logo

Genes within 1Mb (chr1:30489259:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0139 0.128 0.1 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0613 0.103 0.1 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 3.90e-02 -0.177 0.0854 0.1 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -234326 sc-eQTL 8.57e-01 0.0164 0.0907 0.1 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 7.01e-01 0.0273 0.071 0.1 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00681 0.0833 0.1 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 1.49e-01 -0.142 0.0981 0.1 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0462 0.113 0.1 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 8.89e-01 0.0124 0.0882 0.1 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0483 0.0785 0.1 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 4.47e-01 0.0663 0.0869 0.1 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0152 0.0779 0.1 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00311 0.0933 0.1 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0509 0.145 0.1 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 5.51e-01 0.0578 0.0968 0.1 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0432 0.0852 0.1 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 7.51e-02 0.147 0.0822 0.1 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 2.30e-01 -0.116 0.0967 0.1 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 7.95e-01 0.0317 0.122 0.1 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 3.46e-01 0.12 0.127 0.104 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 2.45e-01 -0.175 0.15 0.104 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0719 0.118 0.104 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0825 0.0841 0.104 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -920306 sc-eQTL 3.09e-02 -0.299 0.137 0.104 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 1.68e-01 0.184 0.133 0.104 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 5.25e-01 0.0636 0.0997 0.1 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 9.04e-01 -0.015 0.124 0.1 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 6.27e-01 0.0386 0.0793 0.1 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 8.06e-01 0.0179 0.0729 0.1 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -419499 sc-eQTL 6.37e-02 0.259 0.139 0.1 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -920306 sc-eQTL 7.20e-02 -0.27 0.149 0.1 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 4.39e-02 -0.232 0.115 0.1 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 6.07e-01 0.0721 0.14 0.101 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 2.15e-01 -0.119 0.0954 0.101 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0391 0.1 0.101 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 3.79e-01 -0.102 0.115 0.101 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0845 0.13 0.101 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 1.77e-01 -0.162 0.119 0.101 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0905 0.104 0.1 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 3.47e-01 -0.104 0.111 0.1 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 5.04e-01 0.0668 0.0997 0.1 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 4.63e-01 0.0601 0.0817 0.1 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 5.04e-01 0.0895 0.134 0.1 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 2.68e-01 -0.154 0.139 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 6.58e-01 0.0724 0.163 0.112 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 2.15e-01 -0.204 0.164 0.112 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 8.89e-01 0.0214 0.153 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -234326 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0359 0.134 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 3.84e-01 0.0813 0.0932 0.112 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 9.60e-01 0.00756 0.151 0.112 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0516 0.133 0.112 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0892 0.157 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 4.19e-02 -0.266 0.13 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 4.98e-01 -0.084 0.124 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -234326 sc-eQTL 8.22e-01 0.029 0.129 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0252 0.079 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 5.12e-01 0.0728 0.111 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 1.30e-01 -0.188 0.123 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 1.42e-01 -0.22 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 5.31e-01 0.0866 0.138 0.099 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 1.00e+00 -6.79e-05 0.12 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -234326 sc-eQTL 2.29e-01 0.138 0.115 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 2.51e-01 0.117 0.102 0.099 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 3.16e-01 -0.117 0.116 0.099 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 1.10e-01 -0.218 0.136 0.099 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 7.53e-01 0.0438 0.139 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0345 0.12 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 1.70e-01 -0.145 0.105 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -234326 sc-eQTL 8.04e-01 0.0266 0.107 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 5.54e-01 0.0424 0.0716 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0145 0.0941 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0634 0.116 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 5.28e-01 0.094 0.149 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 4.13e-01 -0.101 0.123 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 2.94e-01 -0.126 0.12 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -234326 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0277 0.115 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 6.61e-01 0.0345 0.0784 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 3.02e-01 0.118 0.114 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0158 0.123 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 8.47e-01 0.0284 0.147 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 3.83e-01 -0.126 0.144 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 1.85e-01 -0.188 0.141 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 8.56e-01 0.023 0.126 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 1.98e-01 -0.178 0.138 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 1.84e-01 -0.162 0.121 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0689 0.117 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 4.10e-01 0.0855 0.104 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 1.25e-01 -0.127 0.0824 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 5.47e-01 0.0535 0.0888 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 9.94e-01 0.000649 0.0901 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 5.18e-01 0.067 0.103 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 6.86e-01 0.0596 0.147 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0632 0.119 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0121 0.105 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 8.22e-01 0.0196 0.0871 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 6.20e-01 0.0548 0.11 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 7.05e-01 0.0466 0.123 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 5.80e-01 0.0801 0.144 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 3.22e-01 -0.136 0.137 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0487 0.115 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 2.67e-01 0.129 0.116 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0447 0.136 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 4.79e-01 0.0948 0.134 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 5.99e-01 0.0826 0.157 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 3.21e-01 -0.119 0.12 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 6.30e-01 0.0563 0.117 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0287 0.129 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 4.21e-01 -0.11 0.136 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0957 0.128 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0919 0.144 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 2.39e-01 0.147 0.124 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00308 0.1 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 1.48e-01 0.139 0.0956 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0119 0.12 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0146 0.131 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 6.12e-01 0.0788 0.155 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 9.91e-01 0.00153 0.142 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 9.00e-01 0.0168 0.134 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 6.28e-01 0.068 0.14 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 1.58e-02 -0.311 0.128 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 3.21e-02 0.28 0.13 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 4.80e-01 -0.111 0.157 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 6.50e-01 0.0683 0.15 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 5.18e-01 0.0995 0.154 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 8.37e-01 0.0297 0.145 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 5.65e-01 0.0864 0.15 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 1.75e-01 -0.184 0.135 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 2.14e-01 -0.191 0.153 0.102 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0474 0.136 0.102 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 3.88e-01 -0.113 0.131 0.102 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 5.77e-02 0.233 0.122 0.102 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 2.72e-01 0.151 0.137 0.102 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0894 0.141 0.102 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 5.63e-02 0.294 0.153 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 1.46e-01 -0.19 0.13 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0756 0.137 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0542 0.135 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 1.70e-02 -0.323 0.134 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 8.45e-02 -0.231 0.133 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 8.75e-01 0.0232 0.147 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 9.23e-02 -0.183 0.108 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 5.47e-01 0.0673 0.112 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 2.99e-01 -0.124 0.119 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 6.81e-02 0.272 0.148 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0356 0.123 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 1.59e-01 -0.22 0.156 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0505 0.14 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 2.48e-01 0.157 0.136 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 3.27e-01 -0.127 0.13 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 4.58e-01 -0.103 0.138 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 3.19e-01 -0.133 0.133 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 6.85e-01 0.0594 0.146 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 3.68e-01 -0.103 0.114 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 2.15e-01 -0.153 0.123 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 4.90e-01 -0.094 0.136 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0362 0.144 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 3.22e-01 -0.133 0.134 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0289 0.163 0.107 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 6.90e-01 0.0757 0.189 0.107 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0354 0.164 0.107 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -234326 sc-eQTL 9.13e-01 0.0167 0.153 0.107 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 2.01e-01 0.14 0.109 0.107 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 6.28e-02 0.277 0.147 0.107 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 3.79e-01 -0.14 0.159 0.107 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0304 0.111 0.102 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00285 0.141 0.102 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 1.88e-01 0.173 0.131 0.102 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 6.08e-01 0.0483 0.094 0.102 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 4.35e-02 0.264 0.13 0.102 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0762 0.121 0.102 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0517 0.15 0.1 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 8.11e-01 0.0348 0.145 0.1 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 5.02e-01 0.0779 0.116 0.1 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 4.91e-01 0.0916 0.133 0.1 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 4.45e-02 0.271 0.134 0.1 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0576 0.135 0.1 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 3.56e-01 0.134 0.145 0.107 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0522 0.158 0.107 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 7.70e-01 0.0397 0.135 0.107 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 4.34e-01 0.0744 0.0948 0.107 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -920306 sc-eQTL 2.04e-01 -0.155 0.121 0.107 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 4.74e-01 0.0925 0.129 0.107 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 6.53e-01 0.0541 0.12 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00636 0.134 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 7.58e-01 0.028 0.0907 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 9.66e-01 0.00339 0.0796 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -419499 sc-eQTL 2.87e-01 0.16 0.15 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -920306 sc-eQTL 1.46e-01 -0.221 0.151 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 2.87e-02 -0.273 0.124 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 4.27e-01 0.1 0.126 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 7.70e-01 0.0435 0.149 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 8.66e-01 0.0182 0.107 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00229 0.0826 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -419499 sc-eQTL 1.71e-01 0.195 0.142 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -920306 sc-eQTL 4.48e-02 -0.302 0.15 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 1.01e-03 -0.401 0.12 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 3.00e-01 0.193 0.186 0.106 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 5.38e-01 0.0985 0.16 0.106 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 3.05e-01 0.169 0.164 0.106 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 3.31e-01 -0.174 0.179 0.106 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 2.99e-01 0.172 0.165 0.106 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 8.64e-02 -0.274 0.159 0.106 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0249 0.138 0.104 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 3.76e-02 -0.306 0.146 0.104 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0621 0.125 0.104 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0344 0.0984 0.104 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -419499 sc-eQTL 1.03e-01 0.219 0.134 0.104 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -920306 sc-eQTL 7.39e-02 -0.251 0.14 0.104 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 8.38e-01 0.0273 0.134 0.104 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0562 0.132 0.102 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 2.40e-01 0.166 0.14 0.102 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0841 0.115 0.102 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 9.76e-02 0.173 0.104 0.102 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -419499 sc-eQTL 3.75e-01 0.104 0.117 0.102 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -920306 sc-eQTL 6.00e-03 -0.349 0.126 0.102 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0314 0.133 0.102 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 6.95e-01 0.0578 0.147 0.105 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 1.81e-01 -0.216 0.16 0.105 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0332 0.134 0.105 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 8.54e-02 -0.213 0.123 0.105 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -920306 sc-eQTL 7.64e-02 -0.266 0.149 0.105 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 7.38e-01 0.0462 0.138 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 9.07e-02 -0.251 0.148 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 1.15e-01 -0.195 0.123 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 3.86e-01 -0.095 0.109 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -234326 sc-eQTL 4.40e-01 0.0966 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 5.21e-01 0.0504 0.0784 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 6.87e-01 -0.042 0.104 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 2.01e-01 -0.145 0.113 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 3.80e-01 0.119 0.136 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0482 0.107 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 1.90e-01 -0.133 0.101 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -234326 sc-eQTL 7.99e-01 0.0249 0.0979 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 7.32e-01 0.0236 0.0689 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 8.06e-01 0.0218 0.089 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0607 0.106 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 4.61e-01 0.0844 0.114 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 7.04e-01 0.0492 0.13 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 7.86e-01 0.0225 0.0826 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 8.02e-01 0.0182 0.0726 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -419499 sc-eQTL 1.68e-01 0.204 0.148 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -920306 sc-eQTL 7.14e-02 -0.274 0.151 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 2.69e-03 -0.348 0.115 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0185 0.123 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0804 0.135 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0646 0.11 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 6.95e-01 0.0346 0.0882 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -419499 sc-eQTL 8.96e-02 0.218 0.128 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -920306 sc-eQTL 3.90e-02 -0.275 0.132 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 9.39e-01 0.00977 0.127 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -807529 sc-eQTL 8.44e-01 0.0277 0.141 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -807723 sc-eQTL 2.10e-01 -0.12 0.0957 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -576732 sc-eQTL 9.50e-01 0.00663 0.105 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -268515 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0739 0.117 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 sc-eQTL 8.06e-01 0.0334 0.136 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -242434 sc-eQTL 3.20e-01 -0.116 0.117 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 eQTL 1.21e-03 0.0614 0.0189 0.00365 0.00102 0.112

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -229245 2.6e-07 1.08e-07 3.35e-08 1.68e-07 1.02e-07 9.36e-08 1.36e-07 5.29e-08 1.36e-07 3.99e-08 1.61e-07 7.49e-08 1.2e-07 6.1e-08 4.77e-08 7.87e-08 5.15e-08 1.06e-07 5.22e-08 2.88e-08 1.03e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.01e-08 1.33e-07 1.13e-07 1.11e-07 8.49e-08 1.05e-07 1.09e-07 9.5e-08 3.19e-08 2.74e-08 8.3e-08 9.56e-08 4.26e-08 4.85e-08 8.78e-08 8.22e-08 3.74e-08 3.25e-08 1.4e-07 4.34e-08 1.44e-08 1.12e-07 1.72e-08 1.45e-07 4.82e-09 4.72e-08