logo

Genes within 1Mb (chr1:30472020:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0543 0.125 0.109 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0372 0.1 0.109 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 4.08e-02 -0.171 0.0831 0.109 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -251565 sc-eQTL 5.85e-01 0.0483 0.0882 0.109 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 4.43e-01 0.0531 0.069 0.109 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 9.39e-01 0.00625 0.081 0.109 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 1.38e-01 -0.142 0.0953 0.109 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0768 0.109 0.109 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 7.05e-01 0.0323 0.0852 0.109 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0577 0.0758 0.109 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 7.36e-01 0.0284 0.0841 0.109 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0332 0.0752 0.109 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0068 0.0901 0.109 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0654 0.141 0.109 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 4.43e-01 0.0718 0.0935 0.109 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00208 0.0824 0.109 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 1.62e-01 0.112 0.0797 0.109 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 2.08e-01 -0.118 0.0935 0.109 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 7.90e-01 0.0315 0.118 0.109 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 5.00e-01 0.0845 0.125 0.113 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 4.58e-01 -0.11 0.148 0.113 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0478 0.116 0.113 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0643 0.0829 0.113 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -937545 sc-eQTL 3.25e-02 -0.291 0.135 0.113 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 9.00e-02 0.222 0.13 0.113 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 3.00e-01 0.0998 0.096 0.109 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0744 0.119 0.109 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 6.49e-01 0.0349 0.0765 0.109 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 6.26e-01 0.0343 0.0703 0.109 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -436738 sc-eQTL 9.74e-02 0.224 0.134 0.109 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -937545 sc-eQTL 1.77e-01 -0.196 0.145 0.109 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 6.59e-02 -0.205 0.111 0.109 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 5.64e-01 0.0784 0.136 0.109 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0832 0.0927 0.109 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0114 0.0974 0.109 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0901 0.112 0.109 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 3.64e-01 -0.114 0.126 0.109 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 1.53e-01 -0.166 0.116 0.109 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0982 0.101 0.109 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0992 0.108 0.109 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 5.78e-01 0.0541 0.0972 0.109 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 4.34e-01 0.0623 0.0796 0.109 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 5.32e-01 0.0817 0.13 0.109 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 3.30e-01 -0.132 0.136 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 2.38e-01 0.188 0.159 0.12 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 1.47e-01 -0.233 0.16 0.12 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 5.68e-01 0.0853 0.149 0.12 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -251565 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0713 0.13 0.12 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 2.43e-01 0.106 0.0906 0.12 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 9.34e-01 0.0122 0.147 0.12 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0203 0.13 0.12 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0992 0.154 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 1.04e-01 -0.208 0.127 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 6.14e-01 -0.061 0.121 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -251565 sc-eQTL 6.52e-01 0.0569 0.126 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 7.57e-01 -0.024 0.0773 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 3.80e-01 0.0953 0.108 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 1.59e-01 -0.171 0.121 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 1.28e-01 -0.222 0.145 0.108 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 2.91e-01 0.142 0.134 0.108 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 7.62e-01 0.0356 0.117 0.108 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -251565 sc-eQTL 3.22e-01 0.111 0.112 0.108 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 1.94e-01 0.129 0.0991 0.108 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 1.21e-01 -0.176 0.113 0.108 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 1.26e-01 -0.204 0.133 0.108 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0123 0.135 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0267 0.117 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 7.57e-02 -0.182 0.102 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -251565 sc-eQTL 5.48e-01 0.0628 0.104 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 3.26e-01 0.0685 0.0696 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0194 0.0916 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 7.44e-01 -0.037 0.113 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 6.50e-01 0.0658 0.145 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0812 0.119 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 2.81e-01 -0.126 0.117 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -251565 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0123 0.112 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 6.25e-01 0.0372 0.0762 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 2.04e-01 0.141 0.111 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0432 0.12 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0402 0.143 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0807 0.14 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 1.90e-01 -0.18 0.137 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 8.90e-01 -0.017 0.123 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 1.67e-01 -0.185 0.134 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 2.08e-01 -0.149 0.118 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0554 0.113 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 2.12e-01 0.125 0.0999 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 1.05e-01 -0.13 0.0796 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 8.43e-01 0.017 0.0858 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00982 0.0871 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 6.35e-01 0.0475 0.1 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000134 0.143 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 2.67e-01 -0.128 0.115 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0411 0.102 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 8.84e-01 0.0123 0.0844 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 1.00e+00 5.03e-05 0.107 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 6.37e-01 0.0563 0.119 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 8.12e-01 0.0334 0.141 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0797 0.134 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0564 0.112 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 5.24e-01 0.072 0.113 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00603 0.132 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 3.24e-01 0.128 0.13 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 7.56e-01 0.0473 0.152 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 3.39e-01 -0.112 0.117 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 8.39e-01 0.0231 0.113 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0384 0.126 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 4.07e-01 -0.11 0.132 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0976 0.124 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 3.88e-01 -0.121 0.14 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 1.91e-01 0.158 0.12 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 7.09e-01 0.0362 0.097 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 2.77e-01 0.101 0.0927 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 9.02e-01 0.0143 0.116 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0112 0.126 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 4.98e-01 0.102 0.15 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 7.18e-01 0.0499 0.138 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 5.44e-01 0.0787 0.13 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 7.17e-01 0.0493 0.136 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 4.28e-03 -0.356 0.123 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 9.57e-02 0.211 0.126 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0617 0.152 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 5.72e-01 0.0826 0.146 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 6.88e-01 0.0601 0.149 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 6.98e-01 0.0545 0.14 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 5.36e-01 0.0901 0.146 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 2.66e-01 -0.147 0.131 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 3.18e-01 -0.149 0.149 0.11 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0705 0.133 0.11 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 2.80e-01 -0.137 0.127 0.11 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 6.35e-02 0.222 0.119 0.11 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 4.39e-01 0.104 0.133 0.11 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0996 0.138 0.11 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 1.03e-01 0.246 0.15 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 2.87e-01 -0.136 0.127 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0526 0.134 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0667 0.132 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 4.60e-02 -0.264 0.132 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 1.56e-01 -0.186 0.13 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 9.07e-01 0.0167 0.143 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 1.86e-01 -0.14 0.105 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 3.24e-01 0.107 0.108 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 3.16e-01 -0.116 0.116 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 1.30e-01 0.22 0.144 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 6.23e-01 -0.059 0.12 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 1.51e-01 -0.219 0.152 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0601 0.136 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 4.52e-01 0.1 0.133 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0685 0.127 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0984 0.135 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 1.10e-01 -0.209 0.13 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 6.61e-01 0.0624 0.142 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0681 0.111 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 2.48e-01 -0.138 0.119 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0287 0.132 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0486 0.14 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0946 0.13 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0889 0.161 0.115 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 6.18e-01 0.0931 0.186 0.115 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0166 0.162 0.115 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -251565 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00117 0.151 0.115 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 1.30e-01 0.163 0.107 0.115 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 1.19e-01 0.229 0.146 0.115 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 2.85e-01 -0.168 0.156 0.115 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0297 0.107 0.111 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 8.01e-01 0.0343 0.136 0.111 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 1.27e-01 0.194 0.126 0.111 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 6.60e-01 0.0402 0.0911 0.111 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 6.65e-02 0.233 0.126 0.111 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0906 0.117 0.111 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0274 0.145 0.109 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 5.29e-01 0.0884 0.14 0.109 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 3.12e-01 0.113 0.112 0.109 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 5.84e-01 0.0705 0.128 0.109 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 2.45e-01 0.152 0.13 0.109 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0519 0.131 0.109 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 3.53e-01 0.133 0.143 0.112 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0402 0.155 0.112 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 5.52e-01 0.0794 0.133 0.112 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 3.51e-01 0.0873 0.0934 0.112 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -937545 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0872 0.12 0.112 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 3.36e-01 0.122 0.127 0.112 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 4.01e-01 0.0974 0.116 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0436 0.129 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 8.90e-01 0.0121 0.0875 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 6.12e-01 0.0389 0.0767 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -436738 sc-eQTL 4.54e-01 0.108 0.144 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -937545 sc-eQTL 3.21e-01 -0.145 0.146 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 2.09e-02 -0.277 0.119 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 3.81e-01 0.107 0.122 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 8.68e-01 -0.024 0.144 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 6.96e-01 0.0408 0.104 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 9.75e-01 0.00252 0.0801 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -436738 sc-eQTL 1.70e-01 0.19 0.138 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -937545 sc-eQTL 8.59e-02 -0.251 0.146 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 1.15e-03 -0.384 0.117 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 5.15e-01 0.118 0.18 0.115 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 5.03e-01 0.104 0.155 0.115 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 3.13e-01 0.161 0.159 0.115 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 3.94e-01 -0.148 0.173 0.115 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 1.64e-01 0.223 0.159 0.115 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 1.70e-01 -0.213 0.154 0.115 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0517 0.134 0.111 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 1.48e-02 -0.35 0.142 0.111 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0722 0.122 0.111 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 7.71e-01 -0.028 0.096 0.111 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -436738 sc-eQTL 1.34e-01 0.197 0.131 0.111 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -937545 sc-eQTL 1.83e-01 -0.183 0.137 0.111 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 7.21e-01 0.0467 0.13 0.111 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0625 0.128 0.111 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 2.68e-01 0.151 0.136 0.111 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0481 0.112 0.111 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 1.82e-01 0.135 0.101 0.111 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -436738 sc-eQTL 3.60e-01 0.104 0.114 0.111 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -937545 sc-eQTL 3.53e-02 -0.26 0.123 0.111 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 7.78e-01 0.0363 0.129 0.111 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 9.39e-01 0.0111 0.145 0.113 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 1.69e-01 -0.218 0.158 0.113 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0576 0.131 0.113 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 1.07e-01 -0.197 0.121 0.113 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -937545 sc-eQTL 1.92e-01 -0.193 0.147 0.113 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0129 0.135 0.113 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 9.40e-02 -0.243 0.144 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 3.13e-01 -0.122 0.121 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0583 0.107 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -251565 sc-eQTL 4.45e-01 0.0932 0.122 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 4.11e-01 0.0631 0.0766 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0633 0.101 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 2.36e-01 -0.131 0.11 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 6.63e-01 0.0577 0.132 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0335 0.104 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 1.04e-01 -0.161 0.0983 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -251565 sc-eQTL 4.88e-01 0.066 0.0951 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 5.50e-01 0.0401 0.067 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 7.07e-01 0.0326 0.0865 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0632 0.103 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 2.84e-01 0.118 0.11 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0175 0.125 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 7.63e-01 0.0241 0.0797 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 5.66e-01 0.0403 0.07 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -436738 sc-eQTL 2.62e-01 0.16 0.143 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -937545 sc-eQTL 1.69e-01 -0.202 0.146 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 1.93e-03 -0.347 0.11 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0139 0.119 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 4.36e-01 -0.102 0.13 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0602 0.107 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 7.28e-01 0.0298 0.0855 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -436738 sc-eQTL 8.18e-02 0.217 0.124 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -937545 sc-eQTL 1.44e-01 -0.189 0.129 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 5.90e-01 0.0664 0.123 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -824768 sc-eQTL 7.66e-01 0.0406 0.136 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -824962 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0884 0.093 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -593971 sc-eQTL 7.87e-01 0.0275 0.102 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -285754 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0551 0.114 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00647 0.132 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -259673 sc-eQTL 2.80e-01 -0.123 0.113 0.11 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000168528 SERINC2 -937545 eQTL 0.0482 -0.113 0.0572 0.0 0.0 0.121
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 eQTL 3.06e-03 0.0553 0.0186 0.00292 0.0 0.121

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -246484 1.3e-06 1.01e-06 3.45e-07 1.17e-06 3.2e-07 5.99e-07 1.52e-06 3.31e-07 1.4e-06 5.11e-07 1.79e-06 7.82e-07 2.25e-06 2.77e-07 5.28e-07 9.17e-07 9.26e-07 6.94e-07 8.18e-07 6.52e-07 6.36e-07 1.42e-06 8.9e-07 6.63e-07 2.18e-06 4.23e-07 9.41e-07 7.24e-07 1.48e-06 1.31e-06 6.63e-07 2.39e-07 2.54e-07 6.76e-07 5.49e-07 4.37e-07 6.22e-07 2.38e-07 4.97e-07 3.15e-07 3.53e-07 1.56e-06 1.22e-07 5.68e-08 2.16e-07 1.26e-07 2.24e-07 4.88e-08 1.16e-07