logo

Genes within 1Mb (chr1:30503696:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 2.72e-01 -0.163 0.148 0.073 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 8.83e-01 0.0174 0.119 0.073 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 5.70e-02 0.189 0.0989 0.073 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -219889 sc-eQTL 8.66e-01 0.0177 0.105 0.073 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0489 0.082 0.073 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0112 0.0962 0.073 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 3.16e-01 0.114 0.114 0.073 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 9.31e-01 0.0108 0.125 0.073 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 2.01e-01 -0.125 0.0974 0.073 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0744 0.0869 0.073 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0695 0.0964 0.073 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 8.66e-01 0.0146 0.0863 0.073 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0994 0.103 0.073 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 2.56e-01 0.191 0.168 0.073 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0949 0.112 0.073 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 2.20e-01 -0.121 0.0982 0.073 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 4.40e-01 -0.074 0.0956 0.073 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 5.38e-01 0.0691 0.112 0.073 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0216 0.141 0.073 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 5.07e-01 0.105 0.157 0.068 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 5.33e-01 -0.116 0.186 0.068 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 6.86e-01 -0.059 0.146 0.068 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0822 0.104 0.068 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -905869 sc-eQTL 5.07e-01 -0.114 0.172 0.068 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 3.13e-01 -0.166 0.164 0.068 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 6.90e-01 0.0456 0.114 0.073 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0196 0.142 0.073 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 5.91e-01 0.0489 0.0907 0.073 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0271 0.0835 0.073 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -405062 sc-eQTL 1.47e-01 0.233 0.16 0.073 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -905869 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0262 0.172 0.073 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 2.55e-02 0.295 0.131 0.073 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 3.15e-01 -0.161 0.16 0.073 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0516 0.11 0.073 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 1.30e-01 0.174 0.114 0.073 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 4.05e-01 -0.11 0.132 0.073 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 4.17e-02 -0.302 0.147 0.073 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 1.28e-01 0.208 0.137 0.073 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 3.66e-01 0.111 0.122 0.073 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0521 0.131 0.073 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0732 0.118 0.073 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0882 0.0964 0.073 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 2.03e-01 0.201 0.158 0.073 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 6.47e-01 0.0755 0.165 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 1.84e-01 -0.241 0.181 0.082 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 5.35e-01 -0.114 0.183 0.082 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 5.57e-01 -0.1 0.17 0.082 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -219889 sc-eQTL 5.15e-02 -0.289 0.147 0.082 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 5.61e-01 0.0604 0.104 0.082 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0757 0.168 0.082 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 4.12e-01 0.122 0.148 0.082 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 2.03e-01 -0.228 0.179 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 8.99e-01 0.019 0.149 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 5.61e-01 0.0819 0.141 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -219889 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0469 0.147 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 6.57e-01 -0.04 0.09 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0308 0.126 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 3.33e-01 0.137 0.141 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 1.78e-01 0.233 0.173 0.071 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 3.29e-01 -0.156 0.159 0.071 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0916 0.139 0.071 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -219889 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0439 0.133 0.071 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 1.01e-01 -0.193 0.117 0.071 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 3.11e-01 0.137 0.135 0.071 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 5.60e-01 0.0922 0.158 0.071 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 9.20e-01 0.016 0.16 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 2.68e-01 0.153 0.137 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 5.58e-02 0.232 0.12 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -219889 sc-eQTL 6.34e-01 0.0587 0.123 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0526 0.0823 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 5.36e-01 -0.067 0.108 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 7.10e-01 0.0497 0.134 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 2.01e-03 -0.517 0.165 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0462 0.139 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 3.06e-01 0.14 0.136 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -219889 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0978 0.131 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00355 0.089 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 3.99e-01 -0.109 0.129 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 2.14e-01 0.174 0.14 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 6.13e-02 -0.319 0.17 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 6.79e-01 0.0698 0.168 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 3.81e-03 -0.473 0.161 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 3.74e-01 -0.131 0.147 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 6.64e-01 -0.07 0.161 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 8.99e-01 0.018 0.142 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 5.17e-01 0.0847 0.13 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 4.32e-02 -0.233 0.115 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0222 0.0924 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0314 0.099 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0524 0.1 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 9.98e-01 0.000294 0.115 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 1.18e-01 -0.258 0.164 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 2.37e-01 0.157 0.132 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 8.41e-01 0.0236 0.118 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 2.13e-02 -0.224 0.0964 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 1.48e-01 0.179 0.123 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 2.82e-01 -0.148 0.138 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 8.78e-01 0.0248 0.162 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0389 0.154 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0294 0.129 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 2.75e-01 -0.142 0.13 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 3.39e-01 -0.146 0.152 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 4.03e-01 0.125 0.15 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 1.07e-01 0.303 0.187 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 7.71e-01 0.042 0.144 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 3.20e-01 0.14 0.14 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 7.48e-01 0.0499 0.155 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 2.01e-01 0.208 0.163 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 6.43e-01 0.0712 0.153 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 8.51e-01 0.0306 0.163 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0477 0.14 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 3.15e-01 -0.113 0.113 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 5.97e-02 -0.203 0.107 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 2.87e-02 -0.294 0.133 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 9.70e-01 0.00552 0.147 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 4.71e-01 0.138 0.191 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00387 0.175 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 9.89e-01 0.00238 0.165 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 3.06e-01 -0.176 0.172 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 5.08e-01 0.106 0.159 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 2.72e-01 0.177 0.161 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 3.67e-01 -0.162 0.179 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 6.77e-01 0.0717 0.172 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 7.78e-01 0.0496 0.176 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 4.92e-01 0.114 0.165 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 4.63e-01 -0.126 0.171 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 6.07e-01 0.0799 0.155 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 4.47e-01 0.132 0.174 0.071 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 7.05e-02 -0.278 0.153 0.071 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0735 0.148 0.071 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 4.10e-01 -0.115 0.139 0.071 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 9.39e-01 0.0119 0.155 0.071 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 7.62e-01 0.0485 0.16 0.071 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 1.81e-01 -0.239 0.178 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 7.00e-01 0.0582 0.151 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 4.33e-01 -0.125 0.158 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0977 0.156 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0373 0.157 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 1.43e-01 0.227 0.154 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 2.95e-01 -0.178 0.169 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0839 0.125 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 6.79e-02 0.234 0.128 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0905 0.137 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 1.44e-01 -0.251 0.171 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 5.37e-03 0.392 0.139 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 6.86e-01 0.0726 0.179 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 4.08e-01 0.133 0.16 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 4.29e-02 0.315 0.154 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0927 0.149 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 6.33e-01 0.0758 0.158 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 2.16e-03 0.465 0.15 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 4.32e-01 -0.13 0.165 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 5.13e-01 0.0844 0.129 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 9.56e-01 0.00767 0.139 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 7.77e-01 0.0436 0.154 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 4.41e-01 -0.125 0.162 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 2.74e-01 0.165 0.151 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 2.80e-01 0.191 0.176 0.074 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0259 0.205 0.074 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 2.92e-01 0.188 0.178 0.074 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -219889 sc-eQTL 4.52e-01 -0.125 0.166 0.074 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 4.49e-01 -0.09 0.119 0.074 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0695 0.163 0.074 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 8.55e-01 0.0317 0.173 0.074 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00536 0.132 0.074 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 4.03e-01 -0.14 0.167 0.074 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 1.72e-01 0.213 0.155 0.074 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 6.23e-01 -0.055 0.112 0.074 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 8.82e-01 0.0233 0.156 0.074 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 7.31e-01 0.0494 0.144 0.074 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 3.61e-01 0.162 0.177 0.073 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0251 0.171 0.073 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 2.99e-01 -0.143 0.137 0.073 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0744 0.157 0.073 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 2.66e-01 -0.178 0.16 0.073 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 7.62e-02 0.283 0.159 0.073 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0995 0.18 0.071 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 1.46e-01 -0.284 0.194 0.071 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 3.67e-01 -0.151 0.167 0.071 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0869 0.117 0.071 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -905869 sc-eQTL 4.52e-01 0.114 0.151 0.071 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 1.88e-01 -0.21 0.159 0.071 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 9.72e-01 0.00477 0.136 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 8.83e-01 0.0224 0.152 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 9.56e-01 0.00571 0.103 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 8.35e-01 0.0189 0.0904 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -405062 sc-eQTL 2.04e-01 0.216 0.17 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -905869 sc-eQTL 7.68e-01 0.0509 0.172 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 2.87e-02 0.31 0.141 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0105 0.143 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 3.63e-01 -0.154 0.169 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 9.26e-01 0.0114 0.122 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 2.92e-01 0.0992 0.0939 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -405062 sc-eQTL 6.48e-01 0.0743 0.162 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -905869 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0783 0.172 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 8.80e-01 0.0212 0.14 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 1.60e-01 0.327 0.231 0.064 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 5.58e-01 -0.117 0.2 0.064 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 8.92e-01 0.028 0.206 0.064 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 1.71e-01 -0.307 0.223 0.064 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 8.65e-02 0.354 0.205 0.064 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 3.85e-01 0.174 0.2 0.064 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 3.69e-01 -0.145 0.161 0.076 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 8.76e-01 0.0271 0.173 0.076 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 1.66e-01 0.203 0.146 0.076 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0656 0.115 0.076 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -405062 sc-eQTL 3.46e-01 0.149 0.157 0.076 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -905869 sc-eQTL 8.22e-01 0.0372 0.165 0.076 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 2.68e-01 0.173 0.156 0.076 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 9.62e-02 0.273 0.163 0.072 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 6.04e-02 0.329 0.174 0.072 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0723 0.143 0.072 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0542 0.13 0.072 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -405062 sc-eQTL 4.90e-01 0.101 0.146 0.072 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -905869 sc-eQTL 9.18e-01 0.0165 0.159 0.072 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 1.44e-01 0.241 0.164 0.072 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 2.38e-01 0.217 0.183 0.068 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0942 0.202 0.068 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00991 0.168 0.068 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 1.62e-01 -0.218 0.155 0.068 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -905869 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00708 0.189 0.068 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 1.13e-01 0.273 0.171 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0745 0.17 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 4.12e-01 -0.117 0.142 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 3.79e-01 -0.111 0.125 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -219889 sc-eQTL 1.89e-01 -0.188 0.143 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0951 0.0898 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0146 0.119 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 6.89e-01 0.0519 0.13 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 3.13e-01 -0.158 0.156 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 5.35e-01 0.0769 0.124 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 4.69e-02 0.232 0.116 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -219889 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0032 0.113 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0417 0.0793 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0542 0.102 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 3.03e-01 0.126 0.121 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 7.41e-01 0.0434 0.131 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0945 0.148 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 5.69e-01 0.054 0.0946 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 7.29e-01 0.0288 0.0832 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -405062 sc-eQTL 4.69e-01 0.123 0.17 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -905869 sc-eQTL 9.74e-01 0.00565 0.175 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 8.09e-02 0.234 0.133 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 4.72e-01 0.106 0.147 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 1.80e-01 0.215 0.16 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 6.64e-01 0.0573 0.132 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 2.12e-01 -0.131 0.105 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -405062 sc-eQTL 3.17e-01 0.154 0.154 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -905869 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0135 0.16 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 2.29e-01 0.182 0.151 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -793092 sc-eQTL 3.08e-01 -0.165 0.161 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -793286 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0721 0.11 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -562295 sc-eQTL 1.39e-01 0.179 0.12 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -254078 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0983 0.135 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 sc-eQTL 6.74e-02 -0.284 0.155 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -227997 sc-eQTL 2.29e-02 0.304 0.133 0.073 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121769 FABP3 -873154 pQTL 4.26e-02 0.0648 0.0319 0.0 0.0 0.0697
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -214808 eQTL 9.95e-03 -0.0618 0.0239 0.00137 0.0 0.0672

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina