logo

Genes within 1Mb (chr1:30510257:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 3.39e-01 -0.128 0.133 0.09 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 4.49e-01 0.081 0.107 0.09 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 2.29e-01 0.108 0.0893 0.09 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -213328 sc-eQTL 2.06e-01 0.119 0.0939 0.09 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0235 0.0738 0.09 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0202 0.0865 0.09 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 8.65e-01 0.0174 0.102 0.09 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00918 0.113 0.09 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 1.80e-01 -0.118 0.0877 0.09 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0601 0.0783 0.09 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0849 0.0867 0.09 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00623 0.0777 0.09 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0752 0.0929 0.09 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 3.06e-01 0.156 0.152 0.09 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0465 0.101 0.09 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 1.54e-01 -0.127 0.0886 0.09 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0729 0.0864 0.09 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 5.41e-01 0.062 0.101 0.09 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0367 0.127 0.09 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 6.55e-01 0.0618 0.138 0.086 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 8.48e-01 0.0314 0.163 0.086 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0612 0.128 0.086 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 2.29e-01 -0.11 0.0911 0.086 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -899308 sc-eQTL 4.69e-01 -0.109 0.151 0.086 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -995969 sc-eQTL 9.83e-01 0.00211 0.0999 0.086 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 1.81e-01 -0.193 0.144 0.086 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0259 0.103 0.09 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 9.82e-01 0.00296 0.128 0.09 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 7.18e-01 0.0296 0.0818 0.09 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0324 0.0752 0.09 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -398501 sc-eQTL 4.57e-01 0.108 0.144 0.09 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -899308 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0435 0.155 0.09 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -995969 sc-eQTL 1.37e-01 -0.203 0.136 0.09 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 1.51e-02 0.289 0.118 0.09 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 2.69e-01 -0.159 0.143 0.09 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0168 0.0984 0.09 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 3.32e-01 0.1 0.103 0.09 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0965 0.119 0.09 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 1.31e-01 -0.201 0.133 0.09 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 4.90e-01 0.0852 0.123 0.09 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 2.56e-01 0.126 0.111 0.09 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0372 0.119 0.09 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0841 0.106 0.09 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0343 0.0874 0.09 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 8.14e-01 0.0337 0.143 0.09 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 4.62e-01 0.11 0.149 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 1.05e-01 -0.263 0.161 0.099 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 8.98e-01 0.021 0.164 0.099 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 3.50e-01 -0.142 0.152 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -213328 sc-eQTL 1.19e-01 -0.207 0.132 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 3.88e-01 0.0802 0.0926 0.099 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0615 0.15 0.099 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0556 0.133 0.099 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 2.97e-01 -0.168 0.161 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 9.30e-01 0.0119 0.135 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0106 0.127 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -213328 sc-eQTL 6.39e-01 0.062 0.132 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 9.54e-01 0.0047 0.0811 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 6.75e-01 0.0478 0.114 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 2.45e-01 0.148 0.127 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 2.79e-01 0.169 0.156 0.088 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0639 0.144 0.088 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 3.20e-01 -0.125 0.125 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -213328 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0269 0.12 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 1.69e-01 -0.146 0.106 0.088 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 2.65e-01 0.135 0.121 0.088 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 3.11e-01 0.144 0.142 0.088 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0202 0.143 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 1.43e-01 0.181 0.123 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 7.25e-02 0.195 0.108 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -213328 sc-eQTL 1.07e-01 0.178 0.11 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0395 0.0738 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0603 0.0969 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0218 0.12 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 3.19e-03 -0.443 0.148 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0116 0.125 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 5.26e-01 0.0778 0.122 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -213328 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00895 0.118 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00688 0.0798 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 2.30e-01 -0.14 0.116 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 5.31e-01 0.0788 0.125 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 4.71e-01 -0.112 0.155 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 5.08e-01 0.101 0.152 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 1.13e-03 -0.481 0.146 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0569 0.133 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 9.20e-01 0.0147 0.146 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 8.69e-01 0.0212 0.129 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 7.68e-01 0.0347 0.117 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 6.67e-02 -0.19 0.103 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 9.67e-01 0.00341 0.0831 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0594 0.0889 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0563 0.0902 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00452 0.104 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 5.81e-02 -0.281 0.148 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 2.20e-01 0.147 0.12 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0112 0.106 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 3.74e-02 -0.183 0.0873 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 1.45e-01 0.163 0.111 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 2.76e-01 -0.136 0.124 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 9.38e-01 0.0113 0.146 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0999 0.139 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0673 0.116 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 3.18e-01 -0.117 0.117 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 2.35e-01 -0.163 0.137 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 8.57e-01 0.0245 0.135 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 1.51e-01 0.239 0.166 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 5.70e-01 0.0727 0.128 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 3.78e-01 0.109 0.124 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 9.07e-01 0.0161 0.138 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 2.62e-01 0.162 0.144 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0271 0.136 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 8.13e-01 0.0347 0.147 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0148 0.127 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 1.85e-01 -0.135 0.101 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 3.87e-02 -0.201 0.0966 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 2.57e-02 -0.27 0.12 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0216 0.133 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 3.88e-01 0.147 0.17 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0728 0.156 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0139 0.147 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 2.40e-01 -0.18 0.153 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 4.40e-01 0.11 0.142 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 1.12e-01 0.228 0.143 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 7.38e-02 -0.281 0.157 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 2.20e-01 0.186 0.151 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 7.84e-01 0.0424 0.155 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 9.09e-01 0.0167 0.145 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 3.63e-01 -0.137 0.151 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 4.56e-01 -0.102 0.136 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 4.98e-01 0.106 0.157 0.089 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 2.60e-01 -0.156 0.139 0.089 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0652 0.133 0.089 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 2.32e-01 -0.15 0.125 0.089 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 4.69e-01 -0.101 0.14 0.089 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 4.86e-01 0.101 0.144 0.089 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 2.02e-01 -0.204 0.159 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 4.86e-01 0.0942 0.135 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 3.51e-01 -0.132 0.141 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 3.60e-01 -0.128 0.14 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0581 0.14 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 5.76e-01 0.0774 0.138 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 2.19e-01 -0.187 0.152 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00886 0.113 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 1.26e-01 0.177 0.115 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 4.16e-01 -0.1 0.123 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 4.16e-01 -0.126 0.154 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 2.16e-02 0.291 0.126 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 5.99e-01 0.0839 0.159 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 3.27e-01 0.139 0.142 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 2.93e-01 0.146 0.138 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0278 0.132 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 8.16e-01 0.0328 0.141 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 1.13e-03 0.438 0.133 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0648 0.149 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 5.77e-01 0.0647 0.116 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0576 0.125 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 9.34e-01 0.0114 0.138 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 4.25e-01 -0.117 0.146 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0159 0.136 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 2.06e-01 0.204 0.16 0.089 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 9.42e-01 0.0137 0.187 0.089 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 2.86e-01 0.173 0.161 0.089 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -213328 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0811 0.151 0.089 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0502 0.108 0.089 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 8.13e-01 0.0351 0.148 0.089 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 6.82e-01 0.0646 0.157 0.089 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 9.15e-01 0.0128 0.12 0.091 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 3.20e-01 -0.151 0.151 0.091 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 1.98e-01 0.182 0.141 0.091 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 6.93e-01 0.0401 0.102 0.091 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0173 0.142 0.091 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 6.23e-01 0.0643 0.131 0.091 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 7.74e-01 0.0454 0.158 0.09 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0373 0.153 0.09 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0923 0.122 0.09 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00441 0.14 0.09 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 2.28e-01 -0.172 0.142 0.09 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 6.41e-02 0.263 0.141 0.09 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0767 0.16 0.09 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0486 0.173 0.09 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 3.05e-01 -0.153 0.149 0.09 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 1.61e-01 -0.146 0.104 0.09 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899308 sc-eQTL 5.82e-01 0.0739 0.134 0.09 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995969 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0953 0.132 0.09 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 4.04e-01 -0.118 0.142 0.09 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 3.89e-01 -0.106 0.123 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 5.66e-01 0.0789 0.137 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0128 0.0929 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00768 0.0816 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -398501 sc-eQTL 3.72e-01 0.137 0.153 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899308 sc-eQTL 9.51e-01 0.00965 0.156 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995969 sc-eQTL 2.30e-01 -0.165 0.137 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 2.25e-02 0.291 0.127 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 2.70e-01 -0.143 0.129 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 2.47e-01 -0.177 0.152 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0492 0.11 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 6.14e-01 0.0428 0.0847 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -398501 sc-eQTL 9.01e-01 0.0182 0.146 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899308 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0876 0.155 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995969 sc-eQTL 3.14e-01 -0.127 0.126 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 4.04e-01 0.105 0.126 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 8.40e-02 0.366 0.21 0.079 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 4.92e-01 -0.126 0.182 0.079 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 8.23e-01 0.0421 0.188 0.079 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 3.12e-01 -0.207 0.204 0.079 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 1.46e-01 0.274 0.187 0.079 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 4.30e-01 0.145 0.182 0.079 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0653 0.144 0.093 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 7.68e-01 0.0458 0.155 0.093 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 5.56e-01 0.0776 0.132 0.093 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0329 0.103 0.093 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -398501 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00255 0.141 0.093 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899308 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0158 0.148 0.093 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995969 sc-eQTL 4.56e-01 -0.105 0.14 0.093 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 3.68e-01 0.126 0.14 0.093 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 1.39e-01 0.213 0.144 0.09 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 7.32e-02 0.275 0.153 0.09 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0412 0.126 0.09 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0286 0.114 0.09 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -398501 sc-eQTL 5.09e-01 0.0847 0.128 0.09 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899308 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00797 0.14 0.09 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995969 sc-eQTL 8.38e-01 0.0287 0.14 0.09 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 3.01e-01 0.15 0.145 0.09 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 3.56e-01 0.146 0.158 0.09 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0494 0.174 0.09 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 4.76e-01 -0.103 0.144 0.09 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 3.62e-01 -0.122 0.134 0.09 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899308 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0444 0.162 0.09 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -995969 sc-eQTL 6.95e-01 0.0494 0.126 0.09 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 8.13e-01 0.0351 0.148 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0744 0.153 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0447 0.128 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 1.31e-01 -0.171 0.113 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -213328 sc-eQTL 4.31e-01 -0.102 0.129 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0332 0.0811 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 5.83e-01 0.0589 0.107 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 5.09e-01 0.0772 0.117 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 2.72e-01 -0.154 0.14 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 2.99e-01 0.115 0.111 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 9.96e-02 0.173 0.105 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -213328 sc-eQTL 1.80e-01 0.136 0.101 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0432 0.0713 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0555 0.092 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 8.77e-01 0.0169 0.109 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 3.93e-01 -0.101 0.118 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0685 0.133 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 9.26e-01 0.00796 0.085 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0122 0.0747 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -398501 sc-eQTL 7.67e-01 0.0452 0.152 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -899308 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0284 0.157 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -995969 sc-eQTL 1.97e-01 -0.166 0.128 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 3.65e-02 0.251 0.119 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 3.67e-01 0.119 0.132 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 1.58e-01 0.204 0.144 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 8.70e-01 0.0194 0.118 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0736 0.0944 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -398501 sc-eQTL 7.18e-01 0.05 0.138 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -899308 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0578 0.143 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -995969 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0346 0.136 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 3.35e-01 0.131 0.136 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -786531 sc-eQTL 2.98e-01 -0.151 0.145 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -786725 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0325 0.0991 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -555734 sc-eQTL 3.51e-01 0.101 0.108 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -247517 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0902 0.121 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 sc-eQTL 1.43e-01 -0.205 0.139 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -221436 sc-eQTL 1.38e-01 0.179 0.12 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208247 eQTL 3.39e-03 -0.067 0.0228 0.00243 0.0 0.0765

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 \N -899308 3.14e-07 1.83e-07 4.08e-08 2.35e-07 9.21e-08 8.33e-08 2.4e-07 5.43e-08 1.59e-07 9.35e-08 1.66e-07 1.62e-07 2.05e-07 8.15e-08 6.12e-08 7.97e-08 4.18e-08 1.77e-07 7.18e-08 4.23e-08 1.25e-07 1.31e-07 1.69e-07 2.68e-08 1.85e-07 1.22e-07 1.17e-07 1.01e-07 1.26e-07 1.29e-07 1.09e-07 3.64e-08 3.13e-08 8.72e-08 3.12e-08 3.28e-08 5.8e-08 8.76e-08 6.41e-08 7.65e-08 5.13e-08 1.5e-07 3.2e-08 1.49e-08 3.84e-08 1.55e-08 1.2e-07 1.92e-09 4.8e-08