logo

Genes within 1Mb (chr1:30417428:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 7.65e-01 0.0284 0.095 0.203 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 7.69e-01 0.0224 0.076 0.203 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 6.56e-01 0.0284 0.0638 0.203 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -306157 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0294 0.0671 0.203 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 7.55e-01 0.0164 0.0525 0.203 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0759 0.0613 0.203 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0538 0.0728 0.203 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0771 0.0811 0.203 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00199 0.0635 0.203 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 4.77e-01 0.0402 0.0564 0.203 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 1.13e-01 -0.0991 0.0622 0.203 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 4.63e-02 -0.111 0.0555 0.203 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 5.99e-01 0.0353 0.0671 0.203 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0751 0.107 0.203 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 9.92e-01 0.000682 0.0714 0.203 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 1.31e-01 0.0948 0.0625 0.203 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 2.28e-01 0.0736 0.0608 0.203 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0162 0.0715 0.203 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 8.10e-01 0.0217 0.0899 0.203 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 1.82e-01 -0.128 0.0956 0.203 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0367 0.114 0.203 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0771 0.0889 0.203 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 4.46e-01 0.0485 0.0635 0.203 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -992137 sc-eQTL 3.43e-01 0.0995 0.105 0.203 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 1.50e-01 -0.145 0.1 0.203 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 6.45e-01 0.0345 0.0748 0.203 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 2.80e-03 0.275 0.0908 0.203 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0259 0.0594 0.203 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 8.05e-01 0.0135 0.0547 0.203 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -491330 sc-eQTL 1.26e-01 -0.161 0.105 0.203 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -992137 sc-eQTL 6.90e-01 0.045 0.113 0.203 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 3.98e-01 0.0735 0.0867 0.203 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 3.22e-01 -0.102 0.103 0.204 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 7.31e-02 0.126 0.0699 0.204 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 3.52e-01 0.0688 0.0737 0.204 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 3.87e-02 0.175 0.0841 0.204 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 8.75e-01 0.015 0.0955 0.204 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0145 0.0882 0.204 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 8.10e-01 0.019 0.0786 0.203 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 2.91e-01 0.0888 0.0839 0.203 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 1.97e-01 0.0975 0.0753 0.203 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 9.54e-01 0.0036 0.062 0.203 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 1.89e-02 -0.237 0.1 0.203 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0774 0.106 0.203 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 4.88e-02 -0.247 0.125 0.194 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 6.00e-02 -0.238 0.126 0.194 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0758 0.118 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -306157 sc-eQTL 8.76e-01 0.0161 0.103 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00964 0.072 0.194 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 1.58e-01 -0.164 0.116 0.194 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 5.74e-02 -0.195 0.102 0.194 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 6.31e-01 0.0564 0.117 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 9.61e-01 0.00482 0.0976 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 9.88e-02 -0.152 0.0915 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -306157 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0283 0.0958 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 2.39e-01 0.0692 0.0586 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 9.54e-02 -0.137 0.082 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 7.66e-02 -0.163 0.0917 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 7.06e-01 0.0432 0.114 0.203 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 6.68e-01 0.0451 0.105 0.203 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00172 0.0916 0.203 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -306157 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0282 0.0877 0.203 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0884 0.0775 0.203 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0263 0.0889 0.203 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0085 0.104 0.203 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 2.37e-01 0.123 0.104 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 3.28e-01 0.0878 0.0896 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 9.11e-01 0.00888 0.0792 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -306157 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0528 0.0803 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00645 0.0537 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 6.92e-02 -0.128 0.07 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 8.18e-01 0.0201 0.0871 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0234 0.11 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 7.64e-01 0.0273 0.0909 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 2.33e-01 0.106 0.0887 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -306157 sc-eQTL 3.20e-01 0.0849 0.0852 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 2.90e-01 0.0613 0.0578 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 7.50e-01 0.027 0.0844 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0542 0.0911 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 6.26e-01 0.0534 0.109 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 7.77e-01 0.0304 0.108 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 3.40e-01 0.101 0.105 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 2.83e-01 -0.101 0.0938 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 5.49e-02 0.197 0.102 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 6.67e-01 0.0391 0.0908 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 1.31e-01 -0.128 0.0846 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0354 0.0754 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 9.85e-01 0.00115 0.0602 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0921 0.0642 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 2.03e-02 -0.151 0.0646 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 2.15e-01 0.0933 0.0749 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 3.41e-01 0.102 0.107 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 2.99e-01 0.0895 0.086 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 6.86e-01 0.0309 0.0763 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0852 0.0631 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0773 0.0802 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0697 0.0894 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 7.29e-01 0.0376 0.108 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 4.86e-01 0.0721 0.103 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00586 0.0861 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 7.22e-01 0.031 0.0871 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0122 0.102 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 1.20e-01 -0.156 0.0998 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 3.45e-01 -0.111 0.117 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 7.53e-01 0.0284 0.0901 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 6.41e-02 0.162 0.0869 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 9.40e-02 0.162 0.0963 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 9.00e-02 -0.172 0.101 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0294 0.0959 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 6.78e-01 0.0444 0.107 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0935 0.092 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 8.24e-01 0.0165 0.0742 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 3.45e-01 0.0672 0.0709 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0507 0.0887 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 4.29e-01 0.0765 0.0965 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0891 0.117 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0932 0.107 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 2.19e-01 0.124 0.1 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 1.31e-01 0.159 0.105 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 8.62e-01 0.017 0.0976 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00779 0.0987 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 9.16e-02 -0.19 0.112 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 2.73e-01 0.119 0.108 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 4.91e-01 0.0763 0.111 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00492 0.104 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 4.96e-01 0.0735 0.108 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0819 0.0975 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 2.89e-01 -0.123 0.116 0.199 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 9.50e-01 0.00648 0.103 0.199 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 7.51e-01 0.0314 0.0985 0.199 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 5.75e-01 0.0522 0.0929 0.199 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 1.75e-01 -0.14 0.103 0.199 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 9.14e-01 0.0115 0.107 0.199 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 2.75e-01 -0.126 0.116 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0256 0.0979 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 3.34e-01 0.0994 0.103 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 7.08e-01 0.0381 0.101 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0232 0.102 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0598 0.1 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0242 0.109 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 2.62e-02 0.178 0.0797 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00982 0.0827 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 1.66e-02 0.21 0.087 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0223 0.111 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 1.97e-01 -0.118 0.0908 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 6.26e-01 0.0561 0.115 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0735 0.102 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 7.26e-01 0.0351 0.0999 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 6.87e-02 0.173 0.0946 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00768 0.101 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0901 0.0979 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0891 0.106 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 4.28e-01 0.066 0.0831 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 6.18e-01 0.0449 0.0899 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 2.55e-01 0.113 0.0988 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0146 0.105 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 3.46e-01 0.092 0.0975 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0661 0.133 0.193 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 2.20e-02 0.35 0.15 0.193 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 3.99e-01 -0.113 0.133 0.193 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -306157 sc-eQTL 4.52e-02 -0.248 0.123 0.193 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 4.96e-02 -0.174 0.0876 0.193 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 4.50e-02 -0.243 0.12 0.193 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 8.62e-01 0.0227 0.13 0.193 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 3.98e-01 0.0705 0.0832 0.2 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0468 0.106 0.2 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 2.01e-01 0.126 0.0983 0.2 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00958 0.0708 0.2 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0771 0.0988 0.2 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0495 0.0909 0.2 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0752 0.111 0.203 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0303 0.108 0.203 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 4.12e-01 0.0709 0.0862 0.203 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0658 0.0987 0.203 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0648 0.101 0.203 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 2.92e-01 0.106 0.1 0.203 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 2.56e-01 -0.125 0.109 0.21 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00834 0.119 0.21 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00156 0.102 0.21 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 5.92e-01 0.0384 0.0715 0.21 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -992137 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0415 0.0918 0.21 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 1.11e-01 -0.155 0.0965 0.21 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 1.76e-01 0.121 0.0892 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 5.28e-01 0.0631 0.0999 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 9.51e-01 0.00413 0.0677 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00275 0.0594 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -491330 sc-eQTL 1.86e-01 -0.148 0.111 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -992137 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0286 0.113 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 2.28e-01 0.113 0.093 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 9.46e-01 0.00645 0.0947 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 4.15e-03 0.318 0.11 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0172 0.0808 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 7.61e-01 0.0189 0.0621 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -491330 sc-eQTL 1.41e-02 -0.262 0.106 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -992137 sc-eQTL 5.93e-01 0.0608 0.114 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 7.78e-01 0.0261 0.0927 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0767 0.13 0.212 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 5.30e-01 0.0705 0.112 0.212 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 3.76e-01 0.102 0.115 0.212 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 1.30e-01 0.19 0.125 0.212 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 5.55e-04 -0.392 0.111 0.212 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0113 0.112 0.212 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0891 0.103 0.209 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 6.50e-02 0.204 0.11 0.209 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 5.18e-01 0.0609 0.0941 0.209 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 8.55e-02 0.127 0.0734 0.209 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -491330 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0489 0.101 0.209 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -992137 sc-eQTL 6.10e-01 0.0541 0.106 0.209 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 1.99e-01 0.129 0.1 0.209 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0826 0.0962 0.206 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 1.97e-02 0.238 0.101 0.206 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0525 0.0839 0.206 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00415 0.0763 0.206 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -491330 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0477 0.0855 0.206 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -992137 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0771 0.0932 0.206 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0386 0.0966 0.206 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 3.40e-02 -0.229 0.107 0.223 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 2.09e-01 -0.149 0.118 0.223 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 7.28e-01 0.0343 0.0986 0.223 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 1.88e-01 0.12 0.0912 0.223 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -992137 sc-eQTL 4.58e-01 0.0826 0.111 0.223 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 2.09e-01 -0.127 0.101 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0338 0.111 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0527 0.0927 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0374 0.0822 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -306157 sc-eQTL 8.66e-01 0.0158 0.0937 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0209 0.0589 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 1.35e-01 -0.116 0.0775 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 4.44e-02 -0.17 0.0841 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 2.58e-01 0.115 0.101 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 4.50e-01 0.0607 0.0801 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 4.64e-01 0.0557 0.0758 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -306157 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00119 0.0731 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 8.66e-01 0.00872 0.0515 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0652 0.0663 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 9.52e-01 0.00477 0.0789 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 2.26e-01 0.103 0.0852 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 2.23e-02 0.22 0.0956 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00298 0.0618 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0126 0.0543 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -491330 sc-eQTL 3.84e-02 -0.228 0.11 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -992137 sc-eQTL 8.55e-01 0.0209 0.114 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 3.94e-01 0.0745 0.0873 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 2.43e-01 -0.108 0.0927 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 8.50e-03 0.266 0.1 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0611 0.0833 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 1.89e-01 0.0875 0.0664 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -491330 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0229 0.0974 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -992137 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0105 0.101 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 6.22e-01 0.0474 0.0959 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -879360 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0769 0.103 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879554 sc-eQTL 4.23e-02 0.143 0.0699 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -648563 sc-eQTL 6.69e-01 0.0331 0.0773 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -340346 sc-eQTL 2.47e-02 0.193 0.0854 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301076 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00435 0.0997 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -314265 sc-eQTL 8.65e-01 0.0147 0.086 0.205 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162510 \N -306157 8.21e-07 5.33e-07 5.93e-08 4.43e-07 1.06e-07 1.77e-07 5.2e-07 7.56e-08 2.53e-07 1.5e-07 3.92e-07 1.62e-07 9.23e-07 1.41e-07 1.48e-07 1.13e-07 7.3e-08 2.75e-07 1.5e-07 8.25e-08 1.39e-07 2.48e-07 3.45e-07 7.94e-08 6.87e-07 1.51e-07 1.74e-07 1.77e-07 3.88e-07 2.02e-07 2.19e-07 6.87e-08 4.34e-08 1.37e-07 3.4e-07 5.14e-08 1.08e-07 6.66e-08 4.9e-08 7.39e-08 3.6e-08 5.87e-07 3.31e-08 1.94e-08 8.59e-08 1.95e-08 7.8e-08 2.75e-09 5.69e-08
ENSG00000168528 \N -992137 2.66e-07 1.01e-07 3.44e-08 1.82e-07 9.91e-08 9.32e-08 1.42e-07 5.35e-08 1.37e-07 4.24e-08 1.63e-07 7.58e-08 1.26e-07 6.21e-08 5.4e-08 7.87e-08 5.1e-08 1.07e-07 5.19e-08 3.88e-08 1.06e-07 1.33e-07 1.3e-07 4.67e-08 1.29e-07 1.09e-07 1.1e-07 8.7e-08 1.02e-07 1.09e-07 9.58e-08 3.95e-08 2.74e-08 8.21e-08 8.99e-08 3.93e-08 5.06e-08 9.26e-08 8e-08 3.05e-08 4.36e-08 1.36e-07 4.01e-08 2.4e-08 8.16e-08 1.69e-08 1.3e-07 4.26e-09 4.77e-08