logo

Genes within 1Mb (chr1:30468047:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 3.17e-01 -0.112 0.111 0.126 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0768 0.0892 0.126 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0989 0.0746 0.126 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -255538 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0396 0.0787 0.126 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 4.36e-01 0.0481 0.0616 0.126 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 2.94e-02 0.157 0.0715 0.126 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 9.95e-02 -0.141 0.085 0.126 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0988 0.0963 0.126 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0786 0.0752 0.126 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0131 0.0671 0.126 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 5.14e-01 0.0486 0.0743 0.126 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0238 0.0665 0.126 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 7.14e-01 0.0293 0.0797 0.126 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 3.97e-01 -0.108 0.127 0.126 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 6.27e-01 0.041 0.0845 0.126 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 3.60e-01 0.0681 0.0743 0.126 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 2.82e-01 0.0777 0.0721 0.126 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 1.83e-01 -0.113 0.0843 0.126 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 3.33e-01 0.103 0.106 0.126 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 5.26e-01 0.0711 0.112 0.131 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0388 0.133 0.131 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 2.90e-01 -0.11 0.104 0.131 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0181 0.0743 0.131 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -941518 sc-eQTL 5.72e-02 -0.232 0.121 0.131 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 2.17e-01 0.145 0.117 0.131 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 1.36e-01 0.13 0.087 0.126 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0747 0.108 0.126 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 1.96e-01 0.0898 0.0692 0.126 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 2.84e-01 0.0685 0.0637 0.126 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -440711 sc-eQTL 2.63e-02 0.272 0.121 0.126 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -941518 sc-eQTL 3.65e-01 -0.119 0.132 0.126 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 1.44e-01 -0.148 0.101 0.126 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 1.05e-01 0.198 0.121 0.127 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0989 0.0833 0.127 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0671 0.0876 0.127 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0622 0.101 0.127 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 1.50e-01 -0.163 0.113 0.127 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 1.51e-01 -0.15 0.104 0.127 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0664 0.0909 0.126 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 9.03e-01 0.0119 0.0973 0.126 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 6.17e-01 0.0438 0.0874 0.126 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 4.18e-02 0.145 0.071 0.126 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 2.63e-01 0.131 0.117 0.126 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00529 0.122 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 1.44e-01 0.212 0.144 0.138 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0721 0.146 0.138 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 2.78e-01 0.147 0.136 0.138 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -255538 sc-eQTL 3.62e-01 -0.108 0.119 0.138 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 2.86e-01 0.0885 0.0826 0.138 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 3.68e-01 0.12 0.133 0.138 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 3.49e-01 -0.111 0.118 0.138 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 3.44e-01 -0.13 0.137 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 3.03e-01 -0.118 0.114 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0618 0.108 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -255538 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00662 0.112 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00333 0.069 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 5.63e-02 0.184 0.0959 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 1.87e-01 -0.143 0.108 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 2.47e-01 -0.151 0.13 0.125 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 2.75e-01 -0.131 0.12 0.125 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 4.63e-01 0.0769 0.105 0.125 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -255538 sc-eQTL 4.47e-01 0.0763 0.1 0.125 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 1.69e-01 0.122 0.0883 0.125 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00507 0.102 0.125 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0162 0.119 0.125 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 7.93e-01 0.0321 0.122 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 8.10e-01 0.0254 0.105 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0585 0.0929 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -255538 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0328 0.0943 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 3.19e-01 0.0628 0.0629 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 2.25e-01 0.1 0.0825 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 2.77e-01 -0.111 0.102 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0633 0.13 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0818 0.108 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 2.83e-01 -0.113 0.105 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -255538 sc-eQTL 7.49e-01 0.0324 0.101 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 3.92e-01 0.0588 0.0686 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 8.89e-02 0.17 0.0994 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0518 0.108 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 3.79e-01 0.114 0.13 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 2.99e-01 -0.133 0.128 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 2.78e-01 -0.136 0.125 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 5.87e-01 0.0608 0.112 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 8.15e-02 -0.213 0.121 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 1.94e-01 -0.14 0.107 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 3.09e-01 -0.103 0.101 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0104 0.0895 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 3.28e-01 -0.07 0.0713 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 7.50e-01 0.0244 0.0766 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00268 0.0777 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 3.55e-01 0.0826 0.0891 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0936 0.127 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 4.28e-02 -0.206 0.101 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0833 0.0903 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 3.98e-01 0.0634 0.0749 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 6.50e-01 0.0432 0.0952 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 6.77e-01 0.0442 0.106 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 9.87e-01 0.00205 0.126 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0432 0.12 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 6.74e-01 0.0422 0.1 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 7.19e-01 0.0365 0.101 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0361 0.118 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 2.41e-01 0.137 0.116 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 3.03e-01 -0.142 0.137 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0731 0.105 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 6.62e-01 0.0447 0.102 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0466 0.113 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 1.64e-01 -0.166 0.118 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00317 0.112 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0286 0.125 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 2.82e-01 0.116 0.108 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 2.25e-01 0.105 0.0865 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 2.47e-01 0.0962 0.0829 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0174 0.104 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 5.49e-01 0.0678 0.113 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 8.64e-01 0.0232 0.135 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 2.06e-01 0.157 0.123 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 9.63e-01 0.00546 0.116 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 5.87e-01 0.0662 0.122 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 4.50e-02 -0.225 0.112 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 5.79e-01 0.0633 0.114 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 8.31e-01 -0.03 0.14 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 7.35e-01 0.0456 0.134 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 6.56e-01 0.0612 0.137 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 8.68e-01 0.0215 0.129 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 2.63e-01 0.15 0.134 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 2.67e-01 -0.135 0.121 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 5.92e-01 -0.072 0.134 0.128 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 4.89e-01 0.0822 0.119 0.128 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0704 0.114 0.128 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 7.21e-03 0.286 0.106 0.128 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 4.94e-01 0.0819 0.119 0.128 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0968 0.123 0.128 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 1.59e-01 0.191 0.135 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 7.54e-01 -0.036 0.115 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 3.80e-01 -0.106 0.12 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 8.95e-01 0.0157 0.119 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 2.40e-01 -0.14 0.119 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 2.05e-01 -0.149 0.117 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 2.37e-01 0.152 0.128 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 1.04e-01 -0.155 0.0947 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 9.26e-01 0.0091 0.0977 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 3.16e-01 -0.104 0.104 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 2.46e-01 0.152 0.13 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0885 0.108 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0885 0.136 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0171 0.122 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 3.91e-01 0.102 0.119 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 2.26e-01 0.137 0.113 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0425 0.121 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 1.90e-01 -0.153 0.116 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 6.17e-01 0.0623 0.124 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0804 0.097 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 2.48e-01 -0.121 0.105 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0311 0.116 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 2.99e-01 -0.127 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 1.38e-01 -0.169 0.113 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 9.13e-01 0.0164 0.149 0.126 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 4.22e-01 -0.139 0.173 0.126 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0232 0.15 0.126 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -255538 sc-eQTL 3.19e-01 -0.14 0.14 0.126 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 9.49e-02 0.167 0.0989 0.126 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 2.70e-01 0.151 0.136 0.126 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0129 0.146 0.126 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 5.24e-01 0.0627 0.0982 0.128 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 4.69e-01 0.0903 0.125 0.128 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 1.38e-01 0.173 0.116 0.128 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 1.76e-01 0.113 0.0831 0.128 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 5.00e-01 0.0788 0.117 0.128 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 9.13e-01 0.0117 0.107 0.128 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 9.33e-01 -0.011 0.13 0.126 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 6.25e-01 0.0617 0.126 0.126 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 2.13e-01 0.126 0.101 0.126 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 1.17e-01 0.181 0.115 0.126 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 6.93e-01 0.0465 0.118 0.126 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0163 0.118 0.126 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 5.59e-01 0.075 0.128 0.132 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0234 0.139 0.132 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 6.87e-01 -0.048 0.119 0.132 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 2.41e-01 0.0979 0.0832 0.132 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -941518 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0999 0.107 0.132 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 5.67e-01 0.065 0.113 0.132 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 6.98e-01 0.0409 0.105 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 3.82e-01 -0.103 0.117 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 2.65e-01 0.0886 0.0793 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 1.80e-01 0.0935 0.0695 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -440711 sc-eQTL 1.79e-01 0.176 0.131 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -941518 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0948 0.133 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 1.21e-02 -0.274 0.108 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 6.90e-02 0.202 0.11 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0295 0.131 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0319 0.0949 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 6.83e-01 0.0298 0.0729 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -440711 sc-eQTL 5.56e-02 0.24 0.125 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -941518 sc-eQTL 3.72e-01 -0.119 0.133 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 1.33e-01 -0.163 0.108 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 8.25e-01 0.0347 0.156 0.139 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 6.28e-01 0.0652 0.134 0.139 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0429 0.138 0.139 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0143 0.151 0.139 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 2.45e-02 0.31 0.136 0.139 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 2.10e-01 -0.168 0.134 0.139 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 9.50e-01 0.0076 0.122 0.129 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0777 0.131 0.129 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0423 0.111 0.129 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 9.08e-01 0.0101 0.0875 0.129 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -440711 sc-eQTL 2.47e-02 0.268 0.118 0.129 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -941518 sc-eQTL 1.30e-01 -0.189 0.125 0.129 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00771 0.119 0.129 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 6.70e-01 0.0498 0.117 0.129 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 2.47e-01 0.144 0.124 0.129 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 2.08e-01 0.128 0.101 0.129 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 2.20e-01 0.113 0.092 0.129 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -440711 sc-eQTL 8.43e-01 0.0206 0.104 0.129 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -941518 sc-eQTL 7.99e-02 -0.197 0.112 0.129 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 8.57e-01 0.0212 0.117 0.129 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 9.93e-01 0.00113 0.129 0.133 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 2.58e-02 -0.314 0.14 0.133 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 2.89e-01 -0.125 0.117 0.133 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0858 0.109 0.133 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -941518 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0545 0.133 0.133 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0637 0.121 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 1.73e-01 -0.176 0.129 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 1.98e-01 -0.138 0.107 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0114 0.0953 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -255538 sc-eQTL 8.76e-01 -0.017 0.109 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 2.46e-01 0.0792 0.068 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 3.60e-01 0.0827 0.0901 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 2.82e-01 -0.106 0.0981 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0179 0.119 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00754 0.0942 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0967 0.0888 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -255538 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00205 0.0858 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 4.09e-01 0.0499 0.0603 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 7.65e-02 0.138 0.0774 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 1.28e-01 -0.141 0.0921 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 1.99e-01 0.129 0.0999 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0636 0.113 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 5.24e-01 0.0462 0.0724 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 2.41e-01 0.0746 0.0635 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -440711 sc-eQTL 6.78e-02 0.237 0.129 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -941518 sc-eQTL 3.72e-01 -0.119 0.133 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 1.29e-02 -0.253 0.101 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 4.04e-01 0.0903 0.108 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0194 0.118 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 4.97e-01 0.0659 0.0968 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 4.12e-01 0.0636 0.0774 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -440711 sc-eQTL 8.29e-02 0.196 0.112 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -941518 sc-eQTL 2.13e-01 -0.146 0.117 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 6.95e-01 0.0437 0.112 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -828741 sc-eQTL 1.58e-01 0.173 0.122 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -828935 sc-eQTL 1.61e-01 -0.117 0.0833 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -597944 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0367 0.0916 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -289727 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0462 0.102 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0877 0.118 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -263646 sc-eQTL 2.25e-01 -0.124 0.102 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -250457 eQTL 2.44e-02 0.0403 0.0179 0.0 0.0 0.133

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina