logo

Genes within 1Mb (chr1:30499160:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0139 0.128 0.1 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0613 0.103 0.1 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 3.90e-02 -0.177 0.0854 0.1 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -224425 sc-eQTL 8.57e-01 0.0164 0.0907 0.1 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 7.01e-01 0.0273 0.071 0.1 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00681 0.0833 0.1 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 1.49e-01 -0.142 0.0981 0.1 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0462 0.113 0.1 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 8.89e-01 0.0124 0.0882 0.1 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0483 0.0785 0.1 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 4.47e-01 0.0663 0.0869 0.1 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0152 0.0779 0.1 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00311 0.0933 0.1 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0509 0.145 0.1 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 5.51e-01 0.0578 0.0968 0.1 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0432 0.0852 0.1 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 7.51e-02 0.147 0.0822 0.1 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 2.30e-01 -0.116 0.0967 0.1 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 7.95e-01 0.0317 0.122 0.1 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 3.46e-01 0.12 0.127 0.104 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 2.45e-01 -0.175 0.15 0.104 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0719 0.118 0.104 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0825 0.0841 0.104 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -910405 sc-eQTL 3.09e-02 -0.299 0.137 0.104 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 1.68e-01 0.184 0.133 0.104 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 5.25e-01 0.0636 0.0997 0.1 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 9.04e-01 -0.015 0.124 0.1 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 6.27e-01 0.0386 0.0793 0.1 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 8.06e-01 0.0179 0.0729 0.1 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -409598 sc-eQTL 6.37e-02 0.259 0.139 0.1 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -910405 sc-eQTL 7.20e-02 -0.27 0.149 0.1 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 4.39e-02 -0.232 0.115 0.1 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 6.07e-01 0.0721 0.14 0.101 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 2.15e-01 -0.119 0.0954 0.101 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0391 0.1 0.101 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 3.79e-01 -0.102 0.115 0.101 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0845 0.13 0.101 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 1.77e-01 -0.162 0.119 0.101 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0905 0.104 0.1 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 3.47e-01 -0.104 0.111 0.1 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 5.04e-01 0.0668 0.0997 0.1 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 4.63e-01 0.0601 0.0817 0.1 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 5.04e-01 0.0895 0.134 0.1 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 2.68e-01 -0.154 0.139 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 6.58e-01 0.0724 0.163 0.112 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 2.15e-01 -0.204 0.164 0.112 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 8.89e-01 0.0214 0.153 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -224425 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0359 0.134 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 3.84e-01 0.0813 0.0932 0.112 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 9.60e-01 0.00756 0.151 0.112 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0516 0.133 0.112 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0892 0.157 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 4.19e-02 -0.266 0.13 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 4.98e-01 -0.084 0.124 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -224425 sc-eQTL 8.22e-01 0.029 0.129 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0252 0.079 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 5.12e-01 0.0728 0.111 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 1.30e-01 -0.188 0.123 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 1.42e-01 -0.22 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 5.31e-01 0.0866 0.138 0.099 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 1.00e+00 -6.79e-05 0.12 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -224425 sc-eQTL 2.29e-01 0.138 0.115 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 2.51e-01 0.117 0.102 0.099 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 3.16e-01 -0.117 0.116 0.099 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 1.10e-01 -0.218 0.136 0.099 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 7.53e-01 0.0438 0.139 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0345 0.12 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 1.70e-01 -0.145 0.105 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -224425 sc-eQTL 8.04e-01 0.0266 0.107 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 5.54e-01 0.0424 0.0716 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0145 0.0941 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0634 0.116 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 5.28e-01 0.094 0.149 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 4.13e-01 -0.101 0.123 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 2.94e-01 -0.126 0.12 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -224425 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0277 0.115 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 6.61e-01 0.0345 0.0784 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 3.02e-01 0.118 0.114 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0158 0.123 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 8.47e-01 0.0284 0.147 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 3.83e-01 -0.126 0.144 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 1.85e-01 -0.188 0.141 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 8.56e-01 0.023 0.126 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 1.98e-01 -0.178 0.138 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 1.84e-01 -0.162 0.121 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0689 0.117 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 4.10e-01 0.0855 0.104 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 1.25e-01 -0.127 0.0824 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 5.47e-01 0.0535 0.0888 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 9.94e-01 0.000649 0.0901 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 5.18e-01 0.067 0.103 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 6.86e-01 0.0596 0.147 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0632 0.119 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0121 0.105 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 8.22e-01 0.0196 0.0871 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 6.20e-01 0.0548 0.11 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 7.05e-01 0.0466 0.123 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 5.80e-01 0.0801 0.144 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 3.22e-01 -0.136 0.137 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0487 0.115 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 2.67e-01 0.129 0.116 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0447 0.136 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 4.79e-01 0.0948 0.134 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 5.99e-01 0.0826 0.157 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 3.21e-01 -0.119 0.12 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 6.30e-01 0.0563 0.117 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0287 0.129 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 4.21e-01 -0.11 0.136 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0957 0.128 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0919 0.144 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 2.39e-01 0.147 0.124 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00308 0.1 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 1.48e-01 0.139 0.0956 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0119 0.12 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0146 0.131 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 6.12e-01 0.0788 0.155 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 9.91e-01 0.00153 0.142 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 9.00e-01 0.0168 0.134 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 6.28e-01 0.068 0.14 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 1.58e-02 -0.311 0.128 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 3.21e-02 0.28 0.13 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 4.80e-01 -0.111 0.157 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 6.50e-01 0.0683 0.15 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 5.18e-01 0.0995 0.154 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 8.37e-01 0.0297 0.145 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 5.65e-01 0.0864 0.15 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 1.75e-01 -0.184 0.135 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 2.14e-01 -0.191 0.153 0.102 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0474 0.136 0.102 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 3.88e-01 -0.113 0.131 0.102 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 5.77e-02 0.233 0.122 0.102 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 2.72e-01 0.151 0.137 0.102 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0894 0.141 0.102 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 5.63e-02 0.294 0.153 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 1.46e-01 -0.19 0.13 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0756 0.137 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0542 0.135 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 1.70e-02 -0.323 0.134 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 8.45e-02 -0.231 0.133 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 8.75e-01 0.0232 0.147 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 9.23e-02 -0.183 0.108 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 5.47e-01 0.0673 0.112 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 2.99e-01 -0.124 0.119 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 6.81e-02 0.272 0.148 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0356 0.123 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 1.59e-01 -0.22 0.156 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0505 0.14 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 2.48e-01 0.157 0.136 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 3.27e-01 -0.127 0.13 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 4.58e-01 -0.103 0.138 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 3.19e-01 -0.133 0.133 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 6.85e-01 0.0594 0.146 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 3.68e-01 -0.103 0.114 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 2.15e-01 -0.153 0.123 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 4.90e-01 -0.094 0.136 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0362 0.144 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 3.22e-01 -0.133 0.134 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0289 0.163 0.107 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 6.90e-01 0.0757 0.189 0.107 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0354 0.164 0.107 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -224425 sc-eQTL 9.13e-01 0.0167 0.153 0.107 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 2.01e-01 0.14 0.109 0.107 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 6.28e-02 0.277 0.147 0.107 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 3.79e-01 -0.14 0.159 0.107 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0304 0.111 0.102 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00285 0.141 0.102 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 1.88e-01 0.173 0.131 0.102 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 6.08e-01 0.0483 0.094 0.102 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 4.35e-02 0.264 0.13 0.102 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0762 0.121 0.102 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0517 0.15 0.1 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 8.11e-01 0.0348 0.145 0.1 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 5.02e-01 0.0779 0.116 0.1 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 4.91e-01 0.0916 0.133 0.1 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 4.45e-02 0.271 0.134 0.1 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0576 0.135 0.1 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 3.56e-01 0.134 0.145 0.107 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0522 0.158 0.107 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 7.70e-01 0.0397 0.135 0.107 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 4.34e-01 0.0744 0.0948 0.107 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -910405 sc-eQTL 2.04e-01 -0.155 0.121 0.107 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 4.74e-01 0.0925 0.129 0.107 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 6.53e-01 0.0541 0.12 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00636 0.134 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 7.58e-01 0.028 0.0907 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 9.66e-01 0.00339 0.0796 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -409598 sc-eQTL 2.87e-01 0.16 0.15 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -910405 sc-eQTL 1.46e-01 -0.221 0.151 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 2.87e-02 -0.273 0.124 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 4.27e-01 0.1 0.126 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 7.70e-01 0.0435 0.149 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 8.66e-01 0.0182 0.107 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00229 0.0826 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -409598 sc-eQTL 1.71e-01 0.195 0.142 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -910405 sc-eQTL 4.48e-02 -0.302 0.15 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 1.01e-03 -0.401 0.12 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 3.00e-01 0.193 0.186 0.106 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 5.38e-01 0.0985 0.16 0.106 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 3.05e-01 0.169 0.164 0.106 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 3.31e-01 -0.174 0.179 0.106 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 2.99e-01 0.172 0.165 0.106 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 8.64e-02 -0.274 0.159 0.106 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0249 0.138 0.104 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 3.76e-02 -0.306 0.146 0.104 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0621 0.125 0.104 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0344 0.0984 0.104 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -409598 sc-eQTL 1.03e-01 0.219 0.134 0.104 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -910405 sc-eQTL 7.39e-02 -0.251 0.14 0.104 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 8.38e-01 0.0273 0.134 0.104 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0562 0.132 0.102 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 2.40e-01 0.166 0.14 0.102 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0841 0.115 0.102 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 9.76e-02 0.173 0.104 0.102 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -409598 sc-eQTL 3.75e-01 0.104 0.117 0.102 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -910405 sc-eQTL 6.00e-03 -0.349 0.126 0.102 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0314 0.133 0.102 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 6.95e-01 0.0578 0.147 0.105 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 1.81e-01 -0.216 0.16 0.105 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0332 0.134 0.105 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 8.54e-02 -0.213 0.123 0.105 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -910405 sc-eQTL 7.64e-02 -0.266 0.149 0.105 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 7.38e-01 0.0462 0.138 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 9.07e-02 -0.251 0.148 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 1.15e-01 -0.195 0.123 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 3.86e-01 -0.095 0.109 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -224425 sc-eQTL 4.40e-01 0.0966 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 5.21e-01 0.0504 0.0784 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 6.87e-01 -0.042 0.104 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 2.01e-01 -0.145 0.113 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 3.80e-01 0.119 0.136 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0482 0.107 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 1.90e-01 -0.133 0.101 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -224425 sc-eQTL 7.99e-01 0.0249 0.0979 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 7.32e-01 0.0236 0.0689 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 8.06e-01 0.0218 0.089 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0607 0.106 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 4.61e-01 0.0844 0.114 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 7.04e-01 0.0492 0.13 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 7.86e-01 0.0225 0.0826 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 8.02e-01 0.0182 0.0726 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -409598 sc-eQTL 1.68e-01 0.204 0.148 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -910405 sc-eQTL 7.14e-02 -0.274 0.151 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 2.69e-03 -0.348 0.115 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0185 0.123 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0804 0.135 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0646 0.11 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 6.95e-01 0.0346 0.0882 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -409598 sc-eQTL 8.96e-02 0.218 0.128 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -910405 sc-eQTL 3.90e-02 -0.275 0.132 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 9.39e-01 0.00977 0.127 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -797628 sc-eQTL 8.44e-01 0.0277 0.141 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -797822 sc-eQTL 2.10e-01 -0.12 0.0957 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -566831 sc-eQTL 9.50e-01 0.00663 0.105 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -258614 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0739 0.117 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 sc-eQTL 8.06e-01 0.0334 0.136 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -232533 sc-eQTL 3.20e-01 -0.116 0.117 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 eQTL 2.43e-03 0.0591 0.0195 0.00246 0.0 0.113

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -219344 1.6e-06 1.91e-06 2.73e-07 1.25e-06 4.85e-07 6.64e-07 1.19e-06 4.45e-07 1.72e-06 6.94e-07 2.02e-06 1.28e-06 2.63e-06 4.99e-07 3.31e-07 1.11e-06 1.12e-06 1.21e-06 5.23e-07 7.22e-07 6.57e-07 1.96e-06 1.55e-06 8.48e-07 2.41e-06 1.02e-06 1.04e-06 1.04e-06 1.73e-06 1.36e-06 8.07e-07 2.74e-07 3.74e-07 6.13e-07 8.33e-07 6.59e-07 7.12e-07 3.21e-07 5e-07 2.29e-07 2.88e-07 2.09e-06 4.15e-07 1.31e-07 3.62e-07 3.28e-07 4.11e-07 2.41e-07 2.46e-07