logo

Genes within 1Mb (chr1:30410656:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 6.47e-01 0.0429 0.0935 0.205 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 7.87e-01 0.0203 0.0749 0.205 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 7.60e-01 0.0192 0.0629 0.205 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -312929 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0256 0.0661 0.205 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 8.29e-01 0.0112 0.0518 0.205 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0719 0.0605 0.205 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0515 0.0717 0.205 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0725 0.08 0.205 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00728 0.0626 0.205 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 5.72e-01 0.0315 0.0557 0.205 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0927 0.0614 0.205 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 4.40e-02 -0.111 0.0547 0.205 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 4.89e-01 0.0458 0.0661 0.205 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0811 0.106 0.205 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 7.20e-01 0.0253 0.0705 0.205 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 1.26e-01 0.095 0.0617 0.205 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 1.22e-01 0.0932 0.06 0.205 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 8.32e-01 -0.015 0.0707 0.205 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 8.96e-01 0.0116 0.0888 0.205 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 2.35e-01 -0.113 0.0946 0.205 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0421 0.112 0.205 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0861 0.0878 0.205 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 4.93e-01 0.0431 0.0628 0.205 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -998909 sc-eQTL 3.29e-01 0.101 0.103 0.205 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 1.73e-01 -0.135 0.0989 0.205 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 6.77e-01 0.0309 0.074 0.205 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 3.22e-03 0.268 0.0899 0.205 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0293 0.0588 0.205 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 7.02e-01 0.0207 0.0541 0.205 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -498102 sc-eQTL 1.37e-01 -0.155 0.103 0.205 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -998909 sc-eQTL 5.83e-01 0.0613 0.111 0.205 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 2.91e-01 0.0907 0.0857 0.205 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0954 0.101 0.206 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 8.96e-02 0.118 0.0689 0.206 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 4.07e-01 0.0604 0.0727 0.206 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 5.01e-02 0.164 0.083 0.206 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 8.40e-01 0.0191 0.0942 0.206 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00171 0.087 0.206 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 8.08e-01 0.0188 0.0773 0.205 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 2.97e-01 0.0861 0.0824 0.205 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 2.15e-01 0.0921 0.074 0.205 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 9.52e-01 0.0037 0.0609 0.205 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 2.14e-02 -0.228 0.0984 0.205 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0853 0.104 0.205 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 4.88e-02 -0.247 0.125 0.194 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 6.00e-02 -0.238 0.126 0.194 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0758 0.118 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -312929 sc-eQTL 8.76e-01 0.0161 0.103 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00964 0.072 0.194 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 1.58e-01 -0.164 0.116 0.194 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 5.74e-02 -0.195 0.102 0.194 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 6.18e-01 0.0576 0.115 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000601 0.0963 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 7.42e-02 -0.162 0.0901 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -312929 sc-eQTL 8.16e-01 -0.022 0.0945 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 3.17e-01 0.058 0.0579 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 1.07e-01 -0.131 0.0809 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 1.03e-01 -0.148 0.0905 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 6.71e-01 0.0478 0.113 0.205 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 6.54e-01 0.0466 0.104 0.205 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0161 0.0903 0.205 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -312929 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0136 0.0864 0.205 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0892 0.0763 0.205 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 9.91e-01 0.00101 0.0876 0.205 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0142 0.103 0.205 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 2.11e-01 0.128 0.102 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 3.44e-01 0.0838 0.0883 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000743 0.078 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -312929 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0509 0.0791 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0091 0.0529 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 7.34e-02 -0.124 0.0689 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 9.41e-01 0.00632 0.0858 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 9.88e-01 0.00165 0.109 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 8.08e-01 0.0217 0.0896 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 2.19e-01 0.108 0.0874 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -312929 sc-eQTL 3.73e-01 0.075 0.084 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 3.17e-01 0.0572 0.057 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 9.86e-01 0.00145 0.0832 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0473 0.0899 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 6.26e-01 0.0534 0.109 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 7.77e-01 0.0304 0.108 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 3.40e-01 0.101 0.105 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 2.83e-01 -0.101 0.0938 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 5.49e-02 0.197 0.102 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 6.67e-01 0.0391 0.0908 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 1.42e-01 -0.123 0.0834 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0422 0.0743 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00161 0.0594 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0891 0.0633 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 1.84e-02 -0.151 0.0637 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 1.86e-01 0.0979 0.0738 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 3.86e-01 0.0917 0.106 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 3.71e-01 0.0763 0.0851 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 7.92e-01 0.0199 0.0754 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0828 0.0623 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0754 0.0793 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0528 0.0884 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 7.69e-01 0.0316 0.107 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 4.91e-01 0.0704 0.102 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0322 0.0851 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 8.09e-01 0.0208 0.0861 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0104 0.101 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 1.05e-01 -0.161 0.0987 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 3.51e-01 -0.109 0.117 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 7.74e-01 0.0259 0.09 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 6.27e-02 0.162 0.0867 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 7.51e-02 0.172 0.0961 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 8.50e-02 -0.175 0.101 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0318 0.0957 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 7.23e-01 0.0374 0.106 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0597 0.0909 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 8.68e-01 0.0122 0.0732 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 2.43e-01 0.0819 0.07 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0451 0.0876 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 5.69e-01 0.0543 0.0953 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0891 0.117 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0932 0.107 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 2.19e-01 0.124 0.1 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 1.31e-01 0.159 0.105 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 8.62e-01 0.017 0.0976 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00779 0.0987 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 7.15e-02 -0.199 0.11 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 2.49e-01 0.123 0.106 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 4.56e-01 0.0812 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00482 0.102 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 4.69e-01 0.0768 0.106 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 2.85e-01 -0.103 0.0958 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 3.48e-01 -0.108 0.115 0.201 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 8.74e-01 0.0161 0.102 0.201 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 9.16e-01 0.0103 0.0975 0.201 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 6.97e-01 0.0358 0.0919 0.201 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 2.27e-01 -0.124 0.102 0.201 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 9.85e-01 0.00195 0.106 0.201 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 3.16e-01 -0.115 0.114 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0285 0.0966 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 4.27e-01 0.0806 0.101 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 8.46e-01 0.0194 0.1 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0352 0.1 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0686 0.0989 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0205 0.107 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 3.62e-02 0.166 0.0787 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0119 0.0816 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 2.40e-02 0.195 0.0859 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00735 0.109 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0996 0.0896 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 6.67e-01 0.0488 0.113 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0742 0.101 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 6.00e-01 0.0516 0.0984 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 8.02e-02 0.164 0.0932 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 9.42e-01 0.00725 0.1 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 2.90e-01 -0.102 0.0964 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0741 0.105 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 4.95e-01 0.0561 0.0819 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 7.40e-01 0.0295 0.0886 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 3.17e-01 0.0977 0.0974 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0279 0.103 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 3.73e-01 0.0858 0.0961 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 6.69e-01 -0.055 0.128 0.196 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 2.57e-02 0.329 0.146 0.196 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 4.02e-01 -0.109 0.129 0.196 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -312929 sc-eQTL 6.96e-02 -0.218 0.119 0.196 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 6.59e-02 -0.158 0.0849 0.196 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 4.78e-02 -0.232 0.116 0.196 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 7.87e-01 0.0341 0.126 0.196 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 3.98e-01 0.0694 0.0819 0.202 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0458 0.104 0.202 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 1.89e-01 0.128 0.0968 0.202 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00561 0.0697 0.202 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 4.72e-01 -0.07 0.0973 0.202 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0447 0.0895 0.202 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0472 0.11 0.205 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0188 0.106 0.205 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 5.59e-01 0.0498 0.0849 0.205 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0691 0.0972 0.205 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0659 0.0991 0.205 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 2.63e-01 0.111 0.0988 0.205 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 2.56e-01 -0.125 0.109 0.21 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00834 0.119 0.21 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00156 0.102 0.21 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 5.92e-01 0.0384 0.0715 0.21 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -998909 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0415 0.0918 0.21 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 1.11e-01 -0.155 0.0965 0.21 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 1.52e-01 0.127 0.0882 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 7.34e-01 0.0336 0.0988 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0135 0.0669 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00115 0.0587 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -498102 sc-eQTL 1.68e-01 -0.152 0.11 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -998909 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0175 0.112 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 1.74e-01 0.125 0.0919 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 9.90e-01 0.00113 0.0935 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 2.40e-03 0.332 0.108 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 9.15e-01 0.00851 0.0798 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 6.66e-01 0.0265 0.0613 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -498102 sc-eQTL 2.42e-02 -0.238 0.105 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -998909 sc-eQTL 4.52e-01 0.0844 0.112 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 6.69e-01 0.0392 0.0915 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0748 0.128 0.215 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 5.34e-01 0.0686 0.11 0.215 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 3.95e-01 0.0968 0.113 0.215 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 1.01e-01 0.202 0.122 0.215 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 4.75e-04 -0.391 0.109 0.215 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0142 0.11 0.215 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 3.11e-01 -0.103 0.102 0.211 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 5.94e-02 0.206 0.109 0.211 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 5.82e-01 0.0512 0.0928 0.211 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 7.07e-02 0.131 0.0723 0.211 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -498102 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0596 0.0997 0.211 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -998909 sc-eQTL 5.97e-01 0.0552 0.104 0.211 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 1.59e-01 0.139 0.0985 0.211 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0868 0.0949 0.208 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 2.45e-02 0.227 0.1 0.208 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0714 0.0827 0.208 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 9.55e-01 0.00422 0.0752 0.208 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -498102 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0288 0.0843 0.208 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -998909 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0696 0.0919 0.208 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0396 0.0953 0.208 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 3.40e-02 -0.229 0.107 0.223 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 2.09e-01 -0.149 0.118 0.223 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 7.28e-01 0.0343 0.0986 0.223 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 1.88e-01 0.12 0.0912 0.223 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -998909 sc-eQTL 4.58e-01 0.0826 0.111 0.223 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 2.09e-01 -0.127 0.101 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0234 0.11 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0497 0.0914 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0528 0.081 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -312929 sc-eQTL 7.58e-01 0.0286 0.0924 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0284 0.0581 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0981 0.0765 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 5.34e-02 -0.161 0.083 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 2.06e-01 0.126 0.0996 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 4.59e-01 0.0586 0.079 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 5.32e-01 0.0467 0.0747 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -312929 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00107 0.072 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 9.10e-01 0.00575 0.0507 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0676 0.0653 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00219 0.0778 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 2.20e-01 0.104 0.0842 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 2.57e-02 0.213 0.0946 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00239 0.0611 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 8.80e-01 -0.00808 0.0537 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -498102 sc-eQTL 4.56e-02 -0.218 0.108 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -998909 sc-eQTL 7.29e-01 0.0391 0.113 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 3.03e-01 0.089 0.0863 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 1.69e-01 -0.126 0.0912 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 8.44e-03 0.262 0.0986 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0729 0.082 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 1.56e-01 0.0932 0.0654 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -498102 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0222 0.096 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -998909 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00765 0.0995 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 5.16e-01 0.0615 0.0945 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -886132 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0712 0.102 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886326 sc-eQTL 5.22e-02 0.135 0.069 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -655335 sc-eQTL 7.18e-01 0.0275 0.0762 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -347118 sc-eQTL 3.23e-02 0.182 0.0843 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307848 sc-eQTL 9.96e-01 0.0005 0.0983 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -321037 sc-eQTL 7.49e-01 0.0272 0.0848 0.207 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162510 \N -312929 1.29e-06 9.48e-07 3.12e-07 6.38e-07 3.46e-07 4.77e-07 1.32e-06 3.41e-07 1.28e-06 4.19e-07 1.48e-06 6.01e-07 2e-06 2.78e-07 5.65e-07 8.25e-07 8.54e-07 6.1e-07 7.7e-07 6.96e-07 6.13e-07 1.33e-06 9.26e-07 6.37e-07 1.97e-06 4.23e-07 7.73e-07 7.14e-07 1.29e-06 1.26e-06 5.88e-07 1.58e-07 2.56e-07 5.64e-07 4.49e-07 4.66e-07 5.12e-07 2.15e-07 3.25e-07 2.48e-07 2.89e-07 1.62e-06 6.17e-08 9e-08 1.79e-07 1.27e-07 2.28e-07 5.28e-08 1.63e-07
ENSG00000168528 \N -998909 2.69e-07 1.25e-07 4.91e-08 1.84e-07 9.24e-08 9.8e-08 1.53e-07 5.43e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.57e-07 8.68e-08 1.45e-07 6.56e-08 6.02e-08 7.53e-08 4.17e-08 1.27e-07 5.75e-08 4.04e-08 1.19e-07 1.27e-07 1.44e-07 3.23e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.12e-07 1.03e-07 9.7e-08 3.68e-08 3.96e-08 8.55e-08 7.66e-08 3.6e-08 5.11e-08 9.36e-08 6.54e-08 3.76e-08 5.14e-08 1.35e-07 5.21e-08 1.22e-08 4.7e-08 1.84e-08 1.18e-07 3.78e-09 5.01e-08