logo

Genes within 1Mb (chr1:30392634:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0393 0.0981 0.201 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 4.35e-01 0.0614 0.0784 0.201 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0344 0.0659 0.201 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -330951 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00561 0.0693 0.201 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0155 0.0543 0.201 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 9.98e-01 0.000125 0.0636 0.201 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0362 0.0752 0.201 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0967 0.0831 0.201 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0392 0.0651 0.201 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 4.40e-01 0.0448 0.0579 0.201 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 1.66e-01 -0.089 0.064 0.201 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 1.07e-01 -0.0924 0.0571 0.201 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 1.57e-01 0.0974 0.0685 0.201 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 1.80e-01 -0.147 0.109 0.201 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 9.41e-01 0.00546 0.073 0.201 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 1.66e-01 0.0889 0.064 0.201 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 6.93e-01 0.0247 0.0624 0.201 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0251 0.0732 0.201 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 9.73e-01 0.00311 0.092 0.201 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0606 0.0973 0.203 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0255 0.115 0.203 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 2.46e-01 -0.105 0.0901 0.203 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 8.97e-01 0.00838 0.0645 0.203 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 8.47e-01 0.0198 0.102 0.203 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 2.68e-01 0.0835 0.0753 0.201 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 4.28e-02 0.189 0.0927 0.201 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 7.05e-01 0.0228 0.06 0.201 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 6.01e-01 0.0289 0.0551 0.201 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -516124 sc-eQTL 2.32e-01 -0.127 0.106 0.201 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 3.37e-01 0.0841 0.0874 0.201 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 2.57e-01 -0.119 0.105 0.202 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 6.68e-01 0.0308 0.0718 0.202 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 4.45e-01 0.0576 0.0752 0.202 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 3.02e-01 0.0894 0.0865 0.202 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0838 0.0973 0.202 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 7.14e-01 -0.033 0.0899 0.202 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0296 0.0794 0.201 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 9.88e-01 0.00127 0.0849 0.201 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 1.76e-01 0.103 0.076 0.201 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 8.67e-01 0.0105 0.0626 0.201 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 2.73e-02 -0.225 0.101 0.201 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0583 0.107 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 2.12e-01 -0.165 0.132 0.184 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0435 0.133 0.184 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 2.82e-01 -0.133 0.124 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -330951 sc-eQTL 6.36e-01 0.0513 0.108 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 6.18e-01 0.0377 0.0755 0.184 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 2.61e-01 -0.137 0.122 0.184 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 3.83e-03 -0.309 0.105 0.184 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0257 0.121 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 3.24e-01 0.0994 0.101 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0894 0.0949 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -330951 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0133 0.0989 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 8.44e-01 0.0119 0.0607 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 2.26e-01 -0.103 0.0849 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 8.92e-01 0.0129 0.0954 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 8.70e-01 0.0188 0.115 0.2 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 9.12e-02 0.178 0.105 0.2 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00279 0.092 0.2 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -330951 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0527 0.088 0.2 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0583 0.0779 0.2 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0242 0.0893 0.2 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0953 0.104 0.2 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 7.10e-01 0.0397 0.107 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 3.60e-01 0.0842 0.0919 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0179 0.0812 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -330951 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00616 0.0824 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 7.85e-01 0.015 0.055 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0726 0.0721 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 8.49e-01 0.0171 0.0893 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00333 0.114 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0883 0.0939 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 2.65e-01 0.103 0.0918 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -330951 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0287 0.0884 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 4.26e-01 0.0478 0.0599 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 7.66e-01 0.026 0.0874 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0866 0.0942 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 6.11e-01 -0.057 0.112 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 6.25e-01 0.0538 0.11 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 7.58e-01 0.0333 0.108 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 1.18e-01 -0.15 0.0956 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 3.18e-01 0.105 0.105 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0242 0.0929 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0664 0.0869 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 2.64e-01 -0.086 0.0769 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 7.81e-01 0.0172 0.0616 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 1.14e-01 -0.104 0.0656 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 4.54e-02 -0.133 0.0663 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 1.79e-01 0.103 0.0766 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0102 0.11 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 8.51e-01 0.0167 0.0887 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 6.48e-01 0.0359 0.0785 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0331 0.0651 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 8.53e-01 0.0153 0.0826 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 7.84e-01 0.0253 0.092 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0124 0.111 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 4.08e-01 0.0878 0.106 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 6.99e-01 0.0342 0.0884 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 4.03e-01 0.0748 0.0893 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0897 0.104 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 4.06e-02 -0.21 0.102 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 2.60e-01 -0.136 0.12 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00619 0.0926 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 2.82e-02 0.196 0.0889 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 1.53e-01 0.142 0.0991 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 1.49e-01 -0.151 0.104 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 8.08e-01 -0.024 0.0984 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 9.42e-01 0.00805 0.11 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 9.97e-01 0.0003 0.0946 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 9.00e-01 0.00957 0.0761 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 3.66e-01 0.066 0.0728 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0268 0.091 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 4.82e-01 0.0697 0.099 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 3.14e-01 -0.125 0.123 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 1.19e-01 -0.176 0.113 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 7.57e-02 0.189 0.106 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00735 0.112 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 6.10e-01 0.0527 0.103 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0279 0.104 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 1.51e-01 -0.164 0.113 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 9.92e-01 -0.0011 0.109 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 6.30e-01 0.054 0.112 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0244 0.105 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 9.14e-01 0.0118 0.109 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 2.44e-01 -0.115 0.0984 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 2.81e-01 -0.126 0.117 0.199 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 9.79e-01 0.00278 0.104 0.199 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 5.70e-01 0.0566 0.0995 0.199 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 7.96e-01 0.0243 0.0939 0.199 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 2.96e-01 -0.109 0.104 0.199 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00569 0.108 0.199 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 1.27e-01 -0.182 0.119 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0351 0.101 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 2.88e-01 0.113 0.106 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 3.66e-01 0.0948 0.105 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0244 0.105 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0229 0.104 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 8.98e-01 0.0142 0.111 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 5.85e-01 0.0448 0.0818 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 8.71e-01 0.0137 0.084 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 4.01e-01 0.0753 0.0894 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0522 0.112 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 1.41e-01 -0.136 0.0921 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0549 0.117 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0734 0.104 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 4.89e-01 0.0703 0.101 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 1.64e-01 0.135 0.0965 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 5.80e-01 0.0571 0.103 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0308 0.0997 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 2.57e-01 -0.124 0.109 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 8.99e-01 0.0108 0.0852 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 7.50e-01 0.0293 0.0921 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 8.00e-01 0.0258 0.101 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 3.14e-01 -0.108 0.107 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0452 0.0999 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 1.99e-01 -0.17 0.131 0.196 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 2.16e-01 0.189 0.152 0.196 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 1.78e-01 -0.179 0.132 0.196 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -330951 sc-eQTL 2.23e-01 -0.151 0.123 0.196 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 1.67e-01 -0.122 0.088 0.196 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 6.26e-01 0.0593 0.121 0.196 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0794 0.129 0.196 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00711 0.087 0.198 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 8.51e-01 0.0208 0.11 0.198 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0339 0.103 0.198 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 5.00e-01 0.0498 0.0738 0.198 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 5.36e-02 -0.199 0.102 0.198 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0351 0.0949 0.198 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0661 0.115 0.201 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 2.99e-01 -0.115 0.111 0.201 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 9.81e-01 0.00211 0.0888 0.201 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0732 0.102 0.201 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0174 0.104 0.201 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0147 0.103 0.201 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0339 0.114 0.207 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 8.34e-01 -0.026 0.123 0.207 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0931 0.106 0.207 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0351 0.0743 0.207 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0349 0.101 0.207 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 4.78e-01 0.0641 0.0902 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 6.09e-01 0.0516 0.101 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 9.51e-01 0.00417 0.0682 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0351 0.0598 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -516124 sc-eQTL 7.59e-02 -0.2 0.112 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 1.27e-01 0.144 0.0936 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 2.55e-01 0.108 0.0948 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 7.72e-03 0.297 0.111 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 7.69e-01 0.0239 0.0812 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 4.82e-01 0.0439 0.0624 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -516124 sc-eQTL 1.72e-01 -0.147 0.107 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0634 0.0931 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 4.47e-01 -0.105 0.137 0.2 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 5.54e-01 0.0699 0.118 0.2 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 2.27e-01 0.147 0.121 0.2 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 3.19e-01 0.132 0.132 0.2 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 7.84e-03 -0.321 0.119 0.2 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 5.93e-01 0.0632 0.118 0.2 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 6.02e-01 0.0549 0.105 0.207 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 9.49e-01 0.00716 0.113 0.207 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 1.63e-01 0.133 0.0953 0.207 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 8.03e-02 0.131 0.0746 0.207 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -516124 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0188 0.103 0.207 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 2.76e-01 0.111 0.102 0.207 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0462 0.0988 0.199 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 6.73e-01 0.0445 0.105 0.199 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0327 0.0861 0.199 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 8.49e-01 0.0149 0.0782 0.199 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -516124 sc-eQTL 2.20e-01 -0.108 0.0874 0.199 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0657 0.099 0.199 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 2.19e-01 -0.14 0.114 0.212 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 4.08e-01 -0.104 0.125 0.212 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0277 0.104 0.212 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 3.04e-01 0.0995 0.0965 0.212 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0283 0.107 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0412 0.115 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 2.54e-01 0.109 0.0954 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0308 0.0848 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -330951 sc-eQTL 7.07e-01 0.0364 0.0967 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0328 0.0607 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0846 0.0802 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 3.55e-01 -0.081 0.0874 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 9.14e-01 0.0113 0.104 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 9.65e-01 0.00357 0.0823 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0178 0.0778 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -330951 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00497 0.075 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 4.91e-01 0.0364 0.0527 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000161 0.0682 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0248 0.0809 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 2.84e-01 0.0923 0.0859 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 3.41e-02 0.206 0.0965 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 7.47e-01 0.02 0.0622 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00401 0.0547 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -516124 sc-eQTL 8.53e-02 -0.192 0.111 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 3.88e-01 0.0761 0.0879 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0122 0.0946 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 9.03e-01 0.0127 0.103 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 3.46e-01 0.0799 0.0846 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 2.01e-01 0.0867 0.0675 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -516124 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0408 0.099 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 5.59e-01 0.057 0.0975 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -904154 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0893 0.105 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -904348 sc-eQTL 5.74e-01 0.0406 0.0719 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -673357 sc-eQTL 5.86e-01 0.0429 0.0788 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -365140 sc-eQTL 2.51e-01 0.101 0.0879 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -325870 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0753 0.102 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -339059 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0668 0.0876 0.203 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121769 FABP3 -984216 pQTL 1.58e-02 -0.0504 0.0208 0.0 0.0 0.199

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina