logo

Genes within 1Mb (chr1:30510294:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 1.38e-01 0.183 0.123 0.107 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 5.99e-01 0.052 0.0986 0.107 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 6.25e-02 -0.154 0.0821 0.107 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -213291 sc-eQTL 5.73e-02 0.165 0.0863 0.107 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 6.37e-01 0.0322 0.0681 0.107 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 5.30e-01 0.0502 0.0798 0.107 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 2.32e-01 0.113 0.0942 0.107 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0726 0.105 0.107 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 7.02e-01 0.0314 0.082 0.107 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 1.25e-01 -0.112 0.0726 0.107 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 7.50e-01 0.0258 0.0809 0.107 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 3.75e-01 0.0642 0.0723 0.107 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 4.73e-01 0.0622 0.0866 0.107 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0851 0.139 0.107 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0045 0.0928 0.107 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0301 0.0817 0.107 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 4.06e-01 0.0659 0.0792 0.107 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0401 0.093 0.107 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 6.31e-01 0.0561 0.117 0.107 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 3.03e-01 0.127 0.123 0.108 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 6.46e-04 -0.49 0.141 0.108 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 3.09e-01 -0.116 0.114 0.108 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0962 0.0811 0.108 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -899271 sc-eQTL 3.96e-01 -0.114 0.134 0.108 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -995932 sc-eQTL 2.23e-01 -0.108 0.0885 0.108 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 3.91e-01 0.11 0.128 0.108 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 3.26e-01 0.0929 0.0943 0.107 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 2.35e-01 0.139 0.117 0.107 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 8.59e-01 0.0133 0.0751 0.107 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 1.29e-01 0.105 0.0687 0.107 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -398464 sc-eQTL 7.29e-01 0.046 0.133 0.107 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -899271 sc-eQTL 4.93e-01 0.0977 0.142 0.107 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -995932 sc-eQTL 5.98e-02 -0.236 0.124 0.107 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 8.66e-01 0.0185 0.11 0.107 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 6.25e-01 0.0651 0.133 0.107 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0994 0.091 0.107 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0914 0.0955 0.107 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 2.69e-01 0.122 0.11 0.107 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 4.60e-01 0.0914 0.124 0.107 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 8.95e-01 0.0151 0.114 0.107 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 9.22e-01 0.0097 0.0984 0.107 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0961 0.105 0.107 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 3.93e-01 0.0808 0.0944 0.107 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0454 0.0774 0.107 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 3.56e-01 0.117 0.127 0.107 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 1.80e-01 0.177 0.132 0.107 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 8.68e-01 0.0279 0.167 0.112 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 1.90e-01 -0.221 0.168 0.112 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 7.84e-01 0.043 0.156 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -213291 sc-eQTL 1.95e-01 0.177 0.136 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 2.37e-01 0.113 0.095 0.112 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 1.35e-01 -0.229 0.153 0.112 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 9.30e-01 0.0119 0.136 0.112 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0565 0.149 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 1.92e-01 -0.162 0.124 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 6.26e-01 0.0573 0.117 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -213291 sc-eQTL 8.70e-01 0.02 0.122 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00482 0.075 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 9.17e-01 0.0109 0.105 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0672 0.118 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0274 0.145 0.106 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 8.61e-01 0.0233 0.133 0.106 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 3.81e-01 -0.102 0.116 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -213291 sc-eQTL 4.22e-01 0.0891 0.111 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 7.42e-01 0.0324 0.0982 0.106 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0523 0.112 0.106 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 9.87e-01 0.00222 0.132 0.106 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 1.44e-01 0.194 0.132 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 3.34e-01 0.111 0.115 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 2.53e-02 -0.226 0.1 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -213291 sc-eQTL 1.24e-01 0.158 0.102 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 8.26e-01 0.0151 0.0687 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 1.73e-01 0.123 0.0898 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 8.33e-01 0.0235 0.111 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 1.72e-01 0.191 0.139 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 4.21e-01 0.0931 0.115 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0179 0.113 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -213291 sc-eQTL 7.40e-01 0.0361 0.109 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0333 0.0737 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 3.69e-01 0.0966 0.107 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 1.52e-01 0.166 0.115 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 8.27e-01 -0.031 0.142 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 3.21e-01 -0.138 0.139 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 2.49e-01 -0.158 0.136 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 7.17e-01 0.0442 0.122 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 8.13e-01 0.0317 0.133 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0681 0.118 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 1.83e-01 -0.145 0.109 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 1.06e-01 0.157 0.0963 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 2.56e-02 -0.172 0.0765 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 9.24e-01 0.00791 0.0829 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 1.63e-01 0.117 0.0838 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 9.55e-01 0.0054 0.0967 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 3.84e-01 0.12 0.138 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0997 0.111 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0624 0.0986 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0548 0.0818 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00932 0.104 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 7.54e-02 0.205 0.115 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 9.70e-01 0.00519 0.136 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 1.44e-01 -0.189 0.129 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 1.59e-01 -0.152 0.107 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 3.36e-01 -0.105 0.109 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00413 0.128 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0158 0.126 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 7.05e-02 -0.271 0.149 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0745 0.115 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 5.03e-01 0.075 0.112 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 8.72e-01 0.02 0.124 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0993 0.13 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 6.88e-01 0.0493 0.122 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 8.35e-01 0.0284 0.136 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 8.65e-01 -0.02 0.117 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0313 0.0944 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0538 0.0904 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 2.35e-01 0.134 0.113 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0326 0.123 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0871 0.149 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0337 0.136 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 4.28e-01 0.102 0.128 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0182 0.134 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 3.50e-01 -0.116 0.124 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 3.46e-01 0.118 0.125 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 8.32e-01 0.0313 0.147 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 1.07e-01 -0.226 0.14 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 3.30e-01 0.14 0.144 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 2.78e-01 -0.147 0.135 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 2.57e-01 0.159 0.14 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 1.31e-01 0.192 0.126 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 4.58e-01 -0.106 0.143 0.108 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 2.01e-01 -0.162 0.127 0.108 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 7.59e-01 0.0375 0.122 0.108 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00858 0.115 0.108 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 2.92e-01 0.135 0.128 0.108 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 2.52e-02 0.294 0.13 0.108 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 3.52e-01 0.138 0.147 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 3.55e-01 -0.115 0.124 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 7.50e-01 0.0418 0.131 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0891 0.129 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 9.02e-01 -0.016 0.13 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 1.00e+00 -5.14e-05 0.128 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 7.54e-01 0.0442 0.141 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 3.18e-01 -0.104 0.104 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0549 0.107 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 2.23e-01 0.139 0.113 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 5.84e-01 0.0782 0.142 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0683 0.118 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 2.93e-01 -0.161 0.152 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 8.72e-01 -0.022 0.136 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 7.45e-01 0.0432 0.133 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 3.31e-01 -0.123 0.127 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 6.03e-01 0.0703 0.135 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0594 0.13 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 7.25e-01 0.0492 0.14 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 9.66e-02 -0.181 0.108 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 2.38e-01 -0.139 0.117 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 7.71e-01 0.0378 0.13 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 9.03e-01 0.0167 0.138 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 2.35e-01 0.152 0.128 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 7.94e-02 0.303 0.171 0.1 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0297 0.202 0.1 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 1.75e-01 -0.237 0.174 0.1 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -213291 sc-eQTL 2.54e-01 0.186 0.162 0.1 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 1.68e-01 0.161 0.116 0.1 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 4.77e-01 0.114 0.159 0.1 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 6.17e-01 0.0851 0.17 0.1 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 5.74e-01 0.0597 0.106 0.109 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 8.76e-01 0.021 0.135 0.109 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 7.14e-01 0.0461 0.126 0.109 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 2.49e-01 -0.104 0.0898 0.109 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 3.19e-01 0.126 0.126 0.109 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 3.61e-01 0.106 0.116 0.109 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 3.18e-01 0.14 0.14 0.107 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0712 0.136 0.107 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 8.48e-01 0.0208 0.109 0.107 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0661 0.124 0.107 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 1.85e-01 0.168 0.126 0.107 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0184 0.126 0.107 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 6.09e-01 0.0719 0.14 0.112 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 1.41e-01 -0.223 0.151 0.112 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 9.66e-01 0.00552 0.13 0.112 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 4.54e-01 0.0685 0.0913 0.112 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899271 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0357 0.117 0.112 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995932 sc-eQTL 1.26e-01 -0.176 0.115 0.112 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00845 0.124 0.112 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 5.58e-01 0.0664 0.113 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 3.67e-01 0.114 0.126 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 6.12e-01 0.0434 0.0854 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 8.99e-02 0.127 0.0745 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -398464 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0124 0.141 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899271 sc-eQTL 4.08e-01 0.118 0.143 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995932 sc-eQTL 1.62e-01 -0.177 0.126 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 6.09e-01 0.0604 0.118 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 2.71e-02 0.262 0.118 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 6.52e-01 0.0635 0.141 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 1.00e+00 1.82e-05 0.102 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 4.01e-01 0.0658 0.0781 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -398464 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0294 0.135 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899271 sc-eQTL 8.43e-01 0.0283 0.143 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995932 sc-eQTL 1.16e-01 -0.183 0.116 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0673 0.117 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 4.43e-01 0.134 0.174 0.127 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 4.93e-01 0.102 0.149 0.127 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 2.58e-01 -0.174 0.153 0.127 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 3.69e-01 -0.151 0.167 0.127 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 9.43e-01 0.0111 0.155 0.127 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0158 0.15 0.127 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00545 0.134 0.109 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 3.67e-01 -0.13 0.144 0.109 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 7.91e-01 0.0324 0.122 0.109 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 7.02e-01 0.0367 0.0959 0.109 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -398464 sc-eQTL 8.88e-01 0.0186 0.131 0.109 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899271 sc-eQTL 2.67e-01 0.152 0.137 0.109 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995932 sc-eQTL 2.26e-01 -0.158 0.13 0.109 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0238 0.13 0.109 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 1.61e-01 -0.174 0.124 0.106 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 7.83e-02 0.233 0.132 0.106 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0126 0.108 0.106 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 3.90e-01 0.0847 0.0983 0.106 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -398464 sc-eQTL 1.79e-01 0.148 0.11 0.106 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899271 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0416 0.121 0.106 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995932 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00209 0.12 0.106 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00679 0.125 0.106 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 6.72e-02 0.249 0.135 0.119 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 1.11e-03 -0.481 0.145 0.119 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0846 0.124 0.119 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 1.49e-01 -0.166 0.115 0.119 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899271 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0864 0.14 0.119 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995932 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0958 0.108 0.119 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 2.28e-01 0.154 0.127 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 2.82e-01 -0.153 0.141 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 3.14e-01 -0.119 0.118 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0545 0.105 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -213291 sc-eQTL 1.00e-01 0.196 0.119 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000249 0.0749 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0786 0.099 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 3.76e-01 0.0956 0.108 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 1.90e-02 0.301 0.127 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 1.55e-01 0.145 0.101 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 1.01e-01 -0.158 0.0957 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -213291 sc-eQTL 7.76e-02 0.163 0.0921 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00746 0.0653 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 1.39e-01 0.125 0.0839 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 6.14e-01 0.0506 0.1 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 9.78e-02 0.178 0.107 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 2.06e-01 0.154 0.121 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 7.77e-01 0.022 0.0777 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 1.10e-01 0.109 0.0679 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -398464 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0325 0.139 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -899271 sc-eQTL 5.26e-01 0.0909 0.143 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -995932 sc-eQTL 9.38e-02 -0.197 0.117 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 8.95e-01 0.0146 0.11 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 3.74e-01 -0.106 0.119 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 6.38e-01 0.0613 0.13 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 8.65e-01 0.0182 0.107 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 4.25e-01 0.0681 0.0851 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -398464 sc-eQTL 2.14e-01 0.155 0.124 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -899271 sc-eQTL 7.45e-01 0.0421 0.129 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -995932 sc-eQTL 5.57e-01 -0.072 0.122 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0223 0.123 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -786494 sc-eQTL 6.44e-01 0.0619 0.134 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786688 sc-eQTL 1.73e-01 -0.124 0.0909 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -555697 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0635 0.1 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -247480 sc-eQTL 2.21e-01 0.137 0.111 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 sc-eQTL 3.73e-01 0.115 0.129 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -221399 sc-eQTL 8.53e-01 0.0206 0.111 0.108 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 eQTL 9.14e-04 0.0691 0.0208 0.00124 0.0 0.104
ENSG00000229447 AC114495.2 -753387 eQTL 0.0519 -0.111 0.0568 0.00103 0.0 0.104

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208210 1.58e-06 2.61e-06 3.08e-07 1.7e-06 4.72e-07 8e-07 1.29e-06 4.54e-07 1.8e-06 6.94e-07 2.11e-06 1.27e-06 3.24e-06 1.11e-06 3.31e-07 9.9e-07 1.07e-06 1.3e-06 5.56e-07 5.9e-07 7.33e-07 1.96e-06 1.21e-06 8.48e-07 2.63e-06 9.13e-07 1.01e-06 1.05e-06 1.63e-06 1.63e-06 1.08e-06 2.83e-07 2.84e-07 8.91e-07 8.99e-07 5.58e-07 7.27e-07 3.26e-07 7.83e-07 2.03e-07 2.84e-07 2.11e-06 4.1e-07 1.6e-07 2.96e-07 3.32e-07 2.42e-07 1.57e-07 1.91e-07
ENSG00000229447 AC114495.2 -753387 2.74e-07 1.5e-07 4.91e-08 2.15e-07 1.01e-07 8.45e-08 1.61e-07 5.53e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.73e-07 1.15e-07 1.59e-07 7.64e-08 6.18e-08 7.36e-08 4.17e-08 1.33e-07 6.07e-08 4.89e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.39e-07 2.91e-08 1.55e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.09e-07 9.49e-08 1.07e-07 3.59e-08 3.66e-08 9.3e-08 3.52e-08 3.05e-08 5.51e-08 8.72e-08 6.3e-08 4.19e-08 3.59e-08 1.33e-07 5.22e-08 2.1e-08 4.7e-08 1.77e-08 1.19e-07 1.96e-09 4.91e-08