logo

Genes within 1Mb (chr1:30510837:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0602 0.138 0.079 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 4.20e-01 0.0891 0.11 0.079 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 2.55e-01 0.105 0.0923 0.079 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -212748 sc-eQTL 2.48e-01 0.112 0.0971 0.079 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 8.63e-01 0.0132 0.0763 0.079 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0323 0.0893 0.079 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 5.38e-01 0.0652 0.106 0.079 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00169 0.117 0.079 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 1.56e-01 -0.129 0.0907 0.079 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0504 0.081 0.079 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0534 0.0898 0.079 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0335 0.0804 0.079 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0354 0.0963 0.079 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 3.25e-01 0.153 0.156 0.079 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0398 0.104 0.079 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 3.19e-02 -0.195 0.0905 0.079 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0735 0.0887 0.079 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 4.31e-01 0.082 0.104 0.079 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0531 0.131 0.079 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 4.54e-01 0.109 0.146 0.074 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 6.30e-01 0.0835 0.173 0.074 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 8.13e-01 -0.032 0.135 0.074 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0808 0.0966 0.074 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -898728 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0812 0.159 0.074 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -995389 sc-eQTL 9.37e-01 0.00833 0.106 0.074 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 3.85e-01 -0.133 0.153 0.074 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 8.44e-01 -0.021 0.107 0.079 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 6.39e-01 0.062 0.132 0.079 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 6.92e-01 0.0336 0.0847 0.079 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0536 0.0778 0.079 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -397921 sc-eQTL 5.29e-01 0.0944 0.15 0.079 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -898728 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0707 0.161 0.079 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -995389 sc-eQTL 2.34e-01 -0.168 0.141 0.079 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 6.52e-03 0.334 0.122 0.079 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 4.64e-01 -0.11 0.149 0.079 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0413 0.102 0.079 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 4.30e-01 0.0847 0.107 0.079 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 2.94e-01 -0.13 0.123 0.079 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 1.39e-01 -0.205 0.138 0.079 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 2.71e-01 0.141 0.128 0.079 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 3.65e-01 0.104 0.115 0.079 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 8.39e-01 -0.025 0.123 0.079 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 2.22e-01 -0.135 0.11 0.079 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0759 0.0903 0.079 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 5.54e-01 0.0877 0.148 0.079 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 4.26e-01 0.123 0.154 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 1.06e-01 -0.272 0.167 0.087 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 8.63e-01 0.0293 0.17 0.087 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0609 0.158 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -212748 sc-eQTL 1.42e-01 -0.202 0.137 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 5.86e-01 0.0524 0.096 0.087 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0452 0.155 0.087 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0523 0.137 0.087 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0529 0.168 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 6.77e-01 0.0584 0.14 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 9.00e-01 0.0166 0.132 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -212748 sc-eQTL 6.83e-01 0.0561 0.138 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0225 0.0844 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 9.34e-01 0.00977 0.118 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 4.57e-01 0.0988 0.132 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 2.14e-01 0.202 0.162 0.078 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0625 0.15 0.078 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 2.41e-01 -0.153 0.13 0.078 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -212748 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0749 0.125 0.078 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 2.36e-01 -0.131 0.11 0.078 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 3.65e-01 0.115 0.126 0.078 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 1.66e-01 0.205 0.148 0.078 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0282 0.149 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 1.26e-01 0.196 0.128 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 1.37e-01 0.168 0.113 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -212748 sc-eQTL 1.52e-01 0.164 0.114 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 9.56e-01 0.00422 0.0767 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0276 0.101 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 8.54e-01 0.0229 0.124 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 1.31e-02 -0.39 0.156 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0164 0.131 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 9.30e-01 0.0113 0.128 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -212748 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0414 0.123 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 8.77e-01 0.0129 0.0833 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 1.21e-01 -0.188 0.121 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 6.22e-01 0.0647 0.131 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 3.31e-01 -0.157 0.162 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 5.63e-01 0.0923 0.159 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 3.83e-04 -0.547 0.151 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 1.69e-01 -0.191 0.139 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0313 0.152 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0408 0.134 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 7.42e-01 0.04 0.121 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 3.45e-02 -0.227 0.107 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 9.31e-01 0.0075 0.086 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0162 0.0921 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0694 0.0934 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 8.39e-01 0.0218 0.107 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 1.11e-01 -0.244 0.152 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 2.60e-01 0.139 0.123 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 7.47e-01 0.0354 0.109 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 5.18e-02 -0.176 0.09 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 2.29e-01 0.138 0.115 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0489 0.128 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000663 0.152 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0593 0.145 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 9.93e-01 0.00107 0.12 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 1.81e-01 -0.163 0.121 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 2.42e-01 -0.167 0.142 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 8.77e-01 0.0217 0.14 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 1.51e-01 0.25 0.174 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 2.74e-01 0.146 0.133 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0225 0.13 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 6.50e-01 0.0653 0.144 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 1.68e-01 0.208 0.15 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0114 0.142 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 7.61e-01 0.046 0.151 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0237 0.131 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 8.63e-02 -0.18 0.104 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 7.63e-02 -0.178 0.1 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 2.31e-02 -0.284 0.124 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0315 0.137 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 2.00e-01 0.229 0.178 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 3.84e-01 -0.143 0.163 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0461 0.154 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 3.14e-01 -0.162 0.161 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 2.34e-01 0.178 0.149 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 1.57e-01 0.213 0.15 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 1.05e-01 -0.268 0.165 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 2.25e-01 0.193 0.158 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 4.98e-01 0.11 0.162 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0624 0.153 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0386 0.158 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0753 0.143 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 4.82e-01 0.115 0.163 0.078 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 7.23e-02 -0.259 0.143 0.078 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0699 0.138 0.078 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 2.06e-01 -0.165 0.13 0.078 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0582 0.145 0.078 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 2.86e-01 0.16 0.149 0.078 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 3.52e-01 -0.155 0.166 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 6.44e-01 0.0652 0.141 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 3.42e-01 -0.14 0.147 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 3.37e-01 -0.14 0.145 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 4.28e-01 -0.116 0.146 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 4.48e-01 0.109 0.144 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 4.98e-01 -0.108 0.159 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0545 0.117 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 2.17e-01 0.149 0.12 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 2.66e-01 -0.143 0.128 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 4.45e-01 -0.123 0.161 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 1.03e-02 0.339 0.131 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 5.34e-01 0.104 0.167 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 2.02e-01 0.19 0.148 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 1.31e-01 0.219 0.144 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0151 0.139 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 7.13e-01 0.0543 0.147 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 2.70e-04 0.511 0.138 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 5.16e-01 -0.101 0.155 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 4.41e-01 0.0932 0.121 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0468 0.131 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00935 0.144 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0701 0.152 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 8.70e-01 0.0232 0.142 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 3.59e-01 0.151 0.164 0.081 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0503 0.191 0.081 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 3.65e-01 0.151 0.166 0.081 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -212748 sc-eQTL 5.00e-01 -0.105 0.155 0.081 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0245 0.111 0.081 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0658 0.151 0.081 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 8.68e-01 0.0269 0.161 0.081 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 9.43e-01 0.00899 0.125 0.08 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0814 0.159 0.08 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 2.75e-01 0.162 0.148 0.08 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0647 0.106 0.08 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0646 0.149 0.08 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 7.49e-01 0.0439 0.137 0.08 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 5.29e-01 0.104 0.165 0.079 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0905 0.16 0.079 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 3.17e-01 -0.128 0.127 0.079 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 5.80e-01 0.0811 0.146 0.079 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 2.47e-02 -0.333 0.147 0.079 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 2.71e-02 0.328 0.147 0.079 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00415 0.17 0.078 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 6.26e-01 -0.09 0.184 0.078 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 4.17e-01 -0.128 0.158 0.078 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 1.51e-01 -0.159 0.11 0.078 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -898728 sc-eQTL 6.65e-01 0.0618 0.142 0.078 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995389 sc-eQTL 2.46e-01 -0.162 0.139 0.078 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0593 0.151 0.078 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 3.84e-01 -0.111 0.127 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 4.54e-01 0.107 0.142 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0331 0.0964 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0455 0.0845 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -397921 sc-eQTL 5.00e-01 0.108 0.159 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -898728 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00711 0.161 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995389 sc-eQTL 4.07e-01 -0.118 0.142 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 1.57e-02 0.32 0.131 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0464 0.134 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0934 0.158 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 9.11e-01 0.0128 0.114 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 8.00e-01 0.0223 0.0877 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -397921 sc-eQTL 9.41e-01 0.0112 0.151 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -898728 sc-eQTL 5.30e-01 -0.101 0.16 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995389 sc-eQTL 2.18e-01 -0.161 0.13 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 3.99e-01 0.11 0.131 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 3.17e-01 0.225 0.223 0.067 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 3.16e-01 -0.193 0.192 0.067 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 5.73e-01 -0.112 0.198 0.067 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 2.27e-01 -0.26 0.215 0.067 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 2.79e-02 0.435 0.196 0.067 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 3.26e-01 0.189 0.192 0.067 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 3.93e-01 -0.128 0.15 0.082 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 6.71e-01 0.0685 0.161 0.082 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 3.56e-01 0.126 0.137 0.082 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0892 0.107 0.082 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -397921 sc-eQTL 9.14e-01 0.0159 0.147 0.082 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -898728 sc-eQTL 8.30e-01 -0.033 0.154 0.082 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995389 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0985 0.146 0.082 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 2.50e-01 0.168 0.145 0.082 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 2.29e-01 0.183 0.151 0.079 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 1.08e-01 0.26 0.161 0.079 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0723 0.132 0.079 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0517 0.12 0.079 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -397921 sc-eQTL 6.01e-01 0.0705 0.135 0.079 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -898728 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00611 0.147 0.079 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995389 sc-eQTL 7.46e-01 0.0477 0.147 0.079 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 6.18e-02 0.284 0.151 0.079 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 2.22e-01 0.207 0.169 0.076 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 8.71e-01 0.0303 0.186 0.076 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 4.40e-01 -0.119 0.154 0.076 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0926 0.143 0.076 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -898728 sc-eQTL 8.07e-01 0.0425 0.174 0.076 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995389 sc-eQTL 4.81e-01 0.0952 0.135 0.076 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 6.78e-01 0.066 0.159 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 9.23e-01 0.0154 0.16 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0185 0.133 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 1.54e-01 -0.167 0.117 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -212748 sc-eQTL 4.06e-01 -0.112 0.134 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0628 0.0842 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 9.81e-01 0.00273 0.112 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 5.53e-01 0.0722 0.121 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 3.32e-01 -0.142 0.146 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 2.75e-01 0.126 0.115 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 2.04e-01 0.139 0.109 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -212748 sc-eQTL 2.50e-01 0.121 0.105 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00357 0.0741 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0372 0.0956 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 5.68e-01 0.0649 0.114 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0709 0.122 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 9.80e-01 0.0034 0.138 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 8.59e-01 0.0156 0.0879 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0271 0.0772 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -397921 sc-eQTL 9.09e-01 0.018 0.158 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -898728 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0481 0.162 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -995389 sc-eQTL 3.31e-01 -0.129 0.133 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 2.21e-02 0.283 0.123 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 6.48e-01 0.0627 0.137 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 1.47e-01 0.217 0.149 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 8.08e-01 0.0299 0.123 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 2.08e-01 -0.124 0.098 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -397921 sc-eQTL 6.86e-01 0.0582 0.144 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -898728 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0545 0.149 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -995389 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0176 0.141 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 1.22e-01 0.219 0.141 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -785951 sc-eQTL 4.64e-01 -0.111 0.151 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786145 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0514 0.103 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -555154 sc-eQTL 4.71e-01 0.0816 0.113 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -246937 sc-eQTL 3.31e-01 -0.123 0.126 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 sc-eQTL 2.26e-01 -0.176 0.145 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -220856 sc-eQTL 4.77e-02 0.248 0.125 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -207667 eQTL 3.81e-03 -0.0737 0.0254 0.00154 0.0 0.0604

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 \N -898728 2.74e-07 1.25e-07 3.69e-08 1.86e-07 8.83e-08 9.61e-08 1.49e-07 5.19e-08 1.44e-07 4.74e-08 1.62e-07 8.59e-08 1.47e-07 6.56e-08 6e-08 7.37e-08 3.98e-08 1.21e-07 5.21e-08 4.45e-08 1.05e-07 1.23e-07 1.39e-07 3.42e-08 1.4e-07 1.16e-07 1.08e-07 9.57e-08 1.05e-07 1.1e-07 9.7e-08 3.26e-08 3.3e-08 8.44e-08 8.21e-08 3.62e-08 5.11e-08 9.61e-08 6.55e-08 3.76e-08 5.13e-08 1.35e-07 4.7e-08 1.61e-08 5.7e-08 1.83e-08 1.24e-07 3.81e-09 4.73e-08