logo

Genes within 1Mb (chr1:30508347:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 3.39e-01 -0.128 0.133 0.09 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 4.49e-01 0.081 0.107 0.09 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 2.29e-01 0.108 0.0893 0.09 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -215238 sc-eQTL 2.06e-01 0.119 0.0939 0.09 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0235 0.0738 0.09 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0202 0.0865 0.09 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 8.65e-01 0.0174 0.102 0.09 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00918 0.113 0.09 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 1.80e-01 -0.118 0.0877 0.09 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0601 0.0783 0.09 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0849 0.0867 0.09 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00623 0.0777 0.09 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0752 0.0929 0.09 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 3.06e-01 0.156 0.152 0.09 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0465 0.101 0.09 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 1.54e-01 -0.127 0.0886 0.09 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0729 0.0864 0.09 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 5.41e-01 0.062 0.101 0.09 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0367 0.127 0.09 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 6.55e-01 0.0618 0.138 0.086 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 8.48e-01 0.0314 0.163 0.086 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0612 0.128 0.086 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 2.29e-01 -0.11 0.0911 0.086 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -901218 sc-eQTL 4.69e-01 -0.109 0.151 0.086 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -997879 sc-eQTL 9.83e-01 0.00211 0.0999 0.086 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 1.81e-01 -0.193 0.144 0.086 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0259 0.103 0.09 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 9.82e-01 0.00296 0.128 0.09 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 7.18e-01 0.0296 0.0818 0.09 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0324 0.0752 0.09 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -400411 sc-eQTL 4.57e-01 0.108 0.144 0.09 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -901218 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0435 0.155 0.09 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -997879 sc-eQTL 1.37e-01 -0.203 0.136 0.09 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 1.51e-02 0.289 0.118 0.09 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 2.69e-01 -0.159 0.143 0.09 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0168 0.0984 0.09 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 3.32e-01 0.1 0.103 0.09 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0965 0.119 0.09 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 1.31e-01 -0.201 0.133 0.09 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 4.90e-01 0.0852 0.123 0.09 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 2.56e-01 0.126 0.111 0.09 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0372 0.119 0.09 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0841 0.106 0.09 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0343 0.0874 0.09 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 8.14e-01 0.0337 0.143 0.09 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 4.62e-01 0.11 0.149 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 1.05e-01 -0.263 0.161 0.099 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 8.98e-01 0.021 0.164 0.099 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 3.50e-01 -0.142 0.152 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -215238 sc-eQTL 1.19e-01 -0.207 0.132 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 3.88e-01 0.0802 0.0926 0.099 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0615 0.15 0.099 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0556 0.133 0.099 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 2.97e-01 -0.168 0.161 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 9.30e-01 0.0119 0.135 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0106 0.127 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -215238 sc-eQTL 6.39e-01 0.062 0.132 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 9.54e-01 0.0047 0.0811 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 6.75e-01 0.0478 0.114 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 2.45e-01 0.148 0.127 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 2.79e-01 0.169 0.156 0.088 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0639 0.144 0.088 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 3.20e-01 -0.125 0.125 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -215238 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0269 0.12 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 1.69e-01 -0.146 0.106 0.088 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 2.65e-01 0.135 0.121 0.088 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 3.11e-01 0.144 0.142 0.088 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0202 0.143 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 1.43e-01 0.181 0.123 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 7.25e-02 0.195 0.108 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -215238 sc-eQTL 1.07e-01 0.178 0.11 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0395 0.0738 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0603 0.0969 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0218 0.12 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 3.19e-03 -0.443 0.148 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0116 0.125 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 5.26e-01 0.0778 0.122 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -215238 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00895 0.118 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00688 0.0798 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 2.30e-01 -0.14 0.116 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 5.31e-01 0.0788 0.125 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 4.71e-01 -0.112 0.155 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 5.08e-01 0.101 0.152 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 1.13e-03 -0.481 0.146 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0569 0.133 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 9.20e-01 0.0147 0.146 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 8.69e-01 0.0212 0.129 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 7.68e-01 0.0347 0.117 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 6.67e-02 -0.19 0.103 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 9.67e-01 0.00341 0.0831 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0594 0.0889 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0563 0.0902 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00452 0.104 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 5.81e-02 -0.281 0.148 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 2.20e-01 0.147 0.12 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0112 0.106 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 3.74e-02 -0.183 0.0873 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 1.45e-01 0.163 0.111 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 2.76e-01 -0.136 0.124 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 9.38e-01 0.0113 0.146 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0999 0.139 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0673 0.116 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 3.18e-01 -0.117 0.117 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 2.35e-01 -0.163 0.137 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 8.57e-01 0.0245 0.135 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 1.51e-01 0.239 0.166 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 5.70e-01 0.0727 0.128 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 3.78e-01 0.109 0.124 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 9.07e-01 0.0161 0.138 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 2.62e-01 0.162 0.144 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0271 0.136 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 8.13e-01 0.0347 0.147 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0148 0.127 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 1.85e-01 -0.135 0.101 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 3.87e-02 -0.201 0.0966 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 2.57e-02 -0.27 0.12 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0216 0.133 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 3.88e-01 0.147 0.17 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0728 0.156 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0139 0.147 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 2.40e-01 -0.18 0.153 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 4.40e-01 0.11 0.142 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 1.12e-01 0.228 0.143 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 7.38e-02 -0.281 0.157 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 2.20e-01 0.186 0.151 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 7.84e-01 0.0424 0.155 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 9.09e-01 0.0167 0.145 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 3.63e-01 -0.137 0.151 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 4.56e-01 -0.102 0.136 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 4.98e-01 0.106 0.157 0.089 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 2.60e-01 -0.156 0.139 0.089 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0652 0.133 0.089 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 2.32e-01 -0.15 0.125 0.089 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 4.69e-01 -0.101 0.14 0.089 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 4.86e-01 0.101 0.144 0.089 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 2.02e-01 -0.204 0.159 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 4.86e-01 0.0942 0.135 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 3.51e-01 -0.132 0.141 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 3.60e-01 -0.128 0.14 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0581 0.14 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 5.76e-01 0.0774 0.138 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 2.19e-01 -0.187 0.152 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00886 0.113 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 1.26e-01 0.177 0.115 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 4.16e-01 -0.1 0.123 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 4.16e-01 -0.126 0.154 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 2.16e-02 0.291 0.126 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 5.99e-01 0.0839 0.159 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 3.27e-01 0.139 0.142 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 2.93e-01 0.146 0.138 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0278 0.132 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 8.16e-01 0.0328 0.141 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 1.13e-03 0.438 0.133 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0648 0.149 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 5.77e-01 0.0647 0.116 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0576 0.125 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 9.34e-01 0.0114 0.138 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 4.25e-01 -0.117 0.146 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0159 0.136 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 2.06e-01 0.204 0.16 0.089 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 9.42e-01 0.0137 0.187 0.089 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 2.86e-01 0.173 0.161 0.089 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -215238 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0811 0.151 0.089 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0502 0.108 0.089 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 8.13e-01 0.0351 0.148 0.089 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 6.82e-01 0.0646 0.157 0.089 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 9.15e-01 0.0128 0.12 0.091 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 3.20e-01 -0.151 0.151 0.091 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 1.98e-01 0.182 0.141 0.091 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 6.93e-01 0.0401 0.102 0.091 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0173 0.142 0.091 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 6.23e-01 0.0643 0.131 0.091 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 7.74e-01 0.0454 0.158 0.09 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0373 0.153 0.09 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0923 0.122 0.09 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00441 0.14 0.09 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 2.28e-01 -0.172 0.142 0.09 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 6.41e-02 0.263 0.141 0.09 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0767 0.16 0.09 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0486 0.173 0.09 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 3.05e-01 -0.153 0.149 0.09 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 1.61e-01 -0.146 0.104 0.09 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -901218 sc-eQTL 5.82e-01 0.0739 0.134 0.09 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -997879 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0953 0.132 0.09 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 4.04e-01 -0.118 0.142 0.09 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 3.89e-01 -0.106 0.123 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 5.66e-01 0.0789 0.137 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0128 0.0929 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00768 0.0816 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -400411 sc-eQTL 3.72e-01 0.137 0.153 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -901218 sc-eQTL 9.51e-01 0.00965 0.156 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -997879 sc-eQTL 2.30e-01 -0.165 0.137 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 2.25e-02 0.291 0.127 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 2.70e-01 -0.143 0.129 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 2.47e-01 -0.177 0.152 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0492 0.11 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 6.14e-01 0.0428 0.0847 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -400411 sc-eQTL 9.01e-01 0.0182 0.146 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -901218 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0876 0.155 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -997879 sc-eQTL 3.14e-01 -0.127 0.126 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 4.04e-01 0.105 0.126 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 8.40e-02 0.366 0.21 0.079 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 4.92e-01 -0.126 0.182 0.079 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 8.23e-01 0.0421 0.188 0.079 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 3.12e-01 -0.207 0.204 0.079 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 1.46e-01 0.274 0.187 0.079 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 4.30e-01 0.145 0.182 0.079 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0653 0.144 0.093 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 7.68e-01 0.0458 0.155 0.093 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 5.56e-01 0.0776 0.132 0.093 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0329 0.103 0.093 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -400411 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00255 0.141 0.093 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -901218 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0158 0.148 0.093 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -997879 sc-eQTL 4.56e-01 -0.105 0.14 0.093 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 3.68e-01 0.126 0.14 0.093 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 1.39e-01 0.213 0.144 0.09 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 7.32e-02 0.275 0.153 0.09 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0412 0.126 0.09 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0286 0.114 0.09 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -400411 sc-eQTL 5.09e-01 0.0847 0.128 0.09 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -901218 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00797 0.14 0.09 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -997879 sc-eQTL 8.38e-01 0.0287 0.14 0.09 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 3.01e-01 0.15 0.145 0.09 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 3.56e-01 0.146 0.158 0.09 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0494 0.174 0.09 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 4.76e-01 -0.103 0.144 0.09 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 3.62e-01 -0.122 0.134 0.09 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -901218 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0444 0.162 0.09 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -997879 sc-eQTL 6.95e-01 0.0494 0.126 0.09 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 8.13e-01 0.0351 0.148 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0744 0.153 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0447 0.128 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 1.31e-01 -0.171 0.113 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -215238 sc-eQTL 4.31e-01 -0.102 0.129 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0332 0.0811 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 5.83e-01 0.0589 0.107 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 5.09e-01 0.0772 0.117 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 2.72e-01 -0.154 0.14 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 2.99e-01 0.115 0.111 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 9.96e-02 0.173 0.105 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -215238 sc-eQTL 1.80e-01 0.136 0.101 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0432 0.0713 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0555 0.092 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 8.77e-01 0.0169 0.109 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 3.93e-01 -0.101 0.118 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0685 0.133 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 9.26e-01 0.00796 0.085 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0122 0.0747 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -400411 sc-eQTL 7.67e-01 0.0452 0.152 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -901218 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0284 0.157 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -997879 sc-eQTL 1.97e-01 -0.166 0.128 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 3.65e-02 0.251 0.119 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 3.67e-01 0.119 0.132 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 1.58e-01 0.204 0.144 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 8.70e-01 0.0194 0.118 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0736 0.0944 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -400411 sc-eQTL 7.18e-01 0.05 0.138 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -901218 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0578 0.143 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -997879 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0346 0.136 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 3.35e-01 0.131 0.136 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -788441 sc-eQTL 2.98e-01 -0.151 0.145 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -788635 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0325 0.0991 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -557644 sc-eQTL 3.51e-01 0.101 0.108 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -249427 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0902 0.121 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 sc-eQTL 1.43e-01 -0.205 0.139 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -223346 sc-eQTL 1.38e-01 0.179 0.12 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -210157 eQTL 3.54e-03 -0.0665 0.0227 0.0023 0.0 0.0756

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 \N -901218 2.76e-07 1.34e-07 5.03e-08 1.83e-07 1.01e-07 9.05e-08 1.6e-07 5.66e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.52e-07 1.01e-07 1.59e-07 7.37e-08 6.18e-08 7.23e-08 4.24e-08 1.4e-07 5.97e-08 4.21e-08 1.26e-07 1.26e-07 1.44e-07 2.64e-08 1.55e-07 1.22e-07 1.1e-07 9.92e-08 1.23e-07 1.07e-07 1.02e-07 2.96e-08 3.43e-08 8.23e-08 3.63e-08 3.04e-08 5.3e-08 8.76e-08 6.63e-08 4.19e-08 5.03e-08 1.46e-07 5.27e-08 1.23e-08 4.25e-08 1.89e-08 1.2e-07 1.89e-09 5.01e-08