logo

Genes within 1Mb (chr1:30515518:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 1.60e-01 -0.17 0.121 0.113 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 6.61e-01 0.0426 0.0969 0.113 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 3.57e-01 0.075 0.0812 0.113 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -208067 sc-eQTL 3.26e-01 0.0841 0.0853 0.113 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00862 0.067 0.113 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 9.58e-01 0.00417 0.0785 0.113 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 8.80e-01 -0.014 0.0929 0.113 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0583 0.103 0.113 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 8.16e-02 -0.14 0.0799 0.113 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 7.48e-01 -0.023 0.0716 0.113 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 8.11e-01 -0.019 0.0793 0.113 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00887 0.071 0.113 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 1.42e-01 -0.125 0.0846 0.113 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 8.68e-01 0.0231 0.139 0.113 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0375 0.0924 0.113 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0729 0.0812 0.113 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0106 0.079 0.113 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 6.39e-01 0.0434 0.0925 0.113 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 4.39e-01 -0.09 0.116 0.113 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 4.74e-01 0.0879 0.123 0.108 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 7.78e-01 -0.041 0.145 0.108 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0184 0.114 0.108 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 5.47e-01 -0.049 0.0812 0.108 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -894047 sc-eQTL 1.73e-01 -0.183 0.133 0.108 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -990708 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0197 0.0888 0.108 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 1.21e-01 -0.199 0.128 0.108 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 6.53e-01 -0.042 0.0933 0.113 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 6.53e-01 -0.052 0.116 0.113 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 6.97e-01 0.029 0.0742 0.113 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0409 0.0682 0.113 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -393240 sc-eQTL 5.23e-01 0.0839 0.131 0.113 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -894047 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0895 0.141 0.113 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -990708 sc-eQTL 2.07e-01 -0.156 0.124 0.113 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 2.06e-01 0.137 0.108 0.113 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0583 0.129 0.114 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0239 0.0886 0.114 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 4.43e-01 0.0713 0.0928 0.114 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0475 0.107 0.114 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 2.54e-01 -0.137 0.12 0.114 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 2.76e-01 0.121 0.111 0.114 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 4.74e-01 0.0717 0.0999 0.113 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0315 0.107 0.113 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000434 0.0961 0.113 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 9.21e-01 0.0078 0.0788 0.113 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0192 0.129 0.113 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 5.20e-01 0.0864 0.134 0.113 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 3.98e-02 -0.306 0.148 0.125 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 7.39e-01 0.0504 0.151 0.125 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 2.21e-01 -0.171 0.14 0.125 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -208067 sc-eQTL 1.32e-01 -0.184 0.122 0.125 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 3.57e-01 0.0787 0.0853 0.125 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00654 0.138 0.125 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 2.83e-01 -0.131 0.122 0.125 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 2.50e-01 -0.169 0.147 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00499 0.123 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0366 0.116 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -208067 sc-eQTL 3.84e-01 0.105 0.12 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 7.50e-01 0.0236 0.0739 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 3.88e-01 0.0895 0.104 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 1.45e-01 0.169 0.116 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 3.38e-01 0.137 0.143 0.11 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0812 0.132 0.11 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0452 0.115 0.11 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -208067 sc-eQTL 2.63e-01 0.123 0.11 0.11 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0592 0.0973 0.11 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 1.92e-01 0.145 0.111 0.11 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 6.12e-01 0.0662 0.13 0.11 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0263 0.129 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 1.89e-01 0.146 0.111 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 1.07e-01 0.159 0.0978 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -208067 sc-eQTL 1.57e-01 0.141 0.0994 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00796 0.0667 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 6.73e-01 -0.037 0.0876 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 2.83e-01 -0.116 0.108 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 2.53e-03 -0.412 0.135 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 3.40e-01 -0.108 0.114 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 3.26e-01 0.109 0.111 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -208067 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0964 0.107 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 3.71e-01 0.065 0.0724 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0812 0.106 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 6.69e-01 0.0488 0.114 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0192 0.14 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 9.90e-01 0.00168 0.138 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 3.50e-03 -0.39 0.132 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 4.55e-01 0.0899 0.12 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 9.07e-01 0.0153 0.132 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 8.78e-01 0.0179 0.116 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00613 0.107 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 4.84e-02 -0.187 0.0944 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 9.72e-01 0.00266 0.0761 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0311 0.0815 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 3.84e-01 -0.072 0.0826 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0524 0.0949 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 3.91e-02 -0.279 0.135 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 2.24e-01 0.133 0.109 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 5.93e-01 0.0519 0.097 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 8.57e-02 -0.138 0.08 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 1.11e-01 0.163 0.102 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 1.12e-01 -0.18 0.113 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 8.74e-01 -0.021 0.132 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 3.06e-01 -0.129 0.126 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0837 0.105 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 6.16e-01 0.0533 0.106 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 1.22e-01 -0.192 0.124 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 9.64e-01 0.00556 0.122 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 9.68e-02 0.249 0.149 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0333 0.115 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 8.04e-02 0.195 0.111 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 8.79e-01 0.0188 0.124 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 7.27e-01 0.0455 0.13 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0853 0.122 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0634 0.134 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 9.68e-01 0.00459 0.116 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0502 0.0931 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 2.24e-01 -0.109 0.089 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 3.56e-02 -0.233 0.11 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0895 0.121 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 9.15e-01 0.0163 0.152 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0268 0.139 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 8.36e-01 0.0271 0.131 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 7.26e-01 -0.048 0.137 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 2.93e-01 0.133 0.126 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 4.30e-01 0.101 0.128 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 1.69e-01 -0.198 0.143 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 1.76e-01 0.187 0.138 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 6.47e-01 0.0647 0.141 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 9.81e-01 0.00316 0.133 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 8.56e-01 -0.025 0.138 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 1.79e-01 -0.167 0.124 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 8.42e-01 0.0287 0.144 0.113 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0914 0.127 0.113 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0165 0.122 0.113 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0126 0.115 0.113 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 3.59e-01 -0.118 0.128 0.113 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 6.04e-01 0.0685 0.132 0.113 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 2.99e-01 -0.149 0.143 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 8.95e-01 0.0161 0.122 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 2.75e-01 -0.139 0.127 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 3.45e-01 -0.119 0.126 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 3.22e-01 -0.125 0.126 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 7.94e-01 0.0326 0.125 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 4.07e-01 -0.113 0.136 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00351 0.101 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 1.26e-01 0.158 0.103 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0549 0.111 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 5.98e-01 -0.073 0.138 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 8.18e-03 0.3 0.112 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 5.47e-01 0.0864 0.143 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 8.76e-01 0.0201 0.128 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 1.92e-01 0.163 0.124 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 9.42e-01 0.00869 0.119 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0378 0.127 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 1.77e-02 0.289 0.121 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 5.18e-01 0.087 0.134 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 6.24e-01 0.0514 0.105 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0902 0.113 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 9.73e-01 0.0042 0.125 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0257 0.132 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0217 0.123 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 1.52e-01 0.207 0.143 0.111 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 9.74e-01 0.00546 0.168 0.111 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 5.61e-01 0.0848 0.145 0.111 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -208067 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0693 0.136 0.111 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 9.52e-01 0.00587 0.097 0.111 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 6.57e-01 0.059 0.133 0.111 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 8.49e-01 0.027 0.141 0.111 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00135 0.108 0.115 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 1.29e-01 -0.207 0.136 0.115 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 2.60e-01 0.143 0.127 0.115 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 6.44e-01 0.0423 0.0914 0.115 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 1.00e+00 -3.98e-06 0.128 0.115 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 6.34e-01 0.056 0.117 0.115 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0116 0.141 0.113 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0297 0.137 0.113 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 6.09e-01 -0.056 0.109 0.113 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 3.04e-01 0.129 0.125 0.113 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0698 0.128 0.113 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 1.19e-01 0.198 0.127 0.113 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0354 0.143 0.112 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 4.85e-01 -0.108 0.155 0.112 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 2.13e-01 -0.166 0.133 0.112 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0781 0.0932 0.112 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -894047 sc-eQTL 9.16e-01 0.0126 0.12 0.112 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -990708 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0588 0.118 0.112 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 3.60e-01 -0.116 0.127 0.112 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0879 0.111 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00549 0.124 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0142 0.0838 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0275 0.0735 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -393240 sc-eQTL 7.23e-01 0.0491 0.138 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -894047 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0511 0.14 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -990708 sc-eQTL 2.48e-01 -0.143 0.124 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 2.80e-01 0.125 0.115 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 1.36e-01 -0.174 0.116 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 2.23e-01 -0.168 0.137 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0856 0.0995 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00121 0.0766 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -393240 sc-eQTL 8.37e-01 0.0273 0.132 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -894047 sc-eQTL 4.12e-01 -0.115 0.14 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -990708 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0756 0.114 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 9.24e-01 0.0109 0.114 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 1.49e-01 0.281 0.194 0.097 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0966 0.167 0.097 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 6.20e-01 0.0859 0.173 0.097 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 4.30e-01 -0.149 0.187 0.097 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 1.40e-01 0.255 0.172 0.097 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 3.01e-01 0.173 0.167 0.097 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0903 0.129 0.118 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 8.90e-01 0.0192 0.139 0.118 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 9.21e-01 0.0118 0.118 0.118 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0522 0.0926 0.118 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -393240 sc-eQTL 4.59e-01 0.0941 0.127 0.118 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -894047 sc-eQTL 4.42e-01 -0.102 0.133 0.118 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -990708 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0817 0.126 0.118 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 4.99e-01 0.0852 0.126 0.118 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 1.32e-01 0.192 0.127 0.115 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 4.43e-02 0.273 0.135 0.115 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 8.80e-01 0.0169 0.111 0.115 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0761 0.101 0.115 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -393240 sc-eQTL 3.49e-01 0.106 0.113 0.115 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -894047 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0754 0.124 0.115 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -990708 sc-eQTL 7.85e-01 0.0337 0.124 0.115 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0408 0.128 0.115 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 4.31e-01 0.111 0.14 0.116 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 2.99e-01 -0.16 0.153 0.116 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 9.05e-01 0.0152 0.128 0.116 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0822 0.118 0.116 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -894047 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0634 0.144 0.116 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -990708 sc-eQTL 7.92e-01 0.0296 0.112 0.116 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0211 0.131 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 2.63e-01 -0.156 0.139 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0572 0.116 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 1.55e-01 -0.146 0.102 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -208067 sc-eQTL 9.76e-01 0.00352 0.117 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 9.82e-01 0.00166 0.0735 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 2.60e-01 0.109 0.0969 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 4.57e-01 0.0789 0.106 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 1.79e-01 -0.17 0.126 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 5.89e-01 0.0541 0.1 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 1.01e-01 0.155 0.094 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -208067 sc-eQTL 3.17e-01 0.0912 0.0909 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0137 0.0641 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0359 0.0828 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 5.91e-01 -0.053 0.0983 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 2.46e-01 -0.123 0.106 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 3.06e-01 -0.123 0.12 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0131 0.0765 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0328 0.0672 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -393240 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0135 0.137 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -894047 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0765 0.141 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -990708 sc-eQTL 2.30e-01 -0.139 0.115 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 3.55e-01 0.1 0.108 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 4.40e-01 0.0912 0.118 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 1.79e-01 0.174 0.129 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 7.31e-01 0.0365 0.106 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0752 0.0845 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -393240 sc-eQTL 4.21e-01 0.0996 0.124 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -894047 sc-eQTL 2.25e-01 -0.155 0.128 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -990708 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0174 0.122 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 7.72e-01 0.0353 0.122 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -781270 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0329 0.13 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -781464 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0248 0.0891 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -550473 sc-eQTL 3.80e-01 0.0857 0.0975 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -242256 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0449 0.109 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 sc-eQTL 3.37e-01 -0.121 0.126 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -216175 sc-eQTL 4.72e-02 0.215 0.108 0.114 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -202986 eQTL 8.60e-03 -0.0563 0.0214 0.0011 0.0 0.0913

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 \N -894047 2.74e-07 1.25e-07 5.14e-08 1.84e-07 9.24e-08 9.76e-08 1.53e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.57e-07 9e-08 1.45e-07 6.76e-08 6.04e-08 7.36e-08 4.17e-08 1.27e-07 5.75e-08 4.16e-08 1.19e-07 1.27e-07 1.44e-07 2.95e-08 1.4e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.61e-08 1.12e-07 1.03e-07 9.7e-08 3.06e-08 3.89e-08 8.34e-08 7.51e-08 3.62e-08 5.11e-08 8.93e-08 6.54e-08 3.71e-08 5.43e-08 1.35e-07 5.2e-08 1.16e-08 4.7e-08 1.84e-08 1.21e-07 1.88e-09 5.02e-08