logo

Genes within 1Mb (chr1:30456702:CTT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 3.15e-01 -0.116 0.115 0.124 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0676 0.0919 0.124 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 1.84e-01 -0.102 0.0769 0.124 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -266883 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0318 0.0812 0.124 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 5.97e-01 0.0336 0.0635 0.124 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 2.56e-02 0.165 0.0736 0.124 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 1.19e-01 -0.137 0.0877 0.124 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0788 0.0997 0.124 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 2.28e-01 -0.094 0.0777 0.124 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0113 0.0694 0.124 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 3.15e-01 0.0773 0.0768 0.124 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0382 0.0688 0.124 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 7.63e-01 0.0249 0.0824 0.124 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 6.37e-01 -0.062 0.131 0.124 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 6.03e-01 0.0455 0.0873 0.124 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 3.16e-01 0.077 0.0767 0.124 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 2.40e-01 0.0876 0.0744 0.124 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 2.16e-01 -0.108 0.0872 0.124 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 3.93e-01 0.0939 0.11 0.124 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 6.13e-01 0.0588 0.116 0.128 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0656 0.137 0.128 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 3.17e-01 -0.108 0.107 0.128 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 8.82e-01 0.0114 0.0769 0.128 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -952863 sc-eQTL 9.59e-02 -0.211 0.126 0.128 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 2.35e-01 0.144 0.121 0.128 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 8.15e-02 0.157 0.0895 0.124 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 3.38e-01 -0.107 0.111 0.124 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 2.53e-01 0.0818 0.0714 0.124 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 1.48e-01 0.0951 0.0655 0.124 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -452056 sc-eQTL 2.08e-02 0.291 0.125 0.124 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -952863 sc-eQTL 3.54e-01 -0.126 0.136 0.124 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 2.27e-01 -0.126 0.104 0.124 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 5.00e-02 0.247 0.126 0.124 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 1.34e-01 -0.13 0.0862 0.124 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0646 0.0908 0.124 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00779 0.105 0.124 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 2.56e-01 -0.133 0.117 0.124 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 1.97e-01 -0.14 0.108 0.124 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0509 0.0943 0.124 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 8.15e-01 0.0236 0.101 0.124 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 4.46e-01 0.0691 0.0905 0.124 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 2.69e-02 0.164 0.0734 0.124 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 2.76e-01 0.133 0.121 0.124 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0155 0.127 0.124 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 9.92e-02 0.247 0.149 0.135 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0791 0.152 0.135 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 4.16e-01 0.115 0.141 0.135 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -266883 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0857 0.123 0.135 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 3.49e-01 0.0806 0.0857 0.135 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 3.30e-01 0.135 0.138 0.135 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 1.50e-01 -0.176 0.122 0.135 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 3.70e-01 -0.127 0.142 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 3.67e-01 -0.107 0.118 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0686 0.111 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -266883 sc-eQTL 9.17e-01 0.0121 0.116 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000205 0.0713 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 4.83e-02 0.197 0.0991 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 2.31e-01 -0.134 0.112 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 1.99e-01 -0.173 0.134 0.123 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0924 0.124 0.123 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 5.99e-01 0.057 0.108 0.123 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -266883 sc-eQTL 4.67e-01 0.0753 0.103 0.123 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 3.45e-01 0.0867 0.0915 0.123 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 9.09e-01 0.0121 0.105 0.123 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0139 0.123 0.123 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 5.32e-01 0.0788 0.126 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 9.10e-01 0.0123 0.109 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0577 0.0959 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -266883 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0251 0.0974 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 4.80e-01 0.046 0.065 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 2.11e-01 0.107 0.0852 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 2.81e-01 -0.114 0.105 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0941 0.135 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0686 0.111 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 2.00e-01 -0.139 0.108 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -266883 sc-eQTL 9.66e-01 0.00447 0.104 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 4.37e-01 0.0552 0.0708 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 9.93e-02 0.17 0.103 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0598 0.112 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 2.19e-01 0.166 0.134 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 3.94e-01 -0.113 0.132 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 2.83e-01 -0.139 0.13 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 5.24e-01 0.0739 0.116 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 5.99e-02 -0.238 0.126 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 9.09e-02 -0.189 0.111 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0847 0.104 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0392 0.0924 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0493 0.0737 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 5.08e-01 0.0524 0.079 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0214 0.0802 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 3.48e-01 0.0865 0.092 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0405 0.131 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 3.26e-02 -0.224 0.104 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 2.79e-01 -0.101 0.0931 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 3.10e-01 0.0786 0.0772 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 6.56e-01 0.0438 0.0982 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 5.63e-01 0.0633 0.109 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 9.12e-01 0.0144 0.13 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0414 0.124 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 8.11e-01 0.0247 0.103 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 7.59e-01 0.032 0.104 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0391 0.122 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 4.09e-01 0.0995 0.12 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 2.57e-01 -0.161 0.141 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0546 0.109 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 4.03e-01 0.0883 0.105 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00592 0.117 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 3.28e-01 -0.12 0.123 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0151 0.116 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0188 0.129 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 3.98e-01 0.0941 0.111 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 3.13e-01 0.0904 0.0894 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 2.06e-01 0.108 0.0856 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0491 0.107 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 6.81e-01 0.048 0.117 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 6.23e-01 0.0689 0.14 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 2.63e-01 0.143 0.128 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 8.47e-01 0.0233 0.121 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 5.17e-01 0.0819 0.126 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 4.95e-02 -0.229 0.116 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 5.93e-01 0.0632 0.118 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 7.83e-01 -0.04 0.145 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00906 0.139 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 7.30e-01 0.0492 0.142 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 8.02e-01 0.0336 0.134 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 1.60e-01 0.195 0.138 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 2.32e-01 -0.15 0.125 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0558 0.138 0.126 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 3.43e-01 0.116 0.122 0.126 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0546 0.117 0.126 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 5.73e-03 0.304 0.109 0.126 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 5.03e-01 0.0828 0.123 0.126 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 3.48e-01 -0.12 0.127 0.126 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 3.87e-01 0.122 0.141 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0925 0.119 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0947 0.125 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 4.79e-01 0.0873 0.123 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 2.22e-01 -0.151 0.123 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 2.31e-01 -0.146 0.122 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 1.24e-01 0.205 0.133 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 5.61e-02 -0.188 0.0978 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 9.42e-01 0.00736 0.101 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0667 0.108 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 1.34e-01 0.202 0.134 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0968 0.111 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0556 0.142 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0281 0.127 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 4.34e-01 0.0965 0.123 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 9.90e-02 0.194 0.117 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 7.44e-01 -0.041 0.125 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 2.49e-01 -0.139 0.121 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 4.90e-01 0.0892 0.129 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 2.86e-01 -0.107 0.1 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 2.70e-01 -0.12 0.109 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 9.33e-01 0.0102 0.12 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 2.96e-01 -0.133 0.127 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 1.66e-01 -0.163 0.118 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 7.95e-01 0.0391 0.15 0.122 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 5.13e-01 -0.114 0.174 0.122 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0622 0.151 0.122 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -266883 sc-eQTL 3.05e-01 -0.145 0.14 0.122 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 1.51e-01 0.144 0.0998 0.122 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 3.38e-01 0.132 0.137 0.122 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0641 0.147 0.122 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 2.62e-01 0.114 0.101 0.126 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 3.75e-01 0.114 0.128 0.126 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 9.94e-02 0.197 0.119 0.126 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 1.86e-01 0.114 0.0857 0.126 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 5.42e-01 0.0734 0.12 0.126 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 9.96e-01 0.000559 0.111 0.126 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 7.44e-01 -0.044 0.134 0.124 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 5.21e-01 0.0836 0.13 0.124 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 2.65e-01 0.116 0.104 0.124 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 5.28e-02 0.23 0.118 0.124 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 7.91e-01 0.0323 0.121 0.124 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0251 0.121 0.124 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 5.19e-01 0.085 0.132 0.132 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0126 0.143 0.132 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0831 0.122 0.132 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 1.95e-01 0.111 0.0855 0.132 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -952863 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0992 0.11 0.132 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 3.74e-01 0.104 0.116 0.132 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 6.54e-01 0.0486 0.108 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 2.99e-01 -0.126 0.121 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 2.99e-01 0.085 0.0816 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 1.45e-01 0.105 0.0715 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -452056 sc-eQTL 1.17e-01 0.212 0.135 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -952863 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0925 0.137 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 3.64e-02 -0.235 0.112 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 5.25e-02 0.221 0.114 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 5.85e-01 -0.074 0.135 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0602 0.0978 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 5.78e-01 0.0418 0.0752 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -452056 sc-eQTL 8.13e-02 0.226 0.129 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -952863 sc-eQTL 3.39e-01 -0.132 0.137 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 1.11e-01 -0.179 0.112 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 8.96e-01 0.0214 0.164 0.136 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 8.73e-01 0.0225 0.141 0.136 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0377 0.145 0.136 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 6.11e-01 0.0805 0.158 0.136 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 5.69e-02 0.276 0.144 0.136 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 3.86e-01 -0.122 0.141 0.136 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 7.46e-01 0.0408 0.126 0.127 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 3.39e-01 -0.129 0.135 0.127 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0313 0.115 0.127 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 8.70e-01 0.0148 0.0901 0.127 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -452056 sc-eQTL 4.82e-02 0.243 0.122 0.127 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -952863 sc-eQTL 1.02e-01 -0.211 0.128 0.127 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 9.07e-01 0.0143 0.122 0.127 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 4.47e-01 0.0921 0.121 0.127 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 2.83e-01 0.139 0.129 0.127 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 2.77e-01 0.115 0.105 0.127 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 1.72e-01 0.131 0.0954 0.127 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -452056 sc-eQTL 8.56e-01 0.0195 0.107 0.127 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -952863 sc-eQTL 9.80e-02 -0.194 0.116 0.127 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 8.84e-01 0.0178 0.121 0.127 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0329 0.135 0.13 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 1.34e-02 -0.363 0.145 0.13 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 3.78e-01 -0.108 0.123 0.13 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0663 0.114 0.13 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -952863 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0384 0.139 0.13 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 3.33e-01 -0.123 0.126 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 1.71e-01 -0.182 0.133 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 2.74e-01 -0.122 0.111 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0238 0.0984 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -266883 sc-eQTL 9.29e-01 -0.01 0.112 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 3.52e-01 0.0657 0.0704 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 2.66e-01 0.104 0.093 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 3.08e-01 -0.104 0.101 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0107 0.123 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0107 0.0971 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 2.62e-01 -0.103 0.0916 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -266883 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000713 0.0885 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 5.96e-01 0.0331 0.0622 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 7.31e-02 0.144 0.0798 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 1.24e-01 -0.147 0.095 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 1.67e-01 0.142 0.103 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0948 0.117 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 6.13e-01 0.0378 0.0745 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 1.45e-01 0.0954 0.0652 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -452056 sc-eQTL 5.19e-02 0.259 0.133 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -952863 sc-eQTL 3.54e-01 -0.128 0.137 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 2.57e-02 -0.234 0.104 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 2.65e-01 0.124 0.111 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0415 0.122 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 5.42e-01 0.0611 0.1 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 3.28e-01 0.0783 0.0799 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -452056 sc-eQTL 8.11e-02 0.203 0.116 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -952863 sc-eQTL 1.78e-01 -0.163 0.121 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 6.39e-01 0.0541 0.115 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -840086 sc-eQTL 6.02e-02 0.238 0.126 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -840280 sc-eQTL 1.02e-01 -0.142 0.0862 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -609289 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0383 0.095 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -301072 sc-eQTL 9.78e-01 0.00289 0.106 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0606 0.122 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -274991 sc-eQTL 2.75e-01 -0.115 0.105 0.125 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -261802 eQTL 3.80e-02 0.0367 0.0177 0.0 0.0 0.136

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina