logo

Genes within 1Mb (chr1:30411267:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 2.60e-01 0.101 0.0895 0.244 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 5.23e-01 0.0459 0.0718 0.244 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0149 0.0603 0.244 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -312318 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0619 0.0633 0.244 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 7.97e-01 0.0128 0.0496 0.244 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0511 0.0581 0.244 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0301 0.0688 0.244 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0864 0.0766 0.244 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0152 0.06 0.244 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 2.17e-01 0.066 0.0533 0.244 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 5.34e-02 -0.114 0.0587 0.244 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0684 0.0528 0.244 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 5.31e-01 0.0398 0.0634 0.244 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 2.22e-01 -0.124 0.101 0.244 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0108 0.0675 0.244 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 2.13e-01 0.074 0.0592 0.244 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 2.75e-01 0.0629 0.0576 0.244 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00538 0.0677 0.244 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 6.67e-01 0.0366 0.085 0.244 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 1.24e-01 -0.138 0.0897 0.243 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 9.91e-01 0.00121 0.107 0.243 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0596 0.0836 0.243 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 4.26e-01 0.0476 0.0597 0.243 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -998298 sc-eQTL 2.65e-01 0.11 0.0983 0.243 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0994 0.0943 0.243 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 8.90e-01 0.00978 0.0709 0.244 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 1.67e-03 0.273 0.0858 0.244 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 7.05e-01 0.0213 0.0563 0.244 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 6.11e-01 0.0264 0.0518 0.244 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -497491 sc-eQTL 2.36e-01 -0.118 0.0992 0.244 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -998298 sc-eQTL 6.03e-01 0.0556 0.107 0.244 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 1.25e-01 0.126 0.0818 0.244 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 1.05e-01 -0.156 0.096 0.245 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 1.95e-01 0.0856 0.0659 0.245 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 4.74e-01 0.0497 0.0693 0.245 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 2.49e-02 0.178 0.0789 0.245 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0162 0.0897 0.245 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 4.16e-01 0.0675 0.0827 0.245 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 9.29e-01 0.00651 0.073 0.244 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 9.35e-02 0.131 0.0775 0.244 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 7.54e-01 0.022 0.0701 0.244 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0449 0.0574 0.244 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 5.00e-02 -0.184 0.0933 0.244 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 7.44e-01 -0.032 0.098 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 3.06e-02 -0.259 0.119 0.23 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 8.57e-02 -0.208 0.12 0.23 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 8.83e-01 0.0167 0.113 0.23 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -312318 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0385 0.0986 0.23 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 9.42e-01 0.00505 0.0688 0.23 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 3.23e-01 -0.11 0.111 0.23 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 5.47e-02 -0.188 0.0973 0.23 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 8.46e-01 0.0214 0.11 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 7.69e-01 0.027 0.0918 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 1.96e-02 -0.201 0.0855 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -312318 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0852 0.09 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 4.27e-01 0.0439 0.0553 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0265 0.0776 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0943 0.0866 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 1.95e-01 0.139 0.107 0.244 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 6.39e-01 0.0465 0.099 0.244 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0171 0.0862 0.244 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -312318 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0019 0.0824 0.244 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 1.27e-01 -0.111 0.0727 0.244 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 6.77e-01 0.0349 0.0836 0.244 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0237 0.0979 0.244 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 1.25e-01 0.15 0.0972 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 1.61e-01 0.118 0.084 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0537 0.0744 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -312318 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0935 0.0753 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 8.27e-01 -0.011 0.0505 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 5.90e-02 -0.125 0.0657 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 7.92e-01 0.0217 0.0819 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 8.64e-01 0.0178 0.104 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00435 0.0857 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 3.45e-01 0.0793 0.0837 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -312318 sc-eQTL 3.06e-01 0.0825 0.0804 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 5.31e-01 0.0343 0.0547 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0113 0.0797 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0445 0.086 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00284 0.104 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 6.86e-01 0.0414 0.102 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 3.23e-01 0.0992 0.1 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0585 0.0894 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 2.94e-02 0.212 0.0967 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 5.86e-01 0.0471 0.0863 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0948 0.0801 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0537 0.0711 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 7.48e-01 0.0183 0.0568 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 3.81e-02 -0.126 0.0603 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 5.12e-02 -0.12 0.0613 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 2.18e-01 0.0874 0.0708 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0399 0.101 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 3.89e-01 0.0702 0.0812 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 4.44e-01 0.0551 0.0719 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 2.35e-01 -0.071 0.0596 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 9.70e-01 0.00288 0.0758 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0775 0.0843 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 3.78e-01 0.0896 0.101 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 2.66e-01 0.108 0.0965 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 7.77e-01 0.0229 0.0806 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0339 0.0815 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 8.93e-01 0.0128 0.0954 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 2.54e-01 -0.107 0.0937 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 2.28e-01 -0.135 0.111 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 4.36e-01 0.0667 0.0855 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 3.23e-01 0.0822 0.0829 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 3.51e-01 0.0858 0.0919 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 1.80e-01 -0.13 0.0964 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0157 0.091 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 6.44e-01 0.0469 0.101 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 1.35e-01 -0.13 0.087 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00672 0.0704 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 5.80e-01 0.0374 0.0674 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0369 0.0841 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 4.38e-01 0.0712 0.0915 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 2.21e-01 -0.137 0.112 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 2.55e-01 -0.117 0.102 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 5.37e-01 0.0597 0.0964 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 4.72e-01 0.0727 0.101 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0282 0.0935 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 5.41e-01 0.0578 0.0945 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 9.59e-02 -0.178 0.106 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 1.04e-01 0.167 0.102 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 6.84e-01 0.0428 0.105 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0822 0.0986 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 7.02e-01 0.0392 0.102 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0911 0.0925 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 2.46e-01 -0.125 0.108 0.24 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 5.47e-01 0.0578 0.0957 0.24 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 2.05e-01 -0.116 0.0915 0.24 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00893 0.0866 0.24 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0911 0.0963 0.24 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 7.38e-01 0.0333 0.0994 0.24 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 1.25e-01 -0.167 0.108 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0162 0.0918 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 2.79e-01 0.104 0.0962 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 5.79e-01 0.0528 0.0951 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0359 0.0956 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0356 0.0942 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0401 0.102 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 8.41e-02 0.13 0.0751 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0233 0.0776 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 1.05e-02 0.21 0.0814 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 9.99e-01 0.000179 0.104 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0531 0.0854 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0132 0.108 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0334 0.0965 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 1.98e-01 0.121 0.0937 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 7.87e-02 0.157 0.0891 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0714 0.0954 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 8.66e-01 0.0156 0.0923 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 1.25e-01 -0.153 0.0993 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 6.74e-01 0.0328 0.0779 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 7.66e-01 0.0252 0.0842 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 9.52e-02 0.154 0.0921 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 8.47e-01 0.019 0.0983 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 3.14e-01 0.092 0.0913 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0768 0.119 0.244 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 9.93e-02 0.227 0.136 0.244 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0722 0.12 0.244 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -312318 sc-eQTL 1.76e-01 -0.151 0.111 0.244 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 1.17e-01 -0.125 0.079 0.244 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 1.80e-02 -0.256 0.107 0.244 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 8.48e-01 0.0224 0.116 0.244 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 6.78e-01 0.0326 0.0784 0.241 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0113 0.0995 0.241 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 1.08e-01 0.149 0.0923 0.241 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0575 0.0665 0.241 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0643 0.093 0.241 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0404 0.0855 0.241 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0367 0.105 0.244 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0307 0.101 0.244 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 7.40e-01 0.0269 0.081 0.244 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0953 0.0926 0.244 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0569 0.0945 0.244 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 2.58e-01 0.107 0.0942 0.244 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 1.18e-01 -0.163 0.104 0.246 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0605 0.113 0.246 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0101 0.097 0.246 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 4.57e-01 0.0506 0.0679 0.246 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -998298 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0634 0.0871 0.246 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 1.99e-01 -0.119 0.0919 0.246 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 2.14e-01 0.106 0.0846 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 5.30e-01 0.0595 0.0947 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 8.75e-01 0.0101 0.0641 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 7.17e-01 0.0205 0.0563 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -497491 sc-eQTL 1.66e-01 -0.147 0.106 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -998298 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00582 0.107 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 7.90e-02 0.155 0.0878 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0703 0.0893 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 5.61e-04 0.36 0.103 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 3.69e-01 0.0686 0.0762 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 7.16e-01 0.0213 0.0587 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -497491 sc-eQTL 5.91e-02 -0.191 0.1 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -998298 sc-eQTL 6.25e-01 0.0526 0.107 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 4.42e-01 0.0673 0.0874 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0173 0.124 0.248 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 2.49e-01 0.122 0.106 0.248 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 6.62e-01 0.048 0.109 0.248 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 1.45e-01 0.173 0.118 0.248 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 4.47e-03 -0.309 0.107 0.248 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0552 0.106 0.248 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 2.86e-01 -0.105 0.0981 0.251 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 9.97e-02 0.174 0.105 0.251 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 6.36e-01 0.0425 0.0897 0.251 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 5.32e-02 0.136 0.0697 0.251 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -497491 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0123 0.0964 0.251 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -998298 sc-eQTL 7.56e-01 0.0313 0.101 0.251 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 1.51e-01 0.137 0.0951 0.251 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0733 0.0908 0.242 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 6.61e-02 0.178 0.0962 0.242 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0419 0.0792 0.242 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 8.80e-01 0.0109 0.072 0.242 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -497491 sc-eQTL 6.83e-01 -0.033 0.0807 0.242 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -998298 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0342 0.088 0.242 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 9.99e-01 -0.00013 0.0912 0.242 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 2.81e-02 -0.226 0.102 0.263 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 6.16e-01 -0.057 0.113 0.263 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 8.19e-01 0.0216 0.0941 0.263 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 1.88e-01 0.115 0.0871 0.263 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -998298 sc-eQTL 9.92e-02 0.175 0.105 0.263 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0961 0.0966 0.263 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 8.64e-01 0.018 0.105 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0162 0.0874 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0769 0.0772 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -312318 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0235 0.0883 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0536 0.0553 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0269 0.0733 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 8.95e-02 -0.135 0.0794 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 1.21e-01 0.148 0.095 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 2.82e-01 0.0813 0.0754 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00495 0.0715 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -312318 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0454 0.0688 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00224 0.0485 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0786 0.0623 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 9.25e-01 0.00698 0.0743 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 4.41e-01 0.0624 0.081 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 6.46e-03 0.248 0.0902 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 4.08e-01 0.0485 0.0585 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 9.03e-01 0.00625 0.0515 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -497491 sc-eQTL 5.55e-02 -0.2 0.104 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -998298 sc-eQTL 7.42e-01 0.0355 0.108 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 1.20e-01 0.129 0.0824 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 2.09e-01 -0.11 0.0874 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 2.31e-02 0.217 0.0948 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0435 0.0786 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 1.33e-01 0.0944 0.0626 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -497491 sc-eQTL 8.29e-01 0.0198 0.0919 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -998298 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0133 0.0953 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 4.15e-01 0.0738 0.0904 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -885521 sc-eQTL 1.88e-01 -0.128 0.0966 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -885715 sc-eQTL 1.48e-01 0.0956 0.0659 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -654724 sc-eQTL 7.92e-01 0.0191 0.0726 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -346507 sc-eQTL 1.36e-02 0.199 0.0799 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307237 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0189 0.0936 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -320426 sc-eQTL 4.05e-01 0.0672 0.0806 0.246 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000229447 AC114495.2 -852414 eQTL 0.0155 0.0946 0.039 0.00115 0.0 0.23

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162510 \N -312318 1.26e-06 9.53e-07 2.83e-07 1e-06 3.48e-07 5.95e-07 1.63e-06 3.62e-07 1.39e-06 4.7e-07 1.5e-06 6.45e-07 2.01e-06 2.88e-07 5.22e-07 8.48e-07 8.9e-07 6.25e-07 8.36e-07 6.56e-07 6.61e-07 1.49e-06 8.93e-07 6.33e-07 2.16e-06 4.32e-07 8.98e-07 7.03e-07 1.31e-06 1.32e-06 6.52e-07 3.07e-07 3e-07 6.74e-07 5.87e-07 4.56e-07 6.37e-07 3.07e-07 4.74e-07 3.01e-07 2.88e-07 1.5e-06 1.67e-07 9.61e-08 2.47e-07 1.2e-07 2.43e-07 1.41e-07 1.68e-07