logo

Genes within 1Mb (chr1:30384451:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00376 0.0927 0.241 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 1.27e-01 0.113 0.0739 0.241 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0472 0.0622 0.241 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -339134 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0147 0.0655 0.241 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 8.51e-01 0.00962 0.0513 0.241 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 7.83e-01 0.0166 0.0601 0.241 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0353 0.0711 0.241 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 1.67e-01 -0.109 0.0784 0.241 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0355 0.0615 0.241 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 8.12e-02 0.0953 0.0544 0.241 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 1.24e-01 -0.0932 0.0604 0.241 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0461 0.0542 0.241 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 3.25e-01 0.0641 0.0649 0.241 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 4.51e-02 -0.208 0.103 0.241 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0314 0.0694 0.241 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 2.66e-01 0.068 0.061 0.241 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 7.01e-01 0.0228 0.0594 0.241 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 8.63e-01 -0.012 0.0696 0.241 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 9.68e-01 0.00353 0.0875 0.241 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 1.88e-01 -0.121 0.0916 0.245 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0122 0.109 0.245 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0713 0.0852 0.245 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 9.21e-01 0.00602 0.0609 0.245 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 6.34e-01 0.0459 0.0963 0.245 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 5.13e-01 0.0472 0.072 0.241 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 1.18e-02 0.223 0.088 0.241 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 3.85e-01 0.0498 0.0571 0.241 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 2.77e-01 0.0572 0.0525 0.241 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -524307 sc-eQTL 1.71e-01 -0.138 0.101 0.241 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 1.00e-01 0.137 0.0831 0.241 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 1.20e-01 -0.154 0.0985 0.242 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 5.15e-01 0.0442 0.0678 0.242 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 2.30e-01 0.0854 0.0709 0.242 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 1.38e-01 0.121 0.0814 0.242 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0769 0.0918 0.242 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 7.30e-01 0.0294 0.0849 0.242 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0531 0.0744 0.241 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 5.04e-01 0.0532 0.0795 0.241 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 8.31e-01 0.0152 0.0715 0.241 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0326 0.0586 0.241 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 5.70e-02 -0.182 0.0952 0.241 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 9.95e-01 0.000639 0.1 0.241 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 1.14e-01 -0.193 0.122 0.222 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0607 0.124 0.222 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0571 0.115 0.222 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -339134 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0324 0.1 0.222 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 4.99e-01 0.0474 0.07 0.222 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 4.85e-01 -0.079 0.113 0.222 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 5.37e-03 -0.276 0.0979 0.222 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0626 0.114 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 1.90e-01 0.125 0.0947 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 1.96e-01 -0.116 0.0894 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -339134 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0746 0.0932 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 7.94e-01 0.015 0.0573 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 9.13e-01 0.00881 0.0804 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 5.13e-01 0.059 0.0899 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 4.29e-01 0.0866 0.109 0.241 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 7.46e-02 0.179 0.1 0.241 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 9.41e-01 0.00652 0.0878 0.241 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -339134 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0173 0.084 0.241 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0792 0.0742 0.241 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 8.88e-01 0.012 0.0852 0.241 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0821 0.0996 0.241 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 8.04e-01 0.0252 0.101 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 9.11e-02 0.147 0.0869 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 6.14e-01 -0.039 0.0771 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -339134 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0174 0.0783 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 5.94e-01 0.0279 0.0522 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0749 0.0685 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 7.20e-01 0.0304 0.0848 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0118 0.109 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0877 0.0894 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 6.02e-01 0.0457 0.0876 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -339134 sc-eQTL 1.00e+00 1.2e-05 0.0842 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 5.74e-01 0.0322 0.0571 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 8.21e-01 0.0189 0.0832 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0563 0.0898 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 3.27e-01 -0.104 0.106 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 8.29e-01 0.0226 0.105 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 7.61e-01 0.0312 0.103 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0747 0.0913 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 9.06e-02 0.169 0.0993 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0123 0.0883 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 6.63e-01 -0.036 0.0824 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0819 0.0729 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 4.42e-01 0.045 0.0583 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 6.90e-02 -0.113 0.0621 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 7.12e-02 -0.114 0.063 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 2.58e-01 0.0825 0.0727 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 1.56e-01 -0.147 0.103 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 6.66e-01 0.0362 0.0838 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 1.72e-01 0.101 0.0739 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0198 0.0615 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 2.27e-01 0.0944 0.0778 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00242 0.087 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 8.44e-01 0.0206 0.104 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 2.63e-01 0.111 0.0992 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 1.65e-01 0.115 0.0825 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 6.17e-01 0.042 0.0838 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0243 0.0981 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 7.24e-02 -0.173 0.0959 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 9.35e-02 -0.192 0.114 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 5.78e-01 0.049 0.0878 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 1.47e-01 0.124 0.0849 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 4.67e-01 0.0688 0.0944 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 3.03e-01 -0.102 0.0991 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0188 0.0934 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 8.08e-01 0.0253 0.104 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0524 0.0898 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0367 0.0723 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 4.84e-01 0.0486 0.0692 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0345 0.0865 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 4.79e-01 0.0668 0.094 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 3.46e-02 -0.247 0.116 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 1.01e-01 -0.176 0.107 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 1.88e-01 0.133 0.101 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0398 0.106 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 9.31e-01 0.00856 0.098 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 4.94e-01 0.0678 0.099 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 1.32e-01 -0.166 0.11 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 4.73e-01 0.0761 0.106 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 5.28e-01 0.0684 0.108 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0918 0.102 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0406 0.106 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0879 0.0955 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 1.41e-01 -0.161 0.109 0.24 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 8.05e-01 0.024 0.0972 0.24 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0937 0.093 0.24 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00484 0.0879 0.24 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0853 0.0978 0.24 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 9.14e-01 0.0109 0.101 0.24 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 6.96e-02 -0.204 0.112 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0125 0.0952 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 2.87e-01 0.106 0.0997 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 2.23e-01 0.12 0.0983 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0365 0.0991 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0349 0.0976 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00338 0.105 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 3.94e-01 0.066 0.0772 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 5.98e-01 0.0419 0.0793 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 1.58e-01 0.119 0.0842 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0537 0.106 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0545 0.0874 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0646 0.111 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 6.06e-01 -0.051 0.0987 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 9.77e-02 0.159 0.0956 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 1.02e-01 0.15 0.0913 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00162 0.0978 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 5.41e-01 0.0578 0.0944 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 3.86e-02 -0.212 0.102 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 8.41e-01 0.0161 0.0801 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 9.00e-01 0.0109 0.0866 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 2.20e-01 0.117 0.0951 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00721 0.101 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00634 0.0941 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 2.32e-01 -0.148 0.123 0.241 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 5.81e-01 0.0796 0.144 0.241 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 4.09e-01 -0.103 0.125 0.241 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -339134 sc-eQTL 2.01e-01 -0.149 0.116 0.241 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0878 0.083 0.241 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0529 0.114 0.241 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0584 0.121 0.241 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0247 0.0818 0.239 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 3.07e-01 0.106 0.104 0.239 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 8.93e-01 0.0131 0.0969 0.239 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0365 0.0694 0.239 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 1.79e-01 -0.13 0.0967 0.239 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 9.11e-01 0.01 0.0893 0.239 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0586 0.108 0.241 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0824 0.104 0.241 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00454 0.0836 0.241 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0724 0.0956 0.241 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0168 0.0975 0.241 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 7.33e-01 0.0333 0.0974 0.241 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 3.82e-01 -0.094 0.107 0.249 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0649 0.116 0.249 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 4.36e-01 -0.078 0.0999 0.249 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00797 0.0701 0.249 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0255 0.0952 0.249 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 6.77e-01 0.0361 0.0864 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 4.19e-01 0.0779 0.0963 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 6.89e-01 0.0261 0.0652 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 6.45e-01 0.0264 0.0572 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -524307 sc-eQTL 3.66e-02 -0.225 0.107 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 3.81e-02 0.186 0.0891 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 5.43e-01 0.0553 0.0909 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 4.97e-04 0.369 0.104 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 3.68e-01 0.0699 0.0775 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 2.62e-01 0.0669 0.0595 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -524307 sc-eQTL 7.72e-02 -0.182 0.102 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 9.79e-01 0.0023 0.089 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0545 0.132 0.239 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 2.52e-01 0.13 0.113 0.239 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 3.04e-01 0.12 0.116 0.239 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 4.63e-01 0.0933 0.127 0.239 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 2.83e-02 -0.255 0.115 0.239 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 7.42e-01 0.0374 0.114 0.239 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 7.29e-01 0.0349 0.101 0.249 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0289 0.108 0.249 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 4.54e-01 0.0687 0.0916 0.249 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 5.57e-02 0.137 0.0713 0.249 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -524307 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0195 0.0985 0.249 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 2.03e-01 0.124 0.0973 0.249 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0466 0.0937 0.238 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 6.90e-01 0.0399 0.0999 0.238 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0184 0.0817 0.238 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 4.90e-01 0.0513 0.0741 0.238 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -524307 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0917 0.0829 0.238 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00199 0.094 0.238 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 1.05e-01 -0.175 0.107 0.257 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0178 0.119 0.257 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0439 0.0985 0.257 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 3.75e-01 0.0813 0.0914 0.257 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 9.65e-01 0.00444 0.101 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0139 0.109 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 1.34e-01 0.136 0.0903 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0514 0.0803 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -339134 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00587 0.0917 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0451 0.0575 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00479 0.0762 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0744 0.0829 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 9.19e-01 0.0101 0.0991 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 4.23e-01 0.0628 0.0783 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0403 0.0741 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -339134 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0191 0.0714 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 4.40e-01 0.0388 0.0502 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 8.42e-01 -0.013 0.0649 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00737 0.0771 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 4.80e-01 0.0581 0.0822 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 4.42e-03 0.263 0.0914 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 3.28e-01 0.0582 0.0593 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 4.59e-01 0.0387 0.0522 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -524307 sc-eQTL 2.61e-02 -0.236 0.105 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 1.28e-01 0.128 0.0837 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00867 0.0901 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 9.43e-01 0.00703 0.0986 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 5.97e-01 0.0427 0.0807 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 8.30e-02 0.112 0.0642 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -524307 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000923 0.0944 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 3.75e-01 0.0826 0.0929 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -912337 sc-eQTL 1.82e-01 -0.133 0.0991 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -912531 sc-eQTL 4.78e-01 0.0482 0.0679 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -681540 sc-eQTL 3.19e-01 0.0742 0.0743 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -373323 sc-eQTL 1.01e-01 0.136 0.0827 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334053 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0564 0.0959 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -347242 sc-eQTL 9.74e-01 0.00272 0.0829 0.244 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121769 FABP3 -992399 pQTL 2.10e-02 -0.0457 0.0198 0.0 0.0 0.235
ENSG00000229447 AC114495.2 -879230 eQTL 0.045 0.08 0.0399 0.0 0.0 0.228

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina