logo

Genes within 1Mb (chr1:30458403:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0884 0.111 0.128 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0762 0.0892 0.128 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 1.62e-01 -0.105 0.0746 0.128 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -265182 sc-eQTL 8.29e-01 -0.017 0.0788 0.128 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 5.73e-01 0.0348 0.0617 0.128 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 4.40e-02 0.145 0.0716 0.128 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 1.32e-01 -0.129 0.0851 0.128 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0561 0.0965 0.128 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0825 0.0753 0.128 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0258 0.0672 0.128 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 4.09e-01 0.0615 0.0743 0.128 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0194 0.0666 0.128 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 6.45e-01 0.0367 0.0797 0.128 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0721 0.127 0.128 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 6.52e-01 0.0382 0.0845 0.128 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 3.63e-01 0.0678 0.0743 0.128 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 2.55e-01 0.0823 0.0721 0.128 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 2.24e-01 -0.103 0.0845 0.128 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 3.41e-01 0.102 0.106 0.128 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 5.73e-01 0.0634 0.112 0.133 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0227 0.133 0.133 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 2.91e-01 -0.11 0.104 0.133 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00617 0.0744 0.133 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -951162 sc-eQTL 6.55e-02 -0.225 0.122 0.133 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 1.86e-01 0.155 0.117 0.133 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 1.09e-01 0.14 0.0869 0.128 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0916 0.108 0.128 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 2.10e-01 0.0871 0.0693 0.128 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 2.08e-01 0.0805 0.0637 0.128 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -450355 sc-eQTL 1.74e-02 0.291 0.121 0.128 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -951162 sc-eQTL 3.24e-01 -0.13 0.132 0.128 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 1.94e-01 -0.132 0.101 0.128 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 7.25e-02 0.219 0.121 0.129 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 1.80e-01 -0.112 0.0833 0.129 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 4.32e-01 -0.069 0.0876 0.129 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0569 0.101 0.129 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 1.31e-01 -0.171 0.113 0.129 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 1.75e-01 -0.142 0.104 0.129 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0592 0.091 0.128 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 8.82e-01 0.0145 0.0974 0.128 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 6.05e-01 0.0454 0.0875 0.128 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 4.46e-02 0.144 0.0711 0.128 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 2.94e-01 0.123 0.117 0.128 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 9.91e-01 0.00138 0.122 0.128 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 1.49e-01 0.209 0.144 0.14 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0574 0.146 0.14 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 3.67e-01 0.123 0.136 0.14 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -265182 sc-eQTL 3.66e-01 -0.107 0.119 0.14 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 3.65e-01 0.075 0.0827 0.14 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 2.86e-01 0.143 0.133 0.14 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 3.35e-01 -0.114 0.118 0.14 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 4.00e-01 -0.116 0.137 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 3.09e-01 -0.116 0.114 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0591 0.108 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -265182 sc-eQTL 7.80e-01 0.0315 0.112 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00778 0.069 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 5.42e-02 0.186 0.096 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 1.59e-01 -0.152 0.108 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 2.84e-01 -0.14 0.13 0.127 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 3.34e-01 -0.116 0.12 0.127 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 4.95e-01 0.0715 0.105 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -265182 sc-eQTL 4.42e-01 0.0771 0.1 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 3.08e-01 0.0906 0.0887 0.127 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00416 0.102 0.127 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0255 0.119 0.127 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 5.68e-01 0.0696 0.122 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 9.39e-01 0.00803 0.105 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0754 0.0928 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -265182 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00422 0.0943 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 3.83e-01 0.055 0.0629 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 3.25e-01 0.0815 0.0825 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0987 0.102 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0494 0.13 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0649 0.108 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 2.24e-01 -0.128 0.105 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -265182 sc-eQTL 7.55e-01 0.0316 0.101 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 4.37e-01 0.0534 0.0686 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 1.13e-01 0.158 0.0994 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0548 0.108 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 2.68e-01 0.144 0.13 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 3.09e-01 -0.13 0.128 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 2.59e-01 -0.142 0.125 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 6.04e-01 0.0582 0.112 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 7.27e-02 -0.219 0.122 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 1.54e-01 -0.154 0.108 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0618 0.101 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0172 0.0895 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0752 0.0713 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 5.24e-01 0.0488 0.0765 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 9.27e-01 0.00711 0.0777 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 2.85e-01 0.0955 0.089 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0508 0.127 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 3.93e-02 -0.21 0.101 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 2.58e-01 -0.102 0.0901 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 4.60e-01 0.0555 0.0749 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 6.67e-01 0.0409 0.0951 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 6.54e-01 0.0476 0.106 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 8.84e-01 0.0183 0.126 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0574 0.12 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 7.21e-01 0.0358 0.1 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 8.77e-01 0.0157 0.101 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0535 0.118 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 2.74e-01 0.128 0.116 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 3.97e-01 -0.116 0.137 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0679 0.105 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 6.78e-01 0.0425 0.102 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0309 0.113 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 1.80e-01 -0.159 0.119 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 9.99e-01 0.000125 0.112 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0297 0.125 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 3.19e-01 0.107 0.108 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 2.12e-01 0.108 0.0864 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 2.33e-01 0.0992 0.0828 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0169 0.104 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 5.95e-01 0.0602 0.113 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 7.36e-01 0.0456 0.135 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 2.43e-01 0.145 0.124 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00118 0.117 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 5.82e-01 0.0673 0.122 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 4.16e-02 -0.229 0.112 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 6.61e-01 0.0502 0.114 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 8.31e-01 -0.03 0.14 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 7.35e-01 0.0456 0.134 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 6.56e-01 0.0612 0.137 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 8.68e-01 0.0215 0.129 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 2.63e-01 0.15 0.134 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 2.67e-01 -0.135 0.121 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0567 0.134 0.13 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 4.28e-01 0.094 0.118 0.13 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0734 0.114 0.13 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 1.04e-02 0.273 0.106 0.13 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 5.12e-01 0.0785 0.119 0.13 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0947 0.123 0.13 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 2.79e-01 0.147 0.136 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0492 0.115 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0842 0.121 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 7.63e-01 0.0359 0.119 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 2.13e-01 -0.149 0.119 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 2.89e-01 -0.125 0.118 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 1.87e-01 0.17 0.128 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 8.70e-02 -0.163 0.0947 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 9.83e-01 0.00204 0.0978 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0928 0.104 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 2.36e-01 0.155 0.13 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0863 0.108 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0757 0.137 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0331 0.122 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 3.91e-01 0.102 0.119 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 2.39e-01 0.134 0.113 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0573 0.121 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 1.92e-01 -0.152 0.116 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 5.36e-01 0.0772 0.124 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0972 0.097 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 2.34e-01 -0.125 0.105 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0243 0.116 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 2.74e-01 -0.134 0.122 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 1.58e-01 -0.161 0.114 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 9.13e-01 0.0164 0.149 0.126 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 4.22e-01 -0.139 0.173 0.126 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0232 0.15 0.126 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -265182 sc-eQTL 3.19e-01 -0.14 0.14 0.126 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 9.49e-02 0.167 0.0989 0.126 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 2.70e-01 0.151 0.136 0.126 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0129 0.146 0.126 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 4.86e-01 0.0685 0.0982 0.13 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 4.06e-01 0.104 0.125 0.13 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 1.26e-01 0.178 0.116 0.13 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 1.54e-01 0.119 0.0831 0.13 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 6.03e-01 0.0608 0.117 0.13 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 8.75e-01 0.0169 0.107 0.13 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00965 0.13 0.128 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 6.15e-01 0.0635 0.126 0.128 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 3.35e-01 0.0972 0.101 0.128 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 1.15e-01 0.182 0.115 0.128 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 6.57e-01 0.0522 0.118 0.128 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000109 0.117 0.128 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 6.03e-01 0.0669 0.128 0.134 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0193 0.139 0.134 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0633 0.119 0.134 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 2.00e-01 0.107 0.0834 0.134 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -951162 sc-eQTL 4.80e-01 -0.076 0.107 0.134 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 5.08e-01 0.0753 0.114 0.134 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 7.19e-01 0.038 0.105 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 3.26e-01 -0.115 0.117 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 2.37e-01 0.0941 0.0793 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 1.30e-01 0.105 0.0695 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -450355 sc-eQTL 1.19e-01 0.205 0.131 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -951162 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0977 0.133 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 1.92e-02 -0.256 0.108 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 4.93e-02 0.218 0.11 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0294 0.131 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0507 0.0949 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 6.70e-01 0.0311 0.073 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -450355 sc-eQTL 6.46e-02 0.232 0.125 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -951162 sc-eQTL 3.23e-01 -0.132 0.133 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 1.63e-01 -0.152 0.108 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 7.88e-01 0.0423 0.157 0.142 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 7.13e-01 0.0498 0.135 0.142 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0386 0.139 0.142 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0111 0.151 0.142 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 3.63e-02 0.29 0.137 0.142 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 2.11e-01 -0.169 0.134 0.142 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 9.20e-01 0.0123 0.122 0.131 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0971 0.131 0.131 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0337 0.112 0.131 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 8.90e-01 0.0121 0.0875 0.131 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -450355 sc-eQTL 3.58e-02 0.25 0.119 0.131 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -951162 sc-eQTL 1.02e-01 -0.205 0.125 0.131 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00795 0.119 0.131 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 5.24e-01 0.0746 0.117 0.131 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 3.45e-01 0.118 0.124 0.131 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 2.54e-01 0.116 0.101 0.131 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 2.13e-01 0.115 0.0921 0.131 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -450355 sc-eQTL 6.87e-01 0.0418 0.104 0.131 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -951162 sc-eQTL 6.06e-02 -0.212 0.112 0.131 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 7.92e-01 0.031 0.117 0.131 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0296 0.13 0.136 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 4.66e-02 -0.282 0.14 0.136 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 3.43e-01 -0.112 0.118 0.136 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0972 0.109 0.136 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -951162 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0795 0.133 0.136 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0635 0.121 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 2.30e-01 -0.155 0.129 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 2.03e-01 -0.137 0.107 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00684 0.0954 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -265182 sc-eQTL 9.75e-01 0.00345 0.109 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 3.56e-01 0.0631 0.0682 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 3.20e-01 0.0898 0.0902 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 2.69e-01 -0.109 0.0982 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 9.22e-01 0.0117 0.119 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00806 0.0941 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 2.28e-01 -0.107 0.0887 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -265182 sc-eQTL 8.11e-01 0.0205 0.0857 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 5.13e-01 0.0395 0.0603 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 1.27e-01 0.119 0.0775 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 1.54e-01 -0.132 0.0921 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 1.77e-01 0.135 0.0999 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0741 0.113 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 5.44e-01 0.044 0.0724 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 1.63e-01 0.0888 0.0634 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -450355 sc-eQTL 5.09e-02 0.253 0.129 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -951162 sc-eQTL 3.36e-01 -0.129 0.133 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 2.08e-02 -0.236 0.101 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 3.46e-01 0.102 0.108 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 7.23e-01 -0.042 0.118 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 5.25e-01 0.0617 0.0969 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 3.78e-01 0.0684 0.0774 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -450355 sc-eQTL 6.04e-02 0.212 0.112 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -951162 sc-eQTL 1.50e-01 -0.169 0.117 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 6.48e-01 0.0511 0.112 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -838385 sc-eQTL 9.94e-02 0.201 0.122 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -838579 sc-eQTL 1.19e-01 -0.13 0.0832 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -607588 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0433 0.0916 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -299371 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0429 0.102 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 sc-eQTL 4.07e-01 -0.098 0.118 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -273290 sc-eQTL 2.43e-01 -0.119 0.102 0.129 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -260101 eQTL 3.85e-02 0.0366 0.0177 0.0 0.0 0.137

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina