logo

Genes within 1Mb (chr1:30475333:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 9.77e-01 0.00369 0.128 0.1 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0684 0.103 0.1 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 5.27e-02 -0.166 0.0854 0.1 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -248252 sc-eQTL 8.33e-01 0.0192 0.0906 0.1 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 6.08e-01 0.0365 0.0709 0.1 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 7.82e-01 0.023 0.0832 0.1 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 2.32e-01 -0.118 0.0981 0.1 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0922 0.113 0.1 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 8.86e-01 0.0127 0.0881 0.1 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0488 0.0784 0.1 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 3.55e-01 0.0804 0.0867 0.1 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 8.12e-01 0.0185 0.0777 0.1 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 8.46e-01 0.0181 0.0931 0.1 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0298 0.145 0.1 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 6.35e-01 0.0459 0.0966 0.1 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 8.98e-01 -0.011 0.0851 0.1 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 5.26e-02 0.16 0.0819 0.1 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0911 0.0966 0.1 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 6.34e-01 0.0581 0.122 0.1 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 3.46e-01 0.12 0.127 0.104 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 2.81e-01 -0.162 0.15 0.104 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 3.86e-01 -0.102 0.117 0.104 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0702 0.0839 0.104 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -934232 sc-eQTL 5.62e-02 -0.264 0.137 0.104 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 1.23e-01 0.205 0.132 0.104 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 3.02e-01 0.103 0.0991 0.1 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0338 0.123 0.1 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 9.08e-01 0.00912 0.079 0.1 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 7.73e-01 0.021 0.0726 0.1 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -433425 sc-eQTL 7.41e-02 0.249 0.139 0.1 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -934232 sc-eQTL 1.45e-01 -0.218 0.149 0.1 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 5.43e-02 -0.221 0.114 0.1 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 7.29e-01 0.0482 0.139 0.101 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 2.71e-01 -0.105 0.0949 0.101 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 6.03e-01 -0.052 0.0998 0.101 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0951 0.115 0.101 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0656 0.129 0.101 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 8.42e-02 -0.205 0.118 0.101 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0817 0.104 0.1 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 3.27e-01 -0.109 0.111 0.1 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 4.59e-01 0.0739 0.0995 0.1 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 3.35e-01 0.0787 0.0815 0.1 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 4.15e-01 0.109 0.134 0.1 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 2.50e-01 -0.16 0.139 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 4.29e-01 0.129 0.162 0.112 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 1.89e-01 -0.215 0.163 0.112 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 9.33e-01 0.0129 0.152 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -248252 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0613 0.133 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 5.02e-01 0.0624 0.0928 0.112 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0301 0.15 0.112 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0279 0.133 0.112 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 3.74e-01 -0.139 0.156 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 3.65e-02 -0.272 0.129 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 7.83e-01 -0.034 0.123 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -248252 sc-eQTL 9.13e-01 -0.014 0.128 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0372 0.0786 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 3.08e-01 0.113 0.11 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 2.91e-01 -0.13 0.123 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 1.99e-01 -0.193 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 5.46e-01 0.0836 0.138 0.099 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0396 0.12 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -248252 sc-eQTL 3.05e-01 0.118 0.115 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 2.85e-01 0.109 0.102 0.099 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 2.69e-01 -0.129 0.116 0.099 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 1.22e-01 -0.211 0.136 0.099 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 6.14e-01 0.0697 0.138 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0206 0.119 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 1.55e-01 -0.15 0.105 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -248252 sc-eQTL 6.37e-01 0.0504 0.107 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 6.17e-01 0.0357 0.0713 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 8.50e-01 0.0177 0.0937 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0379 0.116 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 3.85e-01 0.129 0.148 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 3.67e-01 -0.11 0.122 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 3.80e-01 -0.105 0.12 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -248252 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0514 0.115 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 7.82e-01 0.0216 0.078 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 3.35e-01 0.11 0.113 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0195 0.123 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 9.44e-01 0.0103 0.147 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 3.18e-01 -0.144 0.144 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 2.34e-01 -0.168 0.141 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0105 0.126 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 2.87e-01 -0.147 0.138 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 2.10e-01 -0.153 0.121 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0816 0.117 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 3.01e-01 0.107 0.103 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 1.49e-01 -0.119 0.0823 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 4.87e-01 0.0615 0.0885 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 6.45e-01 0.0415 0.0898 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 5.13e-01 0.0676 0.103 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 9.52e-01 0.00885 0.147 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0901 0.118 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0289 0.105 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 6.52e-01 0.0392 0.0868 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 5.88e-01 0.0597 0.11 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 4.77e-01 0.0873 0.123 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 6.29e-01 0.0696 0.144 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 4.33e-01 -0.108 0.137 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0542 0.114 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 2.63e-01 0.129 0.115 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00455 0.135 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 2.44e-01 0.155 0.133 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 6.10e-01 0.0797 0.156 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 2.26e-01 -0.145 0.119 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 5.48e-01 0.07 0.116 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0289 0.129 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0715 0.135 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0873 0.127 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0546 0.143 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 3.25e-01 0.122 0.123 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 9.05e-01 0.0119 0.0995 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 1.11e-01 0.152 0.0948 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 9.65e-01 0.00528 0.119 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 9.61e-01 0.0063 0.13 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 3.47e-01 0.145 0.154 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 9.79e-01 0.00373 0.141 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 7.54e-01 0.0418 0.133 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 6.48e-01 0.0636 0.139 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 1.86e-02 -0.301 0.127 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 2.02e-02 0.301 0.128 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 4.18e-01 -0.128 0.157 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 6.02e-01 0.0786 0.151 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 5.48e-01 0.0927 0.154 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 8.21e-01 0.0328 0.145 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 5.86e-01 0.082 0.15 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 2.89e-01 -0.144 0.136 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 3.32e-01 -0.148 0.152 0.102 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0633 0.135 0.102 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0992 0.129 0.102 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 4.57e-02 0.243 0.121 0.102 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 2.47e-01 0.158 0.136 0.102 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0849 0.14 0.102 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 4.00e-02 0.315 0.152 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 2.26e-01 -0.158 0.13 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 7.09e-01 -0.051 0.137 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0829 0.135 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 5.71e-03 -0.371 0.133 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 9.63e-02 -0.222 0.133 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 9.13e-01 -0.016 0.147 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 1.10e-01 -0.173 0.108 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 7.52e-01 0.0352 0.111 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 3.66e-01 -0.107 0.118 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 2.61e-02 0.329 0.147 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0858 0.122 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 2.55e-01 -0.178 0.156 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0253 0.14 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 3.03e-01 0.14 0.136 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 3.57e-01 -0.12 0.13 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0869 0.138 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 3.09e-01 -0.136 0.133 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 7.63e-01 0.0439 0.145 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 3.11e-01 -0.115 0.113 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 2.84e-01 -0.131 0.122 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 4.54e-01 -0.101 0.135 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0667 0.143 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 3.89e-01 -0.115 0.133 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0407 0.165 0.104 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 6.23e-01 0.0943 0.191 0.104 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0542 0.166 0.104 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -248252 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000276 0.155 0.104 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 2.06e-01 0.14 0.11 0.104 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 6.06e-02 0.283 0.149 0.104 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 3.87e-01 -0.14 0.161 0.104 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0588 0.111 0.102 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 9.22e-01 0.0138 0.14 0.102 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 1.61e-01 0.183 0.13 0.102 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 6.69e-01 0.0402 0.0939 0.102 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 7.57e-02 0.233 0.13 0.102 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0917 0.121 0.102 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 7.07e-01 -0.056 0.149 0.1 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 9.72e-01 0.00502 0.144 0.1 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 4.88e-01 0.0801 0.115 0.1 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 6.45e-01 0.0609 0.132 0.1 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 3.91e-02 0.276 0.133 0.1 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0763 0.134 0.1 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 2.90e-01 0.154 0.145 0.107 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0335 0.157 0.107 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 8.63e-01 0.0233 0.135 0.107 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 4.09e-01 0.0782 0.0945 0.107 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -934232 sc-eQTL 4.03e-01 -0.102 0.121 0.107 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 3.86e-01 0.112 0.128 0.107 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 4.24e-01 0.0958 0.12 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0111 0.134 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 9.85e-01 0.00174 0.0904 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 8.46e-01 0.0155 0.0793 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -433425 sc-eQTL 3.42e-01 0.142 0.149 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -934232 sc-eQTL 2.81e-01 -0.163 0.151 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 4.91e-02 -0.245 0.124 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 1.95e-01 0.162 0.125 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 8.99e-01 0.0188 0.148 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 8.56e-01 0.0194 0.107 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00446 0.0823 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -433425 sc-eQTL 1.74e-01 0.193 0.142 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -934232 sc-eQTL 7.91e-02 -0.264 0.149 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 1.12e-03 -0.396 0.12 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 3.15e-01 0.185 0.183 0.109 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 6.72e-01 0.0671 0.158 0.109 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 3.00e-01 0.169 0.162 0.109 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 3.54e-01 -0.164 0.177 0.109 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 2.64e-01 0.183 0.163 0.109 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 8.59e-02 -0.271 0.157 0.109 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 6.94e-01 -0.054 0.137 0.104 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 2.05e-02 -0.34 0.146 0.104 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0865 0.125 0.104 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0255 0.0981 0.104 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -433425 sc-eQTL 1.42e-01 0.197 0.134 0.104 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -934232 sc-eQTL 1.52e-01 -0.201 0.14 0.104 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 7.96e-01 0.0345 0.133 0.104 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0519 0.132 0.102 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 2.54e-01 0.16 0.14 0.102 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0959 0.115 0.102 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 9.37e-02 0.175 0.104 0.102 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -433425 sc-eQTL 2.62e-01 0.131 0.117 0.102 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -934232 sc-eQTL 2.31e-02 -0.289 0.126 0.102 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 9.73e-01 0.00442 0.132 0.102 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 8.26e-01 0.0322 0.146 0.105 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 1.67e-01 -0.221 0.16 0.105 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0797 0.133 0.105 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 1.34e-01 -0.185 0.123 0.105 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -934232 sc-eQTL 7.71e-02 -0.265 0.149 0.105 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 6.32e-01 0.0657 0.137 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 8.24e-02 -0.257 0.147 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 1.29e-01 -0.187 0.123 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0837 0.109 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -248252 sc-eQTL 6.59e-01 0.055 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 6.02e-01 0.0409 0.0783 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0285 0.104 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0995 0.113 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 2.60e-01 0.152 0.135 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0435 0.107 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 2.21e-01 -0.124 0.101 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -248252 sc-eQTL 6.97e-01 0.0379 0.0974 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 8.34e-01 0.0144 0.0686 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 6.31e-01 0.0426 0.0885 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0453 0.105 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 2.06e-01 0.144 0.114 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 7.91e-01 0.0342 0.129 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00339 0.0823 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 7.47e-01 0.0234 0.0723 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -433425 sc-eQTL 2.13e-01 0.184 0.147 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -934232 sc-eQTL 1.38e-01 -0.225 0.151 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 3.85e-03 -0.334 0.114 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0263 0.123 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0976 0.134 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 4.29e-01 -0.087 0.11 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 6.47e-01 0.0403 0.0879 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -433425 sc-eQTL 8.20e-02 0.223 0.127 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -934232 sc-eQTL 9.61e-02 -0.221 0.132 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 8.79e-01 0.0193 0.127 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -821455 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00556 0.14 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -821649 sc-eQTL 2.35e-01 -0.113 0.0951 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -590658 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0156 0.105 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -282441 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0646 0.117 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 sc-eQTL 5.94e-01 0.072 0.135 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -256360 sc-eQTL 1.60e-01 -0.163 0.116 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 eQTL 1.19e-03 0.0615 0.0189 0.00381 0.00102 0.114

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -243171 1.58e-06 1.5e-06 2.91e-07 1.25e-06 5.07e-07 6.73e-07 1.35e-06 3.75e-07 1.7e-06 7.13e-07 1.98e-06 1.25e-06 2.63e-06 4.13e-07 3.96e-07 9.88e-07 1.14e-06 1.18e-06 5.55e-07 6.08e-07 6.18e-07 1.93e-06 1.34e-06 7.64e-07 2.41e-06 9.3e-07 1.04e-06 1.07e-06 1.65e-06 1.4e-06 8.49e-07 2.82e-07 3.76e-07 7.02e-07 7.08e-07 6.32e-07 6.85e-07 3.26e-07 5.34e-07 2.26e-07 3.58e-07 2.01e-06 3.7e-07 1.66e-07 3.62e-07 3.28e-07 3.2e-07 2.53e-07 2.8e-07