logo

Genes within 1Mb (chr1:30410522:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 6.47e-01 0.0429 0.0935 0.205 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 7.87e-01 0.0203 0.0749 0.205 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 7.60e-01 0.0192 0.0629 0.205 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -313063 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0256 0.0661 0.205 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 8.29e-01 0.0112 0.0518 0.205 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0719 0.0605 0.205 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0515 0.0717 0.205 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0725 0.08 0.205 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00728 0.0626 0.205 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 5.72e-01 0.0315 0.0557 0.205 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0927 0.0614 0.205 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 4.40e-02 -0.111 0.0547 0.205 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 4.89e-01 0.0458 0.0661 0.205 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0811 0.106 0.205 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 7.20e-01 0.0253 0.0705 0.205 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 1.26e-01 0.095 0.0617 0.205 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 1.22e-01 0.0932 0.06 0.205 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 8.32e-01 -0.015 0.0707 0.205 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 8.96e-01 0.0116 0.0888 0.205 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 2.35e-01 -0.113 0.0946 0.205 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0421 0.112 0.205 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0861 0.0878 0.205 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 4.93e-01 0.0431 0.0628 0.205 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -999043 sc-eQTL 3.29e-01 0.101 0.103 0.205 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 1.73e-01 -0.135 0.0989 0.205 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 6.77e-01 0.0309 0.074 0.205 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 3.22e-03 0.268 0.0899 0.205 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0293 0.0588 0.205 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 7.02e-01 0.0207 0.0541 0.205 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -498236 sc-eQTL 1.37e-01 -0.155 0.103 0.205 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -999043 sc-eQTL 5.83e-01 0.0613 0.111 0.205 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 2.91e-01 0.0907 0.0857 0.205 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0954 0.101 0.206 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 8.96e-02 0.118 0.0689 0.206 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 4.07e-01 0.0604 0.0727 0.206 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 5.01e-02 0.164 0.083 0.206 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 8.40e-01 0.0191 0.0942 0.206 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00171 0.087 0.206 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 8.08e-01 0.0188 0.0773 0.205 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 2.97e-01 0.0861 0.0824 0.205 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 2.15e-01 0.0921 0.074 0.205 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 9.52e-01 0.0037 0.0609 0.205 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 2.14e-02 -0.228 0.0984 0.205 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0853 0.104 0.205 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 4.88e-02 -0.247 0.125 0.194 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 6.00e-02 -0.238 0.126 0.194 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0758 0.118 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -313063 sc-eQTL 8.76e-01 0.0161 0.103 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00964 0.072 0.194 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 1.58e-01 -0.164 0.116 0.194 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 5.74e-02 -0.195 0.102 0.194 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 6.18e-01 0.0576 0.115 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000601 0.0963 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 7.42e-02 -0.162 0.0901 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -313063 sc-eQTL 8.16e-01 -0.022 0.0945 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 3.17e-01 0.058 0.0579 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 1.07e-01 -0.131 0.0809 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 1.03e-01 -0.148 0.0905 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 6.71e-01 0.0478 0.113 0.205 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 6.54e-01 0.0466 0.104 0.205 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0161 0.0903 0.205 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -313063 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0136 0.0864 0.205 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0892 0.0763 0.205 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 9.91e-01 0.00101 0.0876 0.205 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0142 0.103 0.205 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 2.11e-01 0.128 0.102 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 3.44e-01 0.0838 0.0883 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000743 0.078 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -313063 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0509 0.0791 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0091 0.0529 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 7.34e-02 -0.124 0.0689 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 9.41e-01 0.00632 0.0858 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 9.88e-01 0.00165 0.109 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 8.08e-01 0.0217 0.0896 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 2.19e-01 0.108 0.0874 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -313063 sc-eQTL 3.73e-01 0.075 0.084 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 3.17e-01 0.0572 0.057 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 9.86e-01 0.00145 0.0832 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0473 0.0899 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 6.26e-01 0.0534 0.109 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 7.77e-01 0.0304 0.108 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 3.40e-01 0.101 0.105 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 2.83e-01 -0.101 0.0938 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 5.49e-02 0.197 0.102 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 6.67e-01 0.0391 0.0908 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 1.42e-01 -0.123 0.0834 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0422 0.0743 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00161 0.0594 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0891 0.0633 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 1.84e-02 -0.151 0.0637 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 1.86e-01 0.0979 0.0738 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 3.86e-01 0.0917 0.106 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 3.71e-01 0.0763 0.0851 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 7.92e-01 0.0199 0.0754 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0828 0.0623 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0754 0.0793 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0528 0.0884 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 7.69e-01 0.0316 0.107 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 4.91e-01 0.0704 0.102 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0322 0.0851 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 8.09e-01 0.0208 0.0861 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0104 0.101 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 1.05e-01 -0.161 0.0987 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 3.51e-01 -0.109 0.117 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 7.74e-01 0.0259 0.09 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 6.27e-02 0.162 0.0867 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 7.51e-02 0.172 0.0961 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 8.50e-02 -0.175 0.101 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0318 0.0957 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 7.23e-01 0.0374 0.106 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0597 0.0909 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 8.68e-01 0.0122 0.0732 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 2.43e-01 0.0819 0.07 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0451 0.0876 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 5.69e-01 0.0543 0.0953 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0891 0.117 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0932 0.107 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 2.19e-01 0.124 0.1 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 1.31e-01 0.159 0.105 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 8.62e-01 0.017 0.0976 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00779 0.0987 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 7.15e-02 -0.199 0.11 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 2.49e-01 0.123 0.106 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 4.56e-01 0.0812 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00482 0.102 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 4.69e-01 0.0768 0.106 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 2.85e-01 -0.103 0.0958 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 3.48e-01 -0.108 0.115 0.201 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 8.74e-01 0.0161 0.102 0.201 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 9.16e-01 0.0103 0.0975 0.201 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 6.97e-01 0.0358 0.0919 0.201 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 2.27e-01 -0.124 0.102 0.201 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 9.85e-01 0.00195 0.106 0.201 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 3.16e-01 -0.115 0.114 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0285 0.0966 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 4.27e-01 0.0806 0.101 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 8.46e-01 0.0194 0.1 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0352 0.1 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0686 0.0989 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0205 0.107 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 3.62e-02 0.166 0.0787 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0119 0.0816 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 2.40e-02 0.195 0.0859 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00735 0.109 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0996 0.0896 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 6.67e-01 0.0488 0.113 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0742 0.101 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 6.00e-01 0.0516 0.0984 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 8.02e-02 0.164 0.0932 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 9.42e-01 0.00725 0.1 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 2.90e-01 -0.102 0.0964 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0741 0.105 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 4.95e-01 0.0561 0.0819 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 7.40e-01 0.0295 0.0886 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 3.17e-01 0.0977 0.0974 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0279 0.103 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 3.73e-01 0.0858 0.0961 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 6.69e-01 -0.055 0.128 0.196 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 2.57e-02 0.329 0.146 0.196 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 4.02e-01 -0.109 0.129 0.196 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -313063 sc-eQTL 6.96e-02 -0.218 0.119 0.196 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 6.59e-02 -0.158 0.0849 0.196 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 4.78e-02 -0.232 0.116 0.196 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 7.87e-01 0.0341 0.126 0.196 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 3.98e-01 0.0694 0.0819 0.202 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0458 0.104 0.202 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 1.89e-01 0.128 0.0968 0.202 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00561 0.0697 0.202 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 4.72e-01 -0.07 0.0973 0.202 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0447 0.0895 0.202 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0472 0.11 0.205 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0188 0.106 0.205 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 5.59e-01 0.0498 0.0849 0.205 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0691 0.0972 0.205 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0659 0.0991 0.205 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 2.63e-01 0.111 0.0988 0.205 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 2.56e-01 -0.125 0.109 0.21 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00834 0.119 0.21 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00156 0.102 0.21 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 5.92e-01 0.0384 0.0715 0.21 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -999043 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0415 0.0918 0.21 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 1.11e-01 -0.155 0.0965 0.21 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 1.52e-01 0.127 0.0882 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 7.34e-01 0.0336 0.0988 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0135 0.0669 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00115 0.0587 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -498236 sc-eQTL 1.68e-01 -0.152 0.11 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -999043 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0175 0.112 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 1.74e-01 0.125 0.0919 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 9.90e-01 0.00113 0.0935 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 2.40e-03 0.332 0.108 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 9.15e-01 0.00851 0.0798 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 6.66e-01 0.0265 0.0613 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -498236 sc-eQTL 2.42e-02 -0.238 0.105 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -999043 sc-eQTL 4.52e-01 0.0844 0.112 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 6.69e-01 0.0392 0.0915 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0748 0.128 0.215 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 5.34e-01 0.0686 0.11 0.215 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 3.95e-01 0.0968 0.113 0.215 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 1.01e-01 0.202 0.122 0.215 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 4.75e-04 -0.391 0.109 0.215 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0142 0.11 0.215 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 3.11e-01 -0.103 0.102 0.211 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 5.94e-02 0.206 0.109 0.211 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 5.82e-01 0.0512 0.0928 0.211 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 7.07e-02 0.131 0.0723 0.211 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -498236 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0596 0.0997 0.211 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -999043 sc-eQTL 5.97e-01 0.0552 0.104 0.211 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 1.59e-01 0.139 0.0985 0.211 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0868 0.0949 0.208 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 2.45e-02 0.227 0.1 0.208 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0714 0.0827 0.208 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 9.55e-01 0.00422 0.0752 0.208 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -498236 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0288 0.0843 0.208 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -999043 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0696 0.0919 0.208 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0396 0.0953 0.208 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 3.40e-02 -0.229 0.107 0.223 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 2.09e-01 -0.149 0.118 0.223 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 7.28e-01 0.0343 0.0986 0.223 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 1.88e-01 0.12 0.0912 0.223 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -999043 sc-eQTL 4.58e-01 0.0826 0.111 0.223 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 2.09e-01 -0.127 0.101 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0234 0.11 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0497 0.0914 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0528 0.081 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -313063 sc-eQTL 7.58e-01 0.0286 0.0924 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0284 0.0581 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0981 0.0765 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 5.34e-02 -0.161 0.083 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 2.06e-01 0.126 0.0996 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 4.59e-01 0.0586 0.079 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 5.32e-01 0.0467 0.0747 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -313063 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00107 0.072 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 9.10e-01 0.00575 0.0507 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0676 0.0653 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00219 0.0778 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 2.20e-01 0.104 0.0842 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 2.57e-02 0.213 0.0946 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00239 0.0611 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 8.80e-01 -0.00808 0.0537 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -498236 sc-eQTL 4.56e-02 -0.218 0.108 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -999043 sc-eQTL 7.29e-01 0.0391 0.113 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 3.03e-01 0.089 0.0863 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 1.69e-01 -0.126 0.0912 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 8.44e-03 0.262 0.0986 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0729 0.082 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 1.56e-01 0.0932 0.0654 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -498236 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0222 0.096 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -999043 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00765 0.0995 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 5.16e-01 0.0615 0.0945 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -886266 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0712 0.102 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -886460 sc-eQTL 5.22e-02 0.135 0.069 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -655469 sc-eQTL 7.18e-01 0.0275 0.0762 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -347252 sc-eQTL 3.23e-02 0.182 0.0843 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -307982 sc-eQTL 9.96e-01 0.0005 0.0983 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -321171 sc-eQTL 7.49e-01 0.0272 0.0848 0.207 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162510 \N -313063 1.33e-06 9.31e-07 3.22e-07 6.75e-07 2.79e-07 4.46e-07 1.24e-06 3.51e-07 1.29e-06 4.15e-07 1.39e-06 5.64e-07 1.99e-06 2.67e-07 4.31e-07 8.25e-07 7.91e-07 6.13e-07 5.7e-07 6.76e-07 4.44e-07 1.22e-06 9.21e-07 6.42e-07 2.01e-06 4.36e-07 7.31e-07 6.89e-07 1.23e-06 1.22e-06 5.91e-07 7.32e-08 2.17e-07 6.68e-07 4.2e-07 4.66e-07 5.17e-07 1.46e-07 3.2e-07 1.3e-07 2.89e-07 1.47e-06 5.37e-08 4.2e-08 1.54e-07 9.77e-08 2.3e-07 8.51e-08 8.61e-08
ENSG00000168528 \N -999043 2.74e-07 1.3e-07 4.48e-08 1.86e-07 9.16e-08 9.8e-08 1.53e-07 5.43e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.55e-07 8.68e-08 1.47e-07 6.56e-08 6.02e-08 7.36e-08 3.93e-08 1.27e-07 5.82e-08 4.04e-08 1.13e-07 1.27e-07 1.44e-07 3.23e-08 1.5e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.12e-07 1.03e-07 9.92e-08 4.09e-08 3.16e-08 8.25e-08 8.21e-08 3.6e-08 5.08e-08 9.22e-08 6.54e-08 3.98e-08 4.64e-08 1.33e-07 4.7e-08 1.49e-08 5.19e-08 1.83e-08 1.21e-07 3.92e-09 4.79e-08