.216 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0134 0.0622 0.216 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0423 0.0553 0.216 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 7.12e-01 0.0227 0.0614 0.216 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 1.69e-01 0.0754 0.0547 0.216 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 5.93e-02 0.124 0.0652 0.216 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 2.94e-02 -0.234 0.107 0.216 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 2.78e-01 -0.078 0.0717 0.216 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0376 0.0633 0.216 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0599 0.0613 0.216 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00398 0.0721 0.216 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 7.70e-02 0.16 0.0899 0.216 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0158 0.096 0.214 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 1.44e-01 0.166 0.113 0.214 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0698 0.0889 0.214 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 5.14e-01 0.0415 0.0635 0.214 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -890629 sc-eQTL 1.67e-01 0.145 0.104 0.214 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -987290 sc-eQTL 4.22e-01 0.0557 0.0693 0.214 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 4.12e-01 0.0825 0.1 0.214 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0746 0.0714 0.216 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0491 0.0887 0.216 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 1.91e-01 0.0743 0.0567 0.216 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 1.08e-01 0.0841 0.052 0.216 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -389822 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0645 0.101 0.216 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -890629 sc-eQTL 1.75e-01 0.146 0.107 0.216 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -987290 sc-eQTL 2.09e-01 0.119 0.0947 0.216 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 2.69e-01 0.0918 0.0829 0.216 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 6.99e-01 0.0401 0.103 0.215 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 7.27e-01 0.0248 0.0708 0.215 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0944 0.074 0.215 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0332 0.0854 0.215 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 4.13e-01 0.0786 0.0959 0.215 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 6.23e-01 0.0436 0.0886 0.215 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 5.95e-01 0.0403 0.0756 0.216 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 2.00e-01 0.104 0.0805 0.216 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0182 0.0727 0.216 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0462 0.0595 0.216 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 3.12e-01 0.0987 0.0973 0.216 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 2.98e-01 -0.106 0.101 0.216 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 3.21e-01 -0.119 0.12 0.217 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 2.68e-01 0.134 0.121 0.217 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 9.85e-01 0.00217 0.112 0.217 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -204649 sc-eQTL 1.80e-02 0.231 0.0967 0.217 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0384 0.0685 0.217 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 1.60e-02 0.265 0.109 0.217 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0594 0.0978 0.217 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0977 0.115 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 5.93e-01 0.0515 0.0963 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 1.56e-01 0.129 0.0904 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -204649 sc-eQTL 2.42e-01 -0.111 0.0943 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0142 0.058 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0189 0.0815 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 1.50e-01 0.131 0.0907 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 6.49e-02 0.203 0.109 0.218 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 9.17e-01 0.0106 0.101 0.218 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0154 0.0883 0.218 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -204649 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0129 0.0845 0.218 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 2.81e-01 0.0808 0.0747 0.218 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 3.08e-01 0.0874 0.0855 0.218 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 2.17e-02 -0.229 0.0991 0.218 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 9.43e-01 0.00729 0.101 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00685 0.0873 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0987 0.0767 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -204649 sc-eQTL 1.43e-03 -0.246 0.0763 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0217 0.0522 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0872 0.0683 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 8.99e-03 0.22 0.0833 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 3.23e-01 -0.106 0.107 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0533 0.0888 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 8.47e-01 0.0168 0.087 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -204649 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0688 0.0834 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 5.15e-01 -0.037 0.0567 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 3.44e-01 0.0782 0.0824 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0688 0.0891 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 4.86e-01 0.0767 0.11 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 7.74e-01 -0.031 0.108 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 1.89e-04 0.389 0.102 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 1.75e-02 0.223 0.0932 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0431 0.103 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 2.94e-01 0.0958 0.091 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0277 0.0838 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00457 0.0743 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0689 0.0592 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0165 0.0636 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 3.35e-01 0.0623 0.0644 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 1.43e-01 0.109 0.0737 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 7.92e-01 0.0276 0.105 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 9.55e-02 -0.14 0.0837 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0503 0.0745 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 4.68e-01 0.045 0.0618 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 2.09e-01 0.0985 0.0782 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 8.42e-02 0.151 0.0868 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00399 0.105 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 3.04e-01 0.103 0.1 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 7.71e-01 0.0243 0.0835 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 7.26e-01 0.0296 0.0844 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000488 0.0988 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 4.98e-01 -0.066 0.0972 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 1.32e-01 -0.173 0.114 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0882 0.0877 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 9.98e-01 0.000233 0.0854 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 5.90e-01 -0.051 0.0945 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 2.18e-01 0.122 0.099 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 8.95e-01 0.0124 0.0935 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 2.60e-01 -0.119 0.106 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 1.78e-01 -0.123 0.0911 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 7.08e-01 0.0276 0.0736 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0542 0.0704 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 6.43e-01 0.0408 0.088 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 5.20e-01 0.0617 0.0958 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 3.90e-01 -0.103 0.12 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 8.96e-01 0.0144 0.11 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 2.22e-01 -0.127 0.103 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 3.71e-01 -0.097 0.108 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0207 0.1 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 9.79e-02 0.168 0.101 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 1.05e-01 -0.186 0.114 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0562 0.11 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 4.82e-01 0.0794 0.113 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0518 0.106 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 2.15e-01 -0.136 0.11 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 9.87e-01 0.00163 0.0997 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 9.43e-01 0.00788 0.111 0.216 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 6.87e-01 0.0396 0.0984 0.216 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0977 0.0941 0.216 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 8.68e-01 0.0148 0.089 0.216 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 4.13e-01 0.0812 0.0989 0.216 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 3.90e-02 -0.21 0.101 0.216 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 9.30e-01 0.0102 0.116 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 1.51e-01 0.14 0.0975 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 1.68e-01 -0.142 0.102 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 8.63e-01 0.0175 0.101 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 9.06e-01 -0.012 0.102 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 1.59e-01 0.141 0.1 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 1.13e-01 -0.173 0.109 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 6.21e-01 0.0401 0.081 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 1.45e-01 -0.121 0.0827 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0844 0.0884 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 4.70e-01 0.0803 0.111 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 5.07e-01 0.0608 0.0915 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 9.17e-02 -0.197 0.116 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 7.26e-01 0.0367 0.105 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 8.30e-01 -0.022 0.102 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 2.48e-01 -0.112 0.097 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 2.27e-02 0.235 0.102 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 3.49e-01 0.0937 0.0998 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 6.34e-02 0.199 0.107 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 6.14e-01 0.0424 0.0838 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0179 0.0907 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 7.66e-01 0.0297 0.0998 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 3.20e-01 -0.105 0.106 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0291 0.0984 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 8.85e-02 0.204 0.118 0.226 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 5.56e-01 -0.082 0.139 0.226 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 1.24e-01 -0.185 0.12 0.226 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -204649 sc-eQTL 6.85e-01 0.0459 0.113 0.226 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 6.99e-01 0.0312 0.0805 0.226 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0767 0.11 0.226 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 8.88e-01 0.0166 0.117 0.226 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0192 0.0821 0.217 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 1.61e-02 0.249 0.103 0.217 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0431 0.0972 0.217 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 7.40e-01 0.0232 0.0697 0.217 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00596 0.0975 0.217 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 9.26e-01 0.00838 0.0897 0.217 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0491 0.107 0.216 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0892 0.104 0.216 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 4.92e-02 -0.163 0.0825 0.216 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00258 0.0953 0.216 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 3.73e-02 0.201 0.0961 0.216 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 1.72e-01 -0.132 0.0966 0.216 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0543 0.109 0.21 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 3.73e-01 0.105 0.118 0.21 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 8.93e-01 0.0137 0.101 0.21 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 5.40e-01 0.0435 0.0709 0.21 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -890629 sc-eQTL 1.60e-01 0.128 0.0907 0.21 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -987290 sc-eQTL 9.36e-01 0.00723 0.0896 0.21 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 9.58e-01 0.00509 0.0964 0.21 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0548 0.0864 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 2.71e-01 -0.106 0.0961 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00853 0.0653 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 4.21e-01 0.0461 0.0572 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -389822 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0169 0.108 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -890629 sc-eQTL 2.00e-01 0.14 0.109 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -987290 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0294 0.0965 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 5.24e-01 0.0574 0.09 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 8.86e-01 0.0131 0.0909 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 8.30e-01 0.0231 0.107 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 9.95e-02 0.128 0.0771 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 7.28e-01 0.0208 0.0596 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -389822 sc-eQTL 5.56e-01 0.0607 0.103 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -890629 sc-eQTL 1.03e-01 0.178 0.108 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -987290 sc-eQTL 8.24e-01 0.0197 0.0886 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 1.68e-01 0.123 0.0886 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 7.33e-02 -0.249 0.138 0.221 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 1.73e-01 0.163 0.119 0.221 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 6.96e-01 0.0484 0.123 0.221 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0848 0.134 0.221 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 3.21e-01 -0.123 0.123 0.221 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 8.53e-01 0.0223 0.12 0.221 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 9.48e-01 0.00673 0.102 0.213 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 8.32e-01 0.0233 0.11 0.213 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 6.84e-01 0.038 0.0933 0.213 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 2.06e-01 0.0926 0.0729 0.213 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -389822 sc-eQTL 1.70e-01 -0.137 0.0998 0.213 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -890629 sc-eQTL 8.89e-01 0.0147 0.105 0.213 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -987290 sc-eQTL 7.76e-01 0.0283 0.0994 0.213 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 1.16e-01 0.156 0.0989 0.213 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 8.84e-01 0.014 0.0956 0.215 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 2.60e-01 -0.115 0.102 0.215 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 2.41e-01 0.0976 0.083 0.215 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 4.36e-02 0.152 0.0749 0.215 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -389822 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0438 0.0848 0.215 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -890629 sc-eQTL 2.70e-01 0.102 0.0923 0.215 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -987290 sc-eQTL 4.73e-03 0.259 0.0907 0.215 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 1.80e-01 -0.129 0.0955 0.215 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 2.03e-01 0.144 0.112 0.195 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 4.79e-01 0.0877 0.124 0.195 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0254 0.103 0.195 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 5.38e-01 0.0589 0.0953 0.195 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -890629 sc-eQTL 1.61e-01 -0.162 0.115 0.195 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -987290 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0416 0.0898 0.195 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 2.06e-01 0.133 0.105 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 2.71e-01 0.121 0.109 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 2.49e-01 0.105 0.091 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 3.31e-01 0.0787 0.0807 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -204649 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0591 0.0922 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0167 0.058 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 3.56e-01 0.0708 0.0765 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 9.82e-01 0.00191 0.0836 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0493 0.0983 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00538 0.0778 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 1.69e-01 -0.101 0.0732 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -204649 sc-eQTL 6.11e-03 -0.193 0.0696 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0283 0.0498 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0312 0.0643 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 5.56e-02 0.146 0.0758 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0554 0.0824 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0472 0.0934 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 6.10e-01 0.0304 0.0596 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 2.85e-01 0.056 0.0523 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -389822 sc-eQTL 6.92e-01 0.0424 0.107 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -890629 sc-eQTL 1.45e-01 0.16 0.109 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -987290 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0138 0.0902 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 1.94e-01 0.11 0.0841 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 4.37e-01 -0.07 0.0899 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0728 0.0983 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 2.62e-01 0.0904 0.0804 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 1.40e-02 0.158 0.0636 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -389822 sc-eQTL 1.31e-01 -0.142 0.0937 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -890629 sc-eQTL 8.14e-01 0.023 0.0977 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -987290 sc-eQTL 1.83e-02 0.218 0.0915 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 9.44e-01 0.0065 0.0929 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -777852 sc-eQTL 8.28e-01 0.0227 0.104 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -778046 sc-eQTL 9.81e-01 0.00172 0.0712 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -547055 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0635 0.0778 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0507 0.087 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -199568 sc-eQTL 5.03e-01 0.0674 0.1 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -212757 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00342 0.0867 0.213 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 eQTL 0.0386 -0.0231 0.0111 0.0 0.0 0.255
ENSG00000168528 SERINC2 -890629 eQTL 0.046 0.0859 0.043 0.0 0.0 0.255

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 LAPTM5 -238838 1.29e-06 1.03e-06 3.41e-07 1.15e-06 3.51e-07 5.26e-07 1.6e-06 3.75e-07 1.52e-06 4.7e-07 1.86e-06 7.32e-07 2.38e-06 2.89e-07 5.28e-07 8.62e-07 8.95e-07 7.02e-07 8.13e-07 6.52e-07 6.36e-07 1.6e-06 8.92e-07 6.51e-07 2.18e-06 5.53e-07 8.73e-07 7.24e-07 1.37e-06 1.22e-06 7.47e-07 1.87e-07 2.02e-07 6.76e-07 5.69e-07 4.4e-07 6.19e-07 2.24e-07 4.1e-07 2.51e-07 2.84e-07 1.63e-06 6.21e-08 1.06e-07 1.69e-07 1.25e-07 2.27e-07 7.74e-08 1.06e-07