logo

Genes within 1Mb (chr1:30509615:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 3.39e-01 -0.128 0.133 0.09 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 4.49e-01 0.081 0.107 0.09 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 2.29e-01 0.108 0.0893 0.09 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -213970 sc-eQTL 2.06e-01 0.119 0.0939 0.09 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0235 0.0738 0.09 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0202 0.0865 0.09 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 8.65e-01 0.0174 0.102 0.09 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00918 0.113 0.09 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 1.80e-01 -0.118 0.0877 0.09 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0601 0.0783 0.09 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0849 0.0867 0.09 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00623 0.0777 0.09 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0752 0.0929 0.09 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 3.06e-01 0.156 0.152 0.09 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0465 0.101 0.09 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 1.54e-01 -0.127 0.0886 0.09 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0729 0.0864 0.09 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 5.41e-01 0.062 0.101 0.09 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0367 0.127 0.09 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 6.55e-01 0.0618 0.138 0.086 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 8.48e-01 0.0314 0.163 0.086 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0612 0.128 0.086 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 2.29e-01 -0.11 0.0911 0.086 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -899950 sc-eQTL 4.69e-01 -0.109 0.151 0.086 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -996611 sc-eQTL 9.83e-01 0.00211 0.0999 0.086 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 1.81e-01 -0.193 0.144 0.086 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0259 0.103 0.09 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 9.82e-01 0.00296 0.128 0.09 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 7.18e-01 0.0296 0.0818 0.09 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0324 0.0752 0.09 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -399143 sc-eQTL 4.57e-01 0.108 0.144 0.09 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -899950 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0435 0.155 0.09 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -996611 sc-eQTL 1.37e-01 -0.203 0.136 0.09 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 1.51e-02 0.289 0.118 0.09 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 2.69e-01 -0.159 0.143 0.09 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0168 0.0984 0.09 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 3.32e-01 0.1 0.103 0.09 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0965 0.119 0.09 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 1.31e-01 -0.201 0.133 0.09 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 4.90e-01 0.0852 0.123 0.09 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 2.56e-01 0.126 0.111 0.09 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0372 0.119 0.09 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0841 0.106 0.09 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0343 0.0874 0.09 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 8.14e-01 0.0337 0.143 0.09 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 4.62e-01 0.11 0.149 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 1.05e-01 -0.263 0.161 0.099 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 8.98e-01 0.021 0.164 0.099 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 3.50e-01 -0.142 0.152 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -213970 sc-eQTL 1.19e-01 -0.207 0.132 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 3.88e-01 0.0802 0.0926 0.099 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0615 0.15 0.099 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0556 0.133 0.099 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 2.97e-01 -0.168 0.161 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 9.30e-01 0.0119 0.135 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0106 0.127 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -213970 sc-eQTL 6.39e-01 0.062 0.132 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 9.54e-01 0.0047 0.0811 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 6.75e-01 0.0478 0.114 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 2.45e-01 0.148 0.127 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 2.79e-01 0.169 0.156 0.088 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0639 0.144 0.088 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 3.20e-01 -0.125 0.125 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -213970 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0269 0.12 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 1.69e-01 -0.146 0.106 0.088 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 2.65e-01 0.135 0.121 0.088 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 3.11e-01 0.144 0.142 0.088 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0202 0.143 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 1.43e-01 0.181 0.123 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 7.25e-02 0.195 0.108 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -213970 sc-eQTL 1.07e-01 0.178 0.11 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0395 0.0738 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0603 0.0969 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0218 0.12 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 3.19e-03 -0.443 0.148 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0116 0.125 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 5.26e-01 0.0778 0.122 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -213970 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00895 0.118 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00688 0.0798 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 2.30e-01 -0.14 0.116 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 5.31e-01 0.0788 0.125 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 4.71e-01 -0.112 0.155 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 5.08e-01 0.101 0.152 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 1.13e-03 -0.481 0.146 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0569 0.133 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 9.20e-01 0.0147 0.146 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 8.69e-01 0.0212 0.129 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 7.68e-01 0.0347 0.117 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 6.67e-02 -0.19 0.103 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 9.67e-01 0.00341 0.0831 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0594 0.0889 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0563 0.0902 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00452 0.104 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 5.81e-02 -0.281 0.148 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 2.20e-01 0.147 0.12 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0112 0.106 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 3.74e-02 -0.183 0.0873 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 1.45e-01 0.163 0.111 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 2.76e-01 -0.136 0.124 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 9.38e-01 0.0113 0.146 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0999 0.139 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0673 0.116 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 3.18e-01 -0.117 0.117 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 2.35e-01 -0.163 0.137 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 8.57e-01 0.0245 0.135 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 1.51e-01 0.239 0.166 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 5.70e-01 0.0727 0.128 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 3.78e-01 0.109 0.124 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 9.07e-01 0.0161 0.138 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 2.62e-01 0.162 0.144 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0271 0.136 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 8.13e-01 0.0347 0.147 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0148 0.127 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 1.85e-01 -0.135 0.101 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 3.87e-02 -0.201 0.0966 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 2.57e-02 -0.27 0.12 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0216 0.133 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 3.88e-01 0.147 0.17 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0728 0.156 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0139 0.147 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 2.40e-01 -0.18 0.153 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 4.40e-01 0.11 0.142 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 1.12e-01 0.228 0.143 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 7.38e-02 -0.281 0.157 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 2.20e-01 0.186 0.151 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 7.84e-01 0.0424 0.155 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 9.09e-01 0.0167 0.145 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 3.63e-01 -0.137 0.151 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 4.56e-01 -0.102 0.136 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 4.98e-01 0.106 0.157 0.089 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 2.60e-01 -0.156 0.139 0.089 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0652 0.133 0.089 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 2.32e-01 -0.15 0.125 0.089 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 4.69e-01 -0.101 0.14 0.089 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 4.86e-01 0.101 0.144 0.089 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 2.02e-01 -0.204 0.159 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 4.86e-01 0.0942 0.135 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 3.51e-01 -0.132 0.141 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 3.60e-01 -0.128 0.14 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0581 0.14 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 5.76e-01 0.0774 0.138 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 2.19e-01 -0.187 0.152 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00886 0.113 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 1.26e-01 0.177 0.115 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 4.16e-01 -0.1 0.123 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 4.16e-01 -0.126 0.154 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 2.16e-02 0.291 0.126 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 5.99e-01 0.0839 0.159 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 3.27e-01 0.139 0.142 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 2.93e-01 0.146 0.138 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0278 0.132 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 8.16e-01 0.0328 0.141 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 1.13e-03 0.438 0.133 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0648 0.149 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 5.77e-01 0.0647 0.116 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0576 0.125 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 9.34e-01 0.0114 0.138 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 4.25e-01 -0.117 0.146 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0159 0.136 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 2.06e-01 0.204 0.16 0.089 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 9.42e-01 0.0137 0.187 0.089 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 2.86e-01 0.173 0.161 0.089 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -213970 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0811 0.151 0.089 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0502 0.108 0.089 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 8.13e-01 0.0351 0.148 0.089 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 6.82e-01 0.0646 0.157 0.089 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 9.15e-01 0.0128 0.12 0.091 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 3.20e-01 -0.151 0.151 0.091 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 1.98e-01 0.182 0.141 0.091 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 6.93e-01 0.0401 0.102 0.091 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0173 0.142 0.091 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 6.23e-01 0.0643 0.131 0.091 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 7.74e-01 0.0454 0.158 0.09 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0373 0.153 0.09 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0923 0.122 0.09 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00441 0.14 0.09 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 2.28e-01 -0.172 0.142 0.09 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 6.41e-02 0.263 0.141 0.09 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0767 0.16 0.09 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0486 0.173 0.09 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 3.05e-01 -0.153 0.149 0.09 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 1.61e-01 -0.146 0.104 0.09 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899950 sc-eQTL 5.82e-01 0.0739 0.134 0.09 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -996611 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0953 0.132 0.09 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 4.04e-01 -0.118 0.142 0.09 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 3.89e-01 -0.106 0.123 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 5.66e-01 0.0789 0.137 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0128 0.0929 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00768 0.0816 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -399143 sc-eQTL 3.72e-01 0.137 0.153 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899950 sc-eQTL 9.51e-01 0.00965 0.156 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -996611 sc-eQTL 2.30e-01 -0.165 0.137 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 2.25e-02 0.291 0.127 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 2.70e-01 -0.143 0.129 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 2.47e-01 -0.177 0.152 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0492 0.11 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 6.14e-01 0.0428 0.0847 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -399143 sc-eQTL 9.01e-01 0.0182 0.146 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899950 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0876 0.155 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -996611 sc-eQTL 3.14e-01 -0.127 0.126 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 4.04e-01 0.105 0.126 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 8.40e-02 0.366 0.21 0.079 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 4.92e-01 -0.126 0.182 0.079 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 8.23e-01 0.0421 0.188 0.079 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 3.12e-01 -0.207 0.204 0.079 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 1.46e-01 0.274 0.187 0.079 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 4.30e-01 0.145 0.182 0.079 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0653 0.144 0.093 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 7.68e-01 0.0458 0.155 0.093 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 5.56e-01 0.0776 0.132 0.093 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0329 0.103 0.093 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -399143 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00255 0.141 0.093 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899950 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0158 0.148 0.093 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -996611 sc-eQTL 4.56e-01 -0.105 0.14 0.093 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 3.68e-01 0.126 0.14 0.093 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 1.39e-01 0.213 0.144 0.09 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 7.32e-02 0.275 0.153 0.09 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0412 0.126 0.09 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0286 0.114 0.09 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -399143 sc-eQTL 5.09e-01 0.0847 0.128 0.09 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899950 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00797 0.14 0.09 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -996611 sc-eQTL 8.38e-01 0.0287 0.14 0.09 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 3.01e-01 0.15 0.145 0.09 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 3.56e-01 0.146 0.158 0.09 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0494 0.174 0.09 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 4.76e-01 -0.103 0.144 0.09 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 3.62e-01 -0.122 0.134 0.09 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -899950 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0444 0.162 0.09 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -996611 sc-eQTL 6.95e-01 0.0494 0.126 0.09 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 8.13e-01 0.0351 0.148 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0744 0.153 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0447 0.128 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 1.31e-01 -0.171 0.113 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -213970 sc-eQTL 4.31e-01 -0.102 0.129 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0332 0.0811 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 5.83e-01 0.0589 0.107 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 5.09e-01 0.0772 0.117 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 2.72e-01 -0.154 0.14 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 2.99e-01 0.115 0.111 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 9.96e-02 0.173 0.105 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -213970 sc-eQTL 1.80e-01 0.136 0.101 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0432 0.0713 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0555 0.092 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 8.77e-01 0.0169 0.109 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 3.93e-01 -0.101 0.118 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0685 0.133 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 9.26e-01 0.00796 0.085 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0122 0.0747 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -399143 sc-eQTL 7.67e-01 0.0452 0.152 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -899950 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0284 0.157 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -996611 sc-eQTL 1.97e-01 -0.166 0.128 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 3.65e-02 0.251 0.119 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 3.67e-01 0.119 0.132 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 1.58e-01 0.204 0.144 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 8.70e-01 0.0194 0.118 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0736 0.0944 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -399143 sc-eQTL 7.18e-01 0.05 0.138 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -899950 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0578 0.143 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -996611 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0346 0.136 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 3.35e-01 0.131 0.136 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -787173 sc-eQTL 2.98e-01 -0.151 0.145 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -787367 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0325 0.0991 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -556376 sc-eQTL 3.51e-01 0.101 0.108 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -248159 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0902 0.121 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 sc-eQTL 1.43e-01 -0.205 0.139 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -222078 sc-eQTL 1.38e-01 0.179 0.12 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -208889 eQTL 3.47e-03 -0.0669 0.0228 0.00239 0.0 0.0765

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 \N -899950 2.91e-07 1.33e-07 5.93e-08 2.05e-07 1.03e-07 8.21e-08 1.81e-07 5.62e-08 1.44e-07 7.6e-08 1.67e-07 1.15e-07 1.87e-07 7.95e-08 5.82e-08 7.89e-08 4.45e-08 1.64e-07 7.12e-08 5.07e-08 1.27e-07 1.31e-07 1.58e-07 2.68e-08 1.68e-07 1.31e-07 1.17e-07 1.04e-07 1.26e-07 1.05e-07 1.07e-07 3.93e-08 3.51e-08 9.52e-08 3.02e-08 2.74e-08 5.42e-08 8.89e-08 6.76e-08 3.99e-08 5.33e-08 1.46e-07 5.22e-08 1.09e-08 3.2e-08 1.71e-08 9.96e-08 1.93e-09 4.8e-08