logo

Genes within 1Mb (chr1:30417358:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 7.65e-01 0.0284 0.095 0.203 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 7.69e-01 0.0224 0.076 0.203 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 6.56e-01 0.0284 0.0638 0.203 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -306227 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0294 0.0671 0.203 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 7.55e-01 0.0164 0.0525 0.203 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0759 0.0613 0.203 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0538 0.0728 0.203 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0771 0.0811 0.203 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00199 0.0635 0.203 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 4.77e-01 0.0402 0.0564 0.203 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 1.13e-01 -0.0991 0.0622 0.203 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 4.63e-02 -0.111 0.0555 0.203 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 5.99e-01 0.0353 0.0671 0.203 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0751 0.107 0.203 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 9.92e-01 0.000682 0.0714 0.203 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 1.31e-01 0.0948 0.0625 0.203 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 2.28e-01 0.0736 0.0608 0.203 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0162 0.0715 0.203 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 8.10e-01 0.0217 0.0899 0.203 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 1.82e-01 -0.128 0.0956 0.203 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0367 0.114 0.203 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0771 0.0889 0.203 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 4.46e-01 0.0485 0.0635 0.203 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -992207 sc-eQTL 3.43e-01 0.0995 0.105 0.203 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 1.50e-01 -0.145 0.1 0.203 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 6.45e-01 0.0345 0.0748 0.203 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 2.80e-03 0.275 0.0908 0.203 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0259 0.0594 0.203 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 8.05e-01 0.0135 0.0547 0.203 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -491400 sc-eQTL 1.26e-01 -0.161 0.105 0.203 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -992207 sc-eQTL 6.90e-01 0.045 0.113 0.203 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 3.98e-01 0.0735 0.0867 0.203 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 3.22e-01 -0.102 0.103 0.204 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 7.31e-02 0.126 0.0699 0.204 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 3.52e-01 0.0688 0.0737 0.204 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 3.87e-02 0.175 0.0841 0.204 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 8.75e-01 0.015 0.0955 0.204 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0145 0.0882 0.204 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 8.10e-01 0.019 0.0786 0.203 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 2.91e-01 0.0888 0.0839 0.203 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 1.97e-01 0.0975 0.0753 0.203 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 9.54e-01 0.0036 0.062 0.203 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 1.89e-02 -0.237 0.1 0.203 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0774 0.106 0.203 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 4.88e-02 -0.247 0.125 0.194 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 6.00e-02 -0.238 0.126 0.194 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0758 0.118 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -306227 sc-eQTL 8.76e-01 0.0161 0.103 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00964 0.072 0.194 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 1.58e-01 -0.164 0.116 0.194 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 5.74e-02 -0.195 0.102 0.194 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 6.31e-01 0.0564 0.117 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 9.61e-01 0.00482 0.0976 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 9.88e-02 -0.152 0.0915 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -306227 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0283 0.0958 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 2.39e-01 0.0692 0.0586 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 9.54e-02 -0.137 0.082 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 7.66e-02 -0.163 0.0917 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 7.06e-01 0.0432 0.114 0.203 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 6.68e-01 0.0451 0.105 0.203 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00172 0.0916 0.203 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -306227 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0282 0.0877 0.203 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0884 0.0775 0.203 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0263 0.0889 0.203 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0085 0.104 0.203 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 2.37e-01 0.123 0.104 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 3.28e-01 0.0878 0.0896 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 9.11e-01 0.00888 0.0792 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -306227 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0528 0.0803 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00645 0.0537 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 6.92e-02 -0.128 0.07 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 8.18e-01 0.0201 0.0871 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0234 0.11 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 7.64e-01 0.0273 0.0909 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 2.33e-01 0.106 0.0887 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -306227 sc-eQTL 3.20e-01 0.0849 0.0852 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 2.90e-01 0.0613 0.0578 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 7.50e-01 0.027 0.0844 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0542 0.0911 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 6.26e-01 0.0534 0.109 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 7.77e-01 0.0304 0.108 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 3.40e-01 0.101 0.105 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 2.83e-01 -0.101 0.0938 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 5.49e-02 0.197 0.102 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 6.67e-01 0.0391 0.0908 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 1.31e-01 -0.128 0.0846 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0354 0.0754 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 9.85e-01 0.00115 0.0602 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0921 0.0642 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 2.03e-02 -0.151 0.0646 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 2.15e-01 0.0933 0.0749 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 3.41e-01 0.102 0.107 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 2.99e-01 0.0895 0.086 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 6.86e-01 0.0309 0.0763 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0852 0.0631 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0773 0.0802 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0697 0.0894 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 7.29e-01 0.0376 0.108 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 4.86e-01 0.0721 0.103 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00586 0.0861 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 7.22e-01 0.031 0.0871 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0122 0.102 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 1.20e-01 -0.156 0.0998 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 3.45e-01 -0.111 0.117 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 7.53e-01 0.0284 0.0901 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 6.41e-02 0.162 0.0869 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 9.40e-02 0.162 0.0963 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 9.00e-02 -0.172 0.101 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0294 0.0959 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 6.78e-01 0.0444 0.107 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0935 0.092 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 8.24e-01 0.0165 0.0742 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 3.45e-01 0.0672 0.0709 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0507 0.0887 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 4.29e-01 0.0765 0.0965 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0891 0.117 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0932 0.107 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 2.19e-01 0.124 0.1 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 1.31e-01 0.159 0.105 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 8.62e-01 0.017 0.0976 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00779 0.0987 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 9.16e-02 -0.19 0.112 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 2.73e-01 0.119 0.108 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 4.91e-01 0.0763 0.111 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00492 0.104 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 4.96e-01 0.0735 0.108 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0819 0.0975 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 2.89e-01 -0.123 0.116 0.199 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 9.50e-01 0.00648 0.103 0.199 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 7.51e-01 0.0314 0.0985 0.199 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 5.75e-01 0.0522 0.0929 0.199 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 1.75e-01 -0.14 0.103 0.199 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 9.14e-01 0.0115 0.107 0.199 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 2.75e-01 -0.126 0.116 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0256 0.0979 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 3.34e-01 0.0994 0.103 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 7.08e-01 0.0381 0.101 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0232 0.102 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0598 0.1 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0242 0.109 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 2.62e-02 0.178 0.0797 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00982 0.0827 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 1.66e-02 0.21 0.087 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0223 0.111 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 1.97e-01 -0.118 0.0908 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 6.26e-01 0.0561 0.115 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0735 0.102 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 7.26e-01 0.0351 0.0999 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 6.87e-02 0.173 0.0946 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00768 0.101 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0901 0.0979 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0891 0.106 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 4.28e-01 0.066 0.0831 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 6.18e-01 0.0449 0.0899 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 2.55e-01 0.113 0.0988 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0146 0.105 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 3.46e-01 0.092 0.0975 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0661 0.133 0.193 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 2.20e-02 0.35 0.15 0.193 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 3.99e-01 -0.113 0.133 0.193 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -306227 sc-eQTL 4.52e-02 -0.248 0.123 0.193 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 4.96e-02 -0.174 0.0876 0.193 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 4.50e-02 -0.243 0.12 0.193 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 8.62e-01 0.0227 0.13 0.193 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 3.98e-01 0.0705 0.0832 0.2 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0468 0.106 0.2 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 2.01e-01 0.126 0.0983 0.2 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00958 0.0708 0.2 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0771 0.0988 0.2 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0495 0.0909 0.2 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0752 0.111 0.203 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0303 0.108 0.203 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 4.12e-01 0.0709 0.0862 0.203 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0658 0.0987 0.203 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0648 0.101 0.203 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 2.92e-01 0.106 0.1 0.203 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 2.56e-01 -0.125 0.109 0.21 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00834 0.119 0.21 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00156 0.102 0.21 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 5.92e-01 0.0384 0.0715 0.21 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -992207 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0415 0.0918 0.21 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 1.11e-01 -0.155 0.0965 0.21 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 1.76e-01 0.121 0.0892 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 5.28e-01 0.0631 0.0999 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 9.51e-01 0.00413 0.0677 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00275 0.0594 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -491400 sc-eQTL 1.86e-01 -0.148 0.111 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -992207 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0286 0.113 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 2.28e-01 0.113 0.093 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 9.46e-01 0.00645 0.0947 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 4.15e-03 0.318 0.11 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0172 0.0808 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 7.61e-01 0.0189 0.0621 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -491400 sc-eQTL 1.41e-02 -0.262 0.106 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -992207 sc-eQTL 5.93e-01 0.0608 0.114 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 7.78e-01 0.0261 0.0927 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0767 0.13 0.212 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 5.30e-01 0.0705 0.112 0.212 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 3.76e-01 0.102 0.115 0.212 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 1.30e-01 0.19 0.125 0.212 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 5.55e-04 -0.392 0.111 0.212 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0113 0.112 0.212 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0891 0.103 0.209 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 6.50e-02 0.204 0.11 0.209 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 5.18e-01 0.0609 0.0941 0.209 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 8.55e-02 0.127 0.0734 0.209 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -491400 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0489 0.101 0.209 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -992207 sc-eQTL 6.10e-01 0.0541 0.106 0.209 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 1.99e-01 0.129 0.1 0.209 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0826 0.0962 0.206 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 1.97e-02 0.238 0.101 0.206 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0525 0.0839 0.206 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00415 0.0763 0.206 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -491400 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0477 0.0855 0.206 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -992207 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0771 0.0932 0.206 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0386 0.0966 0.206 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 3.40e-02 -0.229 0.107 0.223 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 2.09e-01 -0.149 0.118 0.223 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 7.28e-01 0.0343 0.0986 0.223 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 1.88e-01 0.12 0.0912 0.223 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -992207 sc-eQTL 4.58e-01 0.0826 0.111 0.223 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 2.09e-01 -0.127 0.101 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0338 0.111 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0527 0.0927 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0374 0.0822 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -306227 sc-eQTL 8.66e-01 0.0158 0.0937 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0209 0.0589 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 1.35e-01 -0.116 0.0775 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 4.44e-02 -0.17 0.0841 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 2.58e-01 0.115 0.101 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 4.50e-01 0.0607 0.0801 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 4.64e-01 0.0557 0.0758 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -306227 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00119 0.0731 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 8.66e-01 0.00872 0.0515 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0652 0.0663 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 9.52e-01 0.00477 0.0789 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 2.26e-01 0.103 0.0852 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 2.23e-02 0.22 0.0956 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00298 0.0618 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0126 0.0543 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -491400 sc-eQTL 3.84e-02 -0.228 0.11 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -992207 sc-eQTL 8.55e-01 0.0209 0.114 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 3.94e-01 0.0745 0.0873 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 2.43e-01 -0.108 0.0927 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 8.50e-03 0.266 0.1 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0611 0.0833 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 1.89e-01 0.0875 0.0664 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -491400 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0229 0.0974 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -992207 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0105 0.101 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 6.22e-01 0.0474 0.0959 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -879430 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0769 0.103 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -879624 sc-eQTL 4.23e-02 0.143 0.0699 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -648633 sc-eQTL 6.69e-01 0.0331 0.0773 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -340416 sc-eQTL 2.47e-02 0.193 0.0854 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -301146 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00435 0.0997 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -314335 sc-eQTL 8.65e-01 0.0147 0.086 0.205 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162510 \N -306227 1.32e-06 9.07e-07 3.35e-07 5.24e-07 3.57e-07 4.51e-07 1.16e-06 3.51e-07 1.27e-06 4.03e-07 1.35e-06 5.83e-07 1.75e-06 2.59e-07 4.95e-07 7.95e-07 7.91e-07 5.88e-07 6.18e-07 6.8e-07 4.77e-07 1.19e-06 8.26e-07 6.51e-07 1.98e-06 3.91e-07 7.31e-07 7.26e-07 1.24e-06 1.13e-06 5.66e-07 1.52e-07 2.19e-07 5.78e-07 4.4e-07 4.6e-07 4.26e-07 1.26e-07 2.92e-07 2.48e-07 2.82e-07 1.48e-06 5.37e-08 2.66e-08 1.66e-07 1.01e-07 2.38e-07 7.69e-08 1.11e-07
ENSG00000168528 \N -992207 2.74e-07 1.25e-07 4.48e-08 1.8e-07 9.24e-08 1e-07 1.49e-07 5.4e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.57e-07 8.68e-08 1.41e-07 6.56e-08 6.02e-08 7.53e-08 3.87e-08 1.27e-07 5.82e-08 4.04e-08 1.13e-07 1.28e-07 1.39e-07 3.23e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.09e-07 1.07e-07 9.7e-08 3.64e-08 3.56e-08 8.34e-08 7.66e-08 3.6e-08 5.02e-08 9.25e-08 6.56e-08 3.87e-08 5.42e-08 1.33e-07 4.89e-08 1.91e-08 4.92e-08 1.99e-08 1.19e-07 3.83e-09 4.94e-08